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全部话题 - 话题: rnaseq
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z**l
发帖数: 67
1
没有人知道吗?其实我是受朋友之邀要写一个book chapter。书将由Springer出版,是
Springer Protocols系列的其中一本。我负责写RNAseq的数据分析部分。因为topic是
有关Estrogen Receptors的。所以如果能找到有用过RNAseq的wet lab的人合作写这个
章节,就更好了。其实内容很简单,就是把RNAseq的实验过程用Protocol的格式写出来
就可以了。对做过的人来说,可能半个小时都不要。如果有人感兴趣,可以留下你的
email或给我投条,我们合作写这个章节。你可以是第一作者。只要你有RNAseq的wet
lab经验即可。
h*********c
发帖数: 78
2
RNAseq的数据分析技术本身还不是很成熟,几个大组之间分歧也比较大,确实没有什么
好书值得推荐。。。建议lz去看看那几篇比较有影响力的review吧,按时间看会好一点
。目前比较流行的软件是edgeR和cufflinks/cuffdiff,虽然也是各有各的缺点,但没什
么更好的选择。。。你如果有R的基础用edgeR应该更容易上手。cufflinks需要在linux
环境下运行,用起来还挺顺手的。我最近也在做RNAseq的分析,有时间可以交流下~~
j*p
发帖数: 411
3
我所知道的通过RNAseq来找motif,多数是这2种情况:
1. 两个sample,control/treat,跑两个RNAseq,找differential expressed genes
,拿到这个gene list,问,这些gene有什么共同点,例如,gene promoter有没有已知
的TF 的motif,这样可以至少给出几个candidate TF,可以接下来做故事;或者这些
gene sequence本身有什么motif(如果gene又长又多,技术上很难算,当然我遇到这种
情况较少,或者基本不work)。
2. 两个试验,一个input,一个pull down,例如做RNA methylation,RNA-RNA
interaction,等等,通常这种情况是找出RNA中某些位点,信号enrich over input (
如果没input,就是over nothing)。 问题是,这些enriched sites有没有motif(
sequence similarity)。
请问你是哪种情况,如果都不是,不知道能否把你的问题问的清楚些。
l****m
发帖数: 751
4
来自主题: Biology版 - truth about RNAseq vs Microarray
听过一个讲座,human和mouse的一般需求建议用microarray;
其他species,没有完美基因组的,或者有特殊需求,比如想看isoform的建议用RNAseq。
特别少量的用QPCR
实际发文章的时候可能RNAseq更favorable更好接受些。
g*****n
发帖数: 250
5
来自主题: Biology版 - truth about RNAseq vs Microarray
Microarray 和 RNAseq 都属于呼悠类的。半斤八两。但是,从道理上讲,RNAseq更可
靠。用QPCR来确认?QPCR就可靠?要用Northern,大伙都忘了吧?
z********o
发帖数: 137
6
苦命人,严重怀疑课题方向存在问题,但是还是不得不做呀!knockdown之后RNAseq
,microarray结果都非常flat。后来老板非要上了ChIPseq,结果也是不太理想。自己
不会分析,分析的人就说有几个peaks很强,挑出来了,但是这几个target在RNAseq和
microarray里根本就没变化或者没被测到。懂的朋友能解释一下吗?
我老板从来不来实验室,跟别说做实验。估计文献都只看个标题,最多摘要。而且
还是那种给他一颗沙,他能意淫出一座金矿的人。我这个课题根据就是,人家两百多页
的专利上一堆microarray结果,列了个表说我现在做的这个东西跟一种cancer的预后不
良有关。实际上写这个专利的大牛实验室发了无数文章中从来没有提及这个蛋白。我老
板就东扯西拉,找了个人帮他做了些初始数据申请了一个州内的grant。那些初始数据
很不严谨的,其中一张WT图怎么看怎么像造假,没有内参,我做出来的跟此有很大出入
。感觉就是故意把想要的结果调强,不想要的调弱。我进了实验室后,就没听说我老板
还能跟他这位“朋友”取得联系,email人家根本就不理,打电话也不接。... 阅读全帖
M*****k
发帖数: 1556
7
我和我的前老板给一个加拿大的公司(国有企业)卖身好多年,最近拿到一大堆免费测
RNAseq的机会,分了我40个。 跟别人吹了一下牛,结果人家问我差不多值多少钱?我
一时回答不上来。版上有人知道现在测序的价格不? 样品提完了,测序分析全包的那
种。
y***i
发帖数: 11639
8
next-generation sequencing/RNAseq for sure. 我认为Network就是自己忽悠自己
。看过几篇CNS的network,真是超级恶劣。
S**********l
发帖数: 3835
9
来自主题: Biology版 - 菜鸟RNAseq一问
最近拿到collaborator的一些RNAseq数据。他们找了个bioinformatics公司处理。公司
给找出来一些treatment相对control significant的gene.我看这些gene都是在control
里面根本没有map一个read的。回去做pcr,果然不对,这些gene都是在两个sample里表
达差不多的。。。
现在的问题是。对那些map reads极小的。怎么知道是map的部队还是没有表达?
