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全部话题 - 话题: 寡核苷酸
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t******e
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1
也想请大家帮帮忙,给推荐一下审稿的机会。
关键词是: phosphoramidite 的合成, 寡核苷酸/修饰寡核苷酸的合成 (液相,固相
),纯化 (small scale, large scale),鉴定,结构及杂质分析 (UPLC, HPLC,
MALDI, LC-MS, UV, CD...),荧光探针,quadruplex的形成/分析/生物应用,树状分子
设计。
及oligonucleotide cholesterol conjugates, oligonucleotide peptide conjugates
, triphosphate oligonucleotide的合成。
请大牛们帮帮忙推荐一下!有可能的话,请站内联系。
谢谢!
a********0
发帖数: 206
2
洗洗睡吧,主观意识上不想当小白鼠,但事实上已经是了。
转基因食物到底怎么样,外行人基本都是瞎嚷嚷,跟白痴一样。什么转基因食物跟老鼠
减少,猪流产这些现象扯一起的人,没一点科学素养,排除了重金属污染这个因素再唬
吧。如果造成这些哺乳动物流产,痴呆,人类一样,很多科研都是在哺乳类动物身上完
成的。难道山西自然流产率急剧升高了?痴呆新生儿变多了?...没有任何直接证据的
情况下,别JB瞎扯了,太丢人现眼了,说这种话的人感觉是跟土鳖似的。
随火箭上天的种子,经过辐射有变异,结出来的果实都巨大无比,也没见得你们嚷嚷那
么凶,反而还觉得这是科技的力量,但细想下,这些经过辐射的种子,基因如何变异,
到底发生了什么?这个跟转基因食物,对我而言本质上没区别。
行内大牛也说不清道不明,基因还没完全整明白,更不清楚后面蛋白折叠修饰,这系列
的生化过程。讲蛋白核酸最后都分解成多肽或者寡核苷酸,所以无害的,也过分简单了
。这些蛋白核酸在人体类最后被降解成什么样的多肽,什么样的寡核苷酸,对细胞毒性
是什么样的影响,具体怎么样,不知道,这个行业才发展十几二十年,这些方面的研究
少之又少。最近法国的研究项目漏洞百出,... 阅读全帖
t******e
发帖数: 196
3
来自主题: Immigration版 - 也请大家帮忙--推荐审稿机会
也想请大家帮帮忙,给推荐一下审稿的机会。
关键词是: phosphoramidite 的合成, 寡核苷酸/修饰寡核苷酸的合成 (液相,固相
),纯化 (small scale, large scale),鉴定,结构及杂质分析 (UPLC, HPLC,
MALDI, LC-MS, UV, CD...),荧光探针,quadruplex的形成/分析/生物应用,树状分子
设计。
及oligonucleotide cholesterol conjugates, oligonucleotide peptide conjugates
, triphosphate oligonucleotide的合成。
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包子答谢!
n*********b
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4
来自主题: Biology版 - arc-520: 治愈乙肝的新药?
以前有一种曾经非常牛叉治疗方法叫反义寡核苷酸基因治疗。现在没人提了,就好像没
有发生过一样。RNAi和反义寡核苷酸又有多大的差别?
n*********b
发帖数: 140
5
来自主题: Biology版 - arc-520: 治愈乙肝的新药?
以前有一种曾经非常牛叉治疗方法叫反义寡核苷酸基因治疗。现在没人提了,就好像没
有发生过一样。RNAi和反义寡核苷酸又有多大的差别?
