f***a
发帖数: 329 | 1 好的，初步总结下。
如下libaries挺好用的，而且都可以在ubuntu synaptic pckg manager上直接安装。
lapack, blas, atlas：基本的，优化运算；
GSL：强大全面，不过我就用了下random number generator 和 distribution pdf;
armadillo: 矩阵运算很好用。
其他还有个搞了半天没运行成功：
newran: 。。。
codecogs: 要钱，靠 |
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d**o
发帖数: 618 | 4 我说了，clone说明不了任何问题。其中一个原因就是clone的脑synaptic connections
是出生后重新建立的，根本不是原来的复制品。
我打赌如果脑的细胞级的解剖结构可以准确复制的话，意识一定可以。不过我们谁输谁
赢有生之年肯定是看不到的了，LOL |
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d**o
发帖数: 618 | 5 我说了，clone说明不了任何问题。其中一个原因就是clone的脑synaptic connections
是出生后重新建立的，根本不是原来的复制品。
我打赌如果脑的细胞级的解剖结构可以准确复制的话，意识一定可以。不过我们谁输谁
赢有生之年肯定是看不到的了，LOL |
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f**d
发帖数: 768 | 6 这个领域的最新进展，一篇很好的REVIEW，刚刚发表出来的
作者D.Debanne最近发表了不少这个方向的REVIEW文章
http://physrev.physiology.org/content/91/2/555.full
Axon Physiology
Dominique Debanne, Emilie Campanac, Andrzej Bialowas, Edmond Carlier,
and Gisèle Alcaraz
Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale U.641 and
Université de la Méditerranée, Faculté de Médecine Secteur Nord,
Marseille, France
Next SectionAbstract
Axons are generally considered as reliable transmission cables in
which stable propagation occurs once an act... 阅读全帖 |
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k*****1
发帖数: 454 | 7 刚刚找到一篇文章， 两个电生理的专家 Lisman 和 Spruston 的， 有兴趣的话可以看
一下
Questions about STDP as a General Model of Synaptic Plasticity
John Lisman and Nelson Spruston
According to spike-timing-dependent plasticity (STDP), the timing of the Na+
spike relative to the EPSP determines whether LTP or LTD will occur. Here,
we review our reservations about STDP. Most investigations of this process
have been done under conditions in which the spike is evoked by postsynaptic
current injection. Under more realistic condition... 阅读全帖 |
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t******8
发帖数: 478 | 8 你是指在micro-circuitry的机制还是在synapse的机制方面？我就一打酱油的，不过要
是大家讨论了我也听听。 |
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d********r
发帖数: 3279 | 9 我是对synapse的这方面机制有兴趣，还没开始做这个呢，想知道一下意义大不大。感
觉好像机理比较简单，也都知道个差不多了。 |
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L*******n
发帖数: 748 | 10 Kandel做的就是这个……
反正诺贝尔奖是没戏了 |
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d********r
发帖数: 3279 | 11 他是 long term potentiation, 完全不同的机理 |
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l******8
发帖数: 1691 | 12 这个有好多种吧。STSD是一种从现象上命名的统称。你具体对哪个感兴趣？比如哪个脑
区里的哪个回路，通过哪个protocol得到的depression。 |
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d********r
发帖数: 3279 | 13 我想做的就是在synapse level 的机制，不涉及回路，而且是在model organism 的，
protocol 是 high frequency stimulation (10hz)，可能机制是 vesicle depletion,
calcium channel inactivation etc... |
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l******8
发帖数: 1691 | 14 看你是哪个synapse了。如果你说的是calyx of held的话，可以直接patch，那用
calcium uncaging就是可以绕过channel了。有很多方法可以用，但是要具体看你的
depression的性质，比如有多长时间啊，多大幅度啊这些。
depletion, |
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h****i
发帖数: 204 | 15 Calyx的short-term plasticity做得太多了，都没有什么好做了，好几个calyx做得很好的实验室都重心转移了。
最近看来short-term plasticity的机制还有很多啊，除了depletion of vesicle，Ca，还可能是AP waverform改变什么的。Peter Jonas有两篇Neuron说K and Na channel inactivation会改变AP，影响Ca电流，产生STP... |
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l******8
发帖数: 1691 | 16 所以说对于这种从表观上来定义的现象，可能的机制太多了啊。
很好的实验室都重心转移了。
Ca，还可能是AP waverform改变什么的。Peter Jonas有两篇Neuron说K and Na
channel inactivation会改变AP，影响Ca电流，产生STP... |
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f**d
发帖数: 768 | 17 不是这个领域的
但感觉这个领域未解决的问题非常多啊，
你能不能花时间聊聊影响这个领域发展的技术瓶颈？
比如周围的大牛想做但不能继续做的技术限制、和要解决的问题
另外，问一下， 动作电位启动突触传递的fail 率是多少？ |
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h****i
