发帖数: 1 | 1
Download pdf published by SfN (Chapter from 'The History of Neuroscience in
Autobiography, Volume 8' edited by Larry R. Squire)
Yuh-Nung Jan's CV
Lily Jan's CV
Yuh-Nung Jan and Lily Jan
Birth
Family History and Growing Up
National Taiwan University
The Hiking Trip to Shitou in the Spring of 1967
Graduate School Application
Graduate Study at Caltech (1968锟974)
Seymour Benzer Lab (1974锟977)
Steve Kuffler锟絪 Lab at H... 阅读全帖 |
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c******s
发帖数: 428 | 2 A friend of mine working at TIGR called me one day soon after we published
our Cell paper in 1993 to tell me that he had just found 5 human homologues
of ICE from their sequences and asked me if I was willing to collaborate
with TIGR. Although I wanted desperately to get those ICE homologues, MGH
would not agree to the terms of the TIGR collaboration. Instead, my friend
collaborated with my competitor who published Nature, Cell and Science
papers one after another. Facing such stiff competition, |
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g*******y
发帖数: 380 | 3 可能我说的不明白，在第二段里我提到了，我分别用了几个不同的proc sql，先用proc
sql把两个dataset里拥有共同category（same homologue，same weather， same cas
＃），然后用这个list分别subset两个数据，再在每个数据里求same homologue，same
weather的平均，这样的结果是我所想要得到的。
但是用我原贴里的code就达不到这样的目的，我不明白问题出在了哪里？ |
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K**********n
发帖数: 1197 | 4 考考大家的西班牙文，版上几个人能懂？
La décision de la Chine de s’associer à la Russie pour bloquer une ré
solution des Nations unies sur la Syrie jeudi 19 juillet provoque un débat
passionné sur les réseaux sociaux en Chine. Sur son compte Sina Weibo, l’
ONU a publié, en chinois, les déclarations très critiques de l’
ambassadeur français Gérard Araud : “L’histoire montrera qu’ils se
sont trompés, l’histoire les jugera”. Plusieurs utilisateurs se demandent
, avec humour, combien de temps le compte officiel d... 阅读全帖 |
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c******g
发帖数: 4889 | 5 并非假新闻，以下来自《回声报（Les Echos）》：
Moscovici: Paris pourrait être le principal marché du renminbi en zone
euro
26/04 | 16:44
La place de Paris dispose de nombreux atouts pour être le principal marché
du renminbi en zone euro et une plateforme pour les investissements dans la
devise chinoise en Afrique notamment, a estimé vendredi à Hong Kong le
ministre français des Finances Pierre Moscovici.
Notant "le rôle de plus en plus important pris sur la scène
internationale" par le renminbi (RMB, nom... 阅读全帖 |
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k********k
发帖数: 5617 | 6 https://yahoo.skynet.be/nieuws/wereld/artikel/1049868/bezoek-chinese-
president-lichte-verkeershinder-in-brussel-vanaf-zondag
Bezoek Chinese president - Lichte verkeershinder in Brussel vanaf zondag
(Belga) De Chinese president Xi Jinping is in België van zondag 30
maart tot dinsdag 1 april. Brussel blijft relatief vlot bereikbaar, wat bij
het bezoek van Barack Obama eerder deze week niet het geval was. Dat blijkt
uit het persbericht van de verkeersdirectie van de federale politie vrijdag.