g*********d
发帖数: 233
6
目前表观遗传学(Epigenetics)通常被定义为基因表达通过有丝分裂或减数分裂发生了
可遗传的改变, 而DNA 序列不发生改变[1, 2]。表观遗传学的机
制主要包括DNA 甲基化、组蛋白修饰及非编码RNA。DNA 甲基化(DNA methylation)是指
在DNA甲基转移酶(DNA-methyltransferases, DNMTs)的催化下, CpG 二核苷酸中的胞嘧
啶被选择性地添加甲基, 形成5-甲基胞嘧啶[3, 4]。DNA 甲基转移酶有两种, 其中
DNMT1 主要起维持甲基化的作用, 能使半甲基化的DNA 双链分子上与甲基胞嘧啶相对应
的胞嘧啶甲基化, 可参与DNA 复制双链中新合成链的甲基化[5]; 而DNMT3a 和DNMT3b
主要起形成甲基化的作用, 能在未发生甲基化的DNA 双链上进
行甲基化[6]。DNA 甲基化一般与基因的沉默相关,DNA 去甲基化则与基因的活化相关[7
~9]。
组蛋白修饰(Histone modifications) 是指组蛋白的基础氨基末端尾部突出于核小体,
常在转录后发生变化, 包括甲基化、乙酰化、磷酸化和泛素化等翻译后的修饰... 阅读全帖
j*****9
发帖数: 716
7
来自主题: Biology版 - 由百家姓联想到的
这些位点比SNP大,是微卫星标记(microsatellite),简单说起来就是在基因组中含
有大量“二核苷酸、寡核苷酸”重复,重复次数(重复次数多则片段长)在个体间呈高
度变异性

按孟德尔遗传规律遗传:通过大量的家系调查证明,子代DNA 中所有等位核子基因
带都可以在双亲的DNA中找到,片段的传递符合孟德尔遗传规律。
/////////////////////////
上面是我找到的最详细的亲自鉴定的介绍。
文中提到的十几至几十个DNA位点是不是就是SNP啊?
x*****7
发帖数: 7326
8
来自主题: Military版 - 其实变异也没有什么关系
如果以后因为污染,地球人的DNA变异太大,也不要紧,要生孩子的时候找Human
Genome Project
里面的正确数据对比一下,在实验室里纠正过来就是了。
我1997年以前做定点突变的时候好像用的是寡核苷酸引物。我很多年不做分子生物学了
,现在要改孩子
的基因是用同源重组吧?
f***y
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9
中国每年数十种一类新药临床试验。印度比起中国如何?
http://www.pharmcube.com/news/article/3354
这几天,大家都在讨论《我不是药神》这部电影。影片中“格列宁”的原型即诺华的格
列卫(甲磺酸伊马替尼片)。这款药物最初以孤儿药”获批,而后逼近50亿美元的年销
售峰值使其成为超级重磅炸弹药物,可谓是医药工业界“野百合也有春天”的完美阐释
。在美国,一个新药一旦获得FDA孤儿药身份,将享有税收减免、免申请费、研发资助
、加快审批以及上市后7年的市场独占权,甚至还可能获得一张宝贵的优先审评券。因
此从新药研发的角度看,以孤儿药身份进入市场,享受市场独占期后再拓展适应症,不
失为一种“以奇致胜”的临床开发战略。鉴于被FDA批准的药物相对比较容易被其他市
场认可,因此对于国内创新药有研发企业,若选对了适应症,通过申报FDA“孤儿药资
格认定”,采取中美双报的开发策略,更是抢占了国内注册的先机,实现“弯道超车”
。据不完全统计,已经有13款来自中国药企的新药拿到了17项FDA孤儿药资格认定。其
中百济神州的BTK抑制剂BGB-3111获得3项,正大天晴的安罗替尼... 阅读全帖
j*******e
发帖数: 23
10
来自主题: JobMarket版 - 深圳市瀚海基因招聘化学人才
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好久没来MITBBS了,我回国后和朋友创业,创办了一家初创企业,热情期待美国的兄弟
们回来和我们并肩,在中国开创一番事业。
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深圳市瀚海基因科技有限公司(简称:瀚海基因,英文:PacGeno),由美国斯坦福大
学和密歇根大学的博士留学生团队于2012年创立的生物科技公司,获得世界500强正威国
际集团和启迪创业投资管理(北京)有限公司旗下基金的投资,拥有一支生物/机械/电子
工程多学科背景的人才队伍。瀚海基因建立了高通量测序中心,拥有最新的illumina
MiSeq高通量测序仪,为广大科研工作者提供各种类型的测序服务和高级生物信息学分
析服务。公司的核心业务为开发基于二代测序的临床诊疗技术和开发新一代测序仪。瀚
海基因期待有志之士成为我们的伙伴,携手创造和见证瀚海基因的成长和辉煌!
