f********r
发帖数: 3155 | 1 ms2最近又有货了，ms3有实质改进吗？一直没货呀 |
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z***y
发帖数: 7151 | 2 这个不奇怪啊。
你可以看一看那个procedure, 你看里面有几个对temp table 的改变， 这些数据的改
变都会触发
recompilation。
我这个版本是2008 SP2的。
create procedure sys.sp_replmonitorrefreshagentdata
as
begin
set nocount on
declare @retcode int
,@agent_id int
,@agent_id2 int
,@publisher_id int
,@xact_seqno varbinary(16)
,@logreader_latency int
,@publisher_db sysname
,@publication sysname
-- security check
-- Has to b... 阅读全帖 |
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l****y
发帖数: 398 | 3 我觉得趋势就是上面有人说的，同一个run里， 既做MS1，也做MS2；然后用MS2里几个
比较干净的fragment 的 XIC 来定量. 这要求每个peptide被MS2次数足够多，这样XIC
才有足够多的点来define一个峰。
现在机器比较慢，为了让更多不同的peptide被MS2, 人为的用dynamic exclusion减少
同一个peptide被重复MS2的次数；但也造成没法用fragment 的XIC来定量。
所以未来速度比较快的tof仪器应该会重新流行。 |
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k****o
发帖数: 728 | 4 如果你的peptide比较长，以至于产生很多+3--+5甚至更高的fragment ions，那么无论
对于ETD还是CID，在OT里做high resolution的MS2都更有利。而ETD是有利于high
charge state，long peptide的fragmentation。所以，如果你的样品确实有很多long
peptide的话（你去raw data file，average一段MS1的data就有底了），用OT scan
MS2会让搜索效果更好。你搜索时记得把fragment ions的error window舍得很窄，这样
才起到high resolution的效果。比如10 or 20ppm，或者0.01 m/z，取决于你具体的
accuracy。你可以试试MS2用15000 resolution with 20 ppm error window。
关于省时间的问题。诚然IT确实比OT省时间，如果你用老一代的LTQ Orbitrap，这个确
实是个大concern。但技术在进步，Orbitrap Fusion已经在设计上提供了比过去快得多
的ion transmi... 阅读全帖 |
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w********2
发帖数: 632 | 5 Theoretically, the ion
path of MS2 in QE is q filterting, then HCD frag, then in C trap, then in
OT. Q is very fast at isolation, much better than IT. So theoretically, QE
will have no problem at many MS2 scans. The only bottleneck will be OT.
That was why I was confused before about Fusion. How can it do 20 MS2 with
IT. Now I understand that it must be HCD-Q path. If so, it is basically
working as an QE. Of course, Fusion can do MS3 much faster, because it has
two ITs. But at the MS2 level, I r... 阅读全帖 |
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j*********r
发帖数: 24733 | 6 X-Fi HD plug & Play,只听音乐的话根本不用担心驱动,我觉得这个价格的东东声音都
差不多的.我比过X-Fi HD和HRT MS2+708R+HD600,HRT MS2声音有提升,但不能说很显著,
另外HRT MS2更容易有jitter的问题,升级了firmware也没用.
认真听音乐吧. |
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K******S
发帖数: 10109 | 7 你和我说的不是一回事，MRM还是用Lc的Peak Area，但是有Transitions， 其他的Ms1
Based定量也一般有MS2，要不怎么知道定量的什么东西呢？
但现在你即有Ms1也有Ms2，有的人就用Ms2的Spectral Count定量，有的人还回到Ms1，
用Peak Area定量。 |
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b*******g
发帖数: 1309 | 8 我知道你说的意思
我说的是现在or未来的方法就是把 MRM的transition 直接整合到QTOF里面去，因为
TOFscan的速度越来越快，不再需要MRM那样只scan 一个或两个fragment ion，而是直
接在 MS2里面选择一两个fragment ion。用MS2的 某些 ion的 peak area 来定量，同
时MS2也提供了sequence的信息
另外你说的MS1的信息给我另外一个灵感，哈哈，谢谢。。。。
Ms1 |
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s*****5
发帖数: 52 | 9 40个是用IT做的MS2， peak width在60s左右，但是我们当时只是看最多能做多少MS2，
其实很多MS2 spectrum质量都太低了没有价值了，match不到有效的peptide。DIA还没
试过，不过希望以后能有机会试试，reproducibility肯定比现在好很多 |
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k****o
发帖数: 728 | 10 不要追求多MS2。如果你只ID到+2,+3的peptide，那原因就在于MS2的resolution低了。
大的peptide（大多+4以上）需要用15,000 resolution Orbitrap扫MS2。
尤其是如果你的酶是Lys-C一类single amino acid residue cleavage的，那主要就
digest出large peptide了。而large peptide对于protein ID的命中率也高于small
peptide。 |
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s*****5
发帖数: 52 | 11 On fusion, if use Orbi to do MS2 scan(just as what's going on QE), on
average we got 10-15 MS2 scans, which is definitely slower than using IT to
do the MS2 scan. Another limitation of QE is ETD can't be achieved.Orbi-
Fusion is better in terms of PTM analysis and targeted quantitation than QE.