发帖数: 204 | 18 通常认为AIS产生的AP能通过axon传到terminal，这个过程failure很少。AP传递也可能产生failure，比如Debanne et al 1997提示failure可以在branch的地方产生。还有当high-frequency activity的时候，Na channel 会inactivate，也产生AP failure. 至于axon到terminal/bouton的failure好像研究得不多，主要是没法直接看。此外，有不少modeling study值得读一读。
要是错了请指正。 |
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f**d
发帖数: 768 | 19 假设没有spike failure,
每个AP是不是就一定会触发transmitter release? |
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r****t
发帖数: 10904 | 20 没有 AP 都会有 release, 你觉得这问题怎么回答好呢 |
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f**d
发帖数: 768 | 21 the quantity of transmitter release without triggered by AP is much less
than
that by AP
但AP来了却不能启动甚至很少量的transmitter release，就是个有意思的问题了 |
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r****t
发帖数: 10904 | 22 depletion happens, that's all i know... |
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f**d
发帖数: 768 | 23 even in normal situation, for a burst firing, usually the 2nd, or 3rd spike
has very short amplitude, ---which may fail to trigger transmitter release...
don't know, who knows? |
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p****p
发帖数: 3360 | 24 Would you mind shed some light on how to test if depletion happens in a
neuron? Electrophysiological means? Any other means? |
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V****o
发帖数: 112 | 25 有得做，只不过技术上有难度
比如你要in vivo记录一个synapse的strength，然后过一个月或者一年再来记录同一个
synapse的strength看有没有变化，现有技术做不到啊 |
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s*********l
发帖数: 204 | 27 我觉得机会在突触后膜增厚的地方(PSD)。 毕竟神经网络， 不是电网。精确relay 信
号当然重要，但是突触使用后的可塑性变化关键在突触后膜，有很多蛋白质还有局部
mRNA.这方面知道甚少。 |
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n***w
发帖数: 2405 | 28 受教了。
以前journal club总有一些neurogenesis的文章，通过一些marker确实是能看到
proliferation等现象，可以怎么才能证明这些new born neurons和其他的回路发生了
联系从而有些功能性的引导呢？
从电生理的角度怎么去研究呢？ |
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i**y
发帖数: 53 | 29 the question is hard to answer. In general, the release probability from a
single active zone is relatively low (~10-30%), which mean the failure rate
is pretty high, but most synapses have more than one release sites(up to 500
-600 active zones, like the calyx of Held). so it really depends on the
preparation, or the definition of release probability. |
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m******1
发帖数: 95 | 30 很高兴你能指出Hopfield network，和我说的spiking network有相似有不同。
相似的是，每一个神经元都是一个0/1发生器，根据synaptic传来的输入决定是否从0变成1
不同的也很明显，如果你从Hopfield网络里面拽一个神经元出来做neuron recording，会发现大部分神经元的虽然是在0/1之间变来变去，但这个0/1串不符合poisson分布（这是我的推论，我没有仿真实测过也没有看到过类似文章）。而神经脉冲符合poisson分布这是在大量neuron recording的实验数据上总结出来的，虽有例外，但也算得上是个“金科玉律”了。我说的spiking network一定要保证神经元符合poisson分布，这应该是和Hopfield network的显著不同之一，也是难点之一。
希望也对楼上的demoner也make sense |
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d******r
发帖数: 124 | 31 我就是想记mEPSC，看看neuron的synaptic input的有没有变化。
我是应该补充下理论知识，有什么书籍资料推荐吗？ |
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a*******1
发帖数: 8 | 32 你好！我目前主要做Stress对Synaptogensis & synaptic transmission的影响和机制
，focus on一种神经肽及其受体家族在其中的作用。Hippocampus是我最关注的脑区。
掌握的技术主要有：
1、细胞培养：原代如海马神经元，传代的如PC12。
2、ICC/IF，IHC/IF。
3、行为学实验：open-field，Morris水迷宫和Y迷宫。
4、分子技术：western blot，PCR，plasmid的转化和转染。
5、电生理：入门级，会切脑片和whole-cell patch，记录过AP、EPSC和fEPSP。
6、软件：Premer Premier、ImageJ、IPP、SPSS等，Metamorph和Matlab正在学习。
本科时做过一点点生物信息学，关于不同物种的密码子使用偏好。
请多指教！ |
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f*******y
发帖数: 421 | 33 Today, IBM researchers unveiled a new generation of experimental computer
chips designed to emulate the brain’s abilities for perception, action and
cognition. The technology could yield many orders of magnitude less power
consumption and space than used in today’s computers.
