d*********6
发帖数: 6115 | 1 T_T
确实又多了。
cim和去年一样fun run了。
srm, chicagom打算卖力跑。 |
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b***i
发帖数: 10018 | 2 你SRM之前跑两三个tune up race，我们才好预测 |
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d*********6
发帖数: 6115 | 3 好啊，
SRM之前3个比赛，10k, HM， 5K.看看能不能p个r。
：） |
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y**********u
发帖数: 6366 | 4 G找我面试我都不理好多次了。。。
现在的srm都没奖金，没什么意思啊，还不如睡个懒觉 |
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R*****s
发帖数: 41236 | 5 不小心看到这么篇：
http://bbs.runbible.cn/thread-275923-1-1.html
十年前几乎没人听说过心率表，而现在却几乎人手一个。总体来说，我为这样的变化趋
势而高兴，但也有一个担心，那就是我们变得太关注心率了。让我来解释一下。
在心率表出现之前，当运动员开始高强度训练比如做间歇练习时，需要不断地调整训练
过程的进行，并且可能将训练缩短或延长。在前心率表时期，他们做决定的依据就是个
人感官去察觉（PE）。 PE是身体基于训练时的呼吸，乳酸堆积，疲劳，以及其他无法
描述的感觉所做出的主观反应，根据这些有点模糊的数据运动员就可以做出判断。这种
训练系统的好处是它迫使运动员倾听身体的语言并与之保持一致。不足之处在于掌握和
了解身体的语言需要相当的经验和技巧。
但是现在，因为有了心率表，许多运动员都不再关心他们的PE，而是完全依靠
心率了。虽然训练时你的心率一目了然，但却无法告诉你其他一些需要被监测的参数。
实际上，这么做会让你陷入困境。为什么这么说？首先，心率不能让你全面了解身体的
负荷，它甚至不一定能告诉你正确的信息，因为许多因素－－随便列举... 阅读全帖 |
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R*****s
发帖数: 41236 | 6 “比如对骑行表现来说，把心率和功率做对比（例如，使用CompuTrainer，Power-
Tap或SRM）就是一个非常好确定体能是否提高的方法。如果与上次测试相比，输出功率
不变或提高而心率降低了，说明体能提高了；如果心率和输出功率都提高了，则说明运
动员的能力可能还在培养阶段。这个方法也可用来确定基础期训练是否可以结束了。
如果心率和功率都降低了，则说明运动员可能是疲劳，生活压力太大，甚至是训练过度
了。二者的组合还会有其他的可能性，现在你们应该了解某些观念的错误之处了吧。”
同样道理用在跑步上就是同样pace, 心率降低，说明体能提高了，pace和心率都变快，
说明还在培养阶段，如果pace和心率都变慢，就可能是overtrain了... |
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R*****s
发帖数: 41236 | 7 看完了，老哥写得很精彩很欢乐！今年这个温度其实还不算太夸张，我12年跑的时候还
没开跑，已经汗流浃背了...
要不要10月前找个比赛再Q一把？SRM? |
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r***u
发帖数: 1272 | 8 1. 两幅图片同时动作
PowerPoint的动画效果比较多，但图片只能一幅一幅地动作。如果你有两幅图片要一左
一右或一上一下地向中间同时动作，可就麻烦了。其实办法还是有的，先安置好两幅图
片的位置，选中它们，将之组合起来，成为"一张图片"。接下来将之动画效果设置为"
左右向中间收缩"，现在请看一看，是不是两幅图片同时动作了？
2. 滚动文本框的制作
右击工具栏打开"控件工具箱",再点击文本框,而后从"属性"里面把滚动条打开,在TEXT
里面输入文本框的内容.(完成)还可以通过"其他控件"中的SHOCKWAVE FLASH OBJECT 实
现PPT中加入FLASH。
3. 轻松隐藏部分幻灯片
对于制作好的powerpoint幻灯片，如果你希望其中的部分幻灯片在放映时不显示出来，
我们可以将它隐藏。方法是：在普通视图下，在左侧的窗口中，按 Ctrl，分别点击要
隐藏的幻灯片，点击鼠标右键弹出菜单选“隐藏幻灯片”。如果想取消隐藏，只要选中
相应的幻灯片，再进行一次上面的操作即可。
4.在PPT演示文稿内复制幻灯片
要复制演示文稿中的幻灯片，请先在普通视图的“大纲”或“幻灯片”选项中，选择... 阅读全帖 |
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l*****o
发帖数: 835 | 9 "今（二○○一）年四月一日發生的美國EP-3型電子偵察機，在中國南海上空近海南島
約一百公里處，擦撞中國空軍殲八型戰機，造成戰機嚴重毀損，駕駛員王偉跳傘殉難事
件。但該架美軍間諜飛機亦因引擎及機鼻損壞，致迫降海南陵水軍機場，機員二十四人
遭中共軍方留置，"
google and find above in this link: http://www.haixiainfo.com.tw/SRM/125-1630.html
So, I remembered that the news that US paid to China $12345 for this
incident. |
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l*****j