多谢指点!
S**********l
发帖数: 3835
10
来自主题: Biology版 - 菜鸟RNAseq一问
最近拿到collaborator的一些RNAseq数据。他们找了个bioinformatics公司处理。公司
给找出来一些treatment相对control significant的gene.我看这些gene都是在control
里面根本没有map一个read的。回去做pcr,果然不对,这些gene都是在两个sample里表
达差不多的。。。
现在的问题是。对那些map reads极小的。怎么知道是map的部队还是没有表达?
多谢指点!
n****n
发帖数: 610
11
以前microarray时代是一定要做qPCR来确认up/down regulation.不知道在RNAseq的时
代还有没有必要做? 哪位高人有经验? 我在literature里面没看到这方面的信息。
y***j
发帖数: 11235
12
会用R,算是一般熟练了
自学过python但是用的机会不多
以前经常用C过半年,现在忘得差不多。
最近要generate一大批RNAseq的数据。preliminary data分析的时候跟别人一起干的,
主要做differential expression,也看过一些paper,但是总是觉得会的东西东一块西
一块的,有没有比较好适合我这半吊子水平小朋友的书推荐。
S*M
发帖数: 10832
13
帮朋友问个问题
已做了细菌的whole genome的RNAseq
得到上千个mRNA的sequence,另外每个mRNA都得到了一个我们感兴趣的数值(scalar)
不知道有什么算法,能够在这些mRNA里寻找sequence motif,来解释这个scalar的变化
我好像听说最简单的machine learning可以用来预测binary的变量
我们感兴趣的是个连续变量,不知道有没有问题?
另外不知道是不是要把几千个mRNA先align一下(比如Transcription Starting Site对
齐)
才能进行motif finding?
问的比较外行
多谢指教!
b****r
发帖数: 17995
14
你的问题确实看不太懂
什么叫做whole genome的RNAseq
细菌的genome都是DNA,不是RNA
另外我认为不管是RNA 还是DNA,肯定要先align好。现在的测序平台错误都很多,如果
我是reviewer看到有人直接拿原始的测序data来往后推,肯定把这文章打回去
i******g
发帖数: 90
15
来自主题: Biology版 - 问个RNAseq问题
大家做小鼠RNAseq的时候都测几个生物学重复? 我只有一种处理,对照组和处理组各6
只老鼠,如果每个都测30M的话太贵了。 想把3个混到一块,做2个重复,这样只需要测
4个样本,可以吗?
c********e
发帖数: 598
16
来自主题: Biology版 - truth about RNAseq vs Microarray
I'd like to hear your input.
1)Microarray,but not RNAseq correlate well with QPCR.
2)Gene expression uniquely determined by RNA-seq is more likely
to be false positive.
S*********s
发帖数: 304
17
来自主题: Biology版 - truth about RNAseq vs Microarray
感觉RNAseq有很多false positive, QPCR confirm不了
M*****n
发帖数: 16729
18
来自主题: Biology版 - truth about RNAseq vs Microarray
I have just done an RNAseq, the preliminary analysis not good. many false
hits.
M*****n
发帖数: 16729
19
来自主题: Biology版 - truth about RNAseq vs Microarray
但是RNAseq 数据在那里,你可以reanalyze
microarray就只有这么些gene, 不能发现新gene
genome 不完整的话,都是有问题的。
l***z
发帖数: 62
20
来自主题: Biology版 - 讨教大牛,关于RNAseq数据发表
我们想做一套在药物处理过程中RNA的表达变化,用RNAseq的话,发表数据是要什么东
东呢?
