由买买提看人间百态

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全部话题 - 话题: colie
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r*s
发帖数: 2555
1
来自主题: Joke版 - 诺委会太不像话了
尼玛87篇参考文献就不能加一篇施教授或能教授的CNS?
References
1. Ruska, E., Nobel Lectures, Physics 1981-1990, Tore Frängsmyr and
Gösta Ekspong, Eds. (1993) World Scientific Publishing, Singapore
2. Marton, L. (1934) Electron microscopy of biological objects. Nature
133, 911-911
3. Althoff, T., Mills, D. J., Popot, J. L., and Kühlbrandt, W. (2011)
Arrangement of electron transport chain components in bovine mitochondrial
supercomplex I1III2IV1. The EMBO Journal 30, 4652-4664
4. Letts, J. A., Fied... 阅读全帖
n**t
发帖数: 45
2
【 以下文字转载自 Biology 讨论区,原文如下 】
发信人: royluo ( 罗马情结), 信区: Biology
标 题: 从纯化到星辰---CSH蛋白质纯化课侧记(三)
发信站: Unknown Space - 未名空间 (Thu Apr 28 17:44:52 2005) WWW-POST
本文献给YL
(三) 不溶的sigma32
四月六号早上,我们开始了第一模块的实验,Burgess教授负责。这老兄研究了一辈子E.Coli的RNA polymerase。E.Coli RNA polymerase 核心酶是一个蛋白质复合体,只有合成RNA的活性,却没有
识别DNA的能力。Sigma系列因子能够识别启动子, 并且与核心酶结合,从而实现转录。我们这个实验
的核心主角就是其中一个因子,叫sigma32。Sigma32可以识别heat shock genes的启动子。Sigma 32
过表达在大肠杆菌里面的时候,绝大部分形成了不溶的包涵体(inclusion body),我们的任务就是要用变性
剂溶解变性不溶的蛋白,然后做重折叠。
所有的buffer几乎都已经配好了
I*****y
发帖数: 6402
3
来自主题: Biology版 - Re: Question regarding inducible operon
hmmm, to answer your question, I'd like to start as if you understood the
transcription machinery in prokaryotes (E.coli falls into the category of
prokaryotes). In the lac operon (repressor) experiment, we use the plasmid
construct that has incorporated the selective marker gene (e.g. uracil
gene,etc). The marker gene can tell you whether the transcription occurs or
not, because the media that we use contains no uracil, the E.coli iteself has
to produce the uracil. The plasmid construct is alr
r****o
发帖数: 105
4
本文献给YL
(三) 不溶的sigma32
四月六号早上,我们开始了第一模块的实验,Burgess教授负责。这老兄研究了一辈子E.Coli的RNA polymerase。E.Coli RNA polymerase 核心酶是一个蛋白质复合体,只有合成RNA的活性,却没有
识别DNA的能力。Sigma系列因子能够识别启动子, 并且与核心酶结合,从而实现转录。我们这个实验
的核心主角就是其中一个因子,叫sigma32。Sigma32可以识别heat shock genes的启动子。Sigma 32
过表达在大肠杆菌里面的时候,绝大部分形成了不溶的包涵体(inclusion body),我们的任务就是要用变性
剂溶解变性不溶的蛋白,然后做重折叠。
所有的buffer几乎都已经配好了,所以直接做就行了。我们先用1% Triton 来溶解细菌本身的一些蛋白,
inclusion body 相当稳定,不溶于triton,所以这一步,绝大部分垃圾就被去掉了。
下一步就是用变性剂来溶解inclusion body。用什么好呢?Burgess教授提到了sarkosyl。sarkosyl(N-十
s*******y
发帖数: 2366
5
来自主题: Biology版 - 请推荐 mammalian expression system
现在要表达一个人类蛋白,750 aa
试过E coli和yeast
E coli 纯化产量太低,yeast 需要codon optimization
所以想找mammalian表达系统
请用过的推荐一下!谢谢~
s******y
发帖数: 28562
6
Onething you can try first, is to co-transform E.coli with a plasmid
containing the sense mRNA and another plamid containing the antisense RNA,
and see if this antisense RNA can also inhibit the expression of the protein
in E.coli.

