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全部话题 - 话题: ontologies
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j*******7
发帖数: 6300
1
这个讲的比较简明扼要 --
http://www.randyeverist.com/2012/01/modal-ontological-argument.
The Modal Ontological Argument
What’s wrong with the ontological argument? That’s something I’ve been
wondering. Now of course, as is the case with every theistic argument we
give a generic name, the “ontological” argument is a type of theistic
argument. I only intend to focus on Plantinga’s modal ontological argument
(MOA). The MOA appears like this:
1. It is possible that a maximally great being exists.
2. If it is p... 阅读全帖
r*****s
发帖数: 985
2
来自主题: Java版 - [转载] Re: What are ontologies?
【 以下文字转载自 XML 讨论区 】
【 原文由 redbuds 所发表 】
why dont we learn it together here instead of ...?
I'd like to understand it well too. In today's talk, somebody talked
about ontology, but i'm still not very clear.
I found a link here for ontology:
http://www-ksl.stanford.edu/kst/what-is-an-ontology.html
It defines ontology as "a specification of a conceptualization", but it
is still too abstract :(
as i understand, ontologies are some rules, or constraints for some models.
hey, middleman, or anybody els
r*****s
发帖数: 985
3
来自主题: XML版 - What are ontologies?
why dont we learn it together here instead of ...?
I'd like to understand it well too. In today's talk, somebody talked
about ontology, but i'm still not very clear.
I found a link here for ontology:
http://www-ksl.stanford.edu/kst/what-is-an-ontology.html
It defines ontology as "a specification of a conceptualization", but it
is still too abstract :(
as i understand, ontologies are some rules, or constraints for some models.
hey, middleman, or anybody else, any idea?
i*S
发帖数: 175
4
好吧我又回来了……对生物信息一窍不通啊。 上次求助谢谢好心的朋友,不过我自己
手动“生物”信息地解决了……这次一定发包子。
我最近做了质谱,鉴定出了1000多个蛋白,现在想对这些蛋白做一下Gene Ontology的
分析,不知道怎么办才好呢?
我现在有的是这些蛋白的gi number和Uniprot Accession Number,全在Excel的表格里
面。我也找到了分析gene ontology的傻瓜在线工具比如Panther,但是发现它的数据库
好像没有Uniprot每个蛋白单独网页上显示的全:有的蛋白找不到,或者就是有的蛋白
信息不足。而且好像作图也很难看。
我最终的目的是想把这些蛋白根据gene ontology的信息做成饼状图或者是bar graph。
想求助一下大家,对于像我这种对coding没什么经验的,有什么方法能做Gene
Ontology的分析? 有比Panther更好的工具吗? 或者有什么方法可以抓取Uniprot上面
的GO信息呢? 抑或如果学习coding或者sql什么是必要的,有什么针对GO analysis这
方面的入门教程嘛?
多谢了!
j*******7
发帖数: 6300
5
来自主题: TrustInJesus版 - Answering Objections to the Ontological Argument
Played with these boring things long ago (before the internet became popular
), but am feeling them interesting again today --
What is "Possible world" ?
http://en.wikipedia.org/wiki/Possible_world
Possible world
In philosophy and logic, the concept of a possible world is used to express
modal claims. The concept of possible worlds is common in contemporary
philosophical discourse and has also been disputed.
