b*****s 发帖数: 345 | 1 用这个做dna测序。。。我看还是把心思花在别的,比如nanopore还实际一些 |
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s******s 发帖数: 13035 | 3 CG应该是两块, 一种是整合各种测序仪和技术, 给外面提供服务, 这个
其实做的很不错. 另一方面, 是有自己的测序技术, 这个比较低调, 我有
点记不得了, 可能是read length比较长比较准? 可能做其他测序的辅助,
还是很有好处的. 这两个方面其实都是华大需要的, 一个是自己技术, 一个
是美国市场.
不过, 当年收购CG的时候我们bbs就讨论了, 有这钱还不如投资nanopore,
毕竟技术更新换代太快了, 当然风险比较大.
另外, 前两年惊闻华大研发出自己的测序仪了, 不知道啥牛X的技术, 我就
只看到flyer, 发现技术指标很眼熟, 网上一查和454一模一样. 估计今年华
大又要发明第二代测序仪了,嘿嘿嘿 |
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s******s 发帖数: 13035 | 4 CG应该是两块, 一种是整合各种测序仪和技术, 给外面提供服务, 这个
其实做的很不错. 另一方面, 是有自己的测序技术, 这个比较低调, 我有
点记不得了, 可能是read length比较长比较准? 可能做其他测序的辅助,
还是很有好处的. 这两个方面其实都是华大需要的, 一个是自己技术, 一个
是美国市场.
不过, 当年收购CG的时候我们bbs就讨论了, 有这钱还不如投资nanopore,
毕竟技术更新换代太快了, 当然风险比较大.
另外, 前两年惊闻华大研发出自己的测序仪了, 不知道啥牛X的技术, 我就
只看到flyer, 发现技术指标很眼熟, 网上一查和454一模一样. 估计今年华
大又要发明第二代测序仪了,嘿嘿嘿 |
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c******o 发帖数: 1184 | 5 nanopore 不是想投就能投的
Pacbio 更现实些 |
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h*********r 发帖数: 2844 | 11 我看PacBio最先完蛋吧。都是单分子,long read,但是accuracy高很多。 |
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s****l 发帖数: 10462 | 12 PacBio 难道还在竞争名单上吗?早歇菜了吧。有意思的是Roche竟然跟他签了什么个合
同买断什么来着。Roche眼光绝对有问题。454就买死了,呵呵。 |
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s****l 发帖数: 10462 | 13 要说Illumina老板还是有眼光,买了solexa发了大财。如果ONT成功的话,他居然有15%
的股份。好像好说如果第三家开价买ONT的话,Illumina有优先权同等价格购买。
要看看ONT到底是驴子还是马了。
不过没搞懂,Illumina竟然买Varinata而不是Sequnom |
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s******s 发帖数: 13035 | 15 这个玩意儿好山寨不? 比如改造一下酶, 或者换其他的蛋白一类的. |
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M********r 发帖数: 142 | 16 这么小就能高通量测序?
原理我知道,体积怎么做到这么这么小的?
不贵的话,岂不是每个实验室都能买一个。以后高通量测序会不会变成和QPCR,
western一样的实验,想做就做? |
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s******s 发帖数: 13035 | 17 这个通量比较小的. 而且应该是一次性的吧, 成本比qpcr高的多了.
这个虽然cool, 不过我还没想出来有啥特别的用途, 除了野外或者
没有facility的实验室, 时间要求比较高的? |
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s****l 发帖数: 10462 | 18 通量应该比较小,另外一款的GridIon大些。不过通量跟体积没有关系,都是分子水平
的体积。 |
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M********r 发帖数: 142 | 19 探测器应该很精密吧 能测到很小的电压变化 怎么做成那么小的? |
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s****l 发帖数: 10462 | 20 如果只是测电压的话,一个平方厘米上可以做出几百万的感应器,Ion Torrent就是这
样的。
ONT这个不需要洗液(至少一次性的MinIon如此),所以不需要太大容器来装溶液,Ion
Torrent就需要洗液,所以得有几个大瓶子挂外面,但是Ion Torrent的chip也很小,
两三个平方厘米而已。 |
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s******s 发帖数: 13035 | 21 它这个没这么多. ion torrent是完全电子产品, 像集成电路那么做.
