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全部话题 - 话题: sox2
1 (共1页)
j****u
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1
新闻请见http://www.ustcif.org/default.php/content/1674/
5月23日,中国科大775校友汤超的创新性“跷跷板模型”成为生命科学权威期刊《Cell
》封面文章。
汤超是北京大学理论生物学中心主任,美国物理学会会士,曾任加州大学旧金山分校教
授。汤超1977年从江西南昌洪都中学考入中国科学技术大学力学系,1981年毕业,1986
年在芝加哥大学物理学系获得博士学位。随后在统计物理,动力学体系和生物物理等领
域做了许多开创性的工作。
汤超与其合作者邓宏魁研究组的成果,成为北京大学多个院系网站报道的对象,这也是
中国科大校友在北京大学成功的缩影。据统计,北京大学至少有40位教授毕业于中国科
学技术大学,包括物理学院院长谢心澄、心理学系主任韩世辉、生命学院魏丽萍(中国
青年女科学家奖得主)、数学系鄂维南(中国科学院院士)均来自中国科大。北京大学
的多个院系中心(例如物理学院、量子中心、地球空间科学系),中国科大学者堪称学
术脊梁。远在千里之外的中国科大毕业生大举进驻北京大学。人才储于异邦,恰好证明
中国科大了不负“科技英才摇篮”之誉。
生命中心邓宏魁... 阅读全帖
i****g
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2
来自主题: Biology版 - 本期Cell封面很有中国特色
北大邓宏魁和汤超发的:
邓宏魁与汤超研究组在《细胞》(Cell)发表封面论文报道细胞重编程过程中的创新方
法和理论
日期: 2013-05-27 信息来源: 生命科学联合中心
北京大学生命科学院邓宏魁研究组和北京大学定量生物学中心汤超研究组合作,首次证
明小鼠体细胞重编程可由调控分化的基因完成,并在此基础上提出细胞命运转变的“跷
跷板模型”。2013年5月23日,该成果研究论文“Induction of pluripotency in
mouse somatic cells with lineage specifiers”于《细胞》(Cell)期刊以封面文
章形式在线发表。《细胞》同期还配发了希伯来大学Nissim Benvenisty教授对于该工
作的评论文章。
“Seesaw模型”的landscape图
细胞命运决定的“跷跷板模型”
2006年,日本科学家Shinya Yamanaka发现向小鼠体细胞转入胚胎干细胞特异因子(
OCT4, SOX2, KLF4, c-MYC)可以完成体细胞的重编程。在此之后,细胞重编程领域普
遍认为向目标细胞状态的转变需要靠在目标状态中特异高表达的... 阅读全帖
i****g
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3
来自主题: Biology版 - 本期Cell封面很有中国特色
邓宏魁今年爆发了,又一篇Science:
《科学》(Science) 杂志发表北京大学邓宏魁团队的重大研究成果——使用小分子化
合物逆转“发育时钟”
日期: 2013-07-18 信息来源: 生命科学学院
7月18日,国际学术权威杂志Science杂志(Science Express)刊登了北京大学生命科
学学院邓宏魁教授和赵扬博士带领的研究团队在生命科学领域的一项革命性的研究成果
——用小分子化合物诱导体细胞重编程为多潜能干细胞。该成果开辟了一条全新的实现
体细胞重编程的途径,给未来应用再生医学治疗重大疾病带来了新的可能。
在这项研究中,邓宏魁团队仅使用四个小分子化合物的组合对体细胞进行处理就可以成
功地逆转其“发育时钟”,实现体细胞的“重编程”。使用这项技术,他们成功地将已
经特化的小鼠成体细胞诱导成为了可以重新分化发育为各种组织器官类型的“多潜能性
”细胞,并将其命名为“化学诱导的多潜能干细胞(CiPS细胞)”。
哺乳动物细胞只有在胚胎的早期发育阶段具有分化为各种类型组织和器官的“多潜能性
”,而随着生长发育成为成体细胞之后会逐渐丧失这一特性。人类一直在寻找方法让已
分化的成体... 阅读全帖
G****a
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4
【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: toptip (土翁), 信区: Biology
标 题: 从骨科医生到诺贝尔奖-山中伸弥的研究历程
发信站: BBS 未名空间站 (Wed Oct 17 00:04:30 2012, 美东)
引言
山中伸弥(Shinya Yamanaka)获得诺奖已经有几天了,虽然两年前在听完他的讲座后
我兴致很高地写了两篇文章,这些天我却没有多少动力再写一篇完整的文章来介绍他的