No doubt that the cost performance of QE is much better than fusion.
in
QE
my |
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f*******9
发帖数: 74 | 12 我们用Orbitrap XL和Elite，一个代谢质谱的样本(MS1/2)，通常可以有5000 +/- 2000
的二级质谱MS2，然后对MS1 precursor ion进行peak identification之后，MS1 + MS2
+ RT的特征通常有>1000 个。
而和标品库对比之后，一般只能找到<50个化合物——这个数量取决于你的标品质量怎
样，覆盖度有多广。50是很高的数值了，我们与Thermo的msCloud标品库比较通常只能
找到个位数的化合物，和MassBank比较，发现的也很少，但我们自己的库，对植物比较
有针对性，就能找到很多。
如果做很多样本，那么能发现的特征就会增加，一倍以上吧。
然后还有很多没有MS2的离子，很多的峰非常明显，离子强度也高，不知道为什么没有
被裂解。实际上我分析过裂解的离子的强度，有相当数量的强度很低，在full scan里
面也不明显，有的甚至看上去是噪音。
不知道各大药厂是怎么利用LC-MS的，特别关心天然产物里面的应用，有谁来讲一讲？ |
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g*****x
发帖数: 3283 | 13
LFQ用的是MS1的intensity进行定量，MS2只起到identification的作用。所以只要
retention time和mass从MS2中得到了确认，就可以从MS1中得到相当完整的intensity
信息。
如果你打算做MS2-based的定量，当然不能用dynamic exclusion。
abundance |
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j*********r
发帖数: 24733 | 14 其实$80可以跳了,CREATIVE很多洲要收税,所以也得$75.
这个声音其实不错,不比HRT-MS2差很多,我用下来不知为什么MS2更容易jitter. |
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O*******e
发帖数: 6055 | 15 我脚得usb麦可以哈。可能是水准还不够把。。哈哈。反正是我不打算升级了。。
我其实也曾经为设备败过，刚来美国的时候喜欢听歌，就上论坛艘耳机。。最后买了 爱丽丝 Alessandro ms2。。耳机售价299刀，加上声卡耳放什么得乱七八糟花了税后600多刀。已经闲置好几年了。。所以现在买设备冷静多了。。差不多的了。。
最近录歌做后期。。没有好耳机。。突然想起来了。。把都是灰的Alessandro ms2给扒拉出来了。。泡沫pad都糟了。。一碰掉渣。。让我干脆把下来扔了。。刚从网上订了个便宜的pad..