这个我记得低好几个数量级
Ion |
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b****r 发帖数: 17995 | 22 我日,这个太有意义啦。首先按它自己说的,成本,速度,需要的样品两,都极大提高
了。最主要的这玩意是基于单分子而且阅读长度长得多得多。现在的鸟枪技术,漏洞是
很多的,比如重复多一点的地方就几乎map不了。
都这么久了,这次又不给data,我严重认为又是骗人的/!! |
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s****l 发帖数: 10462 | 23 如果ONT所说的都是可以做到的,除了准确度不高之外(这个一定要提高,否则其他再
好都不行了),其他的都是很显而易见的优点。最大的优点就是sample prep简化,说
是只要6个eppendorf管子。将来还要简化成一步即可的sample prep。加上它的快速性
,基本上任何需要快速知道结果的测序工作它都是首选了。另外,长序列在很多时候有
短序列不可替代的优势,比如splicing。 |
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c*******e 发帖数: 5818 | 24 简单看了一下,没太看懂基本原理,谁给简单讲一讲。sample处理完了,nanoball生成
后,用类似microarray杂交的荧光测序,这probe coverage怎么算,要是穷尽,的多少
啊,另外,如用reference genome,这snp怎么测出。 |
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f*******e 发帖数: 628 | 26 nanoball 是 complete genomics 的东西。 |
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f******t 发帖数: 2699 | 27 对repetitive region算是大问题。靠重复测小片段给大片段纠错,跟用illumina的效
果差不多,基本失去了长片段的意义。 |
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s******s 发帖数: 13035 | 28 pacbio的反复测和illumina两个概念. |
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f******t 发帖数: 2699 | 29 你是说它绕圈儿测?还是它用自己的小片段给长片段纠错?Pacbio的10K,大片段比例
太低,准确率也不够,对超长的重复序列基本没用,测基因组还是可以的。 |
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s******s 发帖数: 13035 | 30 绕圈测还是不错的. 不过这pacbio已经死了, idea牛技术跟不上也没用啊 |
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h*********r 发帖数: 2844 | 36 我看PacBio最先完蛋吧。都是单分子,long read,但是accuracy高很多。 |
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s****l 发帖数: 10462 | 37 PacBio 难道还在竞争名单上吗?早歇菜了吧。有意思的是Roche竟然跟他签了什么个合
同买断什么来着。Roche眼光绝对有问题。454就买死了,呵呵。 |
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s****l 发帖数: 10462 | 38 要说Illumina老板还是有眼光,买了solexa发了大财。如果ONT成功的话,他居然有15%
的股份。好像好说如果第三家开价买ONT的话,Illumina有优先权同等价格购买。
要看看ONT到底是驴子还是马了。
不过没搞懂,Illumina竟然买Varinata而不是Sequnom |
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s******s 发帖数: 13035 | 40 这个玩意儿好山寨不? 比如改造一下酶, 或者换其他的蛋白一类的. |
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M********r 发帖数: 142 | 41 这么小就能高通量测序?
原理我知道,体积怎么做到这么这么小的?
不贵的话,岂不是每个实验室都能买一个。以后高通量测序会不会变成和QPCR,
western一样的实验,想做就做? |
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s******s 发帖数: 13035 | 42 这个通量比较小的. 而且应该是一次性的吧, 成本比qpcr高的多了.
这个虽然cool, 不过我还没想出来有啥特别的用途, 除了野外或者
没有facility的实验室, 时间要求比较高的? |
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s****l 发帖数: 10462 | 43 通量应该比较小,另外一款的GridIon大些。不过通量跟体积没有关系,都是分子水平
的体积。 |
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M********r 发帖数: 142 | 44 探测器应该很精密吧 能测到很小的电压变化 怎么做成那么小的? |
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s****l 发帖数: 10462 | 45 如果只是测电压的话,一个平方厘米上可以做出几百万的感应器,Ion Torrent就是这
样的。
ONT这个不需要洗液(至少一次性的MinIon如此),所以不需要太大容器来装溶液,Ion
Torrent就需要洗液,所以得有几个大瓶子挂外面,但是Ion Torrent的chip也很小,
两三个平方厘米而已。 |
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s******s 发帖数: 13035 | 46 它这个没这么多. ion torrent是完全电子产品, 像集成电路那么做.
这个我记得低好几个数量级
Ion |
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b****r 发帖数: 17995 | 47 我日,这个太有意义啦。首先按它自己说的,成本,速度,需要的样品两,都极大提高
了。最主要的这玩意是基于单分子而且阅读长度长得多得多。现在的鸟枪技术,漏洞是
很多的,比如重复多一点的地方就几乎map不了。
都这么久了,这次又不给data,我严重认为又是骗人的/!! |
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s****l 发帖数: 10462 | 48 如果ONT所说的都是可以做到的,除了准确度不高之外(这个一定要提高,否则其他再
好都不行了),其他的都是很显而易见的优点。最大的优点就是sample prep简化,说
是只要6个eppendorf管子。将来还要简化成一步即可的sample prep。加上它的快速性
,基本上任何需要快速知道结果的测序工作它都是首选了。另外,长序列在很多时候有
短序列不可替代的优势,比如splicing。 |
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c*******e 发帖数: 5818 | 49 简单看了一下,没太看懂基本原理,谁给简单讲一讲。sample处理完了,nanoball生成
后,用类似microarray杂交的荧光测序,这probe coverage怎么算,要是穷尽,的多少
啊,另外,如用reference genome,这snp怎么测出。 |
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