Northern
h***e
发帖数: 146
7
It can work in E.coli in tumour? I mean if I express a protein under this
HRE promoter in E.coli or other tumour-targeting bacteria, it can express in
the hypoxia of tumour cells but not in normal cell.
Thanks

thing
background
w*c
发帖数: 875
8
不是e.coli表达的,是从我们做的菌种里面直接提纯的。
e.coli倒是也能表达,但是iron sulfur cluster incorporation就是个问题,需要rec
onstitution。
我生平最恨的两件事情:
DTNB assay和protein reconsitution(我的另外一个蛋白里面有四个4Fe-4S和一个2Fe
-2S)
i***e
发帖数: 13
9
来自主题: Biology版 - 請教tRNA aminoacylation experiment
Hi- All,
I am having trouble with the simple tRNA aminoacylation reaction where E.
coli crude tRNA, E. coli S100 and 3H-Glu were added together with the AA
buffer and ATP. No charged tRNA could be detected. S100 and crude tRNA mix
have been tested to be active before in a similar experiment. The positive
control using Glu tRNA and active Glu -tRNA synthetase also didn't work. Is
anybody familiar with this reaction and suggest some possible reasons?
Thanks a lot!
C*******e
发帖数: 4348
10
来自主题: Biology版 - 乘着人气高求教个PCR疑难
我没有说细菌X来源的endogenous plasmid直接测序测不出
我说E.coli的那个测不出
细菌来源的我前天才提的,不多,做PCR可以,测序不够,所以还没有测序
我同意你的说法E.coli的那个plasmid多半有些什么问题
但是我用细菌X的endogenous plasmid做PCR出来的结果是一样的
x*********a
发帖数: 906
11
来自主题: Biology版 - Question about T7 promoter (Bao Zi)
Is this true?
In T7 RNA polymerase negative E. coli strain, T7 promoter-driven gene could
be expressed at a low level by other (prophage) RNA polymerases.
Anyone observed/heard the expression of T7 promoter-driven gene on high-copy
plasmid in T7 RNA polymerase negative E. coli strains?
Thanks.
h**********d
发帖数: 30
12
来自主题: Biology版 - 请教一下膜蛋白表达问题
基本情况:
E.coli C43, cyoABCDE knockout(Km)表达cytochrome bo3, tyrA knockout(Cm)
tyrosine生物
合成中的一个酶(从prehenate到4-hydroxy-phenylpyruvate)
pAc-YNH2 plasmid(Tet): proK promoter + 6 copy of M.j tyrosine tRNA, glnS
promoter
+ 3-aminno-tyrosine M.j tRNA synthase (M.j is an archea strain)
pET plasmid(Amp): T7 cyoABCDE w/ cyoB Y288Amber stop codon mutation
要表达的是cytochrome bo3 mutant protein, 在蛋白里genetically引入一个非天然氨
基酸
(peter schultz组的技术,pAc-YNH2质粒也是从他们组拿给MIT的STUBBE组做的,她们
组没遇
到过这个质粒的问题)
这两个质粒同时存在于E.coli c43里的时
o********r
发帖数: 775
13
这个和你想P出来原理基本上一样,差别是一个用E coli来扩增,一个用PCR,我还是相
信E coli多些
t********7
发帖数: 22
14
来自主题: Biology版 - 求助: 克隆 60kb DNA fragment
各位大侠,
我需要从一个bacteria的chromosome里克隆一段60kb的dna,并放到E.Coli里去表达。请
问有什么好的PCR方法能够克隆60kb的dna的。我目前只看到Roche好像有卖克隆5-20kb
的kit. 不知道有没有直接可以一次pcr 60kb的方法。(如果不行,是不是需要多次克
隆片段,然后ligation?)
