由买买提看人间百态

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全部话题 - 话题: locus
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a*********7
发帖数: 30080
1

Awards and Honors
2012 World Fantasy Award for Best Short Fiction, winner, "The Paper
Menagerie"
2012 Hugo Award for Best Novella, nominee, "The Man Who Ended History: A
Documentary"
2012 Hugo Award for Best Short Story, winner, "The Paper Menagerie"
2011 Nebula Award for Best Short Story, winner, "The Paper Menagerie"
2011 Nebula Award for Best Novella, nominee, "The Man Who Ended History: A
Documentary"
2012 Locus Award for Best Short Story, finalist, "The Paper Menagerie"
2012 Theodore Stur... 阅读全帖
a*o
发帖数: 25262
2
来自主题: LeisureTime版 - 脑细胞的五大杀手 (ZZ)
在另外一贴看到说脑是一个复杂的器官,无独有偶,看到这新闻,就转一下。就不翻译
了。
5 Ways You're Killing Your Brain Cells
http://www.msn.com/en-us/health/medical/5-ways-youre-killing-yo
Contrary to popular belief, we don’t have a limited supply of brain cells.
Sure, the majority of them grow early in life, but some areas of the brain
continue to grow them into adulthood and beyond — a process called
neurogenesis. The hippocampus is one of these areas, and it’s also among
the most important areas of the brain, playing roles in memory, e... 阅读全帖
b*******t
发帖数: 33714
3
可以这么想,不过三维空间里还是要看k的locus,不是简单的一个数字。
s***q
发帖数: 10585
4
有什么不对的?大陆人去香港生孩子,都是私立的医院,生产费都上10W
当然也有闯关公立医院急诊的,那种钻政策空子的,我也不喜欢
但是大部分还都是私立医院
轰孔那地方,本来房价就贵,出生率低,私立医院此举挣了不少钱,
一个愿买,一个愿卖,有什么不对?你说说看,不对在哪儿 ?
退一步说,就算是大陆人不对,和别的游客有什么关系?
不过港残们围着游客唱粤语歌,一个让人看清了港灿的真实面目,
另一个也向游客们传递了一个信息:“轰孔不欢迎你”
希望这些游客以后能不去香港就尽量别去了,别人不欢迎
哦,对了,还有一点,老墨非法移民,take advantage of 霉D行为
希望你为红脖们也编一个"Song of Locus",也算是给人口实了,哈哈
t******n
发帖数: 2939
5
☆─────────────────────────────────────☆
bigapple331 (大苹果) 于 (Sat Jan 28 01:14:04 2012, 美东) 提到:
最近网上最热门的话题除了龙年春晚,恐怕就是著名的香港地铁骂战了。早几天看了这
条新闻,没太当回事儿,这种事儿在国内随时随地都在发生,没什么新鲜的。可后来大
嘴孔和尚在节目中骂香港人是狗,激起了这场越来越多人参与的骂战。前两天MITBBS上
满篇都是张绍刚和刘俐俐,这两天就基本上都在讨论这场骂战了,每个帖子都是火药味
浓烈,从满清到民国到共和国一股脑的旧账都翻出来了。实在忍不住,就把那段骂战的
视频和孔和尚的节目都看了一遍。我曾于2003年去香港科技大学学习过半年的时间(想
起来也有十年了,时间真是一把杀猪刀),多少对香港有一些了解,所以想说说自己对
这件事儿的看法。
当时一起去香港科技大学学习的有全国好几所高校选派出来的交换生,由于刚开
始我们听不懂香港话(其实后来我也没听懂过),我们这些大陆的学生在一起玩的比较
多,随着大家选不同的课程,也渐渐的有了一些香港的同学和朋友。一个... 阅读全帖
t**i
发帖数: 688
6
重新整理一下:
Assuming all the facts were true;
Assume this phenotype is Mendelian and determined by an autosomal single
locus.
Assuming HWE.
Denote p = population allele frequency of Double-eyelids, q = 1 - p =
population allele frequency of single eyelid.