谢谢
z**l
发帖数: 67
21
版上有谁有用RNAseq研究estrogen/estradiol treated samples的吗?如果有的话,能
否留个联系方式或给我投条。有个简单的问题想问问。谢谢!
g*r
发帖数: 67
22
Re
如果不是特别处理的rnaseq,protocol应该大同小异。
c***y
发帖数: 615
23
来自主题: Biology版 - RNAseq, cDNA normalization的问题
那是不是一个未知样本作RNAseq,同时作两个library比较好,normalized 可以看看到
底那些基因表达, non-normalized, 看看相当基因表达abundance??

发帖数: 1
24
来自主题: Biology版 - 有人用SMARTer方法做RNAseq吗?
有没有人用SMARTer 方法做RNAseq?我不小心把SMARTer IIA oligonucleotide 放-20
了,还能用吗?这种oligo是一个oligo前边是DNA后面五个nt是RNA,是不是存在-20就
不能用了?
d********f
发帖数: 43471
25
【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: zhoumaomao (周毛毛), 信区: Biology
标 题: 被坑惨了,看看我这还做得下去吗?
发信站: BBS 未名空间站 (Wed Jul 10 16:09:50 2013, 美东)
博后搞了个新field,虽然比较陌生,但是做着做着觉得做不下去啦!老板很老,以
前80年代90年代早期靠钓新基因发家的,整了一堆蛋白放那里。看看别人有什么新发现
,就拿出来再做一做。我目前做的这个蛋白,在此叫做A,在02年吧,有个牛人在其有
五六十页的专利的一个table里面列出来,说这个蛋白在一类淋巴瘤细胞里面表达量高
,估计跟这类淋巴瘤关系密切。应该是根据microarray得到的data来推论的。但是之后
牛人发了好多paper,关于这类淋巴瘤的,转录因子,蛋白激酶,做了一大堆,也测了
很多microarray 和RNAseq的data,但就是在其文章中找不到关于我做的这个蛋白A的只
言片语。我的老板写的grant,跟这个牛人实验室独立出来的一个老postdoc合写的,里
面有张WT电泳图要显示A在这类淋巴瘤细胞系里,相对... 阅读全帖
z********o
发帖数: 137
26
博后搞了个新field,虽然比较陌生,但是做着做着觉得做不下去啦!老板很老,以
前80年代90年代早期靠钓新基因发家的,整了一堆蛋白放那里。看看别人有什么新发现
,就拿出来再做一做。我目前做的这个蛋白,在此叫做A,在02年吧,有个牛人在其有
五六十页的专利的一个table里面列出来,说这个蛋白在一类淋巴瘤细胞里面表达量高
,估计跟这类淋巴瘤关系密切。应该是根据microarray得到的data来推论的。但是之后
牛人发了好多paper,关于这类淋巴瘤的,转录因子,蛋白激酶,做了一大堆,也测了
很多microarray 和RNAseq的data,但就是在其文章中找不到关于我做的这个蛋白A的只
言片语。我的老板写的grant,跟这个牛人实验室独立出来的一个老postdoc合写的,里
面有张WT电泳图要显示A在这类淋巴瘤细胞系里,相对与之对应的另外一类淋巴瘤细胞
是高表达的。蛋白A有100kd左右,但是这张WT的图显示的带在35KD左右,他们解释为是
B的特异性降解带。图好像是故意调过的,突出了他们想要表达的意思。我自己专门验
证过,A的蛋白水平并不是在这类淋巴瘤细胞系的每种细胞表达量... 阅读全帖
z********o
发帖数: 137
27
博后搞了个新field,虽然比较陌生,但是做着做着觉得做不下去啦!
老板很老,以前80年代90年代早期靠钓新基因发家的,整了一堆蛋白放那里
。看看别人有什么新发现,就拿出来再做一做。我目前做的这个蛋白,在此叫做A. 在
02年,有个牛人在其有五六十页的专利的一个table里面列出来,说这个蛋白在一类淋巴
瘤细胞里面表达量高,估计跟这类淋巴瘤关系密切。应该是根据microarray得到的data
来推论的。但是之后牛人发了好多paper,关于这类淋巴瘤的,转录因子,蛋白激酶,
做了一大堆,也测了很多microarray 和RNAseq的data,但就是在其文章中找不到关于
我做的这个蛋白A的只言片语。我的老板写的grant,跟这个牛人实验室独立出来的一个
老博后合写的,里面有张WT电泳图要显示A在这类淋巴瘤细胞系里,相对与之对应的另
外一类淋巴瘤细胞是高表达的。蛋白A有100kd左右,但是这张WT的图显示的带在35KD左
右,他们解释为是A的特异性降解带。图好像是故意调过的,突出了他们想要表达的意
思。我专门验证过,A的蛋白水平并不是在这类淋巴瘤细胞系的每种细胞... 阅读全帖
j*p
发帖数: 411
28
Try RNAseq ba. As far as I know, RNAseq requires less starting material, as
few as 100 cells, based on my knowledge (I have never seen RNAseq data from
single cell).