还有,如果要放到e.coli表达,一般是用BAC做vector么?大家有相关什么文章可以推
荐阅读的嘛?或者BAC有哪里可以买的么?
先谢谢了。
m********r
发帖数: 124
15
来自主题: Biology版 - 课题换得太累了,还换不换?
我们是做生化的,体外纯化蛋白,做相互作用(fluorescence,ITC,pulldown),
顺便做点结晶和核磁,mapping作用位点。我第三年下了。
Rotation 的时候做一个真核信号通路蛋白的A domain(这也是老板postdoc做的
domain),是个很好纯化的蛋白,做的还行,有个coauthor的paper(师兄一作,4分左
右,话说我觉得实验室就这个水平了)。
加入实验室之前,另外一个rotation的学生做B和C蛋白,是原核的信号通路。当时
我感觉我加入实验室是不就做这个了。结果老板让我先做D和E, 顺便做原来的真核蛋
白的F domain,理由是应用的技术是一样的,要charaterize的蛋白性质也是相同的。
这是实情。这个时候有个小的grant, 关于蛋白BCDE的。结果我第二年冬天发现F
domain太大,不好做。而D和E表达起来比较困难,不可溶。加上B和C合作者有genetics
的data,所以就做了点这个。之后回国,春天回来做助教,上课考qualify,几乎春季
没做实验。完了之后,发现D和E 已经被马普的两个组发了。人家一... 阅读全帖
C*******e
发帖数: 4348
16
我怎么记得这种“artifical”的其实还是用了现有的细菌的
合成的是染色体
然后把细菌(多半是E.coli)去染色体
然后把合成的染色体放进去
所以细胞质之类的东西还是用的E. coli的
s********n
发帖数: 2939
17
我没有去看那篇文章,只是他们的主要作者过来做报告听了一下,感觉还不错,大概有
以下几点:
1)他们是做Mycoplasma,主要是基因组小,大概0.5M,合成起来相对E. coli容易一些;
2)忘了是哪个species了,暂且称为A和B;
3)他们先在E. coli里合成A的基因组片段,但是好像不稳定,可能是重组吧;
4)然后改在yeast里合成,分段测序验证,最终得到完整的Mycoplasma A的genome(当
然带有yeast的ori和antibiotics resistance gene和一些其他的序列);
5)把Mycoplasma B的genome去掉(一个很复杂的技术,反正我不太了解),将合成的
Mycoplasma A genome转入Mycoplasma B的细胞质内,培养所得到的杂合体;
6)经过多代培养后验证得到的细胞已经完全是Mycoplasma A自己的核糖体及其他的细
胞组成。
虽然还不能真正称得上artificial cells,但至少阐明了可能性和发展了一些关键的技
术,还是很有意思的。
Z****o
发帖数: 999
18
换E.coli菌株吧,记得有一种菌株专门适合表达大的质粒,比如BAC,YAC库之类的。一
般的E.coli菌株表达12k以上的质粒都比较吃力。
h**********r
发帖数: 671
19
来自主题: Biology版 - 大家讨论一下synthetic biology吧
Keasling主要是在yeast中玩的,再说了K先生组在e. coli中偏好arabionose
inducible的Pbad,早期Keasling在这个promoter上花了不少功夫包括模型和实验。
最近WHO已经发现青蒿素的耐药性出现了。这个比较搞,synthetic biology还没有搞好
,人家那边耐药性已经出现了。其实这工作也就这种大组有稳定的funding能玩玩儿。
不过说不定有些enzyme能对前体物修饰,一定程度上对抗这种耐药机制。
以前有篇报道,说这种pathway组装,需要大量的人力来完成(千老的作用显现出来了
),说Keasling的工作(从基因到产量)需要多少个postdoc 50年完成(数字不记得了
)。现在也有人在想发明更高效的pathway assembling的过程。keasling的工作有点像
是“炮轰”式,遇到问题了一堆人来做mutant克服inhibition啊尝试不同的表达量啊。
不喜欢思考形而上学的东东。这么些年来,其实让人印象深刻的东西不太多(scaffold
上蛋白的表达synthetic operon等)。去年发的那篇nature关于... 阅读全帖