工作。
我一直对中国现在还盛行的规划性科研,应用导向型科研耿耿于怀。这些所谓的重大项
目在立项的当初对目标/前景写得宏大无比,之后却通常草草收场。如果那些重大项目
真的能实现立项当初的用意,那诺贝尔奖早就在中国遍地开花了。广大科研人员都觉得
这种运行模式是一个笑话,饶毅、施一公等大牛也重炮轰击,但是分钱游戏还在进行着
。而公众,包括相当一部分科研人员也并不了解科研的自身规律,总是一再地问做基础
研究有什么用。
Shinya Yamanaka的成功是典型的小实验室自由探索的成功。他的成功再一次提示,有
相当多的科学突破是不可预测的。如果中国有大批优质的小实验室得到稳... 阅读全帖
M**a
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5
北大生命科学学院
http://www.bio.pku.edu.cn/
鉴于多方面询问,北大生命科学学院院长饶毅简要回答关于俞君英干细胞
研究的问题。
2007年11月,美国威斯康星大学的俞君英和Thomson等在《科学》杂志发表
论文,报道他们的发现:表达四个基因(OCT4, SOX2, NANOG, 和 LIN28)可以
将人类非干细胞诱导为干细胞,其中三个基因(OCT4, SOX2和NANOG)是必需的,
而LIN2似乎能提高转化效率,但不一定必需。
饶毅认为,这项研究很重要,它成功地证明了用分子生物学手段制造人类
干细胞的可能,提供了具体分子,而且提示了如何摆脱对胚胎干细胞依赖的一种
方法。理论上,有助于研究干细胞形成和维持的机理。在应用方面,因为俞君英
等发现用来诱导的几个基因可以不需要c-myc基因,提示了一种也许有特色的方
法。
饶毅对北大生科院毕业生俞君英的成就感到高兴,并表示祝贺。
饶毅认为,在为俞君英同学高兴的时候,不用媒体中夸大这项本来很重要
的研究,不宜强调诺贝尔奖,不应该有中文媒体贬低日本科学家的成就。京都大
n*********m
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6
来自主题: Biology版 - 问一个CRE的问题
This is because there is maternal effect for some Cre lines. I used Sox2-Cre
before. The offspring from female Sox2-Cre is indistinguishable from
conventional KO ones. But if your Cre line does not have this effect, it
should be OK, I think.
s******r
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7
来自主题: Biology版 - Yamanaka 是不是一个幸运儿
我觉得你没有仔细看他的paper,他那20基因不是随便挑的,个个都是已知和stemness有
关的,如果只用OCT4,SOX2,Nanog他也会成功,KLF4也不是必需的,只是提高了效率。
说得还是他的大胆,这么一锅粥煮在一起,竟然成了。

病毒: retrovirus,很巧妙,在体细胞中表达,ES中silence。
当然最主要的巧指的是他的liberary, 一般人如果能想到,最多也就能想到的也就是
Oct4, Sox2, Nanog 这些ES marker, yamanaka加入了很多oncogene,后来发现klf4也
是必须的,c-myc能大大提高效率。
你可以试着举几个比yamanaka更高明的设计出来瞧瞧。
deserve
l**********1
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8
来自主题: Biology版 - 生物大妈求建议
有时候要看内容的
比如
JBC 280, 24371–24379.
by
Maruyama, M et al. (2005).
title:
Differential roles for sox15 and sox2 in transcriptional control in mouse
embryonic stem cells.
web link:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/15863505
是以下炸药奖
Cell. 126: 663-76. 的敲门砖的话 (sox2 noted at Cell Abstract part)
JBC first author M氏and Cell 1st author T氏
今后找发考题的话 区别不大
当然前提是有Yamanaka 不错的 recommendation letter 的前提下
Takahashi K, Yamanaka S. (2006)
Cell. 126: 663-76.
