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全部话题 - 话题: microbiome
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m*****u
发帖数: 15526
1
来自主题: Biology版 - Nature质疑microbiome 研究
哈哈。shit这种词竟然能用到专业文献上?
s********x
发帖数: 472
2
来自主题: Biology版 - Nature质疑microbiome 研究
非常同一,需要深入的机制性研究,具体到某个分子。 而不是简单profile一下菌种,
看看那个pathway被激活。
s********n
发帖数: 1124
3
来自主题: Biology版 - Nature质疑microbiome 研究
生物学研究太强调所谓机制了。在我看来,其实机制没有什么用,整个生命体系有太多
的redundancy,即使证明了某通路sufficient and necessary causal relationship,
也其实球用不管。没有什么是通过唯一一条通路起作用的。
唯一的用处就是发表一堆CNS论文垃圾。
c*********r
发帖数: 1312
4
来自主题: Biology版 - Nature质疑microbiome 研究
今天也看到了这篇Comment,Mark一下。
s********x
发帖数: 472
5
来自主题: Biology版 - Nature质疑microbiome 研究
所谓科学就是要知其然,知其所以然。中国自古没有科学就是因为不求甚解。
microbio躺着发cns的时代必将过去,科学绝大多数时候都是不是用来哗众取宠的。
m******g
发帖数: 467
6
Nature 14.08.21
推荐:
1. Microbiome science needs a healthy dose of scepticism
稍微了解一下:
1. Ribosomal frameshifting in the CCR5 mRNA is regulated by miRNAs and the
NMD pathway
小知识:
1. A microbial ecosystem beneath the West Antarctic ice sheet
2. Secret to Ebola’s success
m******g
发帖数: 467
7
Nature 14.08.21
推荐:
1. Microbiome science needs a healthy dose of scepticism
稍微了解一下:
1. Ribosomal frameshifting in the CCR5 mRNA is regulated by miRNAs and the
NMD pathway
小知识:
1. A microbial ecosystem beneath the West Antarctic ice sheet
2. Secret to Ebola’s success
j****g
发帖数: 406
8
来自主题: Biology版 - FW: Postdoc Position
Postdoctoral Fellow in Immunology
Icahn School of Medicine at Mount Sinai
The laboratory of Sergio Lira at the Icahn School of Medicine at Mount Sinai
seeks motivated, hard-working postdoctoral fellows to study the role of
microbiome and inflammation in intestinal cancer (JEM, 2014; 211:457-472).
The candidate will conduct cutting-edge research utilizing 16S rDNA analysis
, transcriptome arrays, genome modification using CRISPR technology,
microscopy and immunology techniques. A strong backgroun... 阅读全帖
m**i
发帖数: 355
9
来自主题: Biology版 - 求审稿机会 (转载)
【 以下文字转载自 Faculty 讨论区 】
发信人: mimi (虎子的咪咪), 信区: Faculty
标 题: 求审稿机会
发信站: BBS 未名空间站 (Sun Feb 22 11:47:06 2015, 美东)
求审稿机会,请大家帮帮忙。 我搞免疫的,具体方向是 autoimmunity, nutritional
immunology, microbiome.
请站内联系。多谢! 同时给大家拜年了!
b******n
发帖数: 4225
10
Curr Protoc Hum Genet. 2014 Jul 14;82:18.8.1-18.8.29. doi: 10.1002/
0471142905.hg1808s82.
Getting started with microbiome analysis: sample acquisition to
bioinformatics.
Kumar R1, Eipers P, Little RB, Crowley M, Crossman DK, Lefkowitz EJ, Morrow
CD.