h**********r
发帖数: 671
20
来自主题: Biology版 - 大家讨论一下synthetic biology吧
Keasling主要是在yeast中玩的,再说了K先生组在e. coli中偏好arabionose
inducible的Pbad,早期Keasling在这个promoter上花了不少功夫包括模型和实验。
最近WHO已经发现青蒿素的耐药性出现了。这个比较搞,synthetic biology还没有搞好
,人家那边耐药性已经出现了。其实这工作也就这种大组有稳定的funding能玩玩儿。
不过说不定有些enzyme能对前体物修饰,一定程度上对抗这种耐药机制。
以前有篇报道,说这种pathway组装,需要大量的人力来完成(千老的作用显现出来了
),说Keasling的工作(从基因到产量)需要多少个postdoc 50年完成(数字不记得了
)。现在也有人在想发明更高效的pathway assembling的过程。keasling的工作有点像
是“炮轰”式,遇到问题了一堆人来做mutant克服inhibition啊尝试不同的表达量啊。
不喜欢思考形而上学的东东。这么些年来,其实让人印象深刻的东西不太多(scaffold
上蛋白的表达synthetic operon等)。去年发的那篇nature关于... 阅读全帖
f**u
发帖数: 346
21
来自主题: Biology版 - yeast miniprep
那个beads得protocol分出来的质粒不是给你测序用的,一不够多二不够纯。
那个是让你用来转E. coli或者PCR的。
如果需要纯的质粒可以先转E. coli然后再抽出来。

ml
h**********r
发帖数: 671
22
来自主题: Biology版 - BioBrick使用疑问
不知道版上有没有同修用BioBrick?例如NEB的http://www.neb.com/nebecomm/products/productE0546.asp或iGEM的。我以前没有接触过。最近要从别的实验室要到一个质粒,带有BioBrick。我有几个疑问:
1. 扩增克隆质粒是不是必须用E. coli DB3.1?
BioBrick上带有ccdB。ccdB is a lethal gene that targets DNA gyrase。E. coli
DB3.1上有gyrA462的突变。可是JM109,DH5a还有XL1-Blue上有gyrA96的突变。实验室
没有DB3.1,但有JM109。不知道可以替代不?Invitrogen有新一代的One Shot®
ccdB Survival 2 T1R Competent Cells出来。可是贵啊,没有买感受态细胞的
习惯。
2. 虽然ccdB是个negative selection marker,感觉不像sacB那样有用,在biobrick里面
有点多此一举吧。还是我的理解不够深入?
http://partsregistry.... 阅读全帖
s*********t
发帖数: 600
23
来自主题: Biology版 - 一公时代的到来zz
一公时代的到来
一公时代的到来,指的是清华大学生命科学院、中国的结构生物学史上施一公时代的到
来。借着清华大学百年校庆,这
两天在清华举办的FPS(Frontiers of Protein Sciences)会议作为醒目的标志,给大
家展示了施一公教授的能力与魅
力。一公时代的大幕朝每一个与会者闪亮的拉开。
这段话写的是如此的像托,像清华生科院给媒体的公关文,但这确实是我这次会议的切
身感受,容我一一道来。
施一公教授从2008年回清华组建实验室到现在,满打满算三年。三年对于一个挪窝的人
来说,是短暂的,结束那边的事
情,迎接这边的事情,科研上的行政上的生活上的麻烦不会少,而且还有方/舟/子对他
有理有据的质疑。这种日子肯定
不会好过,他是怎么过的,我不知道,我所知道的是我们大家都能看到的。
科研上。饶毅教授下过结论:施一公教授是华人里发表CNS文章最多的人。这指他在
Princeton的时候,回来以后呢?会
议上发的介绍里,施一公教授从09年到11年的selected publications共11篇,Cell两
篇,Nature四篇,Science一
篇,PNAS两篇,Mol ce... 阅读全帖
x********u
发帖数: 430
24
来自主题: Biology版 - DNA microarray help? Thanks.
