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全部话题 - 话题: pmf
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fe
发帖数: 286
1
来自主题: Biology版 - proteomics data
PMF is for protein identification. But if you have a matched protein with
a good score, then you'll know the identity of the peptides, right?
c******d
发帖数: 306
2
你们这些人,人家明明问入门的书,你们一个个,装B,推荐这个那个,生怕推荐了容
易懂的书,被别人耻笑。推荐难懂的书就说明你牛B了???入门,知道不,人家问的
是入门。。。
Casella那本书对毫无统计背景的生物人能读懂吗?楼主估计pmf 和 pdf的区别还不太
了解。。。
好歹也先推荐 这本mathematical statistics 吧?
http://www.amazon.com/Mathematical-Statistics-Data-Analysis-Joh
楼主,先看这本,看懂了在找别的。别听他们忽悠,没统计背景去看那些书,有害无益
。万事从容易开始嘛。
G***G
发帖数: 16778
3
您的最后一句是什么意思?最后一句中的MS technology是指的MS/MS?
serum属于complex sample吗?

PMF
b*******g
发帖数: 1309
4
protein digestion 3 个小时完成不了
复杂一点的proteomics 实验都要一两天吧。。。
有个建议,你们这个仪器能做TOF/TOF吧,
比较一下proteomics ID 用 PMF 跟 MS/MS search database的区别
一人两个蛋白,一个已知,一个未知,第三个 两个蛋白混在一起
已知的看准确度,未知的看ID 对不对

TRYPSIN
y***l
发帖数: 1095
5
谢谢,我这个外行还需要继续科普。。。请问PMF是什么?
我们是可以作TOF/TOF的,就是用LIFT对吗?
还有,有什么推荐的蛋白吗?
蛋白还是需要学生先DIGEST吗?
如果想找具体的实验步骤,有没有推荐的书或PAPER可以参考?谢谢!!
非常感谢!
f*********e
发帖数: 1144
6
The software together with Autoflex (FlexAnalysis/Biotools) are not that
easy themselves, you don't want to get yourself trapped if you are not
familiar with them.
Skip MS2, just fire on a couple spots and show them the peaks. Make it like
a PC game. Peptides PMF is enough together with calibration (well,
calibration is kinda tricky too). Don't try intact proteins.
We had 3 days onsite training on Autoflex w/o LIFT and I still keep bugging
bruker.....shame on me...hehehehehe
f*********e
发帖数: 1144
7
来自主题: Chemistry版 - 求助:奇怪的质谱结果
If u did pmf, what's the sequence coverage? Compare the one without vc and
the one with vc, if u really want to figure out the peak, do a differential
mapping. Use maldi for digest mapping would be much easier。
And what column are u using?

weight
b****r
发帖数: 2555
8
There is no such thing as P-polarizer-sheet or S-polarizer-sheet, but
you can use a PBS (polarization beam splitter), which can tell you
-roughly- if the light is p-polarized or s-polarized.
But still, there are many technical difficulties in your experimental
setup:
1. what fiber you are using? PMF (polarization-maintain fiber) can
give you a linear polarized output, but the polarization orientation
is dependent on your fiber orientation. Rotate your fiber output end
and you will get a differen
m****t
发帖数: 2684
9
PMF有太大的不确定性,EPA也说这个只表明相对重要性,而不是绝对的,而且他的那副
source profile图(8)的问题太大,应该要进一步细分,否则很难看出这些源有什么
区别,把其中一个因子叫‘Traffic and waste incineration emission’,就说明他
基本不知道这个东西是什么。
另外CMB结果里的‘unidentified’的成分相当大,这个结果也就是发发文章,离实际
情况远了去了。
s*********y
发帖数: 2653
10
同意,其实PMF是个很扯的东西,使用者要有对分析对象良好的认识,因为你输入的
factor的数量都是自己设定的,run出来的结果不好的话还要重新调试输入参数,再run
,直到能自圆其说为止。。。
h****r
发帖数: 9
11
来自主题: Mathematics版 - sum of the outcomes of dice tosses
A dice is tossed K times (K is a constant): P(X_k = i)=p_i, i=1~6 (when even
, p_i=1/6). The outcomes are summed up. Y=\sum_{k}X_k. What's the pmf of Y?
Is this a trival problem?
z*******e
发帖数: 777
12
来自主题: Mathematics版 - 请教一个简单的分布函数问题
大家好,
近来要用统计的知识,这方面我知道的太少,有个问题请指点一二,谢谢。
如果Service time 是3秒(也就是随机变量S(t)为常数),S的分布函数F(t)或者密度分布函数pmf是什么呢?
a**e
发帖数: 5794
13
来自主题: Mathematics版 - 请教一个简单的分布函数问题
我猜你想说average service time是3秒,那么waiting time的分布是
exponential

度分布函数pmf是什么呢?
z*******e
发帖数: 777
14
大家好,
近来要用统计的知识,这方面我知道的太少,有个问题请指点一二,谢谢。
如果Service time 是3秒(也就是随机变量S(t)为常数),S的分布函数F(t)或者密度分布函数pmf是什么呢?
s*****n
发帖数: 2174
15
什么叫service time? 你是想问一个单点(分布)的PMF或者CDF是什么吗?
D*****a
发帖数: 2847
16
什么乱七八糟的
常数还随机个啥

