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全部话题 - 话题: buffering
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s********r
发帖数: 312
1
我是biorad的那个loading buffer,950ul+50ul beta-ME,然后用水1:1稀释。直接加到
孔里,一般12孔板一个孔100-250ul,晃一晃等2分钟,然后200ul的tip前面剪掉,刮一
刮收起来,煮沸上样。
d****i
发帖数: 2346
2
就是做protein电泳的那个buffer。
现在用的配方是网上找来的,但是发现上样的时候protein sample不下沉,而买来的
marker明显就load下去了。用量很大,老板不愿意买。。。。
谢谢!
a****d
发帖数: 1919
j*****a
发帖数: 92
4
阴离子交换色谱 Q Sepharose Fast Flow (GE Healthcare Life Sciences)pH
stability Working Range 2-12 .用1 M NaOH 洗,用纯水洗到pH 7, 换TrisHCl
buffer pH 5.5 平衡, elute pH 变成9.洗了一天还是pH 9. 有人遇到过吗?
j*****a
发帖数: 92
5
Good point. I need to switch buffer system.
w*******r
发帖数: 23
6
来自主题: Biology版 - IP 和 Co-IP lysis buffer 区别
RT.
请问 IP 和 co-IP 的lysis buffer 可以通用吗?
这两个在实验操作过程中具体有什么区别呢?
谢谢。
n****0
发帖数: 696
7
不同公司的buffer和酶可以通用么?谢谢。
x*****e
发帖数: 309
8
应该可以,你可以查查buffer成分,其实差不多.
t****y
发帖数: 168
9
能。
理论上,只要是相同的名字,就应该是同一种蛋白。相同的蛋白在特定的条件下应该有
相同的反应效率。
实践上,曾经无论什么公司的酶都用NEB的buffer,没有不工作的。
n****0
发帖数: 696
10
谢谢。不过他们buffer的成分都有点小差别,可能影响也不大,我试试看
s*******m
发帖数: 24
11
来自主题: Biology版 - 请推荐western blot的stripping buffer
One minute Striping buffer from gmbiosciences. Works nice and fast for most
antibodies.
d****i
发帖数: 2346
12
来自主题: Biology版 - 请推荐western blot的stripping buffer
对fluorescent二抗的strip buffer哪个好些?
s*******m
发帖数: 24
13
来自主题: Biology版 - 请推荐western blot的stripping buffer
One minute Striping buffer from gmbiosciences. Works nice and fast for most
antibodies.
d****i
发帖数: 2346
14
来自主题: Biology版 - 请推荐western blot的stripping buffer
对fluorescent二抗的strip buffer哪个好些?
x*****o
发帖数: 441
15
很多buffer里面都有EDTA, 它的作用是什么?如果不加会怎么样?
w********a
发帖数: 324
16
Qiagen kit 经常是column用完了,但是还剩很多buffer。
Miniprep kit 的column是可以单独定的。但是PCR clean-up或者Gel extraction kit
的column不能单独定。不知道大家是怎么处理的?有其他公司的column可以作为替代品
吗?
多谢!
s******s
发帖数: 13035
17
扔掉。
buffer不值钱,值钱的是column。

kit
s******y
发帖数: 17729
18
直接扔掉
虽然可以和其他公司的混用,不管是PCR clean-up还是胶回收的,基本上所有的公司的
都是buffer有多柱子不够

kit
G*******a
发帖数: 414
19
buffer是Qiagen额外送给你多的,剩下直接扔掉就可以了。
w********a
发帖数: 324
20
ok. 非常感谢!
我说的就是这个意思。单独订管子,把剩余的buffer利用起来。
r******g
发帖数: 600
21
You can order columns and make the buffer on your own. All recipes are very
standard and available from Qiagen site. My homemade QF, QC, P1, P2 always
work well.
x********e
发帖数: 35261
22
QIAGEN的buffer单买真不便宜
s******s
发帖数: 13035
23
柱子多数应该没问题把,倒是buffer可能问题大点。
你不放心的话,最后的wash和elute自己用RNAse free的水配
一下,有点残留也该洗掉了
d****i
发帖数: 2346
24
目前在做小肠组织的western,给RIPA buffer把SDS加到2%,然后sigma的protease
inhibitor cocktail加标准量的4倍(标准量是1:100稀释用的),但是每次lysate里面
都有蛋白降解。。。。。。。。所以想除了inhibitor cocktail还能加点啥瞬间灭火
protease还能用于western?
d****i
发帖数: 2346
25
同时再问一个问题:
昨天做western,上完样品就把lysate(已经加了sample buffer)顺手放在桌子上了,然
后走的时候忘了收到冰箱,在试验台上放了一晚上。问一下,蛋白会不会降解?
d****i
发帖数: 2346
26
同时再问一个问题:
昨天做western,上完样品就把lysate(已经加了sample buffer)顺手放在桌子上了,然
后走的时候忘了收到冰箱,在试验台上放了一晚上。问一下,蛋白会不会降解?
y****i
发帖数: 2194
27
温度是关键,一定要迅速降温,整个组织先扔到ice cold pbs里面冷却
然后再捞出来上lysis buffer
要是还不行 可以混用两种cocktail, roche+sigma, 各自用1x
还有就是如果只是western DTT, EDTA之类都可以招呼上
z*********8
发帖数: 1203
28
我做过这个实验,用液氮ground tissue,然后加点buffer,直接hypotonic lysis了,
感觉效果还可以,不过我整体感觉tissue尤其是gut里面protease, RNAase都比较高。
d****i
发帖数: 2346
29