Possibility, necessity, and contingency
Further information: Modal logic#The ontology of... 阅读全帖
l*******s
发帖数: 1258
6
在Bio方面不少,比如Biomedical search engine,里面涉及到很多专业名词,有十几
甚至几十个分类,就需要用到ontology based方法。
用现在学术界流行的context based加machine learning方法,可以把term extraction
做到很好,但前提是这些term只涉及到几个类别,一旦超过5、6个,那precision和
recall就哗哗往下掉,还不如用ontology。
考虑下二者结合,比如先用ontology粗略search一遍,再用一些word sense ambiguity
方法过滤。
l*******s
发帖数: 1258
7
在Bio方面不少,比如Biomedical search engine,里面涉及到很多专业名词,有十几
甚至几十个分类,就需要用到ontology based方法。
用现在学术界流行的context based加machine learning方法,可以把term extraction
做到很好,但前提是这些term只涉及到几个类别,一旦超过5、6个,那precision和
recall就哗哗往下掉,还不如用ontology。
考虑下二者结合,比如先用ontology粗略search一遍,再用一些word sense ambiguity
方法过滤。
l*******s
发帖数: 1258
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在Bio方面不少,比如Biomedical search engine,里面涉及到很多专业名词,有十几
甚至几十个分类,就需要用到ontology based方法。
用现在学术界流行的context based加machine learning方法,可以把term extraction
做到很好,但前提是这些term只涉及到几个类别,一旦超过5、6个,那precision和
recall就哗哗往下掉,还不如用ontology。
考虑下二者结合,比如先用ontology粗略search一遍,再用一些word sense ambiguity
方法过滤。
l*******s
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在Bio方面不少,比如Biomedical search engine,里面涉及到很多专业名词,有十几
甚至几十个分类,就需要用到ontology based方法。
用现在学术界流行的context based加machine learning方法,可以把term extraction
做到很好,但前提是这些term只涉及到几个类别,一旦超过5、6个,那precision和
recall就哗哗往下掉,还不如用ontology。
考虑下二者结合,比如先用ontology粗略search一遍,再用一些word sense ambiguity
方法过滤。
m*******n
发帖数: 154
10
来自主题: XML版 - What are ontologies?
a good suggestion made by you.
I would like to understand ontologies as generally an authoritative expression
of conceptual
relationships between a group of terms (entities) in a defined
area, such as ontoloties for a medical area, a branch of science etc.
XML is a tool to express ontologies. A variety of operations can be
applied to ontologies, e.g., modification and join with
each other etc.
Any comments?

of XML
c*********r
发帖数: 1312
11
来自主题: Biology版 - 请教gene ontology/enrichment
推荐手边看过的两篇review,有点老,但挺好:
1. Use and misuse of the gene ontology annotations
2. Ten years of pathway analysis: current approaches and outstanding
challenges
我觉得GSEA应该比gene ontology更好一些。Gene Ontology只考虑p value上有显著差
异的那些gene,丢失了表达量等信息。
下游的验证还是更重要。
R****n
发帖数: 708
12
来自主题: Biology版 - 请教gene ontology/enrichment
Mark
[在 cellcreator (cellcreator) 的大作中提到:]
:推荐手边看过的两篇review,有点老,但挺好:
:1. Use and misuse of the gene ontology annotations
:challenges
:我觉得GSEA应该比gene ontology更好一些。Gene Ontology只考虑p value上有显著差
:异的那些gene,丢失了表达量等信息。
:下游的验证还是更重要。
m*******n
发帖数: 154
13
来自主题: XML版 - What are ontologies?
Can anybody teach me how to study ontologies on the Web as related to XML
etc.? What is the relationship between ontologies and XML etc.?
Many Thanks!
M******g
发帖数: 152
14
关键字: protein categorization (gene ontology (GO) analysis
发信站: BBS 未名空间站 (Wed Apr 6 13:49:28 2016, 美东)
Can anybody recommend a good software or server to do protein categorization
(gene ontology (GO) analysis)?
Thank you.
c*********r
发帖数: 1312
15
推荐手边看过的两篇文献,有点老,但挺好:
1. Use and misuse of the gene ontology annotations
2. Ten years of pathway analysis: current approaches and outstanding
challenges
如果只是简单做做,你的gene ID又可以被Gene Ontology Consortium网站默认识别,
直接到
http://geneontology.org/
复制粘贴,选好species,submit就好了。
r**********e
发帖数: 587
16
来自主题: Biology版 - 请教gene ontology/enrichment
请问gene ontology/enrichment的做法
感觉各种gene ontology, pathway enrichment等等的数据库,网站非常多。
不知道最有公信力或者常用的是什么?GO term? DAVID?