Induction of pluripotent stem cells from mouse embryonic... 阅读全帖
t****p
发帖数: 1504
9
引言
山中伸弥(Shinya Yamanaka)获得诺奖已经有几天了,虽然两年前在听完他的讲座后
我兴致很高地写了两篇文章,这些天我却没有多少动力再写一篇完整的文章来介绍他的
工作。
我一直对中国现在还盛行的规划性科研,应用导向型科研耿耿于怀。这些所谓的重大项
目在立项的当初对目标/前景写得宏大无比,之后却通常草草收场。如果那些重大项目
真的能实现立项当初的用意,那诺贝尔奖早就在中国遍地开花了。广大科研人员都觉得
这种运行模式是一个笑话,饶毅、施一公等大牛也重炮轰击,但是分钱游戏还在进行着
。而公众,包括相当一部分科研人员也并不了解科研的自身规律,总是一再地问做基础
研究有什么用。
Shinya Yamanaka的成功是典型的小实验室自由探索的成功。他的成功再一次提示,有
相当多的科学突破是不可预测的。如果中国有大批优质的小实验室得到稳定的资助,那
么类似的科学突破就会随机但是必然地产生。从这种意义上讲,展示Shinya Yamanaka
在研究过程中的这种随机性和必然性,向公众科普科研活动是如何进行的,是值得我花
一点时间的。
解析Shinya Yamanaka发现诱导干细胞(iPS... 阅读全帖
t****p
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10
引言
山中伸弥(Shinya Yamanaka)获得诺奖已经有几天了,虽然两年前在听完他的讲座后
我兴致很高地写了两篇文章,这些天我却没有多少动力再写一篇完整的文章来介绍他的
工作。
我一直对中国现在还盛行的规划性科研,应用导向型科研耿耿于怀。这些所谓的重大项
目在立项的当初对目标/前景写得宏大无比,之后却通常草草收场。如果那些重大项目
真的能实现立项当初的用意,那诺贝尔奖早就在中国遍地开花了。广大科研人员都觉得
这种运行模式是一个笑话,饶毅、施一公等大牛也重炮轰击,但是分钱游戏还在进行着
。而公众,包括相当一部分科研人员也并不了解科研的自身规律,总是一再地问做基础
研究有什么用。
Shinya Yamanaka的成功是典型的小实验室自由探索的成功。他的成功再一次提示,有
相当多的科学突破是不可预测的。如果中国有大批优质的小实验室得到稳定的资助,那
么类似的科学突破就会随机但是必然地产生。从这种意义上讲,展示Shinya Yamanaka
在研究过程中的这种随机性和必然性,向公众科普科研活动是如何进行的,是值得我花
一点时间的。
解析Shinya Yamanaka发现诱导干细胞(iPS... 阅读全帖
w********h
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11
【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: toptip (土翁), 信区: Biology
标 题: 从整型医生到诺贝尔奖-山中伸弥的研究历程
发信站: BBS 未名空间站 (Wed Oct 17 00:04:30 2012, 美东)
引言
山中伸弥(Shinya Yamanaka)获得诺奖已经有几天了,虽然两年前在听完他的讲座后
我兴致很高地写了两篇文章,这些天我却没有多少动力再写一篇完整的文章来介绍他的
工作。
我一直对中国现在还盛行的规划性科研,应用导向型科研耿耿于怀。这些所谓的重大项
目在立项的当初对目标/前景写得宏大无比,之后却通常草草收场。如果那些重大项目
真的能实现立项当初的用意,那诺贝尔奖早就在中国遍地开花了。广大科研人员都觉得
这种运行模式是一个笑话,饶毅、施一公等大牛也重炮轰击,但是分钱游戏还在进行着
。而公众,包括相当一部分科研人员也并不了解科研的自身规律,总是一再地问做基础
研究有什么用。
Shinya Yamanaka的成功是典型的小实验室自由探索的成功。他的成功再一次提示,有
相当多的科学突破是不可预测的。如果中国有大批优质的小实验室得到稳... 阅读全帖
C****g
发帖数: 2220
12
真是“大道之行简也”。。。
Summary
Differentiated cells can be reprogrammed to an embryonic-like state by
transfer of nuclear contents into oocytes or by fusion with embryonic stem (
ES) cells. Little is known about factors that induce this reprogramming.