Then we have
Pr(Mother is hybrid) = 1;
Pr(GaoShuaiFu is pure recessive) = 1;
Pr(Father is hybrid) = 2pq, Pr(Father is pure Double-eyelid) = p*p
Then Pr(kid is Single-eyelid | Father is hybrid) = 1/4
Pr(kid is Single-eyelid | Father is pure Double)... 阅读全帖
H********g
发帖数: 43926
7
来自主题: Joke版 - 老婆生了个混血儿子 (转载)
这个看起来比较靠谱:
Mostly what Andreas has written is correct. However, blue eyes are, I
believe, due to a single recessive gene which first appeared in Eastern
Europe some 10,000-odd years ago and, due to its recent origin, is still
geographically very localised.
Virtually nobody of non-Caucasian descent will carry even a single copy of
this gene. However, if both parents are Caucasian/Asian with their Caucasian
parent having blue eyes, there should be a 25% chance that their child will
have blue eyes.... 阅读全帖
c**********r
发帖数: 88
8
来自主题: Piebridge版 - 【男征女】纽约地区
就贴两篇最近的吧。其实俺想找faculty容易得很,就是想先找下老婆。因为一个女人
当你穷的时候爱你才是真爱。
1.
Control of the Inheritance of Regulatory T Cell Identity by a cis Element in
the Foxp3 Locus.
Feng Y, Arvey A, Chinen T, van der Veeken J, Gasteiger G, Rudensky AY.
Cell. 2014 Aug 14;158(4):749-63. doi: 10.1016/j.cell.2014.07.031.
PMID: 25126783 [PubMed - in process]
2.
Inflammation-induced repression of chromatin bound by the transcription
factor Foxp3 in regulatory T cells.
Feng Y, Arvey A, van der Veeken J, Samstein RM, Stamatoyannopo... 阅读全帖
l*********l
发帖数: 5
9
来自主题: Piebridge版 - 【男征女】纽约地区
你搞错了。
别人都说了,照片差别很大。
你好好做你的实验吧。真是挺无聊的。
----------------------------------------------------------
发信人: costimulater (costimulater), 信区: Piebridge
标 题: Re: 【男征女】纽约地区【附照】
发信站: BBS 未名空间站 (Wed Aug 27 01:43:50 2014, 美东)
就贴两篇最近的吧。其实俺想找faculty容易得很,就是想先找下老婆。因为一个女人
当你穷的时候爱你才是真爱。
1.
Control of the Inheritance of Regulatory T Cell Identity by a cis Element in
the Foxp3 Locus.
Feng Y, Arvey A, Chinen T, van der Veeken J, Gasteiger G, Rudensky AY.
Cell. 2014 Aug 14;158(4):749-63. doi: 10.1016/j.cell.2014.07.... 阅读全帖
n*******s
发帖数: 17267
10
来自主题: Piebridge版 - 给30岁的单亲妈妈加点油吧
加油,每个人的经历不同,对事情的看法自然也不同,少说多听。
30岁是真的很年轻,看你的回帖也能读出来个一二,其实大家的话都有道理,不过造物
主大多数时候还是很厚待我们的,我们是什么样的人,我们如何跟他接触,他就会如何
回应我们。付出和珍惜是相互的,碰到对的人,你付出的越多,回报也越多,或许这才
是locus要表达的本义,不过语言这个东西很容易引起歧义。
随着年龄和阅历的增加,人自己性格的完善比金钱和容貌更容易吸引人, 性格变好的
同时,貌和金钱还有其它的比如健康也会随之而来。We create our own life, hehe.