The procedure I found in the literature;
1) grow E. coli to late-exponential phase
2) extract total RNA with RNeasy Protect Bacteria Mini Kit(Qiagen)
3) purify RNA by RNeasy Mini Kit(Qigen) spin column
4) send samples to xxxxx University Functional Genomics Core Facility for
amplication, labeling and hybridization to the Affymetrix GeneChip E. coli
genome 2.0 Array.
5) Data analysis by MatLab bioinformatics toolbox
Question: For amplication of total mRNA and labeling of the resulting cDNA
in ste... 阅读全帖
l****3
发帖数: 399
25
Escherichia coli (E.coli)
Staphylococcus aureus (S.aureus)
http://www.otradi.org/working-assay-development-and-automation.
Pseudomonas aeruginosa, B. subtilis在天然产物筛选的lab也很常见
找找你们学校药学院或者化学系做天然产物以及抗生素生物合成的人问问
h**********r
发帖数: 671
26
对于这个我是外行,现在也没有机会接触这个。但是有时候也看看这方面的paper,挺矛
盾的。为什么觉得难呢?瞎说说吧:
1. pathway/metabolic engineering归于synthetic biology。虽然为了骗funding,不
得不这样。前段时间来了人做seminar,说是synthetic biology,结果就做了点E.coli
里产 PHB。把人恶心坏了。可是能说他不是synthetic biology吗?这方面好好干也可
以,需要点突破性的东西。
2. 做这行idea最重要。大家连western都不用做,靠一些小电影儿就能弄出大paper。
可见实验手段不是啥制约因素。牛人嘛,克隆表达两三个基因就迷倒万千众生。Craig
Venter那种猛男除外。矛盾在于,有时候过分玩弄小技巧挺没劲的。不玩弄吧,干点啥
好呢?
3. 要跟到大牛!在烂lab里,你做的一文不值。可到牛组,加上老板的vision/忽悠/
network,可能就不一样了。道理很明显,你看看排名50开外的学校,有哪些组在干
synthetic biology?基本上被一些人把持着。当然,皮糙肉厚... 阅读全帖
s*******s
发帖数: 623
27
Job ID: GF2011A001
Posting Title: Research Scientist/Research Associate/Bacterial Geneticist
Brief Introduction of Gate Fuels Inc.: “Imagination, Innovation,
Implementation --- Enabled Technologies for a Green Clean World”
Gate Fuels Inc. is a research start-up firm based in Blacksburg, VA, with
the goal of developing microbial and cell-free platform technologies that
enable low-cost production of biochemicals and biofuels. The first platform
is based on industrially-safe Bacillus subtilis. Thi... 阅读全帖
e*******e
发帖数: 342
28
来自主题: Biology版 - 从国内要菌株
版上有没有从国内要过E.coli菌株的朋友,我现在想从国内的实验室要一个重组的E.
coli菌株,如果邮寄的话,不知道在美国海关会不会被审查和扣押?谢谢
e*****r
发帖数: 1229
29
来自主题: Biology版 - 一个chemotaxis问题
E。 Coli细胞表面上有 TAR 和TSR等receptor,这些receptor
是细胞接受外界化学信号的接受器。 那么比较大的细胞,例如eukaryotic细胞, 表面
上的receptor有那些哪?我查阅了文献, 大家都讨论E. Coli, 没讨论eukaryotic细
胞的。多谢了
c********b
发帖数: 363
30
每个步骤都是别人都知道的,我只是组装了一下. 最大不同是别人是先Urea变性,提出来
再复性.我是利用Triton X-100可以洗脱SDS的特点利用SDS变性,然后Triton X100洗脱
复性,然后过柱. 肯定不会对所有蛋白适用,但是起码我遇到的都work (包括一个>100
Kd的酶).