所以要冷静。。冷静。。哈哈。。其实当年花了600多刀，没有体会到想象中的效果。。所以冷静还是冷静。。哈哈。
过来人了。。咋整。。 |
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b*******g
发帖数: 1309 | 16 MS2 based quantitation 也是 EIC peak integration，不是spectral count
MS2 的好处就是remove background from other ions，就是QQQ的原理
现在MS accuracy 越来越高，如果是TOF的话，scan速度也在加快，
定量的performance跟QQQ越来越接近（当然现阶段QQQ还是有优势的）
以后的趋势绝对是 qual/quant 一个workflow |
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s*****5
发帖数: 52 | 17 您说的很对，所以我之前试着搞了一个既用HCD-OT又用CID-IT的method,但是发现对
proteomics蛋白数检测提升不多，所以才想着看看能不能把ETD整进来，提高对高电荷
（>=+4)ion的coverage,因HCD/CID不容易碎裂高电荷的ion.不知道您对这个有没有什么
建议~
至于拿Fusion当做QE使，其实主要是data analysis方面有瓶颈，我们一般是做大批量
的label-free(30~40个LC-MS run),如果MS2 scan太多了，data processing就会很困难
. 因为Orbi做MS2 scan速度慢，scan数低，谱图信息也少却更精确，所以才选择这种模
式作为常规检测。自从FUSION出来之后，感觉大部分实验室结果是Ion trap做HCD效果
最好，这也是只有fusion才能实现的。
感觉您是真正的行家，希望有机会可以好好请教，我刚接触Fusion不久 |
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w********2
发帖数: 632 | 18 Insightful answer. I remembered that when Fusion just came out, a Thermo
sales director from UK came to US to help to promote. He told me that Fusion
can do 21 MS2, whereas Orbi Elite can do only about 5 MS2. That confirms
your point.
But with more and more people favor data independent CID, maybe Fusion's
advantage is not so apparent?
Quantiva) |
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w********2
发帖数: 632 | 19 When you do 40 dd MS2,what is the typical peak width (in seconds)? Are you
using Orbi or IT as the detector? Seems to me you can try data independent
MS2, may give you more hits. However, dues to the loss of specificity of
swath, maybe specific search algorithm is needed?
data |
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K******S
发帖数: 10109 | 20 Hz就是个频率的感念,每秒多少个MS2
就可以做MS2的数目和HPLC Retention Time的Plot就可以 |
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w********2
发帖数: 632 | 21 You are right. I used first gen LTQ Orbi, when it was over 3 DDA MS2, the
peak did not show smoothness. Now with third gen, 5-6 may be the maixum. So
I think that UK Thermo sales told me the right thing, 20 MS2 on Fusion with
a certain quality is already pretty good for a peak of 60s. |
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k****o
发帖数: 728 | 22 首先，ETD的optimized reaction time是proportional to 1/z2。ETD有利于high
charge state(CS>=+3)。不知道你的peptide大都是多少CS。对于tryptic peptides，
基本都是+2-+3，所以大多CID比ETD效果好。而现在越来越多地用到其他酶解的peptide
比如Lys-C, Glu-C等产生long peptide，那ETD的优势就很明显了。
Fusion用的软件比前几代仪器在data-dependent MS2的设计上有很多优化。你可以针对
不同的CS设定适合各自的CID或ETD（包括ETD的reaction time)。比如+2只用CID，+3和
+4的用both CID and ETD。高于+4的只用ETD。ETD对+3CS可以用60ms，+4就是60 * (3/
4)2= 34ms。其他对于>+3 CS的ETD time以此类推。
最后，不知道你对于MS2是用IT检测（低resolution)还是Orbitrap FT检测（high
resolution)。后者有利于看清long peptid... 阅读全帖 |
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k****o
发帖数: 728 | 23 看你怎么看了。ETD确实是charge assumption的技术。如果想把precursor全部与ETD
reagent anion反应完，则需要比理论optimized reaction更多的时间，而这也同时带
来使First-generation fragment ions继续与reagent ion react产生internal
fragments和更多的small N- and C-term fragment ions。对于不大的peptide（比如
3000 Da以下的），延长reaction time来提高fragment intensity没什么大问题，因为
靠+1, +2 fragments你就能ID或characterize peptide了。 而对于大的peptide，这