... 阅读全帖 |
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x****6
发帖数: 4339 | 7 crispr这个免疫系统也不是现在这个主流的教授发现的，而是欧洲一个发酵制品公司发
现的。按照你的思路，朵得娜张峰教堂都没有原创权了。
同样的，14年的发现之前的十年就发现了argonaute蛋白主导的RNA干扰，并已经得了一
个炸药奖。而那时候就知道了argonaute蛋白可以和核糖核酸结合并且进行targeting,
而14年发现的这个homologue只不过是使用脱氧核糖核酸作为底物。按照你的思路，也
这只是一个改进罢了。 |
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g***j
发帖数: 40861 | 8 【 以下文字转载自 PKU 讨论区 】
发信人: mumu221 (), 信区: PKU
标 题: 复旦大学杭州校友会会长、博士生导师曹明富大量文章抄袭和造假
发信站: BBS 未名空间站 (Wed Sep 14 05:15:38 2016, 美东)
复旦大学杭州校友会会长、博士生导师曹明富大量文章抄袭和造假
http://bbs.tianya.cn/post-free-5558181-1.shtml
复旦大学杭州校友会会长、博士生导师曹明富大量文章抄袭和造假，曹明富作为世界名
校复旦大学的校友，居然出现这么多低劣的抄袭文章，真为复旦大学蒙羞！详情如下：
可以查到曹明富一共34篇文章，其中3篇和生物无关，9篇综述，非第一或者通讯作
者9篇，会议论文1篇，2篇文献搜索不到，剩下10篇论著，居然8篇存在一稿多投或者相
互抄袭：
1. 文章1抄袭1999年《中国兽医学报》11月文章《茶多酚（GTPP）的抗脂质过氧化
作用》
2. 文章2和9为同一文章，一稿两投。
3. 文章6和文章10抄袭1993年《茶叶科学》的文章《茶多酚的生学学作用》
4.文章31，33，34内容相互重复，多处投稿。其... 阅读全帖 |
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Q*****Y
发帖数: 741 | 9 复旦大学博士，复旦大学杭州校友会会长曹明富大量文章抄袭和造假
http://bbs.tianya.cn/post-free-5558181-1.shtml
复旦大学博士，复旦大学杭州校友会会长曹明富大量文章抄袭和造假，详情如下：
可以查到曹明富一共34篇文章，其中3篇和生物无关，9篇综述，非第一或者通讯作
者9篇，会议论文1篇，2篇文献搜索不到，剩下10篇论著，居然8篇存在一稿多投或者相
互抄袭：
1. 文章1抄袭1999年《中国兽医学报》11月文章《茶多酚（GTPP）的抗脂质过氧化
作用》
2. 文章2和9为同一文章，一稿两投。
3. 文章6和文章10抄袭1993年《茶叶科学》的文章《茶多酚的生学学作用》
4.文章31，33，34内容相互重复，多处投稿。其中，文章34的图8，图9，居然和文
章31的图2A，2B完全一致。
文章目录：
1、茶多酚类复合物对小鼠体内脂质过氧化的影响，《科技通报》，2000，V0L.16
N0.1
抄袭1999年《中国兽医学报》11月文章《茶多酚（GTPP）的抗脂质过氧化作用》
2、Effect ofTumor Necrosis Factor Alpha ... 阅读全帖 |
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e******u
发帖数: 3206 | 10 如一石激起千层浪，颜宁微博上爆料自己三天就发science 引发海内外巨大反响。崇拜
拍手叫好的有，妒忌讥讽者的也有。但事实上隔行如隔山，叫好者和讥讽者可能并不真
正了解对颜宁的工作。那么问题来了，颜宁的工作到底牛不牛？有多牛？颜值到底高不
高？
先要回答的问题是结构生物学到底有多牛？因为颜宁毕竟是做结构的。以最具说服力的
诺贝尔奖为例，百年化学+生理和医学诺奖215项中有13项是结构生物学相关的，占6%[1
]。尤其是其中1962年沃森克里克DNA双螺旋结构的发现，是近代生物学的基础，也是百
年来科学领域最重要的发现之一。再看美国霍华德休斯研究所（HHMI）资助的科学领域
。HHMI是全球最具声望的针对生物和医学的私立基金组织，他们资助的科学家个个含金
量十足。目前有超过300名科学家受到HHMI的资助，而其中40人从事结构生物学相关研
究[2]。抛开这些统计不说，结构是功能的基础，而生物大分子是所有结构中最具挑战
的研究对象，所以结构生物学是化学和生物学共同的追逐对象。科学的赛跑里，在生物
学从化学手里接棒之后，结构生物学就成了化学和生物学的圣杯。结构生物学也是同数
学关系最密切的... 阅读全帖 |
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x****d
发帖数: 2239 | 11 https://www.zerohedge.com/health/man-behind-global-coronavirus-pandemic
===============================================================
Because as it turns out, this is a job posting for the lab of Dr. Peng Zhou
(周鹏), Ph.D., a researcher at the Wuhan Institute of Virology and Leader of
the Bat Virus Infection and Immunization Group. Some more on Zhou's
background from the Institute (google translated):
He received his PhD in Wuhan Virus Research Institute in 2010 and has worked
