d********t
发帖数: 29 | 1 http://www.nasonline.org/site/PageServer?pagename=News_May_3_20
News
Date: May 3, 2011
FOR IMMEDIATE RELEASE
National Academy of Sciences
Members and Foreign Associates Elected
The National Academy of Sciences today announced the election of 72 new
members and 18 foreign associates from 15 countries in recognition of their
distinguished and continuing achievements in original research.
Those elected today bring the total number of active members to 2,113 and
the total number of foreign associat... 阅读全帖 |
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a***e
发帖数: 1010 | 2 带着崇敬和向往的心情，本人参加了 keystone RNAi 会议，见到了好多好多传说中的大牛，
也见到了好多华人中的明星科学家，还有更多的华人小牛仔子，一个个
跑的飞快。
我发现做人不仅要长得帅，还要高。 在和这些牛牛们聊天的过程中，
我不仅等心理上仰视，脑袋也得仰视着。
会议中最大的亮点是 David Bartel 提出了个颠覆性的观点，估计大家要花一些时间
来消化。 |
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c**A
发帖数: 1474 | 4 赫赫. 这就叫语不惊人死不休..
Bartel整个会议都死阴着一张脸..
的大牛， |
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s****9
发帖数: 932 | 6 发2002年Nature的时候Eric是个graduate student。他在Jason Cyster实验室毕业后
当然不可能直接去做faculty，于是去了cornell作postdoc。之后似乎publication一般
，当然当不了faculty，于是去columbia作了第二轮postdoc.
之前Nature我想可能是graduate school之前发的吧,比如本科的时候。
他学生时候的publication比postdoctoral好只能说明，他postdoc选的实验室一般般，学生的时候老板（Cyster,Bartel)太牛。
B |
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a***y
发帖数: 19743 | 7 哦，有内幕了。
，学生的时候老板（Cyster,Bartel)太牛。 |
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s******s
发帖数: 13035 | 8 xutian同学不就是靠着graduate student的超牛frt/flp搞到的faculty?
ms薄厚没搞啥， 说错了大家给我科普
，学生的时候老板（Cyster,Bartel)太牛。 |
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a****o
发帖数: 1786 | 9 请给个链接
in vivo SELEX 上个世纪Kevin Struhl和 David Bartel就都做过 |
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l*******k
发帖数: 361 | 10 David Bartel/MIT, tough
Greg Hannon/CSHL, nice to someone, however, I do not like him personally. |
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d***y
发帖数: 195 | 11 Lin一直在做一种叫piwi／miwi的蛋白，
后来bartel还是hannon的组发现结合一种小RNA，就取名为了piRNA
两三年前竞争超激烈的一个领域，不过也是超狭窄的一个领域吧。
Lin 还好，不是纯RNA研究的，热了扎一下，冷了也可以退出来。
如果是看中piRNA之类的选lin，有可能错，不看好。
BIG |
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w******y
发帖数: 8040 | 13 早在2004年， Merck@Seattle就发表了mRNA降解在mammalian里是非常普遍的
Bartel这片能上nature我觉得很奇怪
倾向翻译抑制，我的印象中没人很严格的set up实验证明哺乳动物里哪个是主导，这篇
文章算是一个基因组水平的解惑吧。 |
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a***e
发帖数: 1010 | 14 the main conclusion of this paper is that " that destabilization of target
mRNAs is the predominant reason for reduced protein output"
--------------------
Bartel gave the talk in Keystone symposium in January and shocked everyone.