In a sharp departure from traditional concepts in designing and building
computers, IBM’s first neurosynaptic computing chips recreate the phenomena
between spiking neurons and synapses in biolog... 阅读全帖 |
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r***y
发帖数: 25 | 34 Their macro architecture, instead of their micro ones, are more interesting
. From a glimpse of the diagram (it is really a glimpse in all of their
videos, LOL), they have single units from all brain regions (visual cortex,
thalamus, BG, etc) involved in a task and establish hardware connections
between these units. The single unit could be any currently successful
neuron model (Though in personal opinion, the Izhikevich version is best
suited in this large-scale network approach). The connecti... 阅读全帖 |
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f*******y
发帖数: 421 | 35 Today, IBM researchers unveiled a new generation of experimental computer
chips designed to emulate the brain’s abilities for perception, action and
cognition. The technology could yield many orders of magnitude less power
consumption and space than used in today’s computers.
In a sharp departure from traditional concepts in designing and building
computers, IBM’s first neurosynaptic computing chips recreate the phenomena
between spiking neurons and synapses in biolog... 阅读全帖 |
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r***y
发帖数: 25 | 36 Their macro architecture, instead of their micro ones, are more interesting
. From a glimpse of the diagram (it is really a glimpse in all of their
videos, LOL), they have single units from all brain regions (visual cortex,
thalamus, BG, etc) involved in a task and establish hardware connections
between these units. The single unit could be any currently successful
neuron model (Though in personal opinion, the Izhikevich version is best
suited in this large-scale network approach). The connecti... 阅读全帖 |
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n***w
发帖数: 2405 | 37 There are lots of active research on neurogenesis which is known to occur in
dentate gyrus of hippocampus, and periventricular nucleus.
But to me, even though there is neurogenesis, whether these new-born neurons
can establish correct synaptic connections is more relevant. |
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n***w
发帖数: 2405 | 38 There are lots of active research on neurogenesis which is known to occur in
dentate gyrus of hippocampus, and periventricular nucleus.
But to me, even though there is neurogenesis, whether these new-born neurons
can establish correct synaptic connections is more relevant. |
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f**d
发帖数: 768 | 39 【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: squirrabbit (松鼠兔), 信区: Biology
标 题: 科学追求的事实和谬论—2011年神经所蒲慕明报告ZT
发信站: BBS 未名空间站 (Sat Dec 31 12:25:06 2011, 美东)
没人转这个咩？老Poo的2012年新年报告
版主给m下，再给一个包子吧：）
——————————————————————
科学追求的事实和谬论——2011中科院神经所年会蒲慕明所长报告
方琪
今年的神经所年会蒲慕明所长的报告继续由我根据录音整理，不知是不是独家，在年末
愿与有志于科学的同学们共勉~^^
科学追求的事实和谬论
Facts and Fallacies in Science
Mu-ming Poo
2011.12.29 16:30-17:15
好，我们今年年会非常热烈，大家都看到了，我们年年有进展，今年很多进展的报告大
家都觉得很兴奋，我想先讲今年所里几件大事吧，第一件大事是现在所里的领导增加了
鲜血，大家可能还不知道，王燕老师是我们所里正式的学术副所长，舒友生老师是我们
的党委副书记[在座一同学说道：... 阅读全帖 |
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J*****n
发帖数: 1041 | 40 最近在作相关的分泌蛋白，请教下什么不同？subcelluar location? vesicle content?