1. 高级工程师(化学)
职位描述
工作性质:全职 职位类别:研发工程师
1. 以显微成像为主要手段,进行单分子荧光高灵敏检测;
任职条件
学历:博士 工作经验:0年 性别:男性
1. 分析化学,表面化学,... 阅读全帖

发帖数: 1
11
全球生物试剂定制化服务领域的领导者之一。公司成立于2002年,现已跻身于全球化的
跨国公司行列。总部位于中国南京,目前在南京和美国新泽西州设有研发、生产和运营
中心,在镇江和济南有生产基地,并在欧洲成立了传奇爱尔兰研发中心和荷兰物流中心
,在日本亦有全资子公司。公司利用在酶工程领域积累的技术和研发优势,在上海新建
了生物催化研究院。这一系列资源,是集团为全球100多个国家与地区的20余万客户提
供优质和便捷服务的坚实基础。
目前公司2600多名员工中,有超过800人拥有硕士和博士以上的学位,在研发和商务团
队中这个比例更是占90%以上。公司业务领域涵盖基因合成、寡核苷酸合成、蛋白生产
、多肽合成、抗体开发、临床前药物研发、免疫精准治疗等广泛的生命科学研究及应用
服务领域,生物试剂产品和仪器等目录产品业务,以及工业酶制剂和微生物制剂等工业
应用领域。
工作地点:南京,中国
招募职位:
1. Project Manager/ Senior Project Manager
Role Description:
We are looking for an experienced Project ... 阅读全帖
n****3
发帖数: 543
12
我有一个想法可以极大改进寡核苷酸引物overlap延伸合成基因的特异性,适合一次合
成大的基因。但自己买引物合成可能会成本很高,到头来反而没有价格优势。如何买到
最便宜的引物?或者自己买二手合成仪器来合成引物的投入会很高吗?
非常感谢
s*****e
发帖数: 18
13
来自主题: Biology版 - [转载] 生物芯片概述
【 以下文字转载自 Science 讨论区 】
【 原文由 science 所发表 】
生物芯片概述
一个廉价、稳定的象计算机那样,可以对生命科学与医学中的成千上万的生物化学反应过
程进行集成并执行的芯片,成为人们梦寐以求的东西。因为这些芯片能替代重复而烦琐的
实验室工作,并做到微型化,微流控制,相对传统实验而言能提供精确灵敏的检测方法,
极低的花费,和占用很小的空间,从而实现对DNA、RNA、多肽、蛋白质以及其它生物成分
进行高效快捷的测试和分析。而这一切已经由梦成为现实.