发帖数: 5163 | 10 啤酒鉴赏指标 by 黑麦
以国际标准划分，啤酒常以发酵法为限分为两大类型，顶层发酵与上发酵法被统称为艾
尔；低层发酵与下层发酵被称作拉格。温度是决定发酵法的基本分水岭，在上发酵时，
所需温度为15～24摄氏度，酵母大多在水面进行发酵反应，由于温度较高，酿酒师把它
称作“传统酿造方法”。而下发酵所需的温度为5～10摄氏度，由于密度的改变，酵母
大多会沉淀到发酵槽底部才开始反应。下发酵方式的最大优点是不易变质，通过整个过
程便可预知啤酒的口味，由于大规模的工业化啤酒排斥“意外惊喜”，偏好“统一口味
”，因此，除英国风格的啤酒外，市场上的多数啤酒均由这种方式所酿造。人们常说的
艾尔、波特（Porter）、塞多特（Stout）、阿尔特（Altbier）、特酿以及小麦啤酒等
，均为上发酵啤酒；贮藏、慕尼黑（Munich）、博克（Bock）啤酒、黑啤等，属下发酵
型啤酒；除上下发酵型外，自然发酵啤酒亦形成一种特有的风格。在荷兰啤酒爱好者范
霍夫（B.Verhoef）看来，以发酵法分类啤酒非常主观，虽然啤酒的风格大多由啤酒师
制定，但它对于饮酒者味蕾的触感毫无影响。
除了酿制方式的分类，啤... 阅读全帖 |
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c*******r
发帖数: 238 | 11 图灵奖很多是几个人分的吧，不如你说说看在统计学习理论上还有谁的贡献
跟VAPNIK是比肩的。
VAPNIK早年的那一套理论(关于示性函数的大数定理，ERM/SRM的一致性等)
不能不说是统计学习理论上的开创性以及里程碑式的贡献。 |
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A**********e
发帖数: 3102 | 12 靠，气坏了。
昨天发现连不上我过去学校的服务器了，想：是不是又断电了？赶紧找 IT 去看看，一
再强调说，您了看见它要是在跑，就别动；要是检查 file system 报错，就告诉我，也
别动。人家回来告诉我：ID"h1" respawning too fast。我说，好，别动，千万别断电
，我去找 Linux 行家来解决（其实就是把 /etc/fstab 里注掉 Oracle 的那行就成了）
。人家不爽了，发 email 来告诉我说，对于我不 care 的机器，人家已经 care 了，连
续按了几次 reset 钮，直到那个 h1 错误消失，改成报 Volume Group home file sys
tem 检查出错。喜滋滋地以为自己已经解决了上个问题，问我下一步该咋办，是否应该
选择让 linux 自己修复 -- 大家还记得上次小微手欠，搞得全站地震不？就是在这一步
。
我鼻子已经被气歪了。靠。我的东西倒是狡兔三窟的到处备份了，可是组里有个学生马
上要毕业，死活不备份，这下子算是完蛋了。
还好我的 Alpha machine 他卡在 SRM 界面不知所措，没有乱来。 |
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l**n
发帖数: 44 | 13 两次了，每次都有6个测试example都可以通过，但不能通过其系统测试，有什么办法能
知道其系统测试的集合吗？
ps，topcoder1000左右的编程水平是什么样的（c++）？ |
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M**u
发帖数: 10158 | 14 才6个
程序有bug
tco 1000的水平level II是中等吧 |
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l**n
发帖数: 44 | 15 多谢回复，我也认为是有bug，但是没找出来，所以才想找测试集合。
这个水平是不是只能找entry level的工作？ |
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B******5
发帖数: 4676 | 16 去practice room提交你的程序，可以知道你fail的是哪个system test example |
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M**u
发帖数: 10158 | 17 竞赛和工作不是一个东西
可能只能做最简单的题也能找到好的工作 |
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n********5
发帖数: 323 | 18 除非上2000分，，做得再好，，communication skill不行，，再好的工作也做不了.. |
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t****n
发帖数: 263 | 19 I don't believe you can solve "most" of div 1 level 3 problems within 20
lines. I don't need most, just show us 2 of your solutions to the div 1
level 3 problems of the latest 10
SRMs. |
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d*********e
发帖数: 3835 | 20 Citizenship Requirement: U.S. Citizen
Job Description:
• The Chief Inspector is responsible for all FAA regulatory, safety,
EPA and Haz Mat oversight at the repair station.