Here, we demonstrate induction of pluripotent stem cells from mouse
embryonic or adult fibroblasts by introducing four factors, Oct3/4, Sox2, c-
Myc, and Klf4, under ES cell culture conditions. Unexpectedly, Nanog was
dispensable. These cells, which we desi... 阅读全帖
T**7
发帖数: 264
13
杂志介绍
http://www.rsc.org/publishing/journals/MB/about.asp
Impact factor: 3.859
劳驾站内信发给我:
你的名字,你的email,你的专业特长关键词(3-5个即可),你的发表文章。
为了你省事,你可以copy paste你的resume也可以
希望不同专业都来试试,“分子生物系统”杂志算是交叉学科杂志。
谢谢!
稿件摘要:
TITLE: Noninvasive measurement of respiratory activity of mouse embryoid
bodies and its correlation with undifferentiation/differentiation markers
ABSTRACT: Mouse embryoid bodies (mEBs) were evaluated in detail on the basis
of respiratory activity and high-throughput quantitative reverse
transcriptio... 阅读全帖
d**********u
发帖数: 4124
14
☆─────────────────────────────────────☆
CaMKII (不作postdog) 于 (Sat Nov 8 01:18:35 2008) 提到:
发信人: CaMKII (不作postdog), 信区: Biology
标 题: 北大邓宏魁发了一篇Cell Stem Cell
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Nov 7 22:09:29 2008)
做的也是iPSC,看来和国外跟得很紧啊。
北大今年ms很牛,除了程和平之前发的一篇Cell,程还有一篇Nature被接受,另外尚永
丰也有一篇Cell被接受。
Cell Stem Cell, Volume 3, Issue 5, 475-479, 6 November 2008
doi:10.1016/j.stem.2008.10.002
Two Supporting Factors Greatly Improve the Efficiency of Human iPSC
Generation
Yang Zhao1, 4, Xiaolei Yin1, 2, 4, Han Qin1,... 阅读全帖
m******5
发帖数: 1383
15
Gontan, C., T. Guttler, et al. (2009). "Exportin 4 mediates a novel nuclear
import pathway for Sox family transcription factors." J Cell Biol 185(1): 27
-34.
SRY and other Sox-type transcription factors are important developmental
regulators with various implications in human disease. In this study, we
identified Exp4 (exportin 4) as an interaction partner of Sox2 in mouse
embryonic stem cells and neural progenitors. We show that, besides its
established function in nuclear export, Exp4 acts
a*****g
发帖数: 543
16
what kind of Cre did you use?
If you happened to have SOX2-Cre, you will be able to get good KO( of target
ed site).
I'm assuming you are doing appropriate control of the genotyping, with both
WT primers and recombinant primers...
How big was the targeted exon? where is your qRT-PCR targeting? Having one p
rimer locating in the exon may help to clarify whether deletion of the exon
occurred...
J********3
发帖数: 3151
17
来自主题: Biology版 - NIBS太变态了吧?
你这个应该靠谱啊,但延期评审了,是留还是去农大?
BTW,发现ID有Oct4,Nanog了,Sox2啥的有吗
k****o
发帖数: 589
18
来自主题: Biology版 - Seminar上有人喝咖啡居然还加糖
诸位都太低端了。
我一般都是优雅地沏一杯espresso,然后加入我新鲜制备的Oct4, SOX2, NANOG和LIN28
载体,一口喝完。
n***g
发帖数: 5027
19
来自主题: Biology版 - Yamanaka 是不是一个幸运儿
病毒: retrovirus,很巧妙,在体细胞中表达,ES中silence。
当然最主要的巧指的是他的liberary, 一般人如果能想到,最多也就能想到的也就是
Oct4, Sox2, Nanog 这些ES marker, yamanaka加入了很多oncogene,后来发现klf4也
是必须的,c-myc能大大提高效率。
你可以试着举几个比yamanaka更高明的设计出来瞧瞧。

deserve
n***g
发帖数: 5027
20
来自主题: Biology版 - Yamanaka 是不是一个幸运儿
OCT4,SOX2,Nanog效率太低太低,很容易找不到克隆的。
当然,yamanaka的大胆确实是他成功的最大的因素,敢做别人不敢想的,而且还能成功

stemness有
n********k
发帖数: 2818
21
来自主题: Biology版 - Yamanaka 是不是一个幸运儿
alright, u corned me:)) so here is my take: The entire system can work out
was really amazing and it must be a decent/smart one, bold too and clearly
luck was with them...