Besides, if you decide to use RNAseq, I suggest NuGEN RNA amplification kits
, because data from NuGEN is the best I have ever see, in comparing to at
least 3 other kits.
z********o
发帖数: 137
29
cell culture
我也不知道kd的效率怎么回事,我qPCR和WT做的kd的效率都很高的,但是上了
microarray和RNAseq kd效率就只有~50%。我觉得我一步步做的很小心仔细了(我有点
完美主义似的强迫症),但是microarray和RNAseq结果就是没什么变化。我个人都怀疑
这个课题的方向是不是存在问题,但是老板和实验室的人现在都揪着这个kd的效率,说
microarray和RNAseq测的效率只有~50%,这个效率不足以引起变化,所以我的RNAseq
和microarray的结果很flat。
z********o
发帖数: 137
30
大家遇到这样的情况吗?在送totalRNA去做microarray之前做qPCR确定了
knockdown的效率有73%, 但是micoarray做出来只有~50%。后来又去做了RNAseq,结
果也差不多。microarray和RNAseq的结果看,这个被knockdown的factor几乎没引起什
么基因表达的变化。但是在蛋白水平上,这个factor几乎被knockdown清除了。不知道
是怎么回事?是不是这个factor根本不值得做,还是在我这类细胞里不是作为转录因子
起作用的?
还有,我的RNAseq的library是让学校的测序部门做的,然后他们再测序。测
100mer/reads,一共测了30 million。但是得降到70mer时mapping efficiency才只有
~50%左右。那这个测序结果好吗?可信吗?我刚接触这些东西,分析也是一个专门做
bioinformatics的韩国学生帮我分析的。
希望各位能人帮我分析下这些问题。谢谢呀!
a**********u
发帖数: 28450
31
【 以下文字转载自 Dreamer 讨论区 】
发信人: Dreamer (不要问我从哪里来), 信区: Dreamer
标 题: 招生物、生物信息或CS 专业人员若干名
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Feb 12 12:36:28 2015, 美东)
请哪位好心人帮忙转到job hunting 或 biology版
我们公司虽然是一个startup公司,但是我们已经拿到了超过$1M的风投,四月或五月,
会有另外的$4M进来。我们在招募两类员工,一类是有在老年、老年相关疾病研究经历
,一类是生物信息或CS经历的人员。
1. Ph.D. in related fields with research experience in Aging and aging-
related diseases or
2. BS, MS or Ph.D. in bioinformatics, CS or related fields.
You can find our AD at Craigslists, indeed and linkedin
Programmer / Scientist /... 阅读全帖
m****s
发帖数: 18160
32
【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: BachCello (cello), 信区: Biology
标 题: Postdoc positions in Weill Cornell medical college
发信站: BBS 未名空间站 (Mon Jul 29 16:32:52 2013, 美东)
Description
POSTDOCTORAL POSITION – Hematopoietic Stem Cell Biology
Weill Cornell Medical College, Cornell University, New York, NY
A postdoctoral position is available to investigate mechanisms controlling
hematopoietic stem cell (HSC) quiescence and how disruption of these
mechanisms contributes to the pathogenesis of hematopoietic m... 阅读全帖
m****s
发帖数: 18160
33
来自主题: JobMarket版 - postdoc position in NYC
【 以下文字转载自 Postdoc 讨论区 】
发信人: mummy (老菜皮), 信区: Postdoc
标 题: postdoc position in NYC
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Sep 26 10:42:03 2013, 美东)
朋友招postdoc,帮他贴广告,有兴趣的可以申请, 如果贴错地方请帮忙转到正确的
地方,谢谢
Description
POSTDOCTORAL POSITION – Hematopoietic Stem Cell Biology
Weill Cornell Medical College, Cornell University, New York, NY
A postdoctoral position is available to investigate mechanisms controlling
hematopoietic stem cell (HSC) quiescence and how disruption of these
mechanisms contributes to the pathogenesis of ... 阅读全帖
j*p
发帖数: 411
34
来自主题: Biology版 - 怎样map long noncoding RNA啊
There has been quite a few RNAseq data released recently, many of them been
uploaded to UCSC genome browser as tracks (human and mouse). You may want to
try:
(1) go to that loci of the noncoding RNA you are interested.