我是用的sonication water bath, 也可以用probe sonication再加SDS,都OK,但是注意
dilution的比例和体积.
Good luck. 用的高兴分我几个包子.
Key, keep a fraction from every step for analyses and trouble shooting
- Culture the E. coli overnight
- Induce it at a proper concentration of IPTG, room temperature for ~
4hrs
- Pellet the E. coli at 6000 rpm at 4 degree
- R... 阅读全帖
s******a
发帖数: 472
31
http://www.cell.com/molecular-cell/fulltext/S1097-2765(11)00331
Fifty Years after Jacob and Monod: What Are the Unanswered Questions in Molecular Biology?
=====================================================================
Tomorrow's Molecular Biology
Marc W. Kirschner
Harvard University
Today, the term molecular biology has a rather prosaic sound. After all,
there is little in contemporary biology that isn't molecular. It's hard to
remember that 50 years ago, molecular biology was distinctly ... 阅读全帖
C*******e
发帖数: 4348
32
lambda red system的有一个2002年的PNAS
那个实验室有这个E.coli菌株
插入片段两端有46nts的flanking region就可以了
线性DNA片段和目标plasmid一起电转化到那个E.coli菌株就行
就是你要有个方法筛
比如线性DNA片段上有另外一个抗性之类的
不然大海捞针
z*h
发帖数: 773
33
来自主题: Biology版 - gateway克隆的问题
try this new technology -- Simple Cloning.
You, C., X.-Z. Zhang, and Y.-H. P. Zhang. 2012. Simple Cloning: direct
transformation of PCR product (DNA multimer) to Escherichia coli and
Bacillus subtilis. Appl. Environ. Microbiol.:doi:10.1128/AEM.07105-07111.
Abstract
We developed a general restriction enzyme-free and ligase-free method for
subcloning up to three DNA fragments into any location of a plasmid. The DNA
multimer generated by prolonged overlap extension PCR was directly
transformed in E... 阅读全帖
g***j
发帖数: 40861
34
来自主题: Biology版 - 文献求助 有连接
Thank you very much and have a good holiday!
s*****[email protected]
1.
Inhibition of Salmonella enterica by plant-associated pseudomonads in
vitro
and on sprouting alfalfa seed
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16629011
2.
Effects of community versus single strain inoculants on the
biocontrol of
Salmonella and microbial community dynamics in alfalfa sprouts
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/15690802
3.
Scale-up seed decontamination process to inactivate Escherichia coli
O157:H7
and Salmonella Enter... 阅读全帖
h**********r
发帖数: 671
35
来自主题: Biology版 - 问个酵母质粒表达的弱智问题
酵母做的少,e. coli做得多点。所以就有问题了。用的基本上是商业化的质粒,pESC-
leu.
问题是看不出来翻译起始位点ATG,而且多种版本的manual上面不提这个问题.不像E.
coli的pET系列,要么在NdeI要么在NcoI.
我是不是把带有ATG的ORF放在多克隆位点就行了?我亚克隆的片段自己有终止密码子,
在此之前也有tag,所以不需要载体的tag。而且载体的tag正好在C端。当然转录方向还
是要看的。
包子伺候!
多谢啊!
g***j
发帖数: 40861
36
来自主题: Biology版 - 文章求助
s*****[email protected]
谢谢!
1.
Inactivation of Escherichia coli O157:H7 and Salmonella Typhimurium DT 104
on Alfalfa Seeds by Levulinic Acid and Sodium Dodecyl Sulfate
Authors: Zhao, Tong; Zhao, Ping; Doyle, Michael P.
Source: Journal of Food Protection®, Volume 73, Number 11, November
2010 , pp. 2010-2017(8)
2.
