promoter region 寻找 - Biology版

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Biology版 - promoter region 寻找

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话题: region话题: binding话题: promoter话题: regulater

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m******5
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正在比较同一个转录因子在不同种里面的upstream region的序列的同源区，试图找到
potential regulater/enhancer binding region
想请教一下，这种比较一般用哪种算法最好呢？
另外，因为transcriptional regulater，比如transcriptional factor可能binding任
何地方，那么，0,-1应该怎么定义呢？是第一个ATG前，或者设法找potential
polymerase binding site定义为0,-1?

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