加油。
k********k
发帖数: 5617
11
来自主题: Piebridge版 - 美东假性单亲妈妈征友
在 supermother1 () 的大作中提到: 】
发信人: spacespirit (宇宙精灵), 信区: Piebridge
标 题: Re: 给30岁的单亲妈妈加点油吧
发信站: BBS 未名空间站 (Sun Oct 30 23:50:28 2016, 美东)
我劝你一句,你可能不喜欢听,但是我说的句句是大实话。
我能够理解你的痛苦和你想找另外一半的心情。但是呢,你花的找男人的时间还不如给
自己和女儿做点好吃的,或者自己跟自己和女儿多赚一点钱。
我还真的没有见过带小孩子的女人二婚幸福的。
发信人: elsiehsu (elsie), 信区: Piebridge
标 题: 给30岁的单亲妈妈加点油吧
发信站: BBS 未名空间站 (Mon Oct 31 06:54:29 2016, 美东)
为了自己去找,别为了孩子去找,那是本末倒置。不但委屈了你未来的丈夫,你自己心
理也会失衡。
真愿意和你过一辈子的,即使做不到爱屋及乌,也会对孩子公平。
发信人: locus (星星), 信区: Piebridge
标 题: Re: 给30岁的单亲妈妈加点油吧
发信站: BBS 未名空间... 阅读全帖
k********k
发帖数: 5617
12
来自主题: Piebridge版 - 美东假性单亲妈妈征友
发信人: spacespirit (宇宙精灵), 信区: Piebridge
标 题: Re: 给30岁的单亲妈妈加点油吧
发信站: BBS 未名空间站 (Tue Nov 1 22:46:10 2016, 美东)
你不要激动。这里没有人说那种继父可能对继女发生的极端事情,而是说的平常的事情
和时间的处理。
你的男朋友要是给你娃娃三天两头送个20美元的玩具,愿意带你娃娃出去玩,你还不得
感动得不行谢天谢地的啊?这是要怎样心胸的男人才能够做到的,你还不得跟他不停的
上床啊?但是如果是娃娃的亲生父亲送20美元的玩具,你只怕嫌少了,觉得他没有尽到
做父亲的义务。
我知道离婚带2-3个娃娃的女人都是单身。我知道离婚带一个娃娃的女人,都是带男娃
娃的有男朋友了,但是就是不结婚,周末让男朋友带娃娃出去玩上中文学校,自己去赚
钱。人家心里明白这个世界所谓的爱情对女人来说到底是怎样一回事情,但是你不明白
,你还以为你是一个公主,你没有把自己当做单身母亲。但是,单身母亲比公主伟大。
女人,有的时候要守好自己,也就是有的时候要守好那份孤独和寂寞做好自己该做的事
情。
你爬男人的床已经失败过一次了,再次准... 阅读全帖
c**c
发帖数: 2593
13
大概找不到吧. 这书出了没多久, 恐怕还没人有这么
大的兴致把它扫描上网. 至少也该等它拿到一两个大
奖以后, 网上大家需求高了, 才会有人动手扫描.
前一阵Locus杂志的读者票选这一年最喜爱的科幻小说,
这本Cryptonomicon排在第一位. 但随后的坎贝尔纪念
奖, 如DaNee介绍的, 没见到这本书的影子, 估计是因
为这书的科幻味实在不是那么足. 等等看接下去真正的
大奖雨果奖的结果吧...
d***e
发帖数: 66
14
科幻大奖巡礼(3)约翰.坎伯纪念奖(上)
(The John W. Campbell Memorial Award)
◎猫昌
科幻界里头的著名大奖,一般而言不出雨果(Hugo)或星云(Nebula)。然而
在这两个奖项之外,还有不少具有公信力、代表性的奖项。有的奖颁发对象设
有限制,像是普罗米修斯奖(Prometheus Award)和菲利普.迪克奖(Philip
K. Dick Award);有的则是杂志办的读者票选奖,例如《轨迹》票选奖(
Locus Poll Award)、《科幻编年》奖(SF Chronicle Award)等;剩下的大
概就是地区意味浓厚的各国首奖了。给奖对象和两大奖相去不远的,就是这一
个约翰.坎伯纪念奖(简称 JWCMA,大夥儿可不要把这个奖跟约翰.坎伯之最
佳新进作家奖(John W. Campbell Award,JWCA)搞混)了。
JWCMA 同样也是为了纪念坎伯这位科幻界大老而设立的。坎伯于1971年逝世之
后,由哈利.哈利森(Harry Harrison)与布莱恩.艾迪斯(Brian W.