样做会产生internal fragmentation（这些internal fragment你是看不到的，他们“
沉淀”成为MS2 background），会让比较small的terminal fragment ions增多（
signal增强），你只能得到比较好的terminal seq... 阅读全帖 |
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k****o
发帖数: 728 | 24 你说的有道理。不过我们发现OF里IT isolation比传统LTQ sereis仪器里的IT的
isolation差很多。尤其是如果做data-dependent MS2，对于最abundant的ions，IT效
果还可以。但对于low abundant ions的isolation,虽然表观上达到了设定的MSn
target，但实际isolate的量远低于那个target，所以MS2也很差。具体原因我们有自己
的猜测，不好说。不确定是OF本身设计带来的缺陷，还是只是我们的这台有问题。弄了
很久了，不过好在主要用Quad iso。 |
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l*******k
发帖数: 63 | 25 我们是考虑到二硫键scramble这个问题，但是因为做in gel digest，也没有特别好的
办法，正常的PAGE 胶还是照样跑，我只是把所有的反应条件从pH 8 改成了pH 7.0 从
而尝试着减少二硫键重组。我上周去查了MS1，发现有一组condition中的duplicate都
有match的MS1，但是很多MS1都仅仅在其中一组被选中去打MS2而没有再另外一组中打
MS2。但是另外一组比较奇怪的是duplicate中几乎没有什么相同的MS1，这是让我很费
解的一件事情。请您介绍下您的经验好吗？包括二硫键shuffle和打质谱的经验。谢谢！
shuffeling. |
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w***7
发帖数: 1637 | 26 MS2 是Q3 scan
为啥MS2 如果是product ion scan， 需要选定parent ion m/z？ |
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c*****t
发帖数: 520 | 27 你们想批判邓小平，转载文章时好歹把内容转全，不要断章取义。
原文是《龙啸九天—中国核潜艇专家采访录》，发表于《现代舰船》杂志2004年12月下
半月刊。
你们引的内容，是关于1988年我国战略核潜艇试射洲际导弹的总鉴定试验。之前1982年
在常规潜艇上试射洲际导弹成功，然后再此基础上在核潜艇上进行发射试验。1982年和
1988年所取得的成绩，得算是改革开放时期的国防成就吧。
另外该文提到1988年试验结束后项目下马，“一下就是20几年”。但是这个采访是在
2004年进行的，因此“20几年”的说法本身就是夸大其词的。
我把文章链接和相关段落附在后面，大家自己判断吧。
《现代舰船》有关此文的目录链接如下：
http://www.shipnet.com.cn/ms2.htm
新浪网2005年的转载链接如下：
http://mil.news.sina.com.cn/2005-04-06/1045278804.html
相关的段落摘抄如下：
本刊记者：1988年，我国战略核潜艇水下发射洲际导弹成功。您能不能回忆一下当时的
情况和感受？
黄总：88年，核潜艇进行了最后两个大的试验，算是总鉴定。第... 阅读全帖 |
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l****n
发帖数: 768 | 28 选 Ltx ms2
不想用这个的话还是latitude的
我用的cross terrain，感觉一般 |
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S*******i
发帖数: 508 | 29 看了一下review，好像ltx-ms2还不错的。已经在costco下单了。多谢推荐 |
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m*******e
发帖数: 1569 | 30 卢湾ms2,3年前并给黄浦了已经，新天地附近的楼盘15w/平的话倒也正常。
经鉴定你表哥已初步脱离中产，即将迈入土豪圈。
70 |
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j*********r
发帖数: 24733 | 31 Kao,真明显，Laptop+HRT-MS2用foobar2000和defragment就不照了。断了好几次。 |
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r*****8
发帖数: 2697 | 32 这个好像不能算到USB的头上吧, HDD忙于defrag, foobar就读不到数据, 结果当然是
jitter
以前我的音乐都放在SSD上, E17一点压力都没有, 后来我把音乐挪到2nd drive HDD上,
经常有jitter, 恨不得进一个MS2, 听你这么一测试, 看样子还是HDD的局限么 |
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j*********r
发帖数: 24733 | 33 I don't think so, my HDD is just fragmented before test. You can looked at
Amazon frequently for a used MS2. I got mine at $106 shipped, not bad, but
do not see significant improvement over X-FI HD. I think Dota is right.
上, |
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l****6
发帖数: 220 | 34 Call for reviewers for an open review journal in the field of infectious
disease and antimicrobial resistance.
Ms1: Antibiotic Resistance Trends and The ESBL Prevalance of Escherichia
coli and Klebsiella xxxx
Ms2: Aminoglycoside combination therapy for xxxx due to ESBL-producing xxxx
If you are interested, please send me a message with your offical e-mail
address and a list of your pertinent publications.