Link: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25042718
email: [email protected]
/* */
Thanks a lot!
s****9
发帖数: 932
11
从market上arthritis最大,但是现有药物(anti-TNF,anti-CD20,anti-IL6R)也
比较有效,竞争比较激励。TNF NR机理不清楚。2-3年内,Jak inhibitor的进场,anti
-TNF biosimilar入市,竞争会更激励。
其次是IBD,市场比较大,现有药物remission rate都不高,但是IBD本身比较复杂,很
多是host-microbiom的balance。抑制免疫有时候效果相反。
Lupus现有的药物都不好,但是clinical trial比较难做(variation大)。belimumab
前年approve,但是效果很差,sale也很差。
non-oncology的免疫药物研发以后会越来越难。
c*********r
发帖数: 181
12
来自主题: Biology版 - paper help!
http://www.annualreviews.org/doi/pdf/10.1146/annurev-phyto-0827
Roots Shaping Their Microbiome: Global Hotspots for Microbial Activity
Annual Review of Phytopathology
Vol. 53: 403-424 (Volume publication date August 2015)
DOI: 10.1146/annurev-phyto-082712-102342

发帖数: 1
13
来自主题: Biology版 - paper thanks
Gut microbiome–derived metabolites modulate intestinal epithelial cell
damage and mitigate graft-versus-host disease
http://www.nature.com.sci-hub.io/ni/journal/vaop/ncurrent/full/
c*********r
发帖数: 1312
14
我觉得microbiome可以持续一段时间的热度
测序会在各个领域得到更深入的应用
个人比较喜欢这两个领域,仅供参考。
c****t
发帖数: 194
15
来自主题: Biology版 - Miseq or Ion S5
想做16s rRNA microbiome,不知道谁用过这2个 system?哪个比较好?
m*****e
发帖数: 129
16
来自主题: Biology版 - SCI - 2016
Rank Full Journal Title Total Cites Journal Impact Factor
1 CA-A CANCER JOURNAL FOR CLINICIANS 20,488 131.723
2 NEW ENGLAND JOURNAL OF MEDICINE 283,525 59.558
3 NATURE REVIEWS DRUG DISCOVERY 25,460 47.12
4 LANCET 195,553 44.002
5 NATURE BIOTECHNOLOGY 48,650 43.113
6 NATURE REVIEWS IMMUNOLOGY 31,545 39.416
7 NATURE MATERIALS 72,306 38.891
8 NATURE REVIEWS MOLECULAR CELL BIOLOGY 36,784 38.602
9 NATURE 627,846 ... 阅读全帖
b*********1
发帖数: 1054
17
我觉得是个很有希望的方向,肠道对我们行为,思维,免疫的影响是很明确的。而微生
物平衡对肠道健康的影响是很明显的。不过,如何建立起菌群肠道以及相关疾病或者身
体功能的联系是个难点,普通的动物模型可能并不能反应人体,体外模型就更不能用来
研究这种系统调节了。
p*******1
发帖数: 495
18
这个肠道微生物菌群可以很容易进行人为调节吧,比如我多注射抗生素,或者服用一定
的药物,就可以改变整个肠道微生物的菌群结构,难道我就因此而不健康了或者是更健
康了?
实在不清楚这个东西有多大可靠性?
s******8
发帖数: 2131
19
Jeff Gordon据说被提名今年的诺奖了
w***u
发帖数: 17713
20
免疫和消化营养方面的影响还是很大的。几万年甚至更久进化出来的共生关系,不是想
摆脱就摆脱的。
e*******o
发帖数: 4654
21
这个就是淘金
反正这个地方挖不到,就换个地方。
z********8
发帖数: 818
22

抗生素真的能杀死这些菌。大人的反应没有或小。
但是很多小孩,尤其是婴儿吃了抗生素经常拉肚子,还会红屁股。
b********w
发帖数: 334
23
靠大数据了
变量太多了。
p*******1
发帖数: 495
24
难道生物也学物理,进入到了玄学的阶段???