on bat virus and ... 阅读全帖 |
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A****7
发帖数: 902 | 12 https://www.med.unc.edu/microimm/directory/ralph-baric-phd-1/
Ralph Baric, PhD
Professor
Department of Epidemiology
3304 MHRC, School of Public Health
919-966-3895
Research
Most of the research in our laboratory has used coronaviruses as models to
study the genetics of RNA virus transcription, replication, persistence, and
cross species transmission. We have also been using alphavirus vaccine
vectors to develop novel candidate vaccines against caliciviruses. Specific
areas of interest include:
1... 阅读全帖 |
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a****2
发帖数: 3735 | 13 我们可以从多份由中国科研人员在当时的国际学术期刊所发表的论文，得以管窥，以下
是其中三份较具代表性：
1.〈Difference in Receptor Usagebetween Severe Acute Respiratory Syndrome (
SARS) Coronavirus and SARS-LikeCoronavirus of Bat Origin（源于蝙蝠的严重急性
呼吸系统综合症（SARS）冠状病毒和SARS样冠状病毒之间的受体使用差异）〉，美国微
生物学会，病毒学报，2008 年2月号
2. 〈Bat severe acute respiratorysyndrome-like coronavirus ORF3b homologues
display different interferonantagonist activities（ 蝙蝠严重急性呼吸综合征样
冠状病毒ORF3b同源物表现出不同的干扰素拮抗剂活性）〉，Journal of General
Virology, United Kingdom, 2012
3.〈Identification ofImmuno... 阅读全帖 |
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发帖数: 1 | 14 复旦大学杭州校友会会长、博士生导师曹明富大量文章抄袭和造假
http://bbs.tianya.cn/post-free-5558181-1.shtml
复旦大学杭州校友会会长、博士生导师曹明富大量文章抄袭和造假，曹明富作为世界
名校复旦大学的校友，居然出现这么多低劣的抄袭文章，真为复旦大学蒙羞！详情如下：
可以查到曹明富一共34篇文章，其中3篇和生物无关，9篇综述，非第一或者通讯作
者9篇，会议论文1篇，2篇文献搜索不到，剩下10篇论著，居然8篇存在一稿多投或者相
互抄袭：
1. 文章1抄袭1999年《中国兽医学报》11月文章《茶多酚（GTPP）的抗脂质过氧化
作用》
2. 文章2和9为同一文章，一稿两投。
3. 文章6和文章10抄袭1993年《茶叶科学》的文章《茶多酚的生学学作用》
4.文章31，33，34内容相互重复，多处投稿。其中，文章34的图8，图9，居然和文
章31的图2A，2B完全一致。
文章目录：
1、茶多酚类复合物对小鼠体内脂质过氧化的影响，《科技通报》，2000，V0L.16
N0.1
抄袭1999年《中国兽医学报》11月文章《茶多酚（GTPP）的抗脂质过氧化作... 阅读全帖 |
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发帖数: 1 | 15 复旦大学杭州校友会会长、博士生导师曹明富大量文章抄袭和造假
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复旦大学杭州校友会会长、博士生导师曹明富大量文章抄袭和造假，曹明富作为世
界名校复旦大学的校友，居然出现这么多低劣的抄袭文章，真为复旦大学蒙羞！详情如
下：
可以查到曹明富一共34篇文章，其中3篇和生物无关，9篇综述，非第一或者通讯作
者9篇，会议论文1篇，2篇文献搜索不到，剩下10篇论著，居然8篇存在一稿多投或者相
互抄袭：
1. 文章1抄袭1999年《中国兽医学报》11月文章《茶多酚（GTPP）的抗脂质过氧化
作用》
2. 文章2和9为同一文章，一稿两投。
3. 文章6和文章10抄袭1993年《茶叶科学》的文章《茶多酚的生学学作用》
4.文章31，33，34内容相互重复，多处投稿。其中，文章34的图8，图9，居然和文
章31的图2A，2B完全一致。
文章目录：
1、茶多酚类复合物对小鼠体内脂质过氧化的影响，《科技通报》，2000，V0L.16
N0.1
抄袭1999年《中国兽医学报》11月文章《茶多酚（GTPP）的抗脂质过... 阅读全帖 |
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发帖数: 1 | 16 复旦大学杭州校友会会长、博士生导师曹明富大量文章抄袭和造假
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界名校复旦大学的校友，居然出现这么多低劣的抄袭文章，真为复旦大学蒙羞！详情如
下：