Thanks!!! |
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J***b
发帖数: 76 | 41 The effect of dopamine on animal behaviors seems very complicated. Dopamine
may via D1 receptors stimulate "Go" neurons in the striatum to facilitate
the section of "Go" action in rewarding behaviors;simultaneously via D2
receptor suppress "No-Go" neurons to inhibit the section of "No-Go" actions.
So the net effect is "Go". This might be why dopamine is so powerful,
although none of dopamine receptors are ion channels. These receptors do not
mediate fast synaptic transmission.
However,naturally ... 阅读全帖 |
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g****z
发帖数: 822 | 42 Neuroscience, mental disorders, patch clamp, ion channels, glutamate
receptors, trafficking, synaptic transmission, biochemistry, molecular
biology, cell biology相关领域都行。有一些审稿经历 (自己有审，也经常帮老板审)
，但数量不够，现在申请EB1就审稿这一项比较弱，希望版上的朋友帮帮忙，万分感谢
！！
如有需要可提供简历和详细信息。
联系邮箱： j****[email protected]
非常感谢！！
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k*****d
发帖数: 177 | 43 诚心求各位同行前辈推荐审稿机会，万分感谢（有审稿经验）
研究方向：Neuroscience, Molecular and developmental biology
1: ion channel properties, neural circuits, drug discovery
2: synaptic plasticity, learning and memory, aging, alzheimer’s, parkinson
’s disease
3: protein-protein interactions during the development of brain and neurons
研究方式主要包括：
molecular biology,
electrophysiology patch-clamp recordings,
rodent surgeries and behavioral tests…
恳请各位前辈不吝赐教，已发表的文章IF从3-15不等，如果需要简历，可以单独奉上。
可通过email联系我：kk.ephys (AT) gmail.com
感激不尽。 |
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发帖数: 1 | 44 审稿经验太少，诚心求各位前辈推荐审稿机会，不胜感激！
研究方向：Neuroscience and Molecular biology, glutamate receptors
trafficking, synaptic development.
如有需要可提供简历和详细信息。
联系邮箱: yuanqiuyuedui(AT)gmail.com
万分感谢！ |
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y*****l
发帖数: 5997 | 45 来自主题: _pennystock版 - stec The 5 Top Stocks in the Computer Storage & Peripherals Industry With the
Highest Upside Potential (STEC, NTAP, SNDK, SYNA, EMC)
3 hours 41 minutes ago - Comtex SmarTrend(R) via Comtex
Comtex SmarTrend(R)Below are five top stocks (share price over $20) in the
Computer Storage & Peripherals industry with the highest upside potential.
Upside potential represents potential gains between the current stock price
and the projected average analyst target.
STEC (NASDAQ:STEC) has a potential upside of 30.... 阅读全帖 |
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m****g
发帖数: 530 | 46 什么样的神经机制可以解释人体生理从消闲性药物的消费到强迫性滥用甚至毒瘾复发的
转化？一项发表在7月在线出版的
《自然—神经科学》期刊上的论文研究了这一过程，在神经细胞的连接中，研究人员发
现了一些由谷氨酸受体所控制的可
卡因导致的持久性变形。
可卡因等上瘾性药物会在大脑中留下可探测的印记。特别的是，可卡因的使用改变了神
经细胞间的连接，因此，通过它们
传递到其他神经细胞的信号或被放大或被缩小，这一过程被称为药物引导突触塑性。
通过对模式小鼠进行研究，Christian Luscher和同事分析了药物上瘾所导致的神经活
性和行为的变化。在小鼠大脑中名为
VTA的区域中，他们发现可卡因所导致的神经突触塑性变化受谷胺酸受体mGluR1所调控
。控制VTA区域中mGluR1的活性
可影响该区域突触塑性的早期和持久性形成，这一区域对停药后小鼠对可卡因的寻求行
为密切相关。阻断VTA区域的变化
可降低小鼠对可卡因的渴求行为。
参阅文献：
Cocaine-evoked synaptic plasticity: persistence in the VTA triggers
adaptations i |
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