The highlight I personally think was to pool 24 factors and then do 24-1 to
reduce the sheer demand for labor. Luckily it worked out, it could be a
trash/disastrous design---when one pool things together, God knows what may
happen: either needs to be sequential, or some may be antagonists...Anyway,
you can say, that's very s... 阅读全帖
s******a
发帖数: 472
22
http://www.cell.com/molecular-cell/fulltext/S1097-2765(11)00331
Fifty Years after Jacob and Monod: What Are the Unanswered Questions in Molecular Biology?
=====================================================================
Tomorrow's Molecular Biology
Marc W. Kirschner
Harvard University
Today, the term molecular biology has a rather prosaic sound. After all,
there is little in contemporary biology that isn't molecular. It's hard to
remember that 50 years ago, molecular biology was distinctly ... 阅读全帖
c**********8
发帖数: 458
23
近日中科院上海药物研究所/国家新药筛选中心的研究人员在小分子化合物提高iPS诱导
效率的研究中取得突破性研究成果,相关研究论文发表在重要核心期刊《Cell
Research 》上
《Cell Research》杂志于1990年创刊,2001年首次获得影响因子,创造了中国人创办
与出版的科技期刊首次突破2分的历史纪录。份杂志由中国科学院上海生命科学研究院
生物化学与细胞生物学研究所与中国细胞生物学学会共同主办,2006年与国际著名的自
然出版集团合作,通过优秀论文开辟快速审理的绿色通道,国际编委协助组织专题稿件
,期刊发表的优秀原创论文推荐到顶级学术期刊点评栏目等。并且在之后的这些年里,
影响因子逐步提升,今年其影响因子达增长至9.417,位于国际细胞生物学领域核心期
刊10%。
文章的通讯作者是中科院上海药物研究所/国家新药筛选中心的白人计划女博士谢欣,
本研究工作得到中科院干细胞先导专项及科技部重科学研究计划的支持。
干细胞具有在体外大量增殖和分化为细胞的潜能,可为再生医学的替代疗法提供充足的
细胞来源。2006年以来,日美科学家利用病毒载体转染不同转录因子(Oct4, So... 阅读全帖
i*****i
发帖数: 154
24
来自主题: Biology版 - 同时表达四个基因用的vector
老大要找的质粒应该是叫STEMCCA
Stem Cells. 2009 Mar;27(3):543-9.
Induced pluripotent stem cell generation using a single lentiviral stem cell
cassette.
Sommer CA, Stadtfeld M, Murphy GJ, Hochedlinger K, Kotton DN, Mostoslavsky G.
Abstract
Induced pluripotent stem (iPS) cells can be generated using retroviral
vectors expressing Oct4, Klf4, Sox2, and cMyc. Most prior studies have
required multiple retroviral vectors for reprogramming, resulting in high
numbers of genomic integrations in iPS cells and limiting... 阅读全帖
l**********1
发帖数: 5204
25
来自主题: Biology版 - lncRNA问题请教
Re LZ
pls go to
one RNA-seq blog
one topic:
Long noncoding RNAs in pathogenesis
web link:
http://www.rna-seqblog.com/
LncRNAs (pronounced “link”) are long non-coding RNAs that are emerging as
important regulators of gene expression in biological processes and diseases
. In this issue of the Journal of Clinical Investigation, two papers connect
lncRNAs to inherited conditions in humans.
Sylvia B-hring and colleagues at the Experimental and Clinical Research
Center in Berlin found a chromosomal ... 阅读全帖
f*********6
发帖数: 94
26
Epiblast is a loose term to define undifferentiated pluripotent stem cells
in ICM.
Here is an excerpt from the review I suggested you to read:
...It is expressed in the 8- to 16-cell morula but becomes
restricted to the epiblast cells of the ICM in the expanded
blastocyst, and has been shown to be under the direct regulation of
the pluripotency factors Oct4 (Pou5f1) and Sox2 (Yuan et al.,
1995).