• This person must hold a valid A&P License and have extensive Quality
and Inspection background.
• The individual will have the authority and responsibility to make
final decisions on all airworthiness matters and will be the primary contact
with the FAA FSDO assigned PMI and all customer quality issues.
Co... 阅读全帖 |
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s*****t
发帖数: 71 | 21 SRM或者MRM的话，trap还是不行，qqq才是王道。
同位素标记，相对定量的话，trap的应用才是最多的。
我前面说的就是同位素标记的相对定量的MS数据，2倍差异的，我们实验室的100多个WB
验证，大概有20-30%的情况下抗体不行，剩下70%抗体work的，能得到和MS相同结果的
也就30%不到。100多个抗体没有多少钱吧，比起来metabolically labeling 动物。 |
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b*****r
发帖数: 203 | 22 I agree.
Quantitation in mass spectrometry is always a problem. It is easy to
generate data, but it is more difficult to get reliable quantitation from
the data.
MRM is probably the easiest and relatively reliable way for quantitation.
But even for MRM, there are also chances of "measuring an ion other than the
intended target"; see the discussion on SRM in "Recommendations for mass
spectrometry data quality metrics for open access data (corollary to the
Amsterdam principles)."
Proteomics. 2011 ... 阅读全帖 |
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T**N
发帖数: 129 | 23 这是真的么
October 11, 2013
Faulty Antibodies Continue to Enter US and European Markets, Warns Top
Clinical Chemistry Researcher
By Adam Bonislawski
One year after alerting the proteomics community to a Chinese life sciences
company that he said had infiltrated the US and European markets with faulty
antibodies, researcher Nader Rifai told ProteoMonitor this week that the
rogue firm is still at it.
Rifai, director of clinical chemistry at Children's Hospital Boston, first
warned of the faulty antibod... 阅读全帖 |
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K******S
发帖数: 10109 | 24 尽量多做定量,SRM/MRM,PRM,HRAM什么的,DISCOVERY的LC-MS/MS次要.另外要多摸仪器,
日常维护什么的也挺重要的.
industry
market |
|
f*******K
发帖数: 34 | 25 大家觉得PTMs方向前景如何？以及不同PTMs的cross-talk。
十分同意这句话，
尽量多做定量,SRM/MRM,PRM,HRAM什么的,DISCOVERY的LC-MS/MS次要.另外要多摸仪器,
日常维护什么的也挺重要的. |
|
s*****5
发帖数: 52 | 26 你好。我现在不负责仪器的维护和校正，因为lab有专门的人在做，老板觉得这样管理
比较reproducible. 而且我们的方法比较固定化，不做太多LC-MS方面方法的
development。我其实有相当一部分工作都是做high dimensional data的analysis,以
及后面的clustering之类的，我这种奇葩背景是不是很难找到工作呢？ lab有另一部分
工作做SRM/MRM定量的，是不是转到那个方面比较好呢？
re. PTM的问题，一点浅见：感觉很热门，但是PTM的很多文章都比较少有特别solid的
结论，characterize的居多吧。之前thermo的一个proteomics group的scientist说，
protein abundance都被研究烂了，key solution一定在PTM上，所以thermo投了很多钱
研究糖基化等修饰的新方法，所以也许是个新的趋势吧 |
|
K******S
发帖数: 10109 | 27 你分析数据是自己写algorithms 还是用现成的？
SRM还是定量的golden standard无论在工业界还是在clinic里面。能学最好学学。 |
|
s*****5
发帖数: 52 | 28 是用R写一些小的algorithm，以及各种包的接口。大部分工作是，比较各种现成的各种
algorithm,database search，FDR control,alignment,quantification等等，找出对
我们lab最优化的再把他们接在一起，这样。自己和统计系的collaborator合作develop
过一个proteomics data analysis的R包。
嗯，谢谢您的建议，打算找机会做个SRM的课题。 |
|
k****o
发帖数: 728 | 29 工业界还是少。cross-talk更是太学术界的概念。工业界都是具体case具体分析。找
PTM当然也找，但大都是characterize具体的therapeutic protein的PTM（包括环境导
致的各种modification），看影不影响Protein药物的efficacy。Drug discovery阶段
可能会有些大规模的筛选，但貌似用MS做discovery在工业界还是太超前了。好像有少
量职位是偏研究型discovery的。
SRM确实是用的多。所以Triple quadruple永远不会退出舞台。 |
|
K******S
发帖数: 10109 | 30 尽量多做定量,SRM/MRM,PRM,HRAM什么的,DISCOVERY的LC-MS/MS次要.另外要多摸仪器,
日常维护什么的也挺重要的.