简单的说芯片技术是通过微加
工工艺同时将大量的探针分子固定到固相支持物上后与标记的样品分子进行杂交,通过检
测每个探针分子的杂交信号强度进而获取样品分子的数量和序列信息并进行高效的解读和
分析。目前最成功且形成一定商业市场的是DNA芯片,即将无数预先设计好的寡核苷酸或c
DNA在芯片上做成点阵,与样品中同源核酸分子杂交。理论上允许几乎所有种类的生物分子
作芯片上的探针,比如蛋白、糖、脂类和其它小分子。这种技术的特点是微量化、大规模
、并行化和高度自动化处理感兴趣的生物样品,精细地研究组织细胞基因表达情况,了解
s******y
发帖数: 28562
14
来自主题: Biology版 - PCR 技术发明的背后
转贴来源于:
http://www.genechina.com/news.php?id=577
http://www.sciencenet.cn/m/user_content.aspx?id=29704
核酸体外扩增最早的设想
本世纪60年代末、70年代初人们致力于研究基因的体外分离技术,1971年,Khorana及
其同事提出:“经过DNA变性,与合适引物杂交,用DNA聚合酶延伸引物,并不断重复该
过程便可克隆tRNA基因。”但由于当时很难进行测序和合成寡核苷酸引物,且当时(
1970年)Smith等发现了DNA限制性内切酶,使体外克隆基因成为可能,所以,使Khorana
等的早期设想被人们遗忘。
聚合酶链反应的发明
直到1985年,美国PE-Cetus公司的人类遗传研究室Mullis等人才发明了具有划时代意义
的聚合酶链反应(Polymerase Chain Reaction, PCR),使人们梦寐以求的体外无限扩增
核酸片段的愿望成为现实。1993年,Mullis等人因发明PCR而获得了诺贝尔化学奖。
PCR背后的故事
其实PCR技术诞生的背后还有一段故事。PCR的发明人,一般公
m******i
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15
来自主题: NanoST版 - 第一章 原理zz
生物芯片及应用简介
生物芯片技术
《科学》:生物芯片与基因发现
抗体芯片:新一代的蛋白分析手段
生物芯片:本世纪最大的产业
生物芯片及应用简介
一、简介
生物芯片(biochip)是指采用光导原位合成或微量点样等方法,将大量生物大分
子比如核酸片段、多肽分子甚至组织切片、细胞等等生物样品有序地固化于支持物(如
玻片、硅片、聚丙烯酰胺凝胶、尼龙膜等载体)的表面,组成密集二维分子排列,然后
与已标记的待测生物样品中靶分子杂交,通过特定的仪器比如激光共聚焦扫描或电荷偶
联摄影像机(CCD)对杂交信号的强度进行快速、并行、高效地检测分析,从而判断样
品中靶分子的数量。由于常用玻片/硅片作为固相支持物,且在制备过程模拟计算机芯
片的制备技术,所以称之为生物芯片技术。根据芯片上的固定的探针不同,生物芯片包
括基因芯片、蛋白质芯片、细胞芯片、组织芯片,另外根据原理还有元件型微阵列芯片
、通道型微阵列芯片、生物传感芯片等新型生物芯片。如果芯片上固定的是肽或蛋白,
则称为肽芯片或蛋白芯片;如果芯片上固定的分子是寡核苷酸探针或DNA,就是DNA芯片
。由于基因芯片(Genechip)这一专有名词已经被业界
s*****e
发帖数: 18
16
来自主题: Science版 - 生物芯片概述
生物芯片概述
一个廉价、稳定的象计算机那样,可以对生命科学与医学中的成千上万的生物化学反应过
程进行集成并执行的芯片,成为人们梦寐以求的东西。因为这些芯片能替代重复而烦琐的
实验室工作,并做到微型化,微流控制,相对传统实验而言能提供精确灵敏的检测方法,
极低的花费,和占用很小的空间,从而实现对DNA、RNA、多肽、蛋白质以及其它生物成分
进行高效快捷的测试和分析。而这一切已经由梦成为现实.
