由买买提看人间百态

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全部话题 - 话题: cytof
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f*****m
发帖数: 24
1
pharma company located in Massachusetts, looking for a head to lead the core
facility which was just built.
Requirement:
preferred PhD with a couple of year experience(either postdoc or industry
eperience).
solid immunology background.
strong technical expertise in handling Mass cytometry (CyToF),FACS and Flow
Cytometry.
Play manager role/ to be managing at least one scientist.
内推。职位要求管好仪器,提供sorting, 懂cytof data analysis, 会有机会自己
做science, 有兴趣的和背景相近的,简历可以发到 f*******[email protected]
有问题可以私信我。
f*****m
发帖数: 24
2
pharma company located in Massachusetts, looking for a head to lead the core
facility which was just built.
Requirement:
preferred PhD with a couple of year experience(either postdoc or industry
eperience).
solid immunology background.
strong technical expertise in handling Mass cytometry (CyToF),FACS and Flow
Cytometry.
Play manager role/ to be managing at least one scientist.
可以内推。职位要求管好仪器,提供sorting, 懂cytof data analysis, 会有机会自己
做science, 有兴趣的和背景相近的,简历可以发到 f*******[email protected]
有问题可以私信我。
b*****n
发帖数: 34
3
来自主题: Biology版 - 免疫学热点都有什么
纯个人观点
Metabolic control during the establishment of immune responses
Neoantigen (for cancer mostly)
CyToF
Crispr-Cas9 in modulating immune cells
Autophagy of immune cells
y****6
发帖数: 196
4
来自主题: Biology版 - 免疫学热点都有什么
大家对Cytof 这么推崇?

★ 发自iPhone App: ChineseWeb 1.0.4
p**t
发帖数: 160
5
来自主题: Biology版 - 免疫学热点都有什么
CyTOF基本上是研究方法上的一个革命,但是对问题本身不够懂的也用不好这个工具,
就是流水线一样发papers。对问题本身很懂的,可以用这个tool做很多有意义的事情。
A*****n
发帖数: 243
6
来自主题: Biology版 - t-SNE和PCA哪个好?为什么?
当数据维数很高的时候,比如3万多个基因,尤其其中还有一些co-linear的特征,使用
PCA以及SVD有助于将数据维数降到一个合理范围,比如50或者100以下。这样对于距离
矩阵的计算有很大帮助,另外也有助于减少噪音对于距离计算的影响。这个时候可以试
着用PC1 to 3 先对数据进行初步的观察,看看有没有一些结构。如果PC1 to 3的total
variance实在太小,这个时候才考虑用tSNE做进一步的降维分析。当然如果象CyTOF这
种维数本来就比较低,而且基因之间差异又比较大的数据,倒是无所谓。
所有非线性的转换如果不选择合适的参数的话,结果很容易misleading,发现一些
artificial的结构。不过这种负结论很多人不爱听。
http://distill.pub/2016/misread-tsne/
K******S
发帖数: 10109
7
来自主题: Biology版 - 高大上实验室装备
高大上还不好办。哪个贵买那个。比如买thermo 的 fusion lumos 1M, 一个米, 做
proteomics. 加上现在免疫领域里比较火的cyTOF做flow,也是一个米朝上的price tag.

:最近有很大一笔经费,用于实验室重建和购置全新设备。很大的实验室像个
department, ~65人
B***v
发帖数: 113
8
来自主题: Biology版 - 高大上实验室装备
你推荐的这个Orbitrap非常好,这个需要有专人负责吗?还是操作数据处理很简单,一
般的做试验的Ph.D都可以操作?
CyTOF也是非常好的推荐,有具体的型号推荐吗?比如这个?
http://cn.fluidigm.com/products/helios
同样的问题:需要雇佣专人操作机器和处理数据吗?
我说的高大上就是这些买了可以扩大研究手段节省时间,价格$5000 - $1+M

tag.
K******S
发帖数: 10109
9
来自主题: Biology版 - 高大上实验室装备
质谱需要1到2个专门的人,CyTOF的至少3到5人。

:你推荐的这个Orbitrap非常好,这个需要有专人负责吗?还是操作数据处理很简单,
一般的做试验的Ph.D都可以操作?
g*****x
发帖数: 3283
10
来自主题: Biology版 - 高大上实验室装备
做proteomics的话,仪器基本得靠买thermo的service pack,自己只能做一些简单的日
常维护。
实验本身都是比较routine的东西,基本上是个人就能做。
难点在于大量数据分析。基本上一个样品重复几分可能就有上百万张spectra,找到一
个可靠的workflow产生有意义的结论还是需要有经验的人的。


: 你推荐的这个Orbitrap非常好,这个需要有专人负责吗?还是操作数据处理很简
单,一

: 般的做试验的Ph.D都可以操作?

: CyTOF也是非常好的推荐,有具体的型号推荐吗?比如这个?

: http://cn.fluidigm.com/products/helios

: 同样的问题:需要雇佣专人操作机器和处理数据吗?

: 我说的高大上就是这些买了可以扩大研究手段节省时间,价格$5000 - $1 M

: tag.

K******S
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来自主题: Biology版 - 高大上实验室装备
高大上还不好办。哪个贵买那个。比如买thermo 的 fusion lumos 1M, 一个米, 做
proteomics. 加上现在免疫领域里比较火的cyTOF做flow,也是一个米朝上的price tag.

:最近有很大一笔经费,用于实验室重建和购置全新设备。很大的实验室像个
department, ~65人
B***v
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来自主题: Biology版 - 高大上实验室装备
你推荐的这个Orbitrap非常好,这个需要有专人负责吗?还是操作数据处理很简单,一
般的做试验的Ph.D都可以操作?
CyTOF也是非常好的推荐,有具体的型号推荐吗?比如这个?
http://cn.fluidigm.com/products/helios
同样的问题:需要雇佣专人操作机器和处理数据吗?
我说的高大上就是这些买了可以扩大研究手段节省时间,价格$5000 - $1+M

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K******S
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质谱需要1到2个专门的人,CyTOF的至少3到5人。

:你推荐的这个Orbitrap非常好,这个需要有专人负责吗?还是操作数据处理很简单,
一般的做试验的Ph.D都可以操作?
g*****x
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做proteomics的话,仪器基本得靠买thermo的service pack,自己只能做一些简单的日
常维护。
实验本身都是比较routine的东西,基本上是个人就能做。
难点在于大量数据分析。基本上一个样品重复几分可能就有上百万张spectra,找到一
个可靠的workflow产生有意义的结论还是需要有经验的人的。


: 你推荐的这个Orbitrap非常好,这个需要有专人负责吗?还是操作数据处理很简
单,一

: 般的做试验的Ph.D都可以操作?

: CyTOF也是非常好的推荐,有具体的型号推荐吗?比如这个?

: http://cn.fluidigm.com/products/helios

: 同样的问题:需要雇佣专人操作机器和处理数据吗?

: 我说的高大上就是这些买了可以扩大研究手段节省时间,价格$5000 - $1 M

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