industry
market |
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f*******K
发帖数: 34 | 31 大家觉得PTMs方向前景如何？以及不同PTMs的cross-talk。
十分同意这句话，
尽量多做定量,SRM/MRM,PRM,HRAM什么的,DISCOVERY的LC-MS/MS次要.另外要多摸仪器,
日常维护什么的也挺重要的. |
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s*****5
发帖数: 52 | 32 你好。我现在不负责仪器的维护和校正，因为lab有专门的人在做，老板觉得这样管理
比较reproducible. 而且我们的方法比较固定化，不做太多LC-MS方面方法的
development。我其实有相当一部分工作都是做high dimensional data的analysis,以
及后面的clustering之类的，我这种奇葩背景是不是很难找到工作呢？ lab有另一部分
工作做SRM/MRM定量的，是不是转到那个方面比较好呢？
re. PTM的问题，一点浅见：感觉很热门，但是PTM的很多文章都比较少有特别solid的
结论，characterize的居多吧。之前thermo的一个proteomics group的scientist说，
protein abundance都被研究烂了，key solution一定在PTM上，所以thermo投了很多钱
研究糖基化等修饰的新方法，所以也许是个新的趋势吧 |
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K******S
发帖数: 10109 | 33 你分析数据是自己写algorithms 还是用现成的？
SRM还是定量的golden standard无论在工业界还是在clinic里面。能学最好学学。 |
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s*****5
发帖数: 52 | 34 是用R写一些小的algorithm，以及各种包的接口。大部分工作是，比较各种现成的各种
algorithm,database search，FDR control,alignment,quantification等等，找出对
我们lab最优化的再把他们接在一起，这样。自己和统计系的collaborator合作develop
过一个proteomics data analysis的R包。
嗯，谢谢您的建议，打算找机会做个SRM的课题。 |
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k****o
发帖数: 728 | 35 工业界还是少。cross-talk更是太学术界的概念。工业界都是具体case具体分析。找
PTM当然也找，但大都是characterize具体的therapeutic protein的PTM（包括环境导
致的各种modification），看影不影响Protein药物的efficacy。Drug discovery阶段
可能会有些大规模的筛选，但貌似用MS做discovery在工业界还是太超前了。好像有少
量职位是偏研究型discovery的。
SRM确实是用的多。所以Triple quadruple永远不会退出舞台。 |
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s*******c
发帖数: 179 | 36
类似MRM可以做SRM。就是和QQQ比，慢不少，所以灵敏度不高。
就是说，trap的电荷越多，对你加载的电场有个反作用力，就trap不严了。所以每次不
能放太多电荷在一起。linear ion trap把离子轴向分散，所以spac charge effect 比
传统3D ion trap 小。
mass
因为一定的Q值只能把某一个m/z范围的离子稳定trap住。新的技术可以打破这个界限了
。tof好像不需要trap离子吧？
你把每种质谱的原理看明白，这些问题就很清楚了。 |
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a*********f
发帖数: 33 | 37 If the identities of each LC peak are known and no co-elution,and the target
compound has UV absorbance, LC-UV is the most reliable way for quantitation
.Otherwise, try LC-MS or LC-SRM-MS, which should work for most of compounds. |
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y*****s
发帖数: 1047 | 38 劳驾哪位对instrumentation熟的来解释一下，包子答谢
QqQ应该是最高的，我想虽然没100%，应该有个八九十吧
QTof我感觉很难超过20%
QLinearTrap感觉比QTof高，没有50%，应该有个30-40%
对QOrbitrap和LinearTrapObitrap不太了解，前者感觉类似于QTof，需要离子的简谐振
动同相位，能够有20%吗？后者要trap两次恐怕还不如QTof。
我的感觉对吗？ |
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l****y
发帖数: 398 | 39 １００％怎么算的，离子化的和最后检测到的肯定差几个数量级啊。 |
