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Biology版 - How to test if a nuclear protein is a DNA binding protein?
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F*K
发帖数: 608
1
Thanks for your advice
o**d
发帖数: 3080
2
如果你知道这个蛋白可能结合到DNA上的序列,可以做EMSA。
F*K
发帖数: 608
3
At this stage I want to know if it binds to DNA.

【在 o**d 的大作中提到】
: 如果你知道这个蛋白可能结合到DNA上的序列,可以做EMSA。
c********r
发帖数: 189
4
1) FRAP to see the protein's mobility in nucleus.
2) cell fractionation to see if the protein only in DNA binding fraction
v*********d
发帖数: 382
5
EMSA 就是用来干这个的,当然只是in vitro
可以参考这个:
http://tools.invitrogen.com/content/sfs/manuals/mp33075.pdf
in vivo 很难证明是direct binding,要是你有目的序列,可以ChIP

【在 F*K 的大作中提到】
: At this stage I want to know if it binds to DNA.
l**********1
发帖数: 5204
6
plus if your nuclaer protein is Proline-Rich Homeodomain protein (PRH)
you can try oligomeric assembly
Please go to 2010 one paper:
//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20675722

【在 v*********d 的大作中提到】
: EMSA 就是用来干这个的,当然只是in vitro
: 可以参考这个:
: http://tools.invitrogen.com/content/sfs/manuals/mp33075.pdf
: in vivo 很难证明是direct binding,要是你有目的序列,可以ChIP

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