Thanks! |
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l****6
发帖数: 220 | 35 Call for reviewers for an open review journal in the field of infectious
disease and antimicrobial resistance.
Ms1: Antibiotic Resistance Trends and The ESBL Prevalance of Escherichia
coli and Klebsiella xxxx
Ms2: Aminoglycoside combination therapy for xxxx due to ESBL-producing xxxx
If you are interested, please send me a message with your offical e-mail
address and a list of your pertinent publications.
Thanks! |
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D**********R
发帖数: 25234 | 36 如果我家有人来，那么我要带
1。娃中文书，国内小学教材（这个ms2年后才可能用上。。。）
2。娃中文字卡，大张的。
3。娃的中国传统服饰，不同年龄多几套，nnd上次人家告诉我2岁的比这里4岁的号还大！
4。小件工艺品，送人用。
5。等娃大些，也许带瓷器餐具过来。
6。花椒等等调味品。
7。发卡类的头饰。
8。棉内裤，某个牌子的BRA，好看的袜子
9。棉布的家居服（假定我爸妈的品味不那么雷人或者我有朋友能帮我挑选）
10。taobao上的情侣t恤。
如果有自己的房子，那么装饰品啥的吧，如果孩子上小学或者我上学，那么专业书优先
。 |
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f********m
发帖数: 8405 | 37 看人吧，单身宅男不念书也是打游戏了。念书还能到学校social一下，说不定把个人问
题也解决了。全职的MS2年，兼职的3年。其实很快过。 |
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M*******0
发帖数: 1502 | 38 12/19/2009我也从Botach Tectical order了两个东东，只有它两个都有现货。
Magpul MS2 Multi-Mission Sling
GG&G Standard Front Sling Thing
一个星期前邮件问了一声，回复说查查。昨天又问了一声，没回复。看样子，夜路走多
了，还是会遇到鬼啊！ |
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H****r
发帖数: 16240 | 39 还是我那支pistol
总共下来花钱和正常的AR长枪差不多少:)
但现在觉得这个枪带还是不舒服
背着是两点或者三点式的踏实，端起来的话还是单点式最舒服
——所以，现在我很倾向Magpul那个MS2枪带 |
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H****r
发帖数: 16240 | 40 我在想，Magpul的MS2 sling能不能装在你的AK上。
那东西可以快速从单点变成传统两点式
后面挂环应该没问题，前面可能需要多挂一个钥匙环之类的 |
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H****r
发帖数: 16240 | 42 BUIS你要预算足就上Troy，而且要上那种菱形照门的
预算紧，上MBUS好了
弹匣肯定是PMAG
枪带我推荐Condor CBT Bungee Sling
比MS2便宜一点，也是单点/两点的
当然你还是需要一个类似Magpul ASAP的东西方便左右手切换 |
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l***a
发帖数: 2677 | 43 我就知道turners一个local店，很多东西都没有。今天去买MS2, ASAP，RSA，店小二跟
我说一个都没有。。。 |
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M*********e
发帖数: 3153 | 44 木有MS2，我那鞋带绑了个相机包的尼龙背带
咱也有两点式了 |
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H****r
发帖数: 16240 | 46 因为要出MS3了吧，说修改了一些MS2塑料件磨损的问题
我看midwayusa很早就列出来MS3然后说bakcorder了
这个condor是很朴实好用的东西 |
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f********t
发帖数: 4574 | 47 ms2还是很不错的，1pt和2pt转换非常方便，是magpul的东西里少有的物有所值的东西
，pmag算另一个
外表看起来真的不像gun case。 |
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f********t
发帖数: 4574 | 48 ms2就是有货也至少要四十刀，你这个可以用到很多枪上，划算 |
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t******8
发帖数: 2803 | 49 zippo油壶？刚叫回国的朋友带了两个过来。价格是美国的1/5。。。
不知道淘宝上山寨magpul ms2的单点带质量怎么样。Amazon上近70美元太肉痛了。 |
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t******8
发帖数: 2803 | 50 不知道店家可靠不可靠。搜索magpul ms2，出来的第一家店。
可以货比三家一下。团购的话，我要1根黑色的～ |
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