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y*****s
发帖数: 1047 | 40 损失大部分是难免的，只考虑离子产生的总时间里有多少比例可以到最后一级, 这能叫
duty cycle吗
QqQ是流水线，出了Q1进q2,出了q2进Q3
QTof出了collision cell只有一个脉冲时间里的进到Tof，完了再进下一个脉冲的，脉
冲之间的间隔应该比脉冲本身占的比重多不少吧
Linear Trap 一段时间打开进离子，然后扫描，完了再打开进离子，不知道扫描时间和
收集离子时间哪个占的比重大
Orbitrap 只看过thermo的一些广告，似乎是 c trap 打开进离子，然后一个脉冲送到
orbitrap扫描，然后c trap再打开收集离子。不知道c trap 收集离子的时间，脉冲时
间和orbitrap扫描时间的长短都是多少。当然前面还有一个Q或者linear trap |
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b*******g
发帖数: 1309 | 41 你这个应该叫transmission efficiency，QQQ,从形成离子进入Q1开始算，到Q3，效率
超过90%，好像在95%以上，所以要提高LOD必须在ionization source 跟Q0上下功夫。
举个例子AB Sciex 的6500跟5500 的区别就是source enhance 2倍LOD，Q0（Qjet)
enhance 2倍2LOD，共计4倍LOD
QTOF 的ion transmission主要是损失在 flight 过程中，另外TOF的pulse frequency
并不慢，大部分仪器都在 20kHz 左右，就是0.05ms一次。
速度慢在仪器跟电脑之间的传输，没想到吧，每个TOF的spectrum在被digitization过
后从instrument到电脑需要的时间在ms ，这段时间TOF只能idle等digitizer
clearance
所以QTOF效率取决于duty cycle time跟飞行过程中的离子损失。QQQ现在的duty cycle
一
般可以到2-5ms per MRM，但是QTOF最快能到10ms，一般只能到50ms。意味着同样的时... 阅读全帖 |
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b*******g
发帖数: 1309 | 42 再讲ion trap
单纯讲 trapping efficiency已经能够超过90%，就是进入trap 能被trap住的效率
但是必须要讲的是 ion trap capacity，因为space charge effect，所以trap 能够
trap的离子数是有限制的。 一般LTQ比普通 ion trap 高20倍。
所以仪器对于进入trap的离子数量是控制的，如果离子的最高值达到了，再多的离子也
不能被检测到。这样就会造成你说的离子的损失
另外整个trap+detection 需要的时间是100ms level，所以在两个cycle 之间损失的离
子也要考虑到。
另外讲orbitrap，orbitrap也是trap，所以space charge effect 也是存在的，所以一
次进入orbi的离子不能超过限度，多余的离子是要浪费的。
另外C-trap就是一个存储离子的功能 ，做完HCD or ETD后，离子要到C-trap里先集合
一下，让后进入orbi做检测，本身的trap efficiency是很高的。唯一要考虑的是造成
的duty cycle的延长。 |
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y*****s
发帖数: 1047 | 43 现在仪器的dwell time可以很短，扫描频率很高
但是 QTof duty cycle很难高的了，因为即使对单个m/z也要扫描等于和低于它的离子,
不考虑这个,哪里可以找到pulse和inter pulse的比例？
trap的效率也可以很高，但是收集离子的时间和trap离子的时间 比例是多少
frequency |
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b*******g
发帖数: 1309 | 44 pulse的频率很高，20k Hz， 每个pulse的时间是0.05ms, inter pluse是包含在0.05ms
之内的
TOF 的pluse pusher不是问题的关键。
一个spectrum 是若干个pluse 累加的，完成一个spectrum过后需要的传输时间很长，
至少在2ms以上。 在传输data前，即使有离子进入detector 也不会被记录的。
甚至仪器在做MS/MS的时候，还有一个 “thinking time”，在50ms level per （MS1+
nMS2） cycle。这些都是造成离子不能被检测到时间。
Trap的accumulation 跟trap 可以在1-10ms完成,对于特别低浓度的可以trap 100ms以
上。 但是检测时间比较长，在50-100ms level，甚至更长。
子, |
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y*****s
发帖数: 1047 | 45 pulse ON时间通过的离子会进入reflectron被检测，而inter pulse或者说pulse OFF时
间通过的离子不能进入reflectron不被检测，这个比例有多少？和频率高低无关，但是
对灵敏度很重要
如果数据传输速度不够快，那么被记录的数据占总数据的比例又是多少？0.05ms/50ms?
