h*********9
发帖数: 35 | 1 UCA1 functions as a competing endogenous RNA to suppress epithelial ovarian
cancer metastasis
tumor biology 据掉审稿的时候可以推荐审稿人，有兴趣的把email和主页发给我。 |
|
v*****z
发帖数: 3067 | 2 in sunnyvale, mountain view, cupertino area.
My cat sick for a while,(whole day not eat and drank)
today find out he got intestinal tumor.
need surgery.
thanks |
|
d****t
发帖数: 26 | 3 The following is from
http://www.nidcr.nih.gov/news/inside%5Fscoop%5Fcancer%5Frsch.asp
CANCER RESEARCH: KILLING TUMOR CELLS WITH ANTHRAX-BASED IMMUNOTOXIN
As the news broke last fall of anthrax-tainted letters, some reporters
eventually spun the story in a completely different direction. They
highlighted early research studies in which scientists use modified anthrax
proteins to fight human disease. Among the work mentioned prominently has been
studies at NIDCR to produce a recombinant immunotox |
|
t*d
发帖数: 1290 | 4 Oncomine 还不全？没后更全的了。买他们的帐号吧。
Oncomine 4.3 Release Features
DNA COPY NUMBER DATA SEGMENTATION: Genomic segments of amplification and
deletion are mapped and reported at the gene level.
New DNA datasets: Amplification and deletion results across 3,490 cell lines
and tumors |
|
m*****s
发帖数: 2227 | 5 有什么好的 antibody可以stain mouse fibroblast in the tumor?
试了 Fibroblast Marker (ER-TR7), 特异性不好
Thanks |
|
l******u
发帖数: 936 | 6 Duke 的 Darell D. Bigner
Sloan 的 Eric C. Holland
西南的 Luis F. Parada
UCSF 的adult neuron stem cell 大牛 Arturo Alvarez-Buylla, 也做brain tumor的
干细胞机理.
现在 IDH1 是这个领域最热, 北卡的熊岳也做了一些小有影响的工作. |
|
c****l
发帖数: 1086 | 7 brain tumor有几十种，你不说那种类型，怎么确定谁是大牛。
当然最常研究的是glioma特别是GBM，pediatric的medulloblastoma etc |
|
l******u
发帖数: 936 | 8 那个文章争议是挺大的, 业内很多人不信他的结果. Metabolic 这个古老的话题,
近些年在cancer里越来越火了. IDH1 的clinical outcome 太强了, 最近一两年
跟进的人很多, 还算是很热的.
BTW, 我不是做brain tumor的.
最强有力
的genetic evidance。
Cancer-
associated IDH1 mutations produce 2-hydroxyglutarate”发现后。 |
|
|
m****r
发帖数: 383 | 9 大牛就是大牛，无论他/她做哪一种类型的brain tumor吧。就好像问做mouse model的
牛，tyler jacks算一个吧，虽然细说起来，他着重于lung cancer mouse model.
我们实验室不做这个，只是我自己想泛泛了解一下，不拘泥于什么类型的。 |
|
a****d
发帖数: 1919 | 10 That's amazing! curious if other types of tumor will do same thing... |
|
C*****h
发帖数: 926 | 11 These findings are wrong.
We examined more than a thousand different GBM slides (stained with all
kinds of important proteins such as PTEN, p53 etc), and found that the
vascularized regions are completely different from the solid tumor regions.
The so-called GBM stem cells are just a piece of crap. |
|
r***e
发帖数: 2539 | 12 能展开说说嘛？
你们检测了人的GBM，没有发现血管内皮上有tumor marker？
这个提示即使有肿瘤来源的内皮细胞，比例也很低？在1000多个样品中没有找到？
谢谢！
. |
|
w******e
发帖数: 1187 | 13 你对，我英语单词没学好呵呵。好吧，我对tan组的敬仰又进了一步。。。
btw，1-2cm的tumor size你觉得正常吗？
imaging
这个体外应用感觉倒不难做。 |
|
h*****o
发帖数: 342 | 14 好像蛮巨大的，对小鼠来说
不过他们的imaging本来也没有要找出tumor的边界在哪
就是告诉你说他们的probe对肿瘤是特异的 |
|
w******e
发帖数: 1187 | 15 my point is, w/ a tumor that big, wouldn't there be a lot of necrosis/
lesions going on, which greatly facilitate the tissue penetration, which
is THE problem when it comes to in vivo application? |
|
y****6
发帖数: 196 | 16 Optical imaging with NIR fluorephore is good for mouse imaging, especially
xenograft tumors. For human application, most likely it will be used in
optical guided surgery. |
|
y****6
发帖数: 196 | 17 In many applications (mouse), NIR optical imaging can substitute PET. Eva M.