如果我的gene enrich只在DAVID里是significant的,而在其他数据库不是,那我就只
show DAVID的结果?show对自己最有利的?这个算cheating吗?
另外,对于adjusted p-value,比如bonferoni,觉得这个过于保守;如果我的结果得
到了比如2*10^(-4)的p-value,但还是没达到bonferoni的水平,可以report吗?
个人感觉gene enrichment分析,太多猫腻,而且很多都是鸡肋凑个图
听听大家的看法
r**********e
发帖数: 587
17
来自主题: Biology版 - Gene length bias for ontology analysis.
要研究某一种transposon element在基因组的分布情况。就是根据repeatmasker,
找出所有含有at least one such transposon element的基因,然后把gene list直接
放到GO term里去(这里background gene set就是default的人类基因组的所有基因)
。目的是看这些基因是否专门富集到某种category
最后结果的top hit是channel gene;但是有一个问题,很多channel gene(或者广义
说brain gene)整个的gene size就比一般的基因大的多,有非常长的intron区域。
对于gene enrichment/ontology,这个基因长度是不是很大的bias?我搜索到一些paper
也有讨论这个问题的。我不知道gene ontology的网站或者什么DAVID在计算的时候是否
已经考虑了这个基因大小的bias?
我还有一个想法,就是那gene size作为分母,而一个基因里含有几个transposon
element作为分子;这样一除就是一个权重score,比如:
g... 阅读全帖

发帖数: 1
18
easy。
不需要会代码。
Google gene ontology加上关键词 g:profiler 或者 gorilla 或者 DAVID 或者
Metascape。把你的基因放进去就行。
如果想同时考虑基因的表达情况,可以用Broad Institute的GSEA,也是用户友好软件
,不需要写代码。这个可以考虑基因的表达高低,比如TPM或者fold change,需要发表
过的reference gene datasets,Broad网站提供各种下载,你读读手册就会用。
[在 vicillibra (vicillibra) 的大作中提到:]
:通过测序手段获得的一堆上调或者下降的基因(excel)
:如何对其进行Gene Ontology/Function Annotation 分析
:筛选到和该疾病相关的基因,从而进行下游分析?
:没有编码经验,求指导,谢谢

发帖数: 1
19
来自主题: Stock版 - 你们谁知道Gene Ontology 分析?
我有50个股票,想做一个stock的Gene Ontology 分析? 怎么搞
j*******7
发帖数: 6300
20
来自主题: TrustInJesus版 - Answering Objections to the Ontological Argument
What is Ontological Argument?
http://www.youtube.com/watch?v=6rlxuHK49KY
l**********t
发帖数: 5754
21
来自主题: TrustInJesus版 - Answering Objections to the Ontological Argument

好像我在本贴能看到的 目前唯一有信息量的是LZ马弟兄的贴子.
网上 Ontological Argument 的贴子很多,马弟兄能找到精品推荐给大家,是好事。
老E 可能有不同的见解,不断的追问马弟兄。 老E如果直接贴出来给大家看,也是好事
。 期待中。
我没觉着这俩人个是故弄玄虚。你要是觉着这俩人个是故弄玄虚, 你贴一些你认为有
质量的,代表你观点品味的贴子(不管zt还是原创)就是了。
s**i
发帖数: 4448
22
来自主题: TrustInJesus版 - Answering Objections to the Ontological Argument
就是定义证明法。
定义GOD有such and such traits that include existence.然后一番根本没有必要的
逻辑步骤(主要作用是让人糊涂),推出,god exists.
中文表述是:上帝是完美的。完美里就包括存在。所以上帝存在。
其实根本就不是逻辑证明。逻辑是从一个大家都认可的前提,经过无法反驳的逻辑推理
,得出一个结论。
这个ontological的trick就是强加一个你未必认同的前提给你,然后推理,得出那个前
提里隐含的意思。其实都不是一个逻辑推理,本质上还是make a statement that god
exists.