这个跟dwell time或者频率有关,而且对灵敏度很重要
如果trap扫描的时间是收集离子时间的十倍，那么跟QqQ比离子利用的效率只有不到1/
10了
但是如linear trap，容量比较大，可以把收集离子的时间提高到多少呢？
05ms
MS1+
level |
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b*******g
发帖数: 1309 | 46
50ms?
一个pulse的时间宽度是ns， 从离子被push开始到达detector 需要的飞行时间是0.05
ms level，
等飞行完了， 下一个pulse就可以又开始了，中间的不要等待。所以plus的频率是20k
Hz
另外如果检测范围增加，比如从0-1700Da 变成0-3200Da，所需的飞行时间变长，Plus
的频率必须降低。所以pulse的频率跟检测范围有关。
另外你的问题就变成了，为什么不把 pluse 时间宽度从ns变成us，这样灵敏度会增加
，但是TOF的resolution就变的很低。飞行时间质谱高分辨率是基于高精度的时间分辨
率。
另外一个spectrum是几百个pulse累加，不是一个pulse，所有pulse的数据会暂时存在
机器上，等完成了，digitize后传给电脑，这个时间大致需要几个甚至几十个ms （具
体我要查一下）。
增加每个spectrum里pulse的次数是增加灵敏度的有效方法，比如说一个spectrum从100
pulse变成200pulse，但是这个就需要更多的time，所以把仪器的scan speed 越慢灵
敏度越高，scan ... 阅读全帖 |
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b*******g
发帖数: 1309 | 47 针对Trap的问题
收集离子的时间可以从1ms（甚至uS)到1s。对于特别低浓度的样品，延长accumulation
time 能够提高LOD。
但是如果trap 饱和了，即使你再延长accumulation time，离子也进不出，
这个控制饱和的参数叫ICC （Agilent 跟Bruker 用这个，Thermo有另外一个名字）
所以Trap的 LOD 也不可能无限制的提高。
由于Linear Ion Trap的容量比一般ion trap大20倍，所以可以提高更多的LOD
因为有检测时间的限制，所以Trap dwell time 比QQQ多很多，所以总的灵敏度还是下
来了。
对于定量来说Trap 要担心的是linear range 特别小，只有2-3 orders of magnitude
50ms? |
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b*******g
发帖数: 1309 | 48 先回答TOF的问题，你的理解不是很正确。
应该是放慢QTOF scan 速度 (就是增加 duty cycle 时间）增加灵敏度，但是跟
resolution无关。
一个pulse的时间，比如5ns的pulse跟50us的flight time 都是不能改变，或者很难改
变。必须加高pulse的电压才能缩短飞行时间（或者把flight tube该短）。缩短飞
行时间才能增加pulse frequency。
能改变的就是每个cycle里面pulse的数量， 如果做100个pulse是5ms （100X0.05ms）
加上digitizting 时间（假设10ms， 我还没查到具体数据，在2ms到几十之间），这样
一个cycle是15ms
如果增加到400个pulse，一个cycle就是30ms.
每个cycle产生一张谱图，每个谱图是所有pulse信号的叠加。100个pulse的信号只有
400 个pulse的1/4. 如果pulse数继续增多，dwell time（简单看就是digitizing时间
）不会减少，但是占的比例就越来越少，说所以信号损失越来越少。
所以说放慢QTOF sc... 阅读全帖 |
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