Aldiss)这两位科幻大师级人物所创办。1973年假
d***e
发帖数: 66
15
来自主题: SciFiction版 - 科幻(奇幻)小说TOP 100(21-40)

Jules Verne 的作品在科幻黄金时期之后,就逐渐不受英米读者
重视了。我想有以下几个原因:
1) Verne 是法国人。种族因素。就跟 Lem 很强,但他的作品很
少进排行一样。
2) Verne 的作品大多属科学游记,故事性较薄弱。英米科幻诉求
不在推广科学知识,自然不受读者青睐。
3) 不管是中国或台湾,当初推广科幻的主要目的其实是要推广科
学,Verne 的作品是很好的样板,所以被推广者大量引介。但其
实 Verne 的作品实际上在英米没那么受欢迎。
但不可否认,Verne 在科幻史上还是有其重要的地位。
至于科幻作品排名,我个人还是比较信任 Locus 杂志十年一度
的 All Time 票选。这个票选除了第一届1975年外,1987年和
1998年,都把科幻和奇幻分开。有兴趣的朋友可以自行查阅。
d***e
发帖数: 66
16

我都看这个
http://www.scifi.com/sfw/current/excess.html
John Clute 比较对味.....^^
不过他的评论最大的缺点是,自己也得看过那本书
才能完全体会他的评论
其他我较欣赏的评论都在Locus纸本杂志内
Gary K. Wolfe 跟 Nick Givers
c****t
发帖数: 19049
17
来自主题: SciFiction版 - 2012年度雨果奖获奖揭晓
2012年度雨果奖获奖名单:
最佳长篇 Best Novel: Among Others by Jo Walton (Tor)
最佳长中篇 Best Novella: "The Man Who Bridged the Mist" by Kij Johnson (
Asimov's, September/October 2011)
最佳短中篇 Best Novelette: "Six Months, Three Days" by Charlie Jane Anders
(Tor.com)
最佳短篇 Best Short Story: "The Paper Menagerie"(《手上纸,心中爱》) by
Ken Liu (刘宇昆)(The Magazine of Fantasy & Science Fiction, March/April
2011)
最佳相关书籍 Best Related Work: The Encyclopedia of Science Fiction, Third
Edition edited by John Clute, David Langford, Peter... 阅读全帖
D*****r
发帖数: 6791
18
http://book.sina.com.cn/tushuogongheguo/excerpt/sz/2006-08-14/1806203728.shtml#page_pic
我查了下应该是先天性遗传多毛症Congenital generalized hypertrichosis
对应的基因的位置已经大致确定了
Mapping of the congenital generalized hypertrichosis locus to chromosome
Xq24?q27.1
http://www.nature.com/ng/journal/v10/n2/abs/ng0695-202.html
这个特例表明,浑身长毛这个现象,在人类基因库里还是有的,发生变异就出现了。还
有人的尾骨,就是个退化结构,发生变异就长出尾巴来了。 按照演化树(
Phylogenetic tree),能够预测很多物种身上的会存在祖先遗留下来的退化结构,鲸
鱼有退化残留的腿骨,蛇有退化残留的骨盆。
这些现象可以用进化论来解释,当然在具体的应用上只是一种猜想。但在生物界里种种
存在的符合进化论的现象,都表明至少在这... 阅读全帖
s*********a
发帖数: 801
19
来自主题: TrustInJesus版 - Chromosome 2 (human)
所有的灵长类都有24对染色体,只有人有23对,为什么?
http://en.wikipedia.org/wiki/Chromosome_2_(human)
All members of Hominidae except humans have 24 pairs of chromosomes. Humans
have only 23 pairs of chromosomes. Human chromosome 2 is widely accepted to
be a result of an end-to-end fusion of two ancestral chromosomes.[3][4]
Fusion of ancestral chromosomes left distinctive remnants of telomeres, and
a vestigial centromereThe evidence for this includes:
The correspondence of chromosome 2 to two ape chromosomes. The close... 阅读全帖
J*****3
发帖数: 4298
20
来自主题: TrustInJesus版 - 人类是黑猩猩进化的吗?