Sevick's group labeled Transtuzumab with both NIR dye and PET (or SPECT?)
agent for mouse tumor imaging. They conclude that NIR optical imaging
overperformed PET (or SPECT?) in many aspects. Cannot remember the details.
You can find their recent publciations if interested. |
|
j***z
发帖数: 105 | 18 LZ already had significant data regarding tumor suppressor activity of the
protein - "干掉我的这个老鼠基因能促进癌基因诱导的皮肤癌，我现在已有足够的老
鼠数据下这个结论."
It takes a long time to find collaboration and prepare the paperwork to
acquire patient samples. For CNS paper in oncology, most have some patient
data to support the clinical significance. |
|
h********n
发帖数: 4079 | 19 actually it is not difficult to find a collaborator with tumor tissue bank,
such as state cancer registry |
|
h********n
发帖数: 4079 | 20 actually my point is that you can find collaborator with eatablished tumor
bank. You don't want to look for "fresh" clinical sample, which is hard. |
|
a***u
发帖数: 155 | 21 去到一个新的实验室，他们在CGH测序时发现某染色体缺失跟胰腺癌的病程有关，由此
推测此染色体上某一基因是肿瘤抑制
基因，由我接手研究此基因的功能，所采用的策略就是过表达此基因看phenotype. 我
做了大半年了，很郁闷，我试了很多种
细胞，只有一种转入该基因抑制生长。我也试了很多种方法，改变 microenviroment
看能否 push出 phenotype，但还是
没效果。我以前不是做 cancer的，我注意到文献中很多关于 tumor suppressor 都是
直接上 knock out 小鼠的，好象很少
有 overexpression来研究的。但我的二老板就是认为是我本身的原因做不出来，对我
很有意见。有做 cancer的同学能给点
建议吗？ |
|
a***u
发帖数: 155 | 22 謝謝sunnyday 的建議。
其實我已經在準備走人了。只是覺得這個project花了很大勁做成這樣，心裡不大爽，
还想再試一把，另外也覺得如果能出點東西再走不致於讓老板很生氣。
本來想來這個實驗室學點 cancer stem cell 的東西，希望以後回國能用來忽悠人。結
果比較失望。
我其實每天都在努力看很多paper, 然後跟老板們討論。悲哀的是他們根本不看paper，
並且沒有經驗， 沒辦法討論。 我以前的老板非常聰明，新老板，接觸的東西新而多，
我只要跟他一提，他馬上就明白， 我現在這個大老板，我有一次看到cell 上一篇
paper 很有啓發，很興奮地跟他們討論，大老板聽了半天，甚麼也沒明白（他連
transfection 是啥也不大明白）， 最後还發了一通脾氣說我英語不好。
我跟我以前的老板在科研思維上可能比較接近，所以總能達成共識，效率很高，以前的
几年基本一年一篇不錯的paper。但現在這個二老板的，我覺得他的建議我總是覺得很
別扭，但不做又不行，所以就不想聴他的建議了。比如說他覺得這個基因在肺癌細胞表
達也很低，肯定也應該是肺癌的tumor suppressor 基... 阅读全帖 |
|
o**i
发帖数: 1165 | 23 想要看solid tumor 里面血液细胞的多少
老板让我去看看有没有可能拿flow用的cd45的抗体去然IHC或者IF
我手上的抗体都没说能在IHC上work
请问大家有人做过类似的试验么? |
|
o**d
发帖数: 3080 | 24 如果你真想做tumor immunology，并且和临床相关的，建议你是去申请MD或MD／PHD
program， 这样你以后会有很多PHD没有的资源和优势。 |
|
z*t
发帖数: 863 | 25 he's moving to methodist, but bcm has losts of labs are doing immunotherapy
for tumor.So it would be a good choice if he want to do some applied/
translational research.
UCSD is also highly recommended |
|
h*****n
发帖数: 263 | 26 最近找了一个CRO 做 Tumor cell line radiation sensitivity study.
文献上说10Gy single dose, about 100% cell death.
同样的cell line，CRO 做了 upto 50Gy/dose, 1 dose/day. After 3 days, the
cells are still fine. 这是不是太违法常理了？ 我强烈怀疑他们机器坏了。请有经
验的同行指点。 |
|
m********m
发帖数: 263 | 27 现有从老鼠身上取出的tumor，如何用beta-gal染色以检测senescence？需要切片吗？
谢谢！ |
|
|
y****y
发帖数: 123 | 29 光做IHC不行吧
至少要用EGFP标好tumor然后confocal才可以吧 |
|
|
s*******y
发帖数: 136 | 31 哪位讲讲 inflammatory cell 和 tumor cell中 glucose-6 phosphatase的比较？
这个版上的大牛很多，肯定有人懂的。 |
|
e******e
发帖数: 45 | 32 因为实验需要，我们lab需要病人标本，但跟本校clinical faculty 合作进度太慢，老
板等不及了，让我找找能不能买一些肿瘤病人的tumor sample来做。本人新人，对此一
无所知。想问一下大家有没有推荐的公司呢？非常感谢！ |
|
s**e
发帖数: 1523 | 33 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24798974
Tumour Biol. 2014 Aug;35(8):7369-82. doi: 10.1007/s13277-014-2006-x. Epub
2014 May 6.
Tumor protein D52 (TPD52) and cancer-oncogene understudy or understudied
oncogene?