However, some people are concerning that the conclusion based on cell lines
may not represent the real mechanism in vivo. For example, Victor said lin-
4 does most in translation control. So does Gary with let-7. |
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t*d
发帖数: 1290 | 15 因为 Bartel 是这个领域的权威。他在 2004 发了两篇reviews，一篇在 CELL， 一篇
在 Nature Reviews Genetics。在两篇 reviews 他都倾向于 mammalian miRNAs 主要
抑制翻译的观点。但是miRNA的大头也基本倾向这个观点。Rosetta 2004 的文章没有提
供直接的证据证明那些下调的 mRNAs 是 miR-1和miR-124 直接targets。所以 Rosetta
的文章动摇了军心，但是还没有颠覆大家伙先入为主的观念。 |
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l******n
发帖数: 105 | 16 对，之前大家都被1993年microRNA lin-4主要抑制lin-14 RNA的翻译、而对lin-14 RNA
降解影响很小的情况误导了。
后来用cDNA microarray发现microRNA减少target RNA量的幅度非常小，就还是以为
microRNA主要是直接抑制target RNA的翻译，促进target RNA的降解是次要的。
实际上现在Bartel证明microRNA整个减少target蛋白的作用幅度就非常小（已经发表的
绝大部分direct target蛋白减少非常显著的文章，其实都是特例，因为target蛋白减
少幅度很小的情况很难发表文章），而且其中至少84％甚至90％都是促进target RNA的
降解产生的，直接抑制target RNA的翻译只占16％，甚至只占10%。
过去做microRNA抑制翻译的生化机理的实验几乎全是用串联3个，甚至7个microRNA
target的artificial 3'UTR来做，很可能根本不反映生理情况下的作用机制。
这对用RNA-Seq寻找microRNA direct target是一个福音啊。 |
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l******i
发帖数: 14 | 17 我太爱这篇paper了，当时我们这边一个教授的实验室就是有这么一个争论，一个中国
人认为是mRNA level,而另外一个印度薄厚认为是translation level,结果这位老板信
了后者，因为这位中国人脾气火爆，然后惹怒了这位教授，结果这位东欧的教授把那位
中国学生以作假的名义fire掉了。
现在bartel的实验室由一位中国学生做出相反的结果，真是让人大快人心啊，呵呵。我
希望篇paper能够被重复出来。 |
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Z**********g
发帖数: 222 | 18 本人对mir是外行,一些疑问想请教大家.
1.mir的binding site刚开始认为在靶基因mRNA的3'UTR,但后来又有报道表明mir也可能
binding在5'UTR或coding region.那这样的话,目前常用的luciferase reporter方法是
否适用于binding site在5'UTR或coding region的情况?我看文献大多是只检测3'UTR的
情况.
2.近期David Bartel的一篇Nature(2010 Aug 12;466(7308):835-40)说哺乳动物的mir
主要通过降低靶基因的mRNA level (destablization)而起作用的,而不是之前认为的干
扰mRNA翻译.那这样的话,luciferase reporter方法还适用否?或者说,是否应该和siRNA
一样,应该灵敏的检测到靶基因mRNA level的变化?
请牛人们帮忙解惑哦. |
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l******e
发帖数: 427 | 19 1. pairing is widespread to occur at the 3'utr. if you have candidates,
focus on 3'utr first. donot get distracted by sporadic publications (i don'
t mean that they are false; i mean they are not representative.)
2. it is not a new story. once again, focus on protein levels. no matter
how miR might operate, the effect on protein levels will reflect the effect.
.. (I used to like david bartel very much, but now i feel more and more
disappointed by his work, anyway...) |
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w***a
发帖数: 4361 | 20 这个公司银子多主要是因为很多RNAi的重要patent在手上，
像Sharp，Bartel，Zamore这种牛人都是公司的founder，所以单单版税就不少。 |
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a****d
发帖数: 1919 | 21 还有Thomas Tuschl,话说David Bartel的谱系太强大了 |
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p*****m
发帖数: 7030 | 22 生物里phd直接faculty的多是肯定不多的。。。做chem bio的颇有一些，不过那些主要
是chem PhD （Sheng Ding, David Liu, etc）。如果只算纯bio的PhD，袁钧瑛算很成
功的例子吧；Peter Walter算另一个很成功的例子吧。然后不著名的例子也不少了其实
，比如Blobel实验室和Peter同时期的很多人都直接AP了，不过那些人总体混得都一般
就是了。别人肯定能给出更多的例子来。
然后还颇有一些人PhD毕业就拿到AP了但是放弃不去，要做个postdoc学习一下新东西。
我老板其实就是这样。然后我至少认识两个朋友是这样。名字就不说了。
另外生物phd出来做independent fellow的还是挺多阿。这样虽然不是AP,但是已经独立
了。这样的成功例子就更多了，Steve Mcknight, Philip Beachy, David Page, David
Bartel，David Sabatini... |
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j**********k
发帖数: 296 | 23 http://www.nasonline.org/site/PageServer?pagename=News_May_3_20
Date: May 3, 2011
FOR IMMEDIATE RELEASE
National Academy of Sciences
Members and Foreign Associates Elected
The National Academy of Sciences today announced the election of 72 new
members and 18 foreign associates from 15 countries in recognition of their
distinguished and continuing achievements in original research.