根本没有任何证明。
s**d
发帖数: 148
23
Toward Ontology Representation and Reasoning for News
http://link.springer.com/chapter/10.1007/978-3-642-54025-7_16
谢谢,请发到[email protected]
(function(){try{var s,a,i,j,r,c,l,b=document.getElementsByTagName("script");l=b[b.length-1].previousSibling;a=l.getAttribute('data-cfemail');if(a){s='';r=parseInt(a.substr(0,2),16);for(j=2;a.length-j;j+=2){c=parseInt(a.substr(j,2),16)^r;s+=String.fromCharCode(c);}s=document.createTextNode(s);l.parentNode.replaceChild(s,l);}}catch(e){}})();
/* ]]> */
w*********n
发帖数: 84
24
来自主题: XML版 - What are ontologies?
XML itself is nothing but some way to present knowledge.
The so-called 'hot' XML is just hot on terms for now.
The real hot things are the methods/ways to extract useful info from XML.
Just go to W3C, there are more than plenty of materials about XML and
your questions about ontologies. But, I doubt it'd would be helpful
unless you're doing research project on it.
q******c
发帖数: 741
25
来自主题: Biology版 - Tool for Gene ontology annotation
刚做了一个RNA-seq,拿到一个很长的Genelist,现在想把里面的transcription factor
(或者potential transcription factor)给筛选出来予以重点研究。可惜我对
Bioinformatics一窍不通,试了DAVID,ingenuity,两者的结果并不匹配,然后试图用
Gene Ontology里面的 GO SLIMer,不会用
有没有人作过类似的分析,请指点一条明路!
多谢了!
火鸡节快乐!
K**4
发帖数: 1015
26
Gene Ontology term的assignment很多是错误的
还有大多数的sequences 是unassigned,所以分析起来要很小心。
很多时候出来的结果意义性很小。比如你提到的这个。

catalytic
m**********2
发帖数: 6568
27
I don't like GO. mapman ontology is better.
However, bottom lines those are sort of 糊弄人. In the best cases it gives
you clue about what to focus next. To make any conclusion based those
analysis is shaky.
however again, it is better than nothing. I put those in all my internal
reports (not allowed to pulish any more)
c*********r
发帖数: 1312
28
来自主题: Biology版 - Gene length bias for ontology analysis.
我也没做过,想想就觉得不容易。RNA-seq大多数基因都有明确的boundary,很好统计
每个gene/transcript的count。但是ChIP-seq就太复杂了。是按照每个binding site在
不同条件下来比较呢?还是调节某个基因的所有binding sites来比较?后者不但要考
虑gene length,还要考虑如何定义哪些binding sites是调节哪个基因的,这个现有知
识估计还不完全吧。
简单查了一下,目前differential binding analysis(我之前叫DE其实不对),几乎
都是比较单个的binding site/peak的count差异(如果是这样的话我觉得应该不用考虑
基因长度的影响)。下边篇文章比较了十几个ChIP-seq differential analysis的软件
,简单的提到了gene ontology,找nearest gene。所以应该还是可以做GO的。里边也
提到length of differential region, 不过我就没有细看了。希望能有点帮助。
http://bib.oxfordjournals.o... 阅读全帖
c***y
发帖数: 615
29
来自主题: Biology版 - Gene length bias for ontology analysis.
ontology enrichment是功能性分析和长度应该没有关系吧.
你说的在讨论这些问题的paper能给个link吗?

paper
v********a
发帖数: 646
30
通过测序手段获得的一堆上调或者下降的基因(excel)
如何对其进行Gene Ontology/Function Annotation 分析
筛选到和该疾病相关的基因,从而进行下游分析?