简单的说芯片技术是通过微加
工工艺同时将大量的探针分子固定到固相支持物上后与标记的样品分子进行杂交,通过检
测每个探针分子的杂交信号强度进而获取样品分子的数量和序列信息并进行高效的解读和
分析。目前最成功且形成一定商业市场的是DNA芯片,即将无数预先设计好的寡核苷酸或c
DNA在芯片上做成点阵,与样品中同源核酸分子杂交。理论上允许几乎所有种类的生物分子
作芯片上的探针,比如蛋白、糖、脂类和其它小分子。这种技术的特点是微量化、大规模
、并行化和高度自动化处理感兴趣的生物样品,精细地研究组织细胞基因表达情况,了解
各种状态下分子结构变异和分子病理过程.并且解决了传统核酸印迹杂交技术操作繁杂、
自动化程度
s*****e
发帖数: 18
17
来自主题: Science版 - 生物芯片的应用
生物芯片的应用

美国科学促进会将基因芯片技术列为 1998 年度自然科学领域十大进展之一,足见其在科
学史上的意义。现在,基因芯片这一时代的宠儿已被应用到生物科学众多的领域之中。它
以其可同时、快速、准确地分析数以千计基因组信息的本领而显示出了巨大的威力。目前
在文献上可查到的生物芯片的应用有基因表达谱、HLA分型、SNP分析、丙型肝炎分型、物
种鉴定、DNA测序、连锁不平衡作图、HIV-1诊断、BRCA1突变分析、炎症分析、线粒体基因
组分析、囊性纤维检测、地中海贫血症突变检测、寡核苷酸间相互作用研究,等等。在基
因表达检测的研究上人们已比较成功地对多种生物包括拟南芥、酵母及人的基因组表达情
况进行了研究,并且用该技术(共 157,112 个探针分子)一次性检测了酵母几种不同株间
数千个基因表达谱的差异。实践证明基因芯片技术也可用于核酸突变的检测及基因组多态
性的分析,例如对人 BRCA Ⅰ基因外显子 11、 CFTR 基因、β-地中海贫血、酵母突变菌
株间、HIV-1 逆转录酶及蛋白酶基因(与 Sanger 测序结果一致性达到 98%)等的突变检
测,对人类基因组单核苷酸多态性
f***y
发帖数: 4447
18
http://news.nju.edu.cn/show_article_2_37651
一个偶然的机会,张辰宇将目光瞄准了当时刚刚引起学术界关注的一种小分子核酸物质
——微小核糖核酸(MicroRNA)。并在南京大学生命科学院组建了一支被称作M3的研究
团队,该团队由生命科学、分子生物学、植物生物学、生物信息学、医学、化学等多学
科研究者组成。
在“泡了”三天三夜实验室后,陈熹和导师张辰宇的研究团队,得出了一个突破传统生
物学常识、震惊学术界、国际首发的实验结论,即MicroRNA在人和动物的血清/血浆中
可长期稳定存在。
本报记者王世玲南京报道
未拆包的搬家行李、满屋书籍、屋中间放置着一个脚踏健身器……2014年年底冬日的一
个周日下午,32岁的陈熹正在刚搬入的新办公室里用电脑敲打着最新的科研论文。即便
是周末,跟陈熹办公室同楼层的南京大学仙林校区的生命科学学院实验室内,一群国内
外研究生们仍在紧张地做着实验。
作为南京大学生命科学院最年轻的博士生导师,7年前,当陈熹还是南大博士时,他被
导师张辰宇“逼着”去做一个略显疯狂的生物学想法的实验:去检测人的血清中是否含
有微小核糖核酸(m... 阅读全帖
r****o
发帖数: 105
19
本文献给YL
(十五)AP1的活性测定
   第二个模块的实验,DNA affinity chromatography之后我们又跑了一个更精细的
Gel filtration,用的是Amersham卖的Superose 6预装柱子。纯化步骤就只有这么多了。
剩下的就是一些活性测定。无论是sephacryl分出来的组分还是DNA affinity column分出
来的组分,我们都测试了AP-1的活性。方法呢就只有两种,一种是凝胶迁移率变动分析
(EMSA),另一种是DNA水解酶I 足迹分析 (DNase I footprinting assay),都可以用来分析
蛋白与特定DNA的结合能力。我过去没做过这两种实验,所以感觉很新奇,做的也格外卖
力,结果也还不错。
Gel Mobility-shift assay 原理很简单,把蛋白质样品和P32标记的寡聚核苷酸探针
一起孵育十几分钟, 然后拿去跑一个低浓度acrylamide胶。如果探针结合上蛋白了,速度
会变慢很多,就会停滞在胶的上段;如果没有结合上,探针就会自由的跑到胶的下段去。
然后把胶拿去做放射自显影就行了。跑胶的装置
w******n
发帖数: 767
20
拿到基因,知道磷酸化24碱基寡聚核苷酸,后面还需要别人告诉怎么做?
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