http://en.wikipedia.org/wiki/Chromosome_2_%28human%29
All members of Hominidae except humans have 24 pairs of chromosomes. Humans
have only 23 pairs of chromosomes. Human chromosome 2 is widely accepted to
be a result of an end-to-end fusion of two ancestral chromosomes.[3][4]
Fusion of ancestral chromosomes left distinctive remnants of telomeres, and
a vestigial centromere
The evidence for this includes:
The correspondence of chromosome 2 to two ape chromosomes. The closest
human relative, ... 阅读全帖
J*****3
发帖数: 4298
21
来自主题: TrustInJesus版 - 给茄子 - 达尔文和他改变的世界
纪念查尔斯•达尔文诞辰200周年
作者简介:龙漫远,美国芝加哥大学生态与演化学系终身教授,北京大学生物信息中心
长江学者讲座教授,主要从事遗传学与演化论研究;陈振夏,北京大学生物信息中心博
士研究生, 主要研究兴趣是基因演化和生物信息学。
一千年前的中原,凡有水井处,皆唱柳词;今天的世界,凡有科学之处,皆说达尔文。
http://www.plob.org/2011/12/14/971.html
一 超越时空界限与学科藩篱
1809年2月12日,查尔斯·达尔文(Charles Robert Darwin)出生在英国什罗普郡的历
史名城什鲁斯伯里(Shrewsbury)。1859年11月24日,他的不朽名著《物种起源》出版
,一时洛阳纸贵而影响历久不衰。从他的家乡到世界各地,不同信仰的人们或欢呼,或
沉思,或惊愕,或暴怒,谈论的中心议题就是以自然选择理论为基础的演化学说(
Evolution based on the Theory of Natural Selection)。200年后的今天,世界上
许多国家和地区的学者和民众都投入了纪念这位科学伟人的盛事:英国、法国、德国、
... 阅读全帖
N**B
发帖数: 134
22
来自主题: TrustInJesus版 - 关于利未记11:21-22
有网友没常识用圣经利未记11章21-22节来攻击圣经,刚刚大概看了一下。
首先看上下文,20-23节是比较完整的,说的很清楚。用四只脚爬行且有翅膀的昆虫不
能吃,因为对身体不好。创世记中神咒诅蛇在地面爬行且终身吃土。但是蟋蟀是可以吃
的,圣经中也记载了施洗约翰是吃蝗虫和野蜜的。那么蝗虫和其他四足爬行的昆虫有什
么区别呢?就是他们在脚上还有腿可以用来跳跃的,这个就可以吃了。四只脚上面没腿
的有翅膀的爬行的昆虫都当厌恶。
这里说个题外话,前两天参观昆虫展览,看到了百足虫和千足虫,他们差别很大不只是
脚的多少,但是他们只能用脚来爬不能跳跃的。
再说现在科学研究蝗虫等等,有三对足,前两对用于爬行,而最后一对用于跳跃的。所
以也可以说蝗虫等是用四足(前两对)爬行。当然这个只是把现在科研成果用到圣经解
释上的一个合理的猜测而已。
请注意施洗约翰在公元元年左右活动离今2000多年,而摩西写利未记给当时的犹太人是
在公元前1400年左右,距今3400多年,当时人们还没有现代科学提供的分辨手段。要让
没有经过现代科学教育的古人理解,圣经是用生活语言而不是科学语言写成的。这也可
以说明为什么蝙蝠被当成鸟类... 阅读全帖
P******l
发帖数: 1648
23
来自主题: TrustInJesus版 - 科学家教导创造论抛弃进化论的视频
谢谢theisland 指出问题, 我会做些研究后回复.
证明全世界的人身上的这段DNA序列都一样, 所需要的样本不需要是个天文数字,
Actually it doesn't have to be a big number of samples. Only 38 samples(
People from different locations in the world) were tested to draw the
conclusion of Absence of polymorphism at the ZFY locus on the human Y
chromosome. Only 147 samples led to the conclusion of mtDNA eve.
我想dukkha上文和我们讨论的不是同一问题,你需要略花些时间阅读一下原文,http://www.bydnacoding.org/CHT2-P1.html
http://www.bydnacoding.org/CHT6-P1.html
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccor... 阅读全帖

发帖数: 1
24
眠熟無夢時,可以見聞覺知的前六識既然都不運作了,為什麼人不會睡死永遠醒不過來
,甚至清晨鬧鐘響時還聽得到呢?在 2007 年 11 月號第 69 期的《科學人》雜誌上,
有這麼一篇名為〈意識如何產生?鬧鐘為何可以在睡覺(無意識)的人身上引發意識?
〉的文章,兩位享譽國際的腦科學專家 Christof Koch 及 Susan Greenfield 提出各
自的看法來解釋為何熟睡之後,已經在沒有意識的狀態之下,人還聽得到鬧鐘響的機制
(註1)。柯霍提到因為「腦幹裡有一個叫藍斑核(locus coeruleus)的腦區,該處的神
經元會對聽神經突發的強烈刺激產生反應,於是馬上採取行動,將一種化學訊息散佈到
視丘與大腦皮質,最後的結果就是大腦皮質與周邊構造醒了起來。……這種神經活動只
需花幾分之一秒的時間,並且讓你意識到鬧鐘響」;格林菲爾德則認為「任何強烈的感
覺刺激(像是強光),都會引發意識,因此腦子沒有任何一個特定區域負責把人叫醒。
鬧鐘鈴聲喚起意識,不是因為刺激的質(這裡的例子是聽覺)不同,而是量(大小聲)
的不同」。兩位專家雖然從大腦的神經細胞元及連結運作功能的觀點提出各自的看法來
... 阅读全帖
f********y
发帖数: 7
25
来自主题: PKU版 - 报道~
from:05 PKU-college of environmental science
locus:now still in China~
state: undergraduate
大家暑假快乐*^_^*~~~
e**********0
发帖数: 278
26
来自主题: Apple版 - 为什么os X还是那么丑?