度分布函数pmf是什么呢?
s*****n
发帖数: 2174
17
单点分布
PMF: P(ST = 3) = 1
CDF:
F(t) = P(ST <= t) = 0 if t < 3,
F(t) = P(ST <= t) = 1 if t >= 3.
s*****n
发帖数: 2174
18
histogram 本身就是一种exploratory methods, 没什么量化的概念.
你所说的peak高低, 数量, 那些不是用来描述histogram的, 而是用来描述其背后所代
表的pdf(或离散情况下的pmf).
m****r
发帖数: 237
19
来自主题: Statistics版 - 问个技术问题
P(Z=z)=exp(-mu)*mu^(z/2)/((z/2)!)
This is the pmf for Z=2*x1
D******n
发帖数: 2836
20
来自主题: Statistics版 - 新手问个问题 (转载)
create a .vim directory under you home directory(there is a dot before
vim)
and then create a syntax directory under it
and then create a sas.vim file under the syntax directory
==============sas.vim======================
if version < 600
syntax clear
elseif exists("b:current_syntax")
finish
endif
syn case ignore
syn region sasString start=+"+ skip=+\\|\"+ end=+"+
syn region sasString start=+'+ skip=+\\|\"+ end=+'+
" Want region from 'cards;' to ';' to be captured (Bob Heckel)
sy... 阅读全帖
k*******a
发帖数: 772
21
E(xi*xj)-E(xi)E(xj)
E(xi)=npi
E(xj)=npj
E(xi*xj)的话你可以得到 n(n-1)pipj, 这个你可以直接用 pmf*xixj 然后对所有x1...
xn求和得到expected value
y*****w
发帖数: 1350
22
Actually the intercept in the ODS output is the estimated log mean of the
fitted gamma distribution, so I don't need the output statement in PROC
GENMOD. The pertinent code becomes:
proc genmod data=mydata;
model visit = / dist=gamma link=log;
freq episode;
ods output parameterestimates=pe;
run;
proc transpose data=pe out=tpe;
var estimate;
id parameter;
run;
data _null_;
set tpe;
call symputx("logmean", intercept);
call symputx("scale", scale);
stop;
run;
data pmf;
do t = 1 ... 阅读全帖
P*****r
发帖数: 554
23
来自主题: Statistics版 - 求问一道扔硬币求期望的面试题
6似乎是对的,但是这个求解方法好像不太好interpret啊,呵呵
一般要先找PMF,再算mean的
P*****r
发帖数: 554
24
来自主题: Statistics版 - 求问一道扔硬币求期望的面试题
哪敢称大侠,lol
常规解法就是定义下variable,算下pmf,找出mgf,然后就得到mean了
不过貌似很耗时间哈,跟这种解法比起来简直被甩掉了十几条街
p***l
发帖数: 134
25
来自主题: Statistics版 - 求问一道扔硬币求期望的面试题
Use a conditional-unconditional formula, the idea is crystal clear and easy.
It is a classic technique for martingale/stochastic process problem.
Let X=# of tosses until you observe two heads in a row, Y1=the result of the
first toss. Also denote x=E(X) for consistency with your equation.
x=E(X)=E[E(X|Y1)]= E(X|Y1=T)/2 + E(X|Y1=H)/2
Note that Y1 is independent of the remaining tosses. Provided Y1=T, the "
head counter" is reset. Hence E(X|Y1=T)=E(1+X)=1+x. Provided Y1=H, you have
.5:.5 condition... 阅读全帖
h***i
发帖数: 3844
26
来自主题: Statistics版 - 求助 R density plot 出现波纹。。。
6 points is good for pmf not pdf
z****u
发帖数: 1007
27
来自主题: Medicalpractice版 - 分享一下在美国的看牙经历
如果治疗前发现是overtreatment,那是没法去告医生的,因为还没有任何治疗发生。如
果治疗之后有确切证据证实overtreatment,那还有些机会。
一般是先由医生制定方案,和病人讨论,同意了,送去保险公司审批,审批下来了才开
始治疗。保险公司判断方案合理与否的标准基本就是XRay,以及insurance plan
coverage 项目。 所以我觉得像你们,应该确定什么是你们最需要的治疗,先进行,别
的再说。
这里普通的PMF也是Ni-Ti合金。full ceramics当然有了,价钱会比普通PFM贵不少呢。
如果是后牙那就用不着了啊。
z****u
发帖数: 1007
28
来自主题: Medicalpractice版 - 分享一下在美国的看牙经历
如果治疗前发现是overtreatment,那是没法去告医生的,因为还没有任何治疗发生。如
果治疗之后有确切证据证实overtreatment,那还有些机会。
一般是先由医生制定方案,和病人讨论,同意了,送去保险公司审批,审批下来了才开
始治疗。保险公司判断方案合理与否的标准基本就是XRay,以及insurance plan
coverage 项目。 所以我觉得像你们,应该确定什么是你们最需要的治疗,先进行,别
的再说。
这里普通的PMF也是Ni-Ti合金。full ceramics当然有了,价钱会比普通PFM贵不少呢。
如果是后牙那就用不着了啊。
m***r
发帖数: 359
29
来自主题: DataSciences版 - 机器学习日报2015年2月楼
机器学习日报 2015-02-17
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1) 【为什么Ray Kurzweil的垃圾科学理论能够骗人?】 by @王威廉
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什么是垃圾科学?为什么Ray Kurzweil的垃圾科学理论能够骗人? 文/ @王威廉 [1]
[1] http://weibo.com/p/1001603811157545745463
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俺在宾大的导师梅维恒(Victor Mair)对羊年的译法可能最为特别:Year of the
ovicaprid。他主张“羊”是在青铜时代从草原地... 阅读全帖
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