可以查到曹明富一共34篇文章，其中3篇和生物无关，9篇综述，非第一或者通讯作
者9篇，会议论文1篇，2篇文献搜索不到，剩下10篇论著，居然8篇存在一稿多投或者相
互抄袭：
1. 文章1抄袭1999年《中国兽医学报》11月文章《茶多酚（GTPP）的抗脂质过氧化
作用》
2. 文章2和9为同一文章，一稿两投。
3. 文章6和文章10抄袭1993年《茶叶科学》的文章《茶多酚的生学学作用》
4.文章31，33，34内容相互重复，多处投稿。其中，文章34的图8，图9，居然和文
章31的图2A，2B完全一致。
文章目录：
1、茶多酚类复合物对小鼠体内脂质过氧化的影响，《科技通报》，2000，V0L.16
N0.1
抄袭1999年《中国兽医学报》11月文章《茶多酚（GTPP）的抗脂质过... 阅读全帖 |
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发帖数: 1 | 17 复旦大学杭州校友会会长、博士生导师曹明富大量文章抄袭和造假
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校复旦大学的校友，居然出现这么多低劣的抄袭文章，真为复旦大学蒙羞！详情如下：
可以查到曹明富一共34篇文章，其中3篇和生物无关，9篇综述，非第一或者通讯作
者9篇，会议论文1篇，2篇文献搜索不到，剩下10篇论著，居然8篇存在一稿多投或者相
互抄袭：
1. 文章1抄袭1999年《中国兽医学报》11月文章《茶多酚（GTPP）的抗脂质过氧化
作用》
2. 文章2和9为同一文章，一稿两投。
3. 文章6和文章10抄袭1993年《茶叶科学》的文章《茶多酚的生学学作用》
4.文章31，33，34内容相互重复，多处投稿。其中，文章34的图8，图9，居然和文
章31的图2A，2B完全一致。
文章目录：
1、茶多酚类复合物对小鼠体内脂质过氧化的影响，《科技通报》，2000，V0L.16
N0.1
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可以查到曹明富一共34篇文章，其中3篇和生物无关，9篇综述，非第一或者通讯作
者9篇，会议论文1篇，2篇文献搜索不到，剩下10篇论著，居然8篇存在一稿多投或者相
互抄袭：
1. 文章1抄袭1999年《中国兽医学报》11月文章《茶多酚（GTPP）的抗脂质过氧化
作用》
2. 文章2和9为同一文章，一稿两投。
3. 文章6和文章10抄袭1993年《茶叶科学》的文章《茶多酚的生学学作用》
4.文章31，33，34内容相互重复，多处投稿。其中，文章34的图8，图9，居然和文
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N0.1
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发帖数: 1 | 19 复旦大学杭州校友会会长、博士生导师曹明富大量文章抄袭和造假
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校复旦大学的校友，居然出现这么多低劣的抄袭文章，真为复旦大学蒙羞！详情如下：
可以查到曹明富一共34篇文章，其中3篇和生物无关，9篇综述，非第一或者通讯作
者9篇，会议论文1篇，2篇文献搜索不到，剩下10篇论著，居然8篇存在一稿多投或者相
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1. 文章1抄袭1999年《中国兽医学报》11月文章《茶多酚（GTPP）的抗脂质过氧化
作用》
2. 文章2和9为同一文章，一稿两投。
3. 文章6和文章10抄袭1993年《茶叶科学》的文章《茶多酚的生学学作用》
4.文章31，33，34内容相互重复，多处投稿。其中，文章34的图8，图9，居然和文
章31的图2A，2B完全一致。
文章目录：
1、茶多酚类复合物对小鼠体内脂质过氧化的影响，《科技通报》，2000，V0L.16
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发帖数: 1 | 20 复旦大学杭州校友会会长、博士生导师曹明富大量文章抄袭和造假
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复旦大学杭州校友会会长、博士生导师曹明富大量文章抄袭和造假，曹明富作为
世界名校复旦大学的校友，居然出现这么多低劣的抄袭文章，真为复旦大学蒙羞！详情
如下：
可以查到曹明富一共34篇文章，其中3篇和生物无关，9篇综述，非第一或者通讯作
者9篇，会议论文1篇，2篇文献搜索不到，剩下10篇论著，居然8篇存在一稿多投或者相
互抄袭：
1. 文章1抄袭1999年《中国兽医学报》11月文章《茶多酚（GTPP）的抗脂质过氧化
作用》
2. 文章2和9为同一文章，一稿两投。
3. 文章6和文章10抄袭1993年《茶叶科学》的文章《茶多酚的生学学作用》
4.文章31，33，34内容相互重复，多处投稿。其中，文章34的图8，图9，居然和文
章31的图2A，2B完全一致。
文章目录：
1、茶多酚类复合物对小鼠体内脂质过氧化的影响，《科技通报》，2000，V0L.16
N0.1
抄袭1999年《中国兽医学报》11月文章《茶多酚（GTPP）... 阅读全帖 |
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r****o
发帖数: 105 | 21
No, no, the problem is that the peptide you use for antigen should be
on the surface of the protein. Otherwise, your antibody is not gonna work
cause the antigen is buried inside. So knowing the general structure topology