(2) check RNAseq data and computational predicted tracks and see whether the
RNA is expressed, how many exons, what is the predicted splicing structure
etc.
(3) then RACE or you might want to test some functional study before RACE.
Personally, I doubted a noncoding RNA covers ~100... 阅读全帖
d*****8
发帖数: 29
35
谢谢你的建议, 我们有knockout的line,有想过在干细胞中做RNAi和overexpression
的然后sorting做RNAseq,但是老板说可能结果不是很特异,所以sample现在还放着没
做。主要是干细胞太少,做sorting还会损失一些。这个TF的binding应该很强,我们有
做BAC的GFP-tag看到核内有很强的信号。现在想可能还是要RNAseq入手先找可能的
target做control。
d*****8
发帖数: 29
36
谢谢你的建议, 我们有knockout的line,有想过在干细胞中做RNAi和overexpression
的然后sorting做RNAseq,但是老板说可能结果不是很特异,所以sample现在还放着没
做。主要是干细胞太少,做sorting还会损失一些。这个TF的binding应该很强,我们有
做BAC的GFP-tag看到核内有很强的信号。现在想可能还是要RNAseq入手先找可能的
target做control。
s****a
发帖数: 55
37
来自主题: Biology版 - RNA SEQ vs Array
好像现在都倾向于RNASEQ了。用RNAseq去做RNA差显,不知道需要测多少倍才靠谱啊。
比如说热的细胞系3个G的数据量够不够。如果要看剪切的话呢?
T****i
发帖数: 15191
38
来自主题: Biology版 - 高通量的问题很大
不是RNAseq,是exon capture。正要做RNAseq
a**********u
发帖数: 28450
39
【 以下文字转载自 Dreamer 讨论区 】
发信人: Dreamer (不要问我从哪里来), 信区: Dreamer
标 题: 招生物、生物信息或CS 专业人员若干名
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Feb 12 12:36:28 2015, 美东)
请哪位好心人帮忙转到job hunting 或 biology版
我们公司虽然是一个startup公司,但是我们已经拿到了超过$1M的风投,四月或五月,
会有另外的$4M进来。我们在招募两类员工,一类是有在老年、老年相关疾病研究经历
,一类是生物信息或CS经历的人员。
1. Ph.D. in related fields with research experience in Aging and aging-
related diseases or
2. BS, MS or Ph.D. in bioinformatics, CS or related fields.
You can find our AD at Craigslists, indeed and linkedin
Programmer / Scientist /... 阅读全帖
m******c
发帖数: 830
40
最近电面了一个大药厂的职位。这道题不知怎么答好。
有两组病人,用同一种药治疗,其中一组病人的效果好,而另外一组的疗效不好。现有
每个病人的RNAseq数据,也就是两万多个基因的表达值数据(normalized),这个值得范
围可能是0-100,非随机,非线性分布,但总体的均值为1. 问用什么样的机器
学习的方法或统计方法来找出一组基因,也就是两万多个基因中的一小部分,其表达值
可以用于病人对于该治疗的预测?