Byrne JA1, Frost S, Chen Y, Bright RK.
谢谢各位大侠！ |
|
c**********n
发帖数: 177 | 34 How about kai wucherpfennig lab? He is not a tumor immunologist at first
place but he is transferring his lab into the feild. |
|
s******s
发帖数: 13035 | 35 你的理解是错误的。你要找什么data，我也许可以帮到你。
只有raw sequence BAM和FASTQ在CGHub, 其他所有的都在TCGA DCC.
DCC有两个入口，controlled里面是所有有序列的data, 包括genotyping,
variant，和一些pcr sequencing。如果是mutation (tumor - normal), CNA
这些，全部都是open access.
CNA主要是AFFY SNP6的，也有一些其他的平台，包括low coverage WGS,
这些都是open access。问题是TCGA号称 no platform left behind, 所以方法
虽然多，但是并不是所有的disease都有所有的data type.
TCGA的data我一般在三个地方找，DCC是一处，或者用TCGA Assembler
拉，另外常见的open data可以去firebrowse.org下载。firebrowse的好处是
QC有问题的data都扔掉了，然后都combine成matrix form。你要自己找DCC
的data，必须去TCGA ... 阅读全帖 |
|
n******7
发帖数: 12463 | 36 谢谢详细解答，有些是我知道的，有些细节我确实不清楚
我之前就发现TCGA的CNA主要都是array平台来的，而且很多信息不是很清楚（比如有个
cnv/nocnv的注释，去年ACCR我问了TCGA的人，也没完全说明白）
我用TCGA的data matrix 入口download过所有的lv3 data和部分lv2 data
他们那个bulk download没搞清楚怎么用...
TCGA Assembler和firebrowse都没用过，annotation database也是第一次听说
TCGA把这么重要的东西藏这么深也太挫了，我现在文章都写好了。。
我决定先投了，reviewer让QC再QC吧，结果应该只会更好
我们需要WGS data, 在TCGA dcc 只有WES的data，WGS都在cgHub
但是我们不想自己从bam开始处理，想直接拿SNV/SV的calling，这个ICGC可以提供，所
以我们需要access
昨天我想要一个很简单的统计，比如每个cancer sample，整个genome上%多少的region
是double deletion, single dele... 阅读全帖 |
|
i*e
发帖数: 352 | 37 nocnv记得是tumor cnv去除germline cnv
难道我记错了？ |
|
s******s
发帖数: 13035 | 38 那片ABSOLUTE的文章里面应该有purify, 卵巢癌应该非常纯，肺癌啥的很烂。
很多信息都在idf里面, 或者tcga的wiki，另外，这个目录你是怎么也不知道的啊，哈哈
https://tcga-data.nci.nih.gov/docs/，因为哪里都没链接，我喜欢乱翻网站。
至于八卦么，多和TCGA DCC (NCI), BCR (Nationwidechildren), GDAC (Broad) 的人
聊聊天就知道了，嘿嘿嘿嘿嘿嘿嘿。
tumor
purity |
|
|
s******n
发帖数: 175 | 40 请问谁用过PAM50给mouse breast tumor分型? 有没有那50个基因的RT-PCR primer
sequences可以提供？谢谢。 |
|
发帖数: 1 | 41 第一次发帖，尝试在这边求一下审稿机会。。万分感谢！
具体方向是：
cancer therapy
cancer metabolism
mitochondrial disease
tumor microenvironment
exosome
microvesicle
ectosome
有意者可站内~ |
|
r******l
发帖数: 81 | 42 国内的亲人得了carcinoid tumor, 直肠是病源，现已做了手术切除。肝上面有多发的
小转移病灶。
国内医生不建议化疗，因为这种肿瘤对化疗不敏感。
家人一直在四处寻医，但问了几个医生，得到的答案都不一样，因为临床病例少，医生
缺乏治疗经验，基本是不知道下一步怎么治疗。
现在美国这面查到这种病情可以用药物（sandostain LAR，国内没有该药进口)控制，
加上一些积极的治疗手段。
专门打电话给carcinoid support group的人，被告知不少病人可以在治疗下控制很多
年。
因为很多美国的调查是自己在网上找的，或者道听途说，不是很确信。请问懂行的专家
，这病中美治疗是否差距很大？是不是应该到美国来求医？
Any related suggestion or information will be greatly appreciated!! |
|
t***m
发帖数: 96 | 43 下周有个interview @ a brain tumor center。届时， interview with a panel of
three, the Adm Director Of Neuro Science, the Director of Neuro Science and
the business manager。请问前辈们有何高见。谢！ |
|
j****i
发帖数: 496 | 44 Can you please recommend a good hospital/cancer center with experience for
presacral tumor resection with intraoperative radiation therapy? Need name
for surgeon and rad onc. Thank you so much!