5年前就觉得丑,现在还是觉得丑,没有适应它,反而厌烦它。。。
win7就好很多。
学术一下,看看用Eight Golden Rules of Interface Design分析一下。
1 Strive for consistency.
2 Enable frequent users to use shortcuts.
3 Offer informative feedback.
4 Design dialog to yield closure.
5 Offer simple error handling.
6 Permit easy reversal of actions.
7 Support internal locus of control.
8 Reduce short-term memory load.
貌似都是些客观的标准,没有什么主观的。
n*******e
发帖数: 27
27
来自主题: Biology版 - Re: [转载] 问个小问题
ABO血型系统是根据人红细胞表面的半乳糖苷抗原决定的,具体我记不清啦.
O型是有一个基本的基团,然后A或B型添加了不同的修饰.这种糖蛋白的结构
以及翻译后的修饰是由基因决定的.O型对于A型和B型都是隐性的,也就是
说O型血型的人,在这个LOCUS上的等位基因是i/i,而A型是A/A,或者是A/i.
AB型则是A/B.作为抗原的糖蛋白,相应人体里产生拮抗另一种糖蛋白的抗体.
就好象A型产生的是抗B型血清,O型是抗A型和抗B型血清,AB型则没有这类
抗体.所以,虽然具有O型血的人是"万能输血者",因为他们体内没有A型和B型
糖蛋白,但是因为他们还有抗A型和抗B型血清,输血的速度不能太快,要不然
输入的抗血清来不及被稀释,一样有凝集反应.ABO血型系统只是最常用的系
统,可想而知,根据红细胞表面的其它蛋白质,还能定义其它类型的血型.Rh
血型是由Rh因子决定的,Rh阴性是隐性的,基因型为Rh-/Rh-.这种纯合的隐性
基因型在群体里占的百分比是很低的.在Rh+/Rh-和Rh+/Rh-的后代中,只有
1/4.B+表示B型血,Rh阳性.AB型血在美国只有3%.而AB型Rh阴性出现的机率
则更低了
n********k
发帖数: 2818
28
it depends on what you are doing, and how big the risk u like to take?
Nobody really knows in practice(I
asssume u are doing mice knockout?......for easy targeting locus, it is
likely fine but if you are unlucky, u
might get nothing...if it is easy to correct, I would just remake it,
otherwise go ahead with your targeting and
see what happens...If it were me, I'll definitely remake the construct, it
takes nothing to remake one:))
compare to the targeting,. one step is about a week work, isn't it
j*****q
发帖数: 82
29
来自主题: Biology版 - 单克隆细胞系的制备
即使genetic information一致的两个细胞,也有可能有完全不同的phenotype的。
你这个如果确实是monoclonal cell line,那就sort那些还是fluorescent的细胞做实
验。
不过得问一句,你的单clone怎么挑的?
不过既然不在意genomic locus和copy number的,为什么要用单clone做实验呢?工作
量大,也说明不了很多问题啊,为什么不用pool的呢?
o******n
发帖数: 511
30
来自主题: Biology版 - 怎么从ncbi大批量下载基因序列
输个基因名进去,有好几百条结果,这是问题之一.
问题之二在于,绝大部分的这个基因都是unannotated,在测序过的全基因组里,所以点了结果进去看不到直接的单独的基因序列.我目前用最笨的方法,先进入全基因组,再根据locus tag的号码找我要的基因.
几百个结果,这么做太没效率了,有什么好办法?
还有个问题,等我找出这几百个序列,有没有软件可以帮我把它们按序列相似性分类,比
如这几十个很像,放一组,另几十个长些,放另一组,免得比对出来很乱.
谢谢!
m*****u
发帖数: 15526
31
来自主题: Biology版 - 怎么从ncbi大批量下载基因序列
database不要选nucleotide,选gene。

了结果进去看
不到直接的单独的基因序列.我目前用最笨的方法,先进入全基因组,再根据locus tag的
号码找我要的
基因.
o******n
发帖数: 511
32
来自主题: Biology版 - 怎么从ncbi大批量下载基因序列
对的,就是用一个基因名字搜索,找出在不同物种里的序列,但很多这些序列是
unannotated的,要进到全基因组序列里根据locus tag id才能定位到所要基因的序列,
很麻烦,而且有几百个这样的,头大.