Two patient cohorts, all treated with the same drug. One cohort are the
responders, who has response to the treatment and the other one are non-
responders who does not respond to the treatment. RNAseq was performed and
we have the normalized gene expression values of the 20,000 genes for each... 阅读全帖
s**********g
发帖数: 413
41
各位前辈好,
小弟刚收到一个postdoc的offer 想咨询一下各位的建议和single cell RNA seq,
bioinformatics方向在工业界的工作机会
个人背景:
2019 Ph.D. 毕业 方向是biomaterial tissue engineering,主要做的hydrogel based
3D disease modeling 和 biomaterial for bone/cartilage regeneration,bio的技
术学过很多但是大多数是protein 和RNA的表达测试(Western, qPCR, MSD, IF), 没有
很多molecular biology 比如gene editing, cloning, transfection经验。
个人感觉自己不适合faculty,想去工业界,然而专业方向的industry几乎没有,也不
想在这个方向更深入研究因为会更偏离应用,所以想如果博后就强行换方向做一些
disease相关(cancer,neuro)或者bioinformatics掌握编程和数据分析的技术,可是
联系了一些PI,只有个别的... 阅读全帖
m******c
发帖数: 830
42
来自主题: DataSciences版 - 一道药厂computational biology的面试题
最近电面了一个大药厂的职位。这道题不知怎么答好。
有两组病人,用同一种药治疗,其中一组病人的效果好,而另外一组的疗效不好。现有
每个病人的RNAseq数据,也就是两万多个基因的表达值数据(normalized),这个值得范
围可能是0-100,非随机,非线性分布,但总体的均值为1. 问用什么样的机器
学习的方法或统计方法来找出一组基因,也就是两万多个基因中的一小部分,其表达值
可以用于病人对于该治疗的预测?
多谢指教。
Two patient cohorts, all treated with the same drug. One cohort are the
responders, who has response to the treatment and the other one are non-
responders who does not respond to the treatment. RNAseq was performed and
we have the normalized gene expression values of the 20,000 genes fo... 阅读全帖
x********e
发帖数: 35261
43
靠 复杂的不会,最基本的RNASeq和CHIPSeq还是实验室自己处理的,不就是跑几个程序
嘛,都有现成的。跑程序可以用NIH的服务器。耗子那个搞DNASeq只能说有可疑突变,
要证明的确是基因突变造成的代谢病,最铁的还是酶活assay,不过耗子说人家造假了。
r*********g
发帖数: 1160
44
我测48个样品,包library prep,测序,分析,大概估价时20K。我们自己做RNA
isolation.
M*****k
发帖数: 1556
45
明白了。谢谢,谢谢。
y****6
发帖数: 65
46
【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: yhg926 (), 信区: Biology
标 题: 急求生物信息学博后位置-可免费工作三-六个月
发信站: BBS 未名空间站 (Mon Dec 14 22:04:26 2015, 美东)
本人生物信息学博后,J1身份,前不久突然被现任老板通知不继续续签下一年的合约
,离我DS2019表到期只剩下2个多月(Feb 28.2016),而且长假来临,因此打算在此广而
告知,以求尽快在deadline之前找到下家。同时,只要是能够快速转到新位置,如果您
的实验室经费暂时不足,本人也很愿意做志愿者免费打工三-六月时间。
目前,我在Upenn,school of medicine 做博后已近两年 , 研究方向为 大样本
RNAseq analysis,epigenomics , gene expression ,clinical data 的整合分析
以及 eQTL analysis,之前 在研究生阶段从事的是微生物基因组的分析和比较基因组
学研究,在博士阶段则从事NGS 的算法研究。因此,对NGS 之类的数据分析十分熟悉... 阅读全帖
y****6
发帖数: 65
47
【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: yhg926 (), 信区: Biology
标 题: 急求生物信息学博后位置-可免费工作三-六个月
发信站: BBS 未名空间站 (Mon Dec 14 22:04:26 2015, 美东)
本人生物信息学博后,J1身份,前不久突然被现任老板通知不继续续签下一年的合约
,离我DS2019表到期只剩下2个多月(Feb 28.2016),而且长假来临,因此打算在此广而
告知,以求尽快在deadline之前找到下家。同时,只要是能够快速转到新位置,如果您
的实验室经费暂时不足,本人也很愿意做志愿者免费打工三-六月时间。
目前,我在Upenn,school of medicine 做博后已近两年 , 研究方向为 大样本
RNAseq analysis,epigenomics , gene expression ,clinical data 的整合分析
以及 eQTL analysis,之前 在研究生阶段从事的是微生物基因组的分析和比较基因组
学研究,在博士阶段则从事NGS 的算法研究。因此,对NGS 之类的数据分析十分熟悉... 阅读全帖
b********s
发帖数: 272
48
来自主题: Stock版 - 赌NSTG的ER了
能比rnaSeq 还好?炒作吧?
r*m
发帖数: 16380
49
来自主题: Stock版 - 赌NSTG的ER了
看你想干啥。还有性价比。
RNAseq是大锤子,nanoString是小刀。
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