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Biology版 - 请问诸位chi-square test (转载)
相关主题
请教大家一个统计问题,多谢!p< 0.05 与 p< 0.01
求分离x chromosome的idea大家在实践中是如何决定用t-test还是non-parametrical test呢?
问作者要原始数据,不给怎么办求助--基因之间表达量回归分析软件
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话题: 数据话题: square话题: chi话题: test话题: monastrol
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1 (共1页)
y***i
发帖数: 11639
1
【 以下文字转载自 Statistics 讨论区 】
发信人: yuuli (听,...听), 信区: Statistics
标 题: 请问诸位chi-square test
发信站: BBS 未名空间站 (Mon Jun 25 18:52:20 2012, 美东)
看文章
http://jcb.rupress.org/content/180/4/665.full.pdf+html?with-ds=
figure 2C 用了chi-square test 不能理解
我的理解数据是这样的:
以figure2 C,chromosome 2的图,第5天的数据为例子 (红框内数据),这一天的数据
是monastrol significant,所以有个星号
control conditon有5%的cell 有deviation (supplimentary tableS2 红框内数据)
monastrol condition下, clone 10 有21.9%的cell 有deviation(supplimentary
tableS2 红框内数据),然后根据chi square test,这是significant.
我的理解是只有一个数据的话,没办法做统计。如果control和monastrol condition分
别有3个数据的话,勉勉强强可以用student t test。请问我的想法对不对。如果我的
想法是错的,这里的数据的确能做chi square test的话,请略解释一下,然后请教一
下两个比较,分别只有一个数据的话,怎么用这两个数据计算这个chi-square test。
多谢!
p*******c
发帖数: 224
2
我觉得你说的是对的。似乎不能用Chi-square, 数据类型不符合条件啊。
难道他们有额外的数据吗?

【在 y***i 的大作中提到】
: 【 以下文字转载自 Statistics 讨论区 】
: 发信人: yuuli (听,...听), 信区: Statistics
: 标 题: 请问诸位chi-square test
: 发信站: BBS 未名空间站 (Mon Jun 25 18:52:20 2012, 美东)
: 看文章
: http://jcb.rupress.org/content/180/4/665.full.pdf+html?with-ds=
: figure 2C 用了chi-square test 不能理解
: 我的理解数据是这样的:
: 以figure2 C,chromosome 2的图,第5天的数据为例子 (红框内数据),这一天的数据
: 是monastrol significant,所以有个星号

y***i
发帖数: 11639
3
我好像明白了。不是用percentage计算出来的,是用cell counting的数据算chi-
square pValue,类似fisher exact test
变化 不变
control A B
treated C D
然后用A/B/C/D这4个数据计算出chi-square pValue

【在 p*******c 的大作中提到】
: 我觉得你说的是对的。似乎不能用Chi-square, 数据类型不符合条件啊。
: 难道他们有额外的数据吗?

a*******n
发帖数: 156
4
chi square 计算goodness of fit吧,跟你说的不是一种东西
1 (共1页)
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Microarray的数据呈现天朝已经有新人类了 44条染色体
Gene ontology和GSEA分析是不是糊弄人的啊?关于染色体检查的问题46, XY, del(6)(p24)
bash命令急!羊水穿刺microarray 发现性染色体多了一点点,怎么办?
请教Nature上一篇关于pValue的短文real data and shuffle data
请教大家一个统计问题,多谢!p< 0.05 与 p< 0.01
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