of the protein is important. But I doubt there is a good way to predict
structure since the protein's function is unknown. If this protein has
some homologues, you can compare the different proteins and find conserved
sequences. Because conserved residues may be i |
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f**********e
发帖数: 1994 | 22 界面是 python. 如果是 indel 很少，>50% seq id 的 homologue, 20内行搞定。
用它 automodel 的模块就行了。 |
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x**w
发帖数: 112 | 23 homologue recombination |
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O******e
发帖数: 4845 | 24 有一股幽怨之气。。。
homologues
ignore |
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z****g
发帖数: 3340 | 25 牛的在这：
Positional cloning of the mouse obese gene and its human homologue. by Y
Zhang - 1994 - Cited by 7877.
今年的Lasker foundation prize. |
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n********k
发帖数: 2818 | 26 BamH1和Hind3在8里面中间就隔了1个
u run into a difficult but rather common problem...how did u do your
digestion? Have your checked NEB
appendix about it---the correct one would be digest with HindIII first and
then digest with BamHI,
otherwise, your chance of success is very low...That said, I would always
try to avoid this situation...go with
different enzyme cute sites, fusion PCR, homologue based cloning, or blunt
ligation(nowaday very
easy)...For a beginner, I hope to remind one truth: virtually for ... 阅读全帖 |
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h******u
发帖数: 131 | 27 一种柱子，从公司买的。如果你的基因有homologue, 或者多个isoform. 也有可能出现
这种情况。 |
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w******e
发帖数: 1187 | 29 非常感谢！再问个相关的问题：human protein有多少percentage是没有homologue（
across all organisms)的？ |
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l**********1
发帖数: 5204 | 30 So how about TubZ
//www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3132758/
C Moriscot - 2011
8 Jul 2011 – The phylum Crenarchaeota lacks the FtsZ cell division hallmark of bacteria ... cytokinesis and
budding of some enveloped viruses, little is known about the ...... Lowe J. Filament structure of bacterial
tubulin homologue TubZ.
//zh.wikipedia.org/wiki/泉古菌門
//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20974911
//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20818414
more below figure
or go to
http://www.mitbbs.com/article_t/Biology/31... 阅读全帖 |
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l**********1
发帖数: 5204 | 31 only for paralogous
please go to
//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/15865991
its page one:
What is paralogy?