我的另外一个问题就是看有没有软件能把这些序列按相似度分组.
谢谢czcz3 :)
t******r
发帖数: 8600
33
来自主题: Biology版 - Difficult cloning - 求助
要克隆一基因locus,30-50 kb. Genbank没有sequence.大量repetitive segments, PCR
基本不work.好不容易PCR出一4kb片段,TA-cloning总被重组掉80-90%。试用过不同菌
种,30C培养等等。求高人指点。
b******n
发帖数: 4225
34
来自主题: Biology版 - Difficult cloning - 求助
这个可能PCR有难度,
如果是细菌来源的DNA,可以尝试一下这个方法
insert一个抗性基因到该locus
然后找合适的酶消化基因组DNA再连接到相应载体
用该抗性标记筛选

PCR
t******r
发帖数: 8600
35
来自主题: Biology版 - Difficult cloning - 求助
DNA来自细胞,没有locus的reference序列。
g*******0
发帖数: 2152
36
Usually nobody know what locus is the cre located. The safe way to tell cre/
+ or cre/cre is by breeding and look at the Mendelian ratio. But if you pay
enough attention the intensity of PCR genotyping band normally can give you
some clue that two copy PCR band is much brighter than one copy. Better
approach is do cre PCR and a control PCR (say a-actin) in one tube, use the
right cre/+ cre/cre tail DNA control to help you establish the criteria to
judge what is cre/+ or cre/cre (eg. two band wit
n********k
发帖数: 2818
37
It is indeed pretty easy to go for another generation of breeding, that way
you know double or single copy of cre and you only need to start with very
few and then get tons of them.., with my own experience, it saves time and
money unless u only need a few animals...
As for to determine the locus, I suppose one could go for FISH like you
point it out...maybe one could kind of go a RACE approach like insertational
mutation genesis(not sure just my guess), or one could even use Parrallel
sequen
n********k
发帖数: 2818
38
good points...nonetheless, for the most, this won't be a concern and if you
look at the whole genome mutagenesis in 129 or alike, they just sequence
about 100bp or even 30 bp, enough to determine the locus for most...

background
w**********s
发帖数: 72
39
来自主题: Biology版 - Paper help in Atherosclerosis.
Atherosclerosis. 2004 Dec;177(2):443-50.
Locating Ath8, a locus for murine atherosclerosis susceptibility and testing
several of its candidate genes in mice and humans
Thank you very much!
O******e
发帖数: 4845
40
Is this possible that your targeting cassette was inserted somewhere else?
Make sure the primers you were using can tell you if they are amplifying
your gene locus, not the targeting cassette.
One round of Southern blot should answer all your questions.
r*****l
发帖数: 457
41
HWD 影响association 吗?
感觉HWD描述的是一个locus的不同states,association是两个loci之间的LD
H****N
发帖数: 997
42
来自主题: Biology版 - conditional knockout老鼠Cre的问题
For transgenic cre lines, even though there are multiple copies, they are at
one locus as concatemers and will not segregate.
m*********l
发帖数: 182
j****x
发帖数: 1704
44
这个gene编码的蛋白大致是什么功能?
你得先证实,确实存在这三个独立的pre-mRNA,来自不同的locus,尽管编码产物相同
的。
b****n
发帖数: 311
45
来自主题: Biology版 - NIBS太变态了吧?
Nature Genetics也不难:
1: Huang XY, Chao DY, Gao JP, Zhu MZ, Shi M, Lin HX. A previously unknown
zinc
finger protein, DST, regulates drought and salt tolerance in rice via
stomatal
aperture control. Genes Dev. 2009 Aug 1;23(15):1805-17. PubMed PMID:
19651988;
PubMed Central PMCID: PMC2720257.
2: Sun SY, Chao DY, Li XM, Shi M, Gao JP, Zhu MZ, Yang HQ, Luan S, Lin HX.
OsHAL3
mediates a new pathway in the light-regulated growth of rice. Nat Cell Biol.
2009
Jul;11(7):845-51. Epub 2009 Jun 21. PubMed PM... 阅读全帖
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