我是从液氮里直接拿出来的,扔进lysis buffer。。。
d****i
发帖数: 2346
30

你的意思是先研成干粉,然后加lysis buffer?
s******y
发帖数: 28562
31
以前我都是这么做的。先在液氮浸泡里磨成干粉,然后直接加lysis buffer煮了。
i***l
发帖数: 1656
32
i am telling you the trick i used
you are questioning me about my trick
what do you want to hear from me?
before asking"3-4M urea会不会太高了" have you check why use urea and what's
the usual range of urea used in denaturing buffer?
what's the conc. you think is better?
D**A
发帖数: 311
33
protease inhibitor 加够推荐的量就可以,多加浪费钱,效果还不一定好,可以加点
PMSF, benzamidine, EDTA之类的便宜inhibitor, 隔1-2小时补加一次就可。15%
glycerol.
先用液氮冷,然后快速解冻, 加冷的lysis buffer试试。
蛋白在室温下过夜会水解。
能想到的就这么多了。
d*****r
发帖数: 45
34
我们一直用 Stratagene's QuikChange "XL" Mutagenesis Kit 做single mutaion,
最近想试试看别的pfu,发现pfu啊,dNTP啊什么的都可以换掉
但是 stratagene kit里的 "quick solution"还是很有必要加的
说明书里没有写这个buffer成份是什么
google了一下有人猜就是pure DMSO,不知道真的假的
请问有人知道吗?谢谢!
y*****5
发帖数: 567
35
This quick buffer is not necessary at all. You do not need to add it to your
reaction.
m*******e
发帖数: 90
36
感觉像是。
我用的是4x loading buffer,都沉在底部,细胞裂解液都在上面……
哭死,是不是没法用了?
d****i
发帖数: 2346
37
估计悬。有次我没加loading buffer煮了一下都悬起来,然后再也弄不成均一溶液了。
V******t
发帖数: 444
38
用BCA?得稀释多少倍啊
2X laemmli buffer: Solution contains 4% SDS, 20% glycerol, 10% 2-
mercaptoethanol, 0.004% bromphenol blue and 0.125 M Tris HCl, pH approx. 6.8.
那么多SDS BME 会干扰啊。
s******s
发帖数: 13035
39
记得先沉淀下来,再换buffer?

.8.
e****s
发帖数: 1125
40
好像可以只加SDS来裂解细胞,
SDS在0.1%以下,对检测结果的干扰就不大了。一般测总蛋白,起码稀释100-500倍,
SDS浓度就不高了。跑胶的时候再和正常的Laemmi buffer混起来。

.8.
s******y
发帖数: 28562
41
会!
不会酶降解但是会出现化学降解,因为laemmli buffer是一个碱性溶液,会自发水解蛋
白。
不过3个小时应该还有救。如果是过夜,直接扔了算了。
r******k
发帖数: 446
42
sunny老师 一定要液氮速冻吗? 直接放-20 或者-80不行吗?
有的时候有事儿 把lysis 直接放-80 或者-20 第二天再家sds buffer boil 好像也没
啥问题。
d****i
发帖数: 2346
43
身边不同人意见不同。。。。。。。谢谢!
目的是裂解细胞抽取蛋白做western。buffer里还有SDS, GLYCEROL.
h*******o
发帖数: 4884
44
用个两三次没什么问题
而且不管用什么stripping buffer, 用ECL的都要考虑把target 蛋白的位置错开,如
果不能错开的话还是分开做
尤其是ECL plus或者用pierce的dura/femto, 很容易就把膜烧坏了
而且最好rabbit 和 Mouse的抗体轮换做,这样interference 会小很多
R****n
发帖数: 708
45
多谢!其实我也刚定了那个kit,要是时间太长,就自己配buffer吧

点。
R****n
发帖数: 708
46
今天简单一下,虽然不好看,但是意思出来了,似乎核有点结块问题不大。见图,还有
几个问题。
1)我准备后续做southern,MNase处理后,要不要加RNase A 和 proteinase K,原有
MNase buffer行不行?因为lane 2-5,band之间有smear.
2) 1%的胶跑出去了,理想是多大浓度?
非常感谢!

5-
l**j
发帖数: 651
47
来自主题: Chemistry版 - Protein Precipitates in Phosphate Buffer
what are the other common buffers have been tested?

charge
l****i
发帖数: 698
48
【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: lengzi (lengzi), 信区: Biology
标 题: 为什么MOPS buffer要protect from light?
发信站: BBS 未名空间站 (Mon Aug 29 17:28:47 2011, 美东)
下图是MOPS的结构,一般来说都要避光保存。
有没有牛人给解释一下,从结构上说,为什么要避光保存。
最近发现MOPS有一定的还原性,不知道这个从结构上怎么解释,这个分子如何提供电子
的?
f*********e
发帖数: 1144
49
Really really weird...
but it looks large precipitation happens if I dilute the buffer containing
100mM Tris.HCl(pH8) + 10mM CaCl2 with PBS (pH7.4)
Only thing I can thinki off is some sort of calcium phospate compound formed
.... is it possible???
Need help from Niu Ren
j*****a
发帖数: 92
50
阴离子交换色谱 Q Sepharose Fast Flow (GE Healthcare Life Sciences)pH
stability Working Range 2-12 .用1 M NaOH 洗,用纯水洗到pH 7, 换TrisHCl
buffer pH 5.5 平衡, elute pH 变成9.洗了一天还是pH 9. 有人遇到过吗?
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