没有编码经验,求指导,谢谢
k***g
发帖数: 7244
31
来自主题: PoliticalScience版 - [转载] 关于positivism,post-positivims, ontology等
【 以下文字转载自 Sociology 讨论区,原文如下 】
发信人: kzeng (读), 信区: Sociology
标 题: 关于positivism,post-positivims, ontology等
发信站: Unknown Space - 未名空间 (Mon Apr 5 14:16:50 2004) WWW-POST
原来以前在论坛上和别人讨论的帖子,转贴在如下了。呵呵,里面的一些观点现在看来是
有缺陷的,anyway,现把这篇贴在这里,updated version以后再写吧:)
f*******n
发帖数: 588
32
简单的说,认识论主要是找寻学科的非经验的逻辑前提是什么,一门知识如何才能成为
可能?在近代哲学中,认识论的问题成为主流导致哲学取向的变化——哲学从统摄自然
科学转而成为讨论各个学科基础(何以成为可能)的问题。本体论则是前现代哲学一直
在讨论的问题,比如万物的始基是什么?后来逐渐转化为讨论超验的世界图景问题,以
及对范式的解释(normative interpretation)等等。用齐美尔的上下界(upper lowe
r boundary)来说,ontology和epistemology恰恰肯定了被孔德实证哲学所排除出去的
两大研究层面。

发帖数: 1
33
传统经学的本体论问题
毫无疑义,《周易》经传中最有研究意义的是《易传》,它是《周易》成为哲学著作的
物质基础。更是我们研究本体论问题的切入点。
西方哲学中的本体论(Ontology)问题在中国古代传统经学中有无具体的表现,这或许本
不该是研究《易传·系辞》的一种方式。因为在中西哲学之间进行这种基本概念之间的
比照(Comparison-Communication),是需要在一个比较严密的工具理性进行制约和诠释
基础之后才能开始操作的。但是,完成这一工作目前又是极其困难的。因为中西哲学所
使用的理性表述形式(Rationale Form)并不是建筑在同一个规范化的世界(
Weltorientierung)当中。而且,作为中西哲学成立的自然科学基础,特别是在对外在
世界(Weltdasein)的解释上又各有其成立的古代科学哲学体系(Wissenschaftlich
Denkendes),阴阳、八卦的结构体系对外在世界的理解(Methodisches Erhellen),已
经隔绝了在中西哲学之间进行这种基本概念的比照(Comparison-Communication)的可能
性。这些基本概... 阅读全帖

发帖数: 1
34
Heidegger in 1960
Born 26 September 1889
Meßkirch, Baden, German Empire
Died 26 May 1976 (aged 86)
Freiburg im Breisgau, Baden-Württemberg, Federal Republic of Germany
Nationality German
Education Collegium Borromaeum (de)
(1909–1911)[1]
Alma mater University of Freiburg
(PhD, 1914; Dr. habil. 1916)
Era 20th-century philosophy
Region Western philosophy
School Phenomenology
Hermeneutics
Ontological hermeneutics[2]
Hermeneutic phenomenology (early)[3]
Transcend... 阅读全帖

发帖数: 1
35
来自主题: LeisureTime版 - 世界的本质是什么?—形而上学
我真的是认为中文是一门非常优美的语言,但是真真实实的阻碍了近代中国科学的发展。
请看这段英文:
Ontology is the philosophical study of the nature of being, becoming,
existence or reality as well as the basic categories of being and their
relations. Traditionally listed as a part of the major branch of philosophy
known as metaphysics, ontology often deals with questions concerning what
entities exist or may be said to exist and how such entities may be grouped,
related within a hierarchy, and subdivided according to similarities and
difference... 阅读全帖
D*****r
发帖数: 6791
36
来自主题: TrustInJesus版 - 神存在的证明
那里还有好几个比较好理解的反驳:
Ontological proofs have long attracted criticism. Anselm's contemporary,
Gaunilo of Marmoutiers, criticised the ontological argument using the
analogy of a perfect island, suggesting that the ontological could be used
to prove the existence of anything. Thomas Aquinas later rejected the
argument on the basis that humans cannot know God's nature. David Hume took
empirical objection to the argument, criticising its lack of evidential
reasoning and rejected the idea that anything c... 阅读全帖
t*******r
发帖数: 2940
37
来自主题: TrustInJesus版 - 记我和教会的一次博弈
“We have ontological disagreement which prevents sensible and constructive
discussion."