I will strongly suggest you to read the review if you have not done so. It
is a very well-written rev... 阅读全帖
C***2
发帖数: 62
27
http://www.nature.com/ncb/journal/vaop/ncurrent/full/ncb2765.ht
Sequential introduction of reprogramming factors reveals a time-sensitive
requirement for individual factors and a sequential EMT–MET mechanism for
optimal reprogramming
Abstract:
Present practices for reprogramming somatic cells to induced pluripotent
stem cells involve simultaneous introduction of reprogramming factors. Here
we report that a sequential introduction protocol (Oct4–Klf4 first, then c-
Myc and finally Sox2) outperfor... 阅读全帖
l*******i
发帖数: 153
28
来自主题: Biology版 - 这个有点牛啊
这确实是个突破,但是关键的问题还需要回答:这些小分子化合物的安全性如何?会不
会导致genome instability?
另外,如果用造血干细胞,或神经干细胞等,小分子化合物的种类或许可减少至1-2种
即可产生iPS cell。两年前在某小杂志上有一篇文章比较了小鼠的各种somatic cell,
结果显示在Sox2,Klf4 and Myc高表达的细胞中,只需要用VPA刺激一段时间(不需要
任何外源性转录因子),iPS colony就会出现。
l*******i
发帖数: 153
29
干细胞只是众多细胞形态中的一种,并不比其他状态(如成体干细胞,終末分化细胞等
)的细胞处在高一级的状态上,还是我之前说的那样,所有形态/状态的细胞处在同一
水平面上,理论上,所有细胞形态中,任何其中两个都可以进行相互“转化”。
当然,邓的这篇文章比yamanaka的iPS还有一系列transdifferentiation的文章,更进
一步佐证了这种理论,尽管从其实验结果推出其模型,过程似乎并不solid。从这个层
面上讲,邓的“跷跷板”模型是有局限的--不是两者之间的平衡,而应该是“多态平衡
”。
众所周知,GATA3/6, GMNN,HNF4a等TF在Blastocyst之前阶段是高表达的,其对
totipotency维持有重要作用。因此,有一种可能--正如同期preview评论的--需要考虑
到,等所选用的那些lineage specifier可能通过别的pathway,间接地促进endogenous
pluripotency genes(OCT4, NANOG, SOX2等)的表达,来实现reprogramming--类比
miRNA在reprogramming中的作用。如果这种... 阅读全帖
E**********t
发帖数: 56
30
Xuebiao Yao, Dasheng Li and Gang Pei recently wrote an essay to Nature
Review in MCB Which is entitled “In focus: molecular and cell biology
research in China”. Here is the link: http://www.nature.com/nrm/journal/v14/n9/full/nrm3638.html In this article, they discussed the past, present and future of molecular and cell biology research in China. One part which interested me is the key MCB discoveries in China. Although most of the work are nice and likely solid work, few of them are breakthrough... 阅读全帖
Z******t
发帖数: 206
31
向iPS的大牛们求教,如果想看一个基因的knock out 会不会影响human iPS cell
generation 的efficiency, 用什么donor cell做iPS最快最容易看到colonies?
reprogramming factors是不是用lentiviral Oct4,Sox2,Klf4,c-myc 效率最高.
多谢.
Z******t
发帖数: 206
32
来自主题: Biology版 - 制备iPS cell 的疑惑请教
制造iPS的四个基因oct4 klf4 sox2 myc
可不可以先做stable cell line stably 表达其中三个
再转染剩下的那个基因得到iPS cell
这样生成iPS的效率会不会比同时转染四个基因高?
生成的iPS cell里外源基因表达都会被silenced
那如果只转染其中三个基因 再做selection 是不是可以稳定表达这三个外源基因不被
silenced?
s********3
发帖数: 231
33
《科学》对STAP手稿的专家评审意见曝光
《科学》对传说中的STAP细胞论文的三名评审专家意见,过去一直被雪藏,今天终于
被曝光。专家对这一研究的评价不高,认为非常全面的描述性研究,如果结果确定,可
能导致发育生物学大厦的颠覆,其实是不相信这种研究结论。因为没有当时的投稿件,
所以没有办法对这些评价进行更深入分析。不过这些资料显然都在某个地方,只是拥有
的人不愿意拿出来。
Retraction Watch readers are of course familiarwith the STAP stem cell saga,
which was punctuated by tragedy last month whenone of the authors of the
two now-retracted papers in Nature committed suicide.
