c**********r
发帖数: 2372 | 1 我手里有个基因芯片的结果，我想用全部数据做个GO分析
那些免费软件像GenMaPP啊，Pathwayminer啊，总是认不出我的基因ID
分析数据半小时，搞格式……很久……昨天刚搞了一天数据格式，还是没办法
我用的是Agilent家的芯片，他家给出来的结果是这样子的，见附件1
sequence ID 和sequence code好像是他家自有的系统，那些GO分析软件不识别
raw data里倒是有NM开头的可识别ID，见第二个附件。不过一个一个比对粘贴太苦逼了
，coding我又不会。
版上有谁处理过他家数据的么，求指教啊 |
N******n
发帖数: 3003 | |
c**********r
发帖数: 2372 | |
d******u
发帖数: 178 | 4 Primary Sequence Name里面是Gene Symbol和Accession ID混合的，应该能找到可以识
别的GO analysis。 |
t*d
发帖数: 1290 | 5 用 RefSeq ID。
【在 c**********r 的大作中提到】
: 我手里有个基因芯片的结果，我想用全部数据做个GO分析
: 那些免费软件像GenMaPP啊，Pathwayminer啊，总是认不出我的基因ID
: 分析数据半小时，搞格式……很久……昨天刚搞了一天数据格式，还是没办法
: 我用的是Agilent家的芯片，他家给出来的结果是这样子的，见附件1
: sequence ID 和sequence code好像是他家自有的系统，那些GO分析软件不识别
: raw data里倒是有NM开头的可识别ID，见第二个附件。不过一个一个比对粘贴太苦逼了
: ，coding我又不会。
: 版上有谁处理过他家数据的么，求指教啊
|
g******g
发帖数: 14 | |
j*p
发帖数: 411 | |
y*******o
发帖数: 236 | 8 你excel里vlookup一下不就能把gene symbol都给对上了，然后用gene symbol分析啊
【在 c**********r 的大作中提到】
: 我手里有个基因芯片的结果，我想用全部数据做个GO分析
: 那些免费软件像GenMaPP啊，Pathwayminer啊，总是认不出我的基因ID
: 分析数据半小时，搞格式……很久……昨天刚搞了一天数据格式，还是没办法
: 我用的是Agilent家的芯片，他家给出来的结果是这样子的，见附件1
: sequence ID 和sequence code好像是他家自有的系统，那些GO分析软件不识别
: raw data里倒是有NM开头的可识别ID，见第二个附件。不过一个一个比对粘贴太苦逼了
: ，coding我又不会。
: 版上有谁处理过他家数据的么，求指教啊
|
c**********r
发帖数: 2372 | 9 王道
刚用vlookup处理的
不过还是不会在不同文件里查找，粘出来放到一个文件里弄的
【在 y*******o 的大作中提到】
: 你excel里vlookup一下不就能把gene symbol都给对上了，然后用gene symbol分析啊
|
n******7
发帖数: 12463 | 10 就是个mapping id的问题
看来excel还是挺不错的
【在 c**********r 的大作中提到】
: 王道
: 刚用vlookup处理的
: 不过还是不会在不同文件里查找，粘出来放到一个文件里弄的
|
l*****a
发帖数: 1431 | |