Since Darwin, for most biologists (or at least, for evolutionary biologists) homology has
come to mean something like ‘similarity due to common descent’, to distinguish it from
similarity due to convergent evolution. An accurate understanding of the relationships
between living things depends upon correctly identifying homologous characteristics of
an organism from other similarity. A classic ... 阅读全帖 |
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a*****x
发帖数: 901 | 32 Data Not Shown
ClC-ec1最终能成为“大牌“, 固然归功于Roderick的那篇paper, 却主要也是沾了它的
mammalian亲戚的光. ClC指的是一个氯离子通道家族(Chloride Channels). 在
Mammalian中一共发现了9个ClC蛋白, 几乎个个都有很重要的作用 (见上次的ClC
review.pdf, 我就不一一累述了). 顺便提一下一个有趣的知识, 电鳐 (Torpedo fish)
也有一个ClC蛋白, 叫做ClC-0. 电鳐之所以能够放电, 就是靠它.
很多mammalian ClC和ClC-0的单通道电流都被记录到了, 可是这个电流和ClC的结构有
什么关系却一直不清楚. ClC究竟为什么可以选择性的通过氯离子, 而不会通过钾钠之
类的阳离子, ClC的开放与关闭是如何调控的这些问题一直困扰着很多ion channelists
.
2002年Roderick’s group结晶出了ClC-ec1的结构. 如前所述, ClC-ec1就是ClC在E.
Coli里面的亲戚. Roderick看着这个结构, 并且运用他丰富的想象力, 成... 阅读全帖 |
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l**********1
发帖数: 5204 | 33 Agree with U!
Plus
Ilya Prigogine 负熵/耗散结构理论之父
普利高京的非平衡态物理化学理论 可能和 ClC Cl- uphill 有着某种关联吧? (Possibility)
please refer:
>
耗散结构理论
是指用热力学和统计物理学的方法，研究耗散结构形成的条件、机理和规律的理论。耗散结构理论作
为以揭示复杂系统中的自组织运动规律的一门具有强烈方法论功能的新兴学科，其理论、概念和方法不仅适用于自然现
象，同时也适用于解释社会现象。
理论创始人
耗散结构 耗散结构理论的创始人是伊里亚·普里戈金(Ilya Prigogine)教授，由于对非平衡热力学尤其是建立耗散结构
理论方面的贡献，他荣获了1977年诺贝尔化学奖。普里戈金的早期工作在化学热力学领域，1945年得出了最小熵产生
原理，此原理和翁萨格倒易关系一起为近平衡态线性区热力学奠定了理论基础。普里戈金以多年的努力，试图把最小熵
产生原理延拓到远离平衡的非线性区去，但以失败告终，在研究了诸多远离平衡现象后，使他认识到系统在远离平衡态
时，其热力学性质可能与平衡态、近平衡态有重大原则差别... 阅读全帖 |
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l**********1
发帖数: 5204 | 34 check his/her peer review papers CNS record except N sub and Cell sub only
CNS
especially the authorship position:
i mean from NCS only 1st author to last/corresponding author that PI
for example:
//www.lsi.umich.edu/facultyresearch/labs/xz-xu/publications
Publications
Articles
Piggott, B.J.*, Liu, J.*, Feng, Z.*, Wescott, S.A., and Xu, X.Z.S. (2011)
The neural circuits and synaptic mechanisms underlying motor initiation in C
. elegans. Cell 147, 922-933. PubMed
ignored
Feng, Z.*, Li, W.*, Wa... 阅读全帖 |
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g*********5
发帖数: 2533 | 35 sirt yeast homologue long life gene... |
|
l**********1
发帖数: 5204 | 36 3-4 Y
pls refer:
last/corresponding author of CNS and last CNS last author Sternberg then as
3rd author
Li, W., Feng, Z., Sternberg, P.W., and Xu, X.Z.S. (2006) A C. elegans
stretch receptor neuron revealed by a mechanosensitive TRP channel homologue
. Nature 440, 684-687. PubMed Link
Fist author of CNS
Xu, X.Z.S., & Sternberg, P.W. (2003) A C. elegans sperm TRP protein required
for sperm-egg interactions during fertilization. Cell 114, 285-297. PubMed
link:
//www.lsi.umich.edu/facultyresearch/l... 阅读全帖 |
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a*l
发帖数: 2685 | 37 thx in advance
Vip3Aa Tolerance Response of Helicoverpa armigera Populations from a Cry1Ac
Cotton Planting Region
An J, Gao Y, Wu K, Gould F, Gao J, Shen Z, Lei C.