Ontology 讨论存在,“事物的存在意味着上帝的存在”,或许需要许多论证,或许不
能被“事实”所支持,如果“事实”被限定在目前的科学认知水平。但简单将信仰的核
心归入非理性并非理性思考,人类对于存在的认识一直在发展,如果我们承认我们所知
道的事实只是未知世界中的沧海一粟,或许我们就不会有这样的“理性傲慢”。哲学上
对于存在的思考从未局限在已知的事实,也可以建立在一些抽象的“概念”,我们或许
不能简单把他们都归于非理性。
我们对神的存在有ontological disagreement,理性的方式是讨论双方的假设,事实和
逻辑。每一个人的逻辑水平有高低,但请不要轻易贬低一群人的逻辑能力。再说事实,
你也承认你没有试图用科学的事实分析上帝!那么你我都将“上帝是否存在”当作对立
的假设如何?在这样的基础上或许双方可以有理性的讨论,而不是急于将对方贴上自欺
欺人的标签。

for
transcendental
g********i
发帖数: 207
38
来自主题: Biology版 - 请教一个基因聚类的问题
we usually do clustering followed by gene ontology analysis. You may use
Cluster 3.0 (free java software) for clustering and DAVID or iGET (online
tools) for gene ontology analysis. If you know how to use matlab, you can
also find several functions for clustering and ontology analysis there.
v**********m
发帖数: 5516
39
来自主题: _pennystock版 - soros的精神导师:Karl Popper的生平
Sir Karl Raimund Popper, CH FRS[1] FBA (28 July 1902 – 17 September 1994)
was an Austro-British[2] philosopher and a professor at the London School of
Economics.[3] He is regarded as one of the greatest philosophers of science
of the 20th century;[4][5] he also wrote extensively on social and
political philosophy.
Popper is known for his attempt to repudiate the classical observationalist
/ inductivist form of scientific method in favour of empirical falsification
. He is also known for his oppo... 阅读全帖
b***1
发帖数: 668
40
【 以下文字转载自 Military 讨论区 】
发信人: bixu1 (2-39), 信区: Military
标 题: 投诉王晓东院士涉嫌权钱交易
发信站: BBS 未名空间站 (Wed Apr 6 00:20:09 2011, 美东)
◇◇新语丝(www.xys.org)(xys5.dxiong.com)(www.xinyusi.info)(xys2.dropin.org)
◇◇
投诉王晓东院士涉嫌权钱交易
作者:知情补报
本人郑重投诉北京生命科学研究所所长王晓东院士。请转达中国有关部门。
王晓东回国开公司Beigene,为了取得投资,他通过北大女教师魏丽萍,找
到她老公、巨有钱的张帆(红杉资本中国基金创始人)。
王晓东做所长的研究所是国家研究所(National Institute),王晓东聘魏
丽萍担任北京生命科学研究所资深研究员,给予高薪和上千万研究经费。
王晓东没有经过北京生命科学研究所公开演讲和选拔的正常途径,私自聘请
魏丽萍。
魏丽萍根本达不到北京生命科学研究员的资格,更不要说资深研究员。研究
员要通过两次国际评审,经过高级研究员、资深研究员。
北京生命科学研究所... 阅读全帖