Control of Salmonella on Sprouting Mung Bean and Alfalfa Seeds by Using a
Biocontrol Preparation Based on Antagonistic Bacteria and Lytic
Bacteriophages
Authors: Ye, Jianxiong1; Kostrzyns... 阅读全帖
o******d
发帖数: 204
37
来自主题: Biology版 - 这位年轻海归回国做的不错
在国外没发过顶级的文章,回国越做越好,又发了一篇Science:
http://www.sciencemag.org/content/335/6073/1235.abstract
http://lifescience.sysu.edu.cn/main/default/daoshiDetail.aspx?p
Results: 16
1.
Measuring the evolutionary rate of protein-protein interaction.
Qian W, He X, Chan E, Xu H, Zhang J.
Proc Natl Acad Sci U S A. 2011 May 24;108(21):8725-30. Epub 2011 May 9.
PMID: 21555556 [PubMed - indexed for MEDLINE] Free PMC Article
Related citations
2.
Genetic incompatibility dampens hybrid fertility more than hybrid viabilit... 阅读全帖
i******w
发帖数: 407
38
来自主题: Biology版 - 请问一个WB的内参问题
请问大家做E. coli蛋白的WB时,比如比较某个蛋白的表达随药物浓度的变化,都用什
么做内参的啊?
看到做mammalian cell的都用actin,没找到E.coli里该用哪个蛋白,麻烦做过的xdjm
告知一下,先谢过了。
l**********1
发帖数: 5204
39
来自主题: Biology版 - 请问一个WB的内参问题
6xHis tag plus Anti-6X His tag® antibody
//www.abcam.com/E-coli-Positive-Control-Escherichia-coli-Whole-Cell-Lysate-
ab5395.html

xdjm
h**********r
发帖数: 671
40
I am not the expert. Perhaps it depends. For some bacteria, it’s very hard to do genetic transformation and there are many tricks. For E. coli and some model organisms, it’s very hard to compete with some big labs because everyone can reach it. But if you have very good ideas, it’s still a very good system. I don’t know the details of前途.
For example, Alon’s work:
http://www.weizmann.ac.il/mcb/UriAlon/groupPapers.html
You may find many good papers in E. coli. It seems that they have clear big pic... 阅读全帖
b******n
发帖数: 4225
41
来自主题: Biology版 - 见到了传说中的牛人
的弟子了
2012的ASM年会上听了讲座,这个故事老早就听说了,不过第一次看到他present
牛人(或者疯子)Richard Lenski现在已经将E.coli传了55,000代来研究进化
牛人弟子重复其中大概从30,000到35,000代中一个性状的出现
也就是重复传了5000代E.coli
h**********r
发帖数: 671
42
来自主题: Biology版 - 求pRedET质粒
你可以去E. coli Genetic Stock Center request一套做e. coli gene deletion的
lamda red菌株加质粒(7个左右吧)
r****r
发帖数: 36
43
using yeast instead of E. coli to make the construct first then amplify the
plasmid by E. coli.
but u'll have to put yeast selection marker and replication origin into your
vector.
y*******a
发帖数: 303
44
来自主题: Biology版 - 关于protein kinase subclone 的问题
我最近一直在克隆一个protein kinase gene,连在T-easy vector 上还挺轻松,然后
通过粘性末端切下来, 和pCambia binary vector 相连转入E.Coli后就出现问题了。
有时候菌很难长,有时候长的size正常,做colony PCR没有,以为是gene 太长(3.5kb
)普通的Taqpolymerase很难PCR出来,所以用基因的部分片段PCR,colony PCR都有条
带。提取plasmid后酶切总是很乱,所幸去测序,但都是没测序结果。请问是不是
protein kinase的表达会影响E.coli?