Journal of Economic Entomology 103(6):2169-2173. 2010
Characterization of Bacillus thuringiensis isolates from soil and small
mammals that harbour vip3A gene homologues
Izabela Swiecickaa, Maria Sztachelskaa, Magdalena Czajkowskab, Dennis K.
Bideshicd & Brian A. Federicid
Biocontrol Science and Technology 21(4):461-473. 2011 |
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a*l
发帖数: 2685 | 38 Characterization of Bacillus thuringiensis isolates from soil and small
mammals that harbour vip3A gene homologues
Izabela Swiecickaa, Maria Sztachelskaa, Magdalena Czajkowskab, Dennis K.
Bideshicd & Brian A. Federicid
Biocontrol Science and Technology 21(4):461-473. 2011
上次求过，有人说有，可是没有回音了，最后还是没有收到
谁能给发一个到c*******[email protected]或者上传到spacesend都可以
谢谢 |
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m******g
发帖数: 467 | 39 Nature 14.03.06
稍微了解一下：
1. A predictive fitness model for influenza
2. DNA interrogation by the CRISPR RNA-guided endonuclease Cas9
a short trinucleotide protospacer adjacent motif (PAM)
3. Cell-autonomous correction of ring chromosomes in human induced
pluripotent stem cells
lost the abnormal chromosome and duplicated the wild-type homologue
through the compensatory uniparental disomy
小知识：
1. Genes make bacteria magnetic
2. Worms bond to reach new heights
towers with up to 1,000 individuals, r... 阅读全帖 |
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o****u
发帖数: 214 | 40 谨慎猜测你们是不是刚开始做de novo design？如果你们是业界大牛，请原谅我的唐突。
de novo design预测出来的结构，最后表达不出来的，或者折叠不了的，可以说是十有
八九。只是这样的nagative result是发不出来文章的，所以外行看了几篇N/S文章，会
有结构预测已经很成熟的错觉。比较稳妥的做法，还是要参考自然中已经存在的蛋白，
最好是结构已经测定的蛋白来做骨架，然后再通过计算修正。100aa的小蛋白或者长多
肽的折叠已经非常复杂，如果没有homologues,几乎不可能直接准确预测。
另外，de novo design很大程度是依靠统计意义的成功。一般要有上百个预测的结构，
然后在实验室做筛选。最终序列还要做上数轮的定向进化修正。只设计一个序列，然后
就运气好爆直接成功的，我是没见过。
如果有公司在1000美元提供高质量（>80%纯度）的100aa的多肽，我建议你们直接定，
这个价格非常便宜。如果你们想继续试生物表达，除了前面的建议外，你还可以试试
Profinity eXact purification kit.这个系统无需添加额外蛋白酶，加tag表达，... 阅读全帖 |
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x****6
发帖数: 4339 | 41 神棍Michael Behe和你持相同观点。请google irreducible complexity
“生物是个协调工作的系统，考虑到这点，突变出一个新功能，等于和整个系统不兼容
。”
你这里好几一个无法验证的假设：协调工作的系统没有robustness；对体统进行突变，
系统就宕机。
三点来反驳你的观点：
1. 生命系统有高度的繁冗性，就是可以操作相同功能的基因/功能模块在同一个基因组
里存在好多个homologues。就是说突变掉一个，还有候补。这已经在生物信息学和遗传
学上得到了N多验证
2. 给定蛋白质序列空间的无限尺寸（一个61个氨基酸的小多肽的可能序列和全宇宙的
原子数大体相同），进化注定是一个local optimization的过程，也就是说生命系统和
人类设计的系统有本质区别，生命系统可以说是一直在自然界多变的环境里修修补补演
化出来，选择压力随环境一直在变；而人类设计系统是由一个明确定义的目标功能的，
所以非常的specific。
3. 上面提到自然界变化环境，有理论和实验已经发现其实生命不仅对每一次环境变化
适应，而能够对环境变化本身去适应：给定环境变得太多过... 阅读全帖 |
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s****l
发帖数: 820 | 42 Functional characterization and specific effects of various peptides on
enzymatic activity of a DPP-III homologue from goat brain.