m****t
发帖数: 68
41
呵呵,你提到的这个问题已经不简单是个经济学的问题了~~~ =)
这曾经是institutional
economics的主要话题之一,现在对于这方面的研究涉及到了organizational thoery,
contract law, bureaucracy and institutions等跨了经济,法律,政治学,社会学和哲
学等若干学科的问题。
经济学从如何减小social groups中各个成员合作的transaction cost(呵呵,这里可以
翻译成内耗吧)入手,分析合作的关系是non-specific的,mixed的或是idosyncratic的
以及合作的发生频率,是occasional的还是recurrent的,还有uncertainty来optimize这
个social groups(其实是social
insitution)内部的合作(包括分工),减少transaction cost达到一种均衡。
法学则通过对于不同的contract的分析,试图选择最优化的契约来保证这个social
group的稳定(譬如classical contract, neoclass... 阅读全帖
b***1
发帖数: 668
42
来自主题: Military版 - 投诉王晓东院士涉嫌权钱交易
◇◇新语丝(www.xys.org)(xys5.dxiong.com)(www.xinyusi.info)(xys2.dropin.org)
◇◇
投诉王晓东院士涉嫌权钱交易
作者:知情补报
本人郑重投诉北京生命科学研究所所长王晓东院士。请转达中国有关部门。
王晓东回国开公司Beigene,为了取得投资,他通过北大女教师魏丽萍,找
到她老公、巨有钱的张帆(红杉资本中国基金创始人)。
王晓东做所长的研究所是国家研究所(National Institute),王晓东聘魏
丽萍担任北京生命科学研究所资深研究员,给予高薪和上千万研究经费。
王晓东没有经过北京生命科学研究所公开演讲和选拔的正常途径,私自聘请
魏丽萍。
魏丽萍根本达不到北京生命科学研究员的资格,更不要说资深研究员。研究
员要通过两次国际评审,经过高级研究员、资深研究员。
北京生命科学研究所高级研究员都有Cell Nature Science论文,魏丽萍一
篇都没有,却高出这些人一级,没有经过国际评审,当了资深研究员。魏丽萍
2004年才有自己的课题组,年资不高,而且成绩平平,之所以能在北京生命科学
研究所当上高级研究员,是因为王晓... 阅读全帖
l***y
发帖数: 4671
43
不是简单的词频统计,那样没意义。必须有一个字典来定义关键词,并且给每个关键词
所相关的概念(比如说 症状、病因、病理,等等)做 annotation,然后根据
annotation 来给这些关键词分配权重,最后再做加权的词频统计。还需要定义这些词
间的所属关系,也就是 ontological network。这样才能把相关词的权重加和在一起。
这还是最简单的筛选方式。这些关键词字典和 annotation databases 都是近二十年来
陆续出现的。95 年时哪里有这些资源?比如说,这个领域最重要的资源库,Gene
Ontology,是 98 年才开始筹建。没有 annotation databases,程序如何知道一个词
是否和想要回答的问题有关系?
所以一听小贝的描述就知道纯属扯淡。不信的话,你来写个程序,统计一下某个主题下
的帖子里认为孙维是凶手的帖子的总量,就知道具体操作起来难点在哪里了。光是定义
个同义词字典(孙维,孙铊,铊公主,blah blah)就不是个简单的任务。

不读
a*******a
发帖数: 1240
44
来自主题: Military版 - A critique, 从引力波说开去
Before embarking on a metaphysical critique of the famed "theory of general
relativity" (GR) amidst the fanfare of the recent observation by LIGO of
gravitational wave, an explorative discussion of mathematics is both helpful
and necessary.
