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全部话题 - 话题: networkx
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L***s
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p**o
发帖数: 3409
2
不知道版上有没有用Python做科学计算的同好,
本人近日在带Lion的新MBA上安装Python科学计算包遇到了困难,
现把失败经历小结如下,希望后来人不要重走弯路,
如果能为本人指出一条“正路”就更感谢。
尝试1. MacPorts
macports是我第一个试的,下面这些包可以通过编译:gnuplot libsvm py27-numpy
py27-scipy py27-matplotlib python27-doc py27-sympy py27-ipython py27-
networkx py27-pymc py27-django py27-libdnet py27-lint py27-mysql py27-pip
py27-ply py27-pygraphviz py27-pyrex py27-rpy2 py27-scientific py27-sqlite
py27-svn py27-tables py27-tornado igraph py27-igraph py27-numexpr py27-pp
py27-cython py27-psyco py27-twisted... 阅读全帖
L***s
发帖数: 1148
3
来自主题: Programming版 - 请推荐最好的C++/Java/Python开源代码
说说Python的。
如果对图算法感兴趣,可以读读NetworkX,代码简洁,文档详尽,适合教学
http://networkx.github.io/
m***r
发帖数: 359
4
来自主题: Programming版 - Python日报 2015年2月楼
Python日报 2015-02-09
@好东西传送门 出品, 过刊见
http://py.memect.com
订阅:给 [email protected]
/* */ 发封空信, 标题: 订阅Python日报
更好看的HTML版
http://py.memect.com/archive/2015-02-09/short.html
1) 【Python的正则式表达速查图】 by @安全_linso
关键词:基础, 正则表达式
这Python的正则式表达图不错哟[好棒]
长微博图:http://ww3.sinaimg.cn/large/005TSTNXjw1ep1z5qu40ej30ce0qowi9.jpg
2) 【网络编程包networkx的使用】 by @MachineLearning_python
关键词:数据科学, 博客, 图分析, 网络
发表了一篇转载博文《[转载]python下的复杂网络编程包networkx的使用(摘抄)》 [
1]
[1] http://blog.sina.com.cn/s/blog_9f47c51d0102vbk3.html?ref=wei... 阅读全帖
m***r
发帖数: 359
5
来自主题: Programming版 - Python日报 2015年3月楼
Python日报 2015-03-18
@好东西传送门 出品, 过刊见
http://py.memect.com
订阅:给 [email protected]
/* */ 发封空信, 标题: 订阅Python日报
更好看的HTML版
http://py.memect.com/archive/2015-03-18/short.html
1) 【用Gensim+networkx做文本主题抽取和可视化】 by @爱可可-爱生活
关键词:工具, 库, 数据科学, 应用, IPython, 机器学习, 可视化, 图分析
[IPN]《Topic Modelling》 [1] Python下用Gensim+networkx做文本主题抽取和可视化
的ipn,很不错。其实是上次《The Art of Literary Text Analysis》http://weibo.com/1402400261/C8tDOETWf )系列中的一篇,估计好些朋友只转发或收藏还没顾上看,单独推荐下
[1] http://nbviewer.ipython.org/github/sgsinclair/alta... 阅读全帖
J**D
发帖数: 230
6
builder已经给pre-wired了,看了下控制盒那里,电源没给接上,变压器放了一边。
暂时不想用ADT之类的安全service,请问怎么自己激活系统啊?有安装或激活的公司或
组织吗?
非常感谢。
s****a
发帖数: 9912
7
你用谁家的系统,都会给你CUSTOMIZE安装的,BUILDER这个就是想让你
买他们指定公司的服务,不吊戏,要求他们全给撤掉
J**D
发帖数: 230
8
雪妈,请问“不吊戏”是啥意思?看三遍都没看懂。
谢谢
J**D
发帖数: 230
9
builder给pre-wire了。
但是控制箱那里没给接上电,变压器放着没连。
请问怎么连啊?有负责连的吗?其实很简单,就想要个门开了有叮咚的声音,窗门被砸
了能报警。
不需要ADT之类24小时监控,连警局的那种收费服务。
谢谢大家了。

发帖数: 1
10
现在有一个networkx格式的图(graph),它有293,118个节点的,用matplotlib.pyplot
和nx.draw_networkx 画这个图画不出来, 不知道是不是图太大的原因。
怎么才能把这个图画出来?大伙做过这个吗?
谢谢。
n******g
发帖数: 2201
11
随机抽取10% 节点 画画看吧 点太多了没法画
[在 dailygrind16 (天天绞肉机) 的大作中提到:]
:现在有一个networkx格式的图(graph),它有293,118个节点的,用matplotlib.pyplot
和nx.draw_networkx 画这个图画不出来, 不知道是不是图太大的原因。
:怎么才能把这个图画出来?大伙做过这个吗?
:谢谢。
n******7
发帖数: 12463
12
我就是好奇一下,可能有什么perl的包特别适合某种分析?
用什么主要看自己的爱好了,我是开始学的Perl,后来换的Python,觉得整个世界清静
了...
BioPerl 跟 BioPython 我用到的部分都差不多,很多时候还是喜欢自己实现
另外,这两年做点system biology分析,用NetworkX这个包很好很强大,不知道Perl有
没有
类似的
e*******o
发帖数: 4654
13

我知道的东西,都写出来了。我正在申请Bioinformatics的PhD,实际上没用过BioXXX。
我看了那个NetworkX,不错,说不定哪天就用上了,谢谢。
f**********e
发帖数: 1994
14
numpy + matplotlib + networkX + 几个 sequence mapping 软件 (+ RPy +
mySQL) 基本横扫大部分的日常工作。连 matlab 都可以忽略了。从 Python 里边呼叫
R 可以让你的人生清净很多 ,用 Python 做 preprocessing 比用那些不三不四的语
言舒服多了。
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