Those elected today bring the total number of active members to 2,113 and
the total number of foreign associates to... 阅读全帖 |
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c********r
发帖数: 1125 | 24 李家洋跟北大没有任何关系把。。。。。
Sunny xie 倒是北大毕业的没有错。
里面有好些人我以为早就是院士了。。
比如Manley,Malenka,Gottschling,Bartel...已经学霸很多年了。。
Steve Jacobsen 算今年生物里很年轻的了吧？ |
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N*S
发帖数: 783 | 25 看过一张Bartel在Greenberg家打牌的照片，真是帅阿。。。
可惜现在已经秃了。。。 |
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g*********d
发帖数: 233 | 27 《Cell》文献翻译:基因表达的小RNA调节因子
Cell 134, 899 – 902, September 19, 2008
Joel R. Neilson and Philip A. Sharp
今年Lasker基金会承认了Victor Ambros、Gary Ruvkun和David Baulcombe在推断
小RNA分子在真核基因表达的转录后调节中所进行的开创性工作。
分子生物学是一门年轻的学科，如同充满了未开发土地的新大陆。有关小RNA在基
因调节中的作用的重要发现是这门年轻学科中还有许多未开发的重要领域的一个例证。
9月26日，几位先驱（麻州大学医学院的Victor Ambros、麻州总医院和哈佛大学医学院
的Gary Ruvkun和剑桥大学的David Bulcombe有关小RNA的发现将被授予2008年Albert
Lasker基础医学研究奖。
历史上先驱者以及他们的发现的意义通常被忽略，只是在很多年之后才被承认。
Ambros和Ruvkun所发表的描述第一个微RNA及其标靶的优秀论文（发表在高深的Cell杂
志上）被忽略了近10年。与此同时，... 阅读全帖 |
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k****u
发帖数: 3454 | 28 I only know Mark Estelle, who gave a memorial lecture earlier this year in
my school. I think my boss wrote a letter for Bonnie Bartel to compete for
HHMI investigator but it seems she didn't make it.. |
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a********k
发帖数: 2273 | 29 花了一个小时，深深的鄙视一下自己的无聊行径！！
125 蔡亮 男 1980年11月 复旦大学 生命
科学 2007年12月毕业于[美国]北卡大学 [美国]加州大学旧金山分校 博士后
Cai L, Mostov K. Polarity is destiny. Cell. 2009 Nov 13;139(4):660-2. PubMed
PMID: 19914162; PubMed Central PMCID: PMC2900917.
Cai L, Makhov AM, Schafer DA, Bear JE. Coronin 1B antagonizes cortactin and
remodels Arp2/3-containing actin branches in lamellipodia. Cell. 2008 Sep
5;134(5):828-42. PubMed PMID: 18775315; PubMed Central PMCID: PMC2570342.
Cai L, Makhov AM, Bear JE. F-actin... 阅读全帖 |
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y******8
发帖数: 1764 | 30 才开张的新所吧。在北大，所是和学院平行的单位，据我所知，北大给新的所都会给一个5年一个亿的启
动支持。
夫妻店开的好才是好，学校也不用担心培养的人才什么时候为了家庭原因就飞走了。另
外，这个所的人才引进不错啊。这一位在千青中也是翘楚。
132 汪阳明 男 1979年12月 北京大学 生命
科学 2006年02月毕业于[美国]伊利诺伊大学厄巴纳－尚佩恩分校 [美国]加州大
学旧金山分校 博士后
1: Wang Y, Blelloch R. Cell cycle regulation by microRNAs in stem cells.
Results
Probl Cell Differ. 2011;53:459-72. PubMed PMID: 21630156.
2: Wang Y, Blelloch R. Cell cycle regulation by MicroRNAs in embryonic stem
cells. Cancer Res. 2009 May 15;69(10):4093-6. Epub 2009 May 12.... 阅读全帖 |
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d*****r
发帖数: 2583 | 31 Zhang Feng以前的老板:
Deisseroth, Karl; associate professor of bioengineering and psychiatry,
Stanford University, Stanford, Calif.