实在搞不清楚为什么这么人和科研机构都随大流,搞这个东西

发帖数: 1
25
几个月前,我在一个面对很多外行人的场合大骂这研究。。。换作我今天的状态就不会
跟那天那副表现了。。。唉。。

发帖数: 1
26
中国有句激励人心的口号,即为“少年强则中国强”。但现在,中国的年轻男性饱受环
境中各种污染残害,连体内精虫都无一幸免。男性不育症,成了全中国须面对的一个严
重问题。
合格者不到五分之一
湖南一项持续15年,对3万多名申请捐精者进行的有关精液研究报告指出,中国年轻男
性精液质量大幅下滑,去年在湖南捐精的年轻人中,只有不到五分之一的男性精液足够
健康,有资格捐赠。但在2001年,有超过半数申请者合格。
据英国《金融时报》报导,这份发表在美国医学期刊《生育与不孕》的精液研究表明,
中国政府为提升中国出生率所面临的严重障碍,就是年轻男性捐精者的精液质量大幅下
降,而加剧的环境污染可能是造成捐精者精液质量下滑的原因之一。
该项报告的研究人员表示,还没有明确原因能解释捐精者生殖健康为何迅速下滑,但加
剧的水污染、空气污染和食品污染等各种环境污染是可能的原因之一。
世界卫生组织发言人塔里克.贾萨瑞维奇表示,世卫组织目前还不能完全确定什么因素
导致特定国家或多个国家精液质量恶化。他指出,精液质量不一定与男性生育能力直接
相关,男性生殖健康可能受到许多复杂因素影响,包括生活方式、环境及相关疾病。
不过,... 阅读全帖
B8
发帖数: 92
27
The Department of Environmental Sciences and Engineering at Gillings School
of GlobalPublic Health, University of North Carolina at Chapel Hill has a
postdoc opening. We are looking for a self-motivated postdoc to conduct
omics profiling to understand the interactions between the gut microbiome
and diseases/environmental exposures. Our lab has dedicated high-end mass
spectrometers, including Q-Exactive HF Orbitrap and 6550 Q-TOF.
A PhD degree or solid training in analytical chemistry, proteomics... 阅读全帖
c*********r
发帖数: 1312
28
来自主题: Biology版 - 求推荐微生物实验室
http://microbiome.mit.edu/jobs/
Xavier Lab现在还有一个招人广告,不知道还是否有效。
不过我对这几个PI、lab的情况都不了解啊,只是看着牛才考虑过。人品如何实验室氛
围如何,没考察过。不知道版上有没有了解的。
j****n
发帖数: 3370
29
来自主题: Biology版 - 2017 部分 impact factor
microbiome现在这么火
基本就是做测序的
应该会带动不少吧
y******u
发帖数: 1123
30
来自主题: Chemistry版 - 求篇文献,学校下不了
包子答谢
The Pre- and Early Postnatal Microbiome: Relevance to Subsequent Health and
Disease
NEOREVIEWS Vol. 14 No. 12 December 1, 2013
pp. e592 -e599
链接在二楼
email:[email protected]
(function(){try{var s,a,i,j,r,c,l,b=document.getElementsByTagName("script");l=b[b.length-1].previousSibling;a=l.getAttribute('data-cfemail');if(a){s='';r=parseInt(a.substr(0,2),16);for(j=2;a.length-j;j+=2){c=parseInt(a.substr(j,2),16)^r;s+=String.fromCharCode(c);}s=document.createTextNode(s);l.parentNode.replaceChild(s,l)... 阅读全帖
B8
发帖数: 92
31
The Department of Environmental Sciences and Engineering at Gillings School
of GlobalPublic Health, University of North Carolina at Chapel Hill has a
postdoc opening. We are looking for a self-motivated person to conduct omics
profiling to understand the interactions between the gut microbiome and
diseases/environmental exposures. Our lab has dedicated high-end mass
spectrometers, including Q-Exactive HF Orbitrap and 6550 Q-TOF.
A PhD degree or solid training in analytical chemistry or related f... 阅读全帖
c*****o
发帖数: 7
32
来自主题: Pharmaceutical版 - gsk bioinformatics position
The Computational Biology Department supports Drug Discovery and Development
at GSK Pharmaceuticals R&D through the integrative analysis of internal and
external biomedical data, combining strong computational skills with
biological insight. Our analysis competencies are quite diverse with a focus
on target biology, spanning areas such as sequence analysis, comparative
genomics, pathways and networks, molecular evolution, RNA/protein expression
, drug repositioning, disease indications, structur... 阅读全帖
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