非常感谢!
t****b
发帖数: 47
45
2012年11月13日,新的生物学刊物eLife发表论文:中国科学家攻克了一个长期困扰国
际科学界的难题,而这一基础科学问题也与人类、特别是中国人民的健康相关。
过去,世界和中国忽略了1980年代我国科学家在条件艰苦时代做出重要贡献,我们现在
应该赞广西肿瘤防治研究所的严瑞琪和苏建家等、北京第二传染病院的余昌晏等和中国
医学科学院的庞其方等建立乙肝动物模型;
现在,我国已经有条件和能力改革科学管理体制机制、提供适当环境,让一些科研机构
年富力强的科学家心无旁骛,如北京生命科学研究所的李文辉带领学生和同事发现乙肝
病毒受体;
将来,希望全国科研机构能推广适合各个学科和机构自身规律的体制机制改革,使大批
年轻人集中精力在专业上充分发挥作用,他们大有作为才能使中国的科学大有希望。
肝炎和肝炎病毒
肝炎在全世界有广泛的危害,中国人群肝炎患病率尤其高。多种病毒导致病毒性肝炎:
甲、乙、丙、丁、戊(A、B、C、D、E)等。
全球二十亿人曾感染乙型肝炎病毒(HBV),慢性乙肝感染超过3.5亿人。即使在乙肝疫
苗已经研制成功多年以后,我国还有逾九千万人感染过乙肝病毒,上千万乙肝患者,每
年感染超过百万... 阅读全帖
n******t
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46
Job ID: GF2013A001
Posting Title: Research Scientist/Research Associate/Bacterial Geneticist/
Fermentation Scientist
Brief Introduction of Gate Fuels Inc.: “Imagination, Innovation,
Implementation --- Enabled Technologies for a Green Clean World”
Gate Fuels Inc. is a research start-up firm based in Blacksburg, VA, with
the goal of developing microbial platform technologies that enable low-cost
production of biochemicals and biofuels. The platform is based on the well-
studied Gram-positive mode... 阅读全帖
z*h
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47
来自主题: Biology版 - 问个cloning 的问题
Simple Cloning: direct transformation of PCR product (DNA multimer) to
Escherichia coli and Bacillus subtilis
We developed a general restriction enzyme-free and ligase-free method for
subcloning up to three DNA fragments into any location of a plasmid. The DNA
multimer generated by prolonged overlap extension PCR was directly
transformed in Escherichia coli [e.g., TOP10, DH5α, JM109, BL21(DE3)] and
Bacillus subtilis for obtaining chimeric plasmids.
http://aem.asm.org/content/early/2011/12/16/AEM... 阅读全帖
g***j
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48
来自主题: Biology版 - 求文
Identification of the cellular location of internalized Escherichia coli
O157:H7 in mung bean, Vigna radiata, by immunocytochemical techniques.
J Food Prot. 2011 Aug;74(8):1224-30. doi: 10.4315/0362-028X.JFP-11-015.
Identification of the cellular location of internalized Escherichia coli
O157:H7 in mung bean, Vigna radiata, by immunocytochemical techniques.
Deering AJ, Pruitt RE, Mauer LJ, Reuhs BL.
s*****[email protected]
thank you
n*********m
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49
来自主题: Biology版 - What do you guys work for?
Immunology Retraction Exposes Misconduct
07/10/2013 Andrew S. Wiecek
Nature retracts a 1994 paper after the first author was found to have "most
likely" committed research misconduct. Learn more...
Last week, Nature retracted a highly-cited paper published in 1994 because
the authors were unable to reproduce the results, according to the
retraction notice (1). But the real reason behind the retraction might have
more to do with the first author’s scientific misconduct.
Nature has retracted a 19... 阅读全帖
n*********m
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50
来自主题: Biology版 - What are biologists doing?
mmunology Retraction Exposes Misconduct
07/10/2013
Andrew S. Wiecek
Nature retracts a 1994 paper after the first author was found to have "most
likely" committed research misconduct. Learn more...
Last week, Nature retracted a highly-cited paper published in 1994 because
the authors were unable to reproduce the results, according to the
retraction notice (1). But the real reason behind the retraction might have
more to do with the first author’s scientific misconduct.
Nature has retracted a 199... 阅读全帖
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