竟然是Associate Professor...就当选院士了，史无前例的Rising Star...
http://www.nasonline.org/news-and-multimedia/news/2012_05_01_NA
News from the National Academy of Sciences
Date: May 1, 2012
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National Academy of Sciences Members and Foreign Associates Elected
The National Academy of Sciences today announced the election of 84 new
members and 21 foreign associates ... 阅读全帖 |
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l**********1
发帖数: 5204 | 32 Please DIY from below papers:
a,
DNA Methylation Dynamics during In Vivo Differentiation of Blood and Skin
Stem Cells.
Bock C, Beerman I, Lien WH, Smith ZD, Gu H, Boyle P, Gnirke A, Fuchs E,
Rossi DJ, Meissner A.
Mol Cell. 2012 Aug 24;47(4):633-47. Epub 2012 Jul 26.
PMID: 22841485 [PubMed - in process]
b.
In vivo control of CpG and non-CpG DNA methylation by DNA methyltransferases.
Arand J, Spieler D, Karius T, Branco MR, Meilinger D, Meissner A, Jenuwein T
, Xu G, Leonhardt H, Wolf V, Walter J.... 阅读全帖 |
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w***a
发帖数: 432 | 33 这片文章里有讲过一点。和shRNA一样表达。
@Article{Chen2004,
Title = {MicroRNAs modulate hematopoietic lineage
differentiation.},
Author = {Chang-Zheng Chen and Ling Li and Harvey F
Lodish and David P Bartel},
Journal = {Science},
Year = {2004},
Month = {Jan},
Note = {mark},
Number = {5654},
Pages = {83--86},
Volume = {303},
Abst... 阅读全帖 |
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z**********8
发帖数: 766 | 34 David P. Bartel
David Baltimore
V. Narry Kim |
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r*****m
发帖数: 3619 | 35 和老子这一代留欧的王大成，留学期间直接贡献了一些方法学，Robert Huber 在诺贝
尔奖得奖致辞上特别提了他的贡献。当然他是一个学生。所谓晶体指导药物设计，那时
就吹起来了。
In 1970, I had begun work on the basic pancreatic trypsin inhibitor which
has later become the model compound for the development of protein NMR,
molecular dynamics, and experimental folding studies in other laboratories.
Work in the field of proteolytic enzymes and their natural inhibitors has
been continued and extended to many different inhibitor classes, proteases,
their proenzymes, and complexes betwe... 阅读全帖 |
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k*****n
发帖数: 417 | 36 【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: jurassicpark (猪拉稀·怕渴), 信区: Biology
标 题: NAS elected 72 new members
发信站: BBS 未名空间站 (Tue May 3 10:48:47 2011, 美东)
http://www.nasonline.org/site/PageServer?pagename=News_May_3_20
Date: May 3, 2011
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members and 18 foreign associates from 15 countries in recognition of their
distinguished and continuing achieve... 阅读全帖 |
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q***l
发帖数: 177 | 37 News from the National Academy of Sciences
Date: May 1, 2012
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The National Academy of Sciences today announced the election of 84 new
members and 21 foreign associates from 15 countries in recognition of their
distinguished and continuing achievements in original research.
Those elected today bring the total number of active members to 2,152 and
the total number of foreign associates to 430. Foreign associat... 阅读全帖 |
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w********h
发帖数: 12367 | 38 News from the National Academy of Sciences
Date: May 1, 2012
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National Academy of Sciences Members and Foreign Associates Elected
The National Academy of Sciences today announced the election of 84 new
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Those elected today bring the total number of active members to 2,152 and