Dhanda, Suman; Singh, Hari; Singh, Jasbir; Singh, Tej P.
Journal of Enzyme Inhibition and Medicinal Chemistry (2008), 23(2), 174-
181.
(Award: bao zi :)
Thanks! |
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x********8
发帖数: 167 | 43 刚刚看见化学所的一篇相关工作，下午读一读。
Direct Enrichment of Metallic Single-Walled Carbon Nanotubes Induced by the
Different Molecular Composition of Monohydroxy Alcohol Homologues
Yu Wang 1, Yunqi Liu, Prof. 1 *, Xianglong Li, Dr. 1, Lingchao Cao 1,
Dacheng Wei 1, Hongliang Zhang 1, Dachuan Shi 1, Gui Yu, Dr. 1, Hisashi
Kajiura, Dr. 2 *, Yongming Li, Dr. 2
SMALL, Volume 3, Issue 9 , Pages 1486 - 1490 |
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x********8
发帖数: 167 | 44 读到化学所刘云圻教授和索尼公司做的一个工作，发表在最新一期的SMALL上。
Direct Enrichment of Metallic Single-Walled Carbon Nanotubes Induced by the
Different Molecular Composition of Monohydroxy Alcohol Homologues
Yu Wang, Yunqi Liu, Xianglong Li, Lingchao Cao, Dacheng Wei, Hongliang Zhang
, Dachuan Shi, Gui Yu, Hisashi Kajiura, Yongming Li
Small, 2007, 3, 1486
这张摘要图确实画的很诡异，有点迎奥运圣火的意思，呵呵。这个火就是OH激子，容易
把碳管给烧掉。作者考察了不同长度碳链的醇作为碳源，结果发现烷醇的碳氧比对产物
的金属型产虑有很大影响，乙醇金属型最少，戊醇最高，这个可以从喇曼和吸收中判断
出来。作者还使用了一个电烧蚀方法来定量推算金属型单壁管的量，很有意思的方法。
有句话我没看明白：
‘Ge |
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l******u
发帖数: 2314 | 45 Small
Direct Enrichment of Metallic Single-Walled Carbon Nanotubes Induced by the
Different Molecular Composition of Monohydroxy Alcohol Homologues
Volume 3, Issue 9 (September 3, 2007) (p 1486-1490)
Yu Wang, Yunqi Liu, Xianglong Li, Lingchao Cao, Dacheng Wei, Hongliang Zhang
, Dachuan Shi, Gui Yu, Hisashi Kajiura, Yongming Li
Published Online: 13 Aug 2007 DOI: 10.1002/smll.200700241
Abstract References Full Text:HTML,PDF (Size: 680K)
【简评】此文在《豆腐文摘：08/28/07》已收录，但是彼时没有时间八。今天看到黄兄
的简述，决定细读一下。
文章要点： |
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w*****d
发帖数: 57 | 46 转华人科学网。http://www.sciencenets.com/thread-1618-1-1.html
谢灿的文章《A magnetic protein biocompass》终于在《Nature Material》上发表了
，首先恭喜一下作者的文章发表。这也意味着，我们首次有机会比对谢灿与张生家的文
章，对两人关于“抢发”文章的争议做出有一个客观评价。
首先，我来总结并点评一下谢灿的文章所描述的研究成果。
总结：
文章回顾了目前已经提出的动物利用磁场定位的机理。第一，光感蛋白Cryptochromes
（Cry）可以在光线刺激下对地磁场产生反应，而缺失这个蛋白的果蝇会失去磁感应的
能力，因此Cry被认为对动物磁感应起重要作用。但是Cry本身不具备磁极性，因此不具
备指南针的功能。第二，由动物体内具有磁性的矿物质所形成“magnetite”被认为是
另一个磁感应的机制，这些磁性矿物质已经在多种动物的器官中被发现，但是有研究指
出这些矿物质与磁感应无关。
基于以上两点，谢灿在文章中提出一个猜想——应该存在一个具有磁性的蛋白，能与
Cry结合，并且具有磁受体的功能；谢灿将这个假设中的... 阅读全帖 |
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