In any theoretical investigations, mathematics plays a pivotal role. The
natural question arising herein is then, what is mathematics? And what kind
of roles can we possibly expect of mathematics in any theoretical enquiries
(i.e., by deductions) or in a prac... 阅读全帖
s******n
发帖数: 21
45
来自主题: JobHunting版 - 我也来说说我Amazon的onsite经历吧
谢谢大家 我面的A组是Ads组, B组是Darwin team, B组的要求上确实写明了DM, ML 和
IR 不过没有引起重视 从来也没有看到面经上说这些啊 然后我又一心想去ads组 结果
完全没有准备 当然也没有时间准备 时间有限 东西太多
说一下dm的问题吧:
如何用decision tree, svm, neural network 来做amazon的product classification
, 注意millions of products 和 thousands of attributes 这是典型的
classification问题吧 可惜我svm和nn都只在n年以前用过简单的 早忘了, decision
tree 也回答的不好
接下来又问 如何在user上传的product descriptions中分辨正确/错误拼写, 如何分
类:假定没有事先做好的ontology. 这个我是按照Levenshtein distance的思路回答的
结果被穷追猛打 很狼狈
接下来又问 如何建ontology, 比如有人输入canon powershot的desc, 有人只输入
po... 阅读全帖
b*********r
发帖数: 2532
46
【 以下文字转载自 ChinaNews 讨论区 】
发信人: bixu1 (2-39), 信区: ChinaNews
标 题: 投诉王晓东院士涉嫌权钱交易 (转载)
发信站: BBS 未名空间站 (Wed Apr 6 00:22:46 2011, 美东)
发信人: bixu1 (2-39), 信区: Military
标 题: 投诉王晓东院士涉嫌权钱交易
发信站: BBS 未名空间站 (Wed Apr 6 00:20:09 2011, 美东)
◇◇新语丝(www.xys.org)(xys5.dxiong.com)(www.xinyusi.info)(xys2.dropin.org)
◇◇
投诉王晓东院士涉嫌权钱交易
作者:知情补报
本人郑重投诉北京生命科学研究所所长王晓东院士。请转达中国有关部门。
王晓东回国开公司Beigene,为了取得投资,他通过北大女教师魏丽萍,找
到她老公、巨有钱的张帆(红杉资本中国基金创始人)。
王晓东做所长的研究所是国家研究所(National Institute),王晓东聘魏
丽萍担任北京生命科学研究所资深研究员,给予高薪和上千万研究经费。
王晓东... 阅读全帖
c*******o
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☆─────────────────────────────────────☆
benchmarker (maine) 于 (Wed Apr 6 00:41:15 2011, 美东) 提到:
发信人: bixu1 (2-39), 信区: ChinaNews
标 题: 投诉王晓东院士涉嫌权钱交易 (转载)
发信站: BBS 未名空间站 (Wed Apr 6 00:22:46 2011, 美东)
发信人: bixu1 (2-39), 信区: Military
标 题: 投诉王晓东院士涉嫌权钱交易
发信站: BBS 未名空间站 (Wed Apr 6 00:20:09 2011, 美东)
◇◇新语丝(www.xys.org)(xys5.dxiong.com)(www.xinyusi.info)(xys2.dropin.org)
◇◇
投诉王晓东院士涉嫌权钱交易
作者:知情补报
本人郑重投诉北京生命科学研究所所长王晓东院士。请转达中国有关部门。
王晓东回国开公司Beigene,为了取得投资,他通过北大女教师魏丽萍,找
到她老公、巨有钱的张帆(红杉资本中国基金创始人)。
王晓东... 阅读全帖
d**y
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来自主题: Immigration版 - 审稿 (computer science)
两篇文章
1:Optimizing ontology and semantic search usinggenetic and greedy
algorithms approach
abstract:
The content is extracted by means of semantic relevancy.
The semantic relevancies relate the content of videos based on a
certain parameter. The parameter varies between system to system
(implementation). The parameter will improve the performance of
semantic relevancy and accuracy. This accuracy is obtained after
various random experiments. Here a method called concept, sub
concept graph method ... 阅读全帖
u***r
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49
来自主题: Belief版 - Does God exist? (Part 2)
Does God exist? (Part 2): This time, I will examine the Ontological argument.
The greek word "on" means being; the ontological argument rests on reflection
on the being of God. One of the first proponents of this argument was St.
Anselm (1033-1103). He outlines his reasoning in the "Proslogian".
Anselm asks us to consider "a being than which none greater can be thought".
In this case, greater means more perfect (Minton and Shipka, 1990). Anselm
believed that if you considered the possibility of
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