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q*********n
发帖数: 103 | 39 借楼主的帖子问下三次样条拟合。
Matlab里用的spline函数是not a knot的边界条件，不知道实际效果和自然边界(两头二阶
导数为零)有多大的区别？
还有一种 Kochanek-Bartels Hermite Spline interpolation，能通过调节三个参数
得到不同的拟合效果。这种spline是怎么算的？常用么？
(1) tension: 调节峰的尖锐程度
(2) continuity: 节点两边的平滑度
(3) bias: 好像是关于节点两侧对称程度
http://www.shaneaherne.com/research/splines.html
请问怎么为不同类型的曲线选spline的算法？ 比如，是不是光滑曲线要用自然三次样
条， 有很多峰值的曲线则应该用其他的方法？
多谢多谢~ |
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f*********j
发帖数: 1955 | 40 想下一篇paper啊。。。求助，谁帮我下了吧。。。
Bardhan, R.; Chen, W.; Perez-Torres, C.; Bartels, M.; Huschka,
R. M.; Zhao, L. L.; Morosan, E.; Pautler, R. G.; Joshi, A.; Halas,
N. J. Adv. Funct. Mater. 2009, 19 (24), 3901–3909.
多谢多谢 |
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c****n
发帖数: 6 | 41 不像惹麻烦的话不接受任何的return, 发错的例外，因为你也不想让证据留在病人手里
以后sue 你吧。有的病人吃不完的药想拿回pharmacy 希望pharmacy 帮助distroy, 如
果你的pharmacy 没有这种program 也不能收。washington state 只有bartells 有这
种program.一般的patient 都很reasonable, 不过我也遇到过有人把要拿会来非要退说
是不管用的，我们店的policy 是prescription 拿走 的药一律不退，有concern 去找
医生。如果是beh一nd counter 的药，一般不退，要是碰见个不讲理的，少量的就退
了，收回来立即销毁 |
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k*****n
发帖数: 417 | 42 【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: jurassicpark (猪拉稀·怕渴), 信区: Biology
标 题: NAS elected 72 new members
发信站: BBS 未名空间站 (Tue May 3 10:48:47 2011, 美东)
http://www.nasonline.org/site/PageServer?pagename=News_May_3_20
Date: May 3, 2011
FOR IMMEDIATE RELEASE
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p*******g
发帖数: 2976 | 43 【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: albertsmwk (.)(.), 信区: Biology
标 题: 第一批“青年千人计划”生物类@publication列表@
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Aug 18 15:04:16 2011, 美东)
花了一个小时，深深的鄙视一下自己的无聊行径！！
125 蔡亮 男 1980年11月 复旦大学 生命
科学 2007年12月毕业于[美国]北卡大学 [美国]加州大学旧金山分校 博士后
Cai L, Mostov K. Polarity is destiny. Cell. 2009 Nov 13;139(4):660-2. PubMed
PMID: 19914162; PubMed Central PMCID: PMC2900917.
Cai L, Makhov AM, Schafer DA, Bear JE. Coronin 1B antagonizes cortactin and
remodels Arp2/3-containing actin branche... 阅读全帖 |
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a***e
发帖数: 1010 | 45 besides luciferase assay, they even don't bother to do a western blot to
check endogenous protein expression level. Many of his candidates have
antibodies available.
anyway, it is Bartel.
Another problem is that the authors didn't answer whether these UTR
shortening is the cause or the result of tumor biogenesis. Although they
try to get microRNA into the story, the effect on translation is so weak.
However, one wield thing to me is that why their short formed mRNA is more
stable than long form |
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m****g
发帖数: 530 | 46 据一篇发表于《PLoS One》杂志的研究报告，Sara Bartels等人发现，免疫系统中的
肿瘤坏死因子(tumor necrosis
factor-alpha, TNF-α)能使癌变组织血管的渗透性增强，使沙门氏菌(Salmonella)进
入癌变组织中。这项发现或许有助于
科学家研究利用细菌治疗癌症的方法。
机体感染沙门氏菌并且被免疫细胞识别到该病原体后，免疫细胞通过产生TNF-α来告知
其它的免疫细胞，引起炎症反应能
够增强血管的通透性，由于癌变组织的血管与健康的动脉和静脉血管不同，在癌变组织
中，血管呈不规则分布，多空，部
分血管末端阻塞，因此，相对于健康血管，TNF-α更容易分解肿瘤血管壁，使血液流入
到癌变组织中。
沙门氏菌特别生存方式引起了研究人员的注意，这种细菌几乎能够在任何环境生存，包
括在少有氧气供给的组织中。而这
些组织发生溃疡癌变时，一般的癌症治疗方法无法获得疗效。研究人员希望能够通过改
良沙门氏菌，使其能够特异性的侵
入肿瘤并引起肿瘤死亡达到治疗癌症的目的。
参阅文献：
Leschner S, Westphal K, Dietrich N, Viegas |
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