In June, Science‘s news section reported:
Sources in the scientific community confirm that early version... 阅读全帖
z****u
发帖数: 1007
34
来自主题: Biology版 - 关于stem cell marker的筛选的设想
找到一个marker后能开展研究的方向很多,上下游只是一方面。
除此以外,基于这个CreERT model研究其表达pattern ,Stem cell dynamic本身就很有
意义了。比如说Hans Clevers组做的Lgr5, Lgr6在肠道里的那几篇Nature, Science文
章,就只是研究其表达位置,还有拿confetti reporter来研究其激活后populate gut
epithelium后的方式。对其上下游signal pathway基本没咋研究。
就像你说的,其实很多干细胞marker真的只是凑巧在那里表达,没啥重要的功能意义,
比如NG2,nestin,俩都是最早是在brain里面被拿来标记神经干细胞的,然后做MSC的
发现其标记MSC不错。但这俩的knockout并不会导致啥MSC的功能缺陷。还有Gli1也是。
其功能对于MSC来说很弱,有点像是凑巧在干细胞那里表达。
干细胞的marker 可以是功能性的,比如ESC里的sox2, oct4啥的。也可以是非功能性的
,这个该占大多数,比如HSC里面的很多表面标记真的和功能没有明显联系,knockout... 阅读全帖
e***o
发帖数: 60
35
来自主题: Biology版 - paper help
Oncol Rep. 2014 Apr;31(4):1745-53. doi: 10.3892/or.2014.3003. Epub 2014 Jan
28.
OCT3 and SOX2 promote the transformation of Barrett's esophagus to
adenocarcinoma by regulating the formation of tumor stem cells.
b*******0
发帖数: 125
36
来自主题: Biology版 - Ageing+miRNAs NATURE 元芳怎么看?
NATURE | ARTICLE
Hypothalamic stem cells control ageing speed partly through exosomal miRNAs
Yalin Zhang, Min Soo Kim, Baosen Jia, Jingqi Yan, Juan Pablo
Zuniga-Hertz, Cheng Han & Dongsheng Cai
Abstract
It has been proposed that the hypothalamus helps to control ageing, but the
mechanisms responsible remain unclear. Here we develop several mouse models
in which hypothalamic stem/progenitor cells that co-express Sox2 and Bmi1
are ablated, as we observed that ageing in mice start... 阅读全帖

发帖数: 1
37
读了一下这篇文章,不喜欢这种研究思路,不能够称之为科学。
该实验室主页上面所挂出来的以下一些文章中,有很多引用率非常的低。
ROCKII inhibition promotes the maturation of human pancreatic beta-like
cells. Nature Communications. 2017 Academic Article GET IT
High-Content Screening in hPSC-Neural Progenitors Identifies Drug Candidates
that Inhibit Zika Virus Infection in Fetal-like Organoids and Adult Brain.
Cell Stem Cell. 2017 Academic Article GET IT
A Modular Platform for Differentiation of Human PSCs into All Major
Ectodermal Lineages. Cell Stem Cell. ... 阅读全帖
m****g
发帖数: 530
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来自主题: _Harvard_Medical_School版 - 脂肪干细胞更易转化为iPS细胞
据一项9月7日发表于《美国国家科学院院报》的研究报告称,斯坦福大学医学院的研究
人员发现,脂肪干细胞可快速诱导
成多能干细胞(induced pluripotent stem cells, iPS cells),未来有望在实验室条
件下针对每个患者培育出治疗相应疾病
的组织或器官。
(Rendering of human fat cells. )
据研究人员介绍,一般成纤维细胞在基因“重新编排(Reprogram)”之前需要培养三
周以上。但这种脂肪干细胞可以立即诱
导产生iPS细胞。
基因重排的iPS细胞通常是在四个基因表达的条件下才能产生,这四个基因被称为
Yamanaka因子,包括Oct3/4、Sox2、
c-Myc和Klf4,一般在成体细胞中这四个基因不表达或表达量很低。研究人员Sun发现,
脂肪干细胞这四个基因中有两个基
因的实际表达水平要高于成纤维细胞中的表达水平。研究人员在脂肪干细胞和成纤维细
胞中分别加入这四种基因后,发
现,约有0.01%的成纤维细胞转化为iPS细胞,而约有0.2%的脂肪干细胞转化为iPS细胞
,后者转化率为前者的20倍。
此外,研究人员
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