★ 发自iPhone App: ChineseWeb 8.2.2 |
|
j*****7
发帖数: 4348 | 45 现在有一组solid tumor的数据, 我们想要从unconfirmed的response数据情况里面推导
出confirmed的response.
如果我们有一个连续出现uPR的系列, 如数据中的Visit 2到Visit 4, 如果任意相邻两
个的Date的差别大于等于28天的话, 这一个系列的confirmed response就都算作PR; 其
它unconfirmed response结果(SD, PD)出现的话, confirmed response也维持SD, PD.
原始数据:
ID Visit Date Unconfirmed_response
1001 1 12JAN2009 SD
1001 2 13MAR2009 uPR
1001 3 28MAR2009 uPR
1001 4 02MAY2009 uPR
1001 5 31MAY2009 SD
1001 6 02AUG2009 uPR
100... 阅读全帖 |
|
C*****D
发帖数: 1299 | 46 早改名了(exept in lung)。这应叫neuroendocrine carcinoma. 根据病理再分well
differentiated and poorly differentiated. 我们这儿tumor board 上,是尽量把肝
转移灶切掉, 不行就放疗. 化疗得悠着点.
Steve Job得了胰腺endocrine carcinoma,最后还得肝移植.
这病在美国也不常见,不到NCI DESIGNATED 中心治,治坏的可能更大一些. 不要太迷信
CLINICAL TRIAL. |
|
C*****D
发帖数: 1299 | 47 早改名了(exept in lung)。这应叫neuroendocrine carcinoma. 根据病理再分well
differentiated and poorly differentiated. 我们这儿tumor board 上,是尽量把肝
转移灶切掉, 不行就放疗. 化疗得悠着点.
Steve Job得了胰腺endocrine carcinoma,最后还得肝移植.
这病在美国也不常见,不到NCI DESIGNATED 中心治,治坏的可能更大一些. 不要太迷信
CLINICAL TRIAL. |
|
t***m
发帖数: 96 | 48 下周有个interview @ a brain tumor center。届时， interview with a panel of
three, the Adm Director Of Neuro Science, the Director of Neuro Science and
the business manager。请问前辈们有何高见。谢！ |
|
发帖数: 1 | 49 11 月13日 终于找到另一股在我家害我的势力
昨天，这些人折腾了一天，白天，晚上皮啦啦，也不知道谁把谁杀了，谁把谁带走了。
反正我先生和孩子被绑架了，就不知道是不是已经遇害了。我本来是打算睡觉的，但他
们头上，地下装电磁波攻击器，让我几乎窒息。虽然我没倒下，但其实他们在我身上扎
的毒针已经蔓延，我能感觉到我的呼吸有窒息的感觉。我想我对他们已经非常仁慈了，
但他们不依不饶地攻击我，欲置我于死地，让我非常生气，特别是肆意伤害我家里的人
，绑架我先生和孩子，而且有许许多多无辜的生命毁于他们之手，有必要把他们曝光。
当然我还没分析这里边是那几个人具体攻击我，伤害我的，但他们显然都是一伙的。鉴
于他们伤害我的头部，胸部 和胃部，我就把这几部分的医生都曝光，受害者慢慢去调
查，追查他们吧。
Cleveland Clinic, Website: my.clevelandclinic.org
Call 855. REFER. 123 or 855.733.3712
Lung Cancer
Results: 57 Doctors
PREV123NEXT
Results per page:
Dav... 阅读全帖 |
|
v**********m
发帖数: 5516 | 50 楼上文章的comments
Not yet but stay tuned. But a definite fact and you can review it in the FDA
's analysis in the briefing document is that there was no SS of astrocytomas
in male rats or female rats.
Dr. Alavi had concerns about how Arena calculated the exposure margin for
Lorcaserin, that is why it appeared in the CRL. When Arena met directly with
the FDA on December 15th and 16th at the FDA, both Arena and the FDA agreed
on the CSF methodology and the number of participants that would be
acceptab... 阅读全帖 |
|
