z*****s 发帖数: 289 | 1 见几天参观了一个全自动高通量筛选的实验室,真的很震撼! 几乎完全自动化,以前需要
至少20人的实验现在只有4个人.
全球化和科学技术的飞跃,造成了财富过度集中. 穷人将越来越穷,而掌握资
源(包括军队,也许是机器人军队)的富人就会愈来愈富有. 随着人工智能的发展,机器人
会在很多领域替代人工. 总一天,世界不需要很多人参与劳动. 于是,穷人将失去”人肉
电池”的资格!
穷人面临的生存问题如何解决?
要么,国家通过强制手段,均贫富,实现共产主义!
要么,就像很多科幻片一样. 富人将在肉体上消灭穷人, 或者将穷人彻底隔离(新版的
铁臂阿童木,富人在天上,穷人在地下).
我觉得后者的可能性更大啊! |
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p*****c 发帖数: 20445 | 2 【 以下文字转载自 Military 讨论区 】
发信人: pacific (hh), 信区: Military
标 题: 北大生科院发表论文揭示“白虎”形成的遗传学机制
发信站: BBS 未名空间站 (Tue Jun 11 13:33:44 2013, 美东)
罗述金李瑞强组揭示白虎形成的遗传学机制
发布时间:2013-06-03 阅读次数:556
日前,生命科学学院、北大-清华生命科学联合中心罗述金研究组和生物动态光
学成像中心(BIOPIC)、生命科学学院、北大-清华生命科学联合中心李瑞强研究组,
与广州长隆野生动物世界等合作单位共同解开了困惑人们若干世纪的白虎形成的遗传学
机制。2013年6月3日,《当代生物学》(Current Biology)以封面文章发表名为《The
genetic basis of white tigers》的科研论文,揭示了白虎的毛色及相关性状是由毛
色决定基因SLC45A2 突变所致。
白虎是虎的亚种孟加拉虎(Panthera tigris tigris)野外发生的一种罕见突变
型。与通常的毛色全白和... 阅读全帖 |
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s******y 发帖数: 28562 | 3 【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: ronbell (我是小诸), 信区: Biology
标 题: 世界排名前十
发信站: BBS 未名空间站 (Wed Feb 19 21:37:39 2014, 美东)
职位描述
岗位职责:
1、 建设分子生物学公共服务基础实验室,建设SNP基因组分型Array Tape平台,为通
州国际种业科技园区内外众多种子企业、科研机构提供基础服务,并为最终建成中国领
先、世界一流的分子育种实验室及分子育种平台。
2、 在平台搭建成功后,使该平台具备年分析能力达到10000个样品以上,能够初步具
备进行SNP基因标记的开发,高通量基因组分型、构建遗传连锁图谱、基因定位、ELISA
分析等的主要功能。
3、 以国际化的视野,根据市场需要,为平台引进先进的设备和技术,且不断研究和改
进相应技术,不断提高为种业企业及科研院所服务的能力和水平。
任职要求:
1、 作物遗传育种专业,博士学位,华裔;
2、 从事过至少10年以上的育种研发工作,有美国一流种业公司研发工作经历,个人业
绩及声望在世界排名前十,每年至少能在国内工作10个月;
3、 具... 阅读全帖 |
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x**h 发帖数: 53 | 4 vemurafenib
这个明确不是,这个是FBDD方法来的,就是片段筛选(也不是海选,一般的片段库就是
1000-2000个片段),然后根据结构生长出来的,片段对于药物靶点的亲和力在mM水平
,必须要根据结构优化到uM才可能有细胞疗效,再继续优化到nM水平才能上临床。
其他两个的即使可能是高通量筛选来的,也是根据结构改善了很多的,而不是根据已经
有的药物来进行改造的。 |
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x**h 发帖数: 53 | 5 vemurafenib
这个明确不是,这个是FBDD方法来的,就是片段筛选(也不是海选,一般的片段库就是
1000-2000个片段),然后根据结构生长出来的,片段对于药物靶点的亲和力在mM水平
,必须要根据结构优化到uM才可能有细胞疗效,再继续优化到nM水平才能上临床。
其他两个的即使可能是高通量筛选来的,也是根据结构改善了很多的,而不是根据已经
有的药物来进行改造的。 |
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发帖数: 1 | 6 04年的时候,我在极北苦寒的小州州立里研究抗衰老药物。虽然在化合物帅选合成的方
面进展顺利,但研究却陷入一个瓶颈。我是用的酵母衰老模型,明显缺失一些动物或脊
椎动物特有的衰老或凋亡的信号通路。当时新来了一个波士顿来的国女发考题。加州的博
士,波士顿的博后。对斑马鱼和线虫的模型都非常熟悉。我的老板决定尝试合作,试图建
造动物模型的高通量平台。
我和国女发考题没什么深交,只是偶尔通过老板cc的邮件联系。隔一两周去那一个质粒
,拿几株线虫。偶尔聊一两句学术上的事情。国女发考题是上海到加州到麻州的,人聪
明好看又时髦。而我是娄底到平顶山到美国的破州,智力平常相貌老土。让我总觉得我
们阶级悬殊。
05年初,我受到平顶山卫校的邀请,回国给师弟师妹做一个报告,既是学术报告,也是
讲一讲卫校毕业学生的出路问题。机票由学校报销。临走前一周去国女发考题的实验室
的时候,告诉国女发考题要回国一周的事情。国女发考题对我的行程产生了极大的兴趣
。问我是不是飞北京。我说是,飞北京,火车去平顶山。国女发考题说太好了,能不能
帮她带一管线虫去北京某所。我当时没多想,说没问题,我走前一天来找你拿。
走前一天,我突然想起... 阅读全帖 |
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i***R 发帖数: 663 | 7 基本拿到offer 了,下周去JHU 面试,去一个国家实验室,搞离子通道药物高通量筛选。正是我感兴趣的!
基本上是没错了。厚厚。 |
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P******l 发帖数: 1648 | 8 10年内合成任何生命?且看华大梦想
2018-01-29 香柏领导力
记者 | 龙跃梅
文章来源 | 科技日报
编者按
上帝创造万物,最后按自己的“形象和样式”造人,并授予人类管理这个世界的权柄。
今天的人类也开始学上帝的“样式”来“创造生命”。例如2017年3月,经过多国科学
家的通力合作,人类成功合成了酵母菌。
这里需要指出的是,这次成功合成酵母菌的“技术含量”与上帝的“创造大能”相比,
真是太微不足道了。
首先,人类是先解读了上帝造物的密码,再遵循密码的原则,合成酵母菌。
其次,酵母菌还是太简单了,与高等的动、植物以及我们人类相比,它的遗传密码还是
太少、太简单了,差不止几个数量级。
但是,正如本文介绍的一样,居然有人宣称“5-10年内能合成任何生命”?人,总是太
骄傲,尤其是当他们不能够正视自己与造物主之间巨大的、本质性的差别的时候。相信
在我们当中绝大多数人都能继续活这之后的5-10年,尚且不妨让我们作为历史的见证人
,一同见证是否有人曾在当今确实夸口。
“未来5-10年,我们可以化学合成任何生命。”在近日召开的2017深商大会上,华大基
因集团董事长汪建称,未来人造生命的进... 阅读全帖 |
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w***e 发帖数: 1331 | 9 还有啊,老骂过去也没啥用。你要是有好的建议给华理,说出来听听吗。本来搞个药学
院,结合华理化学化工,在API合成设计放大上可以搞一搞,以后争取混到制剂配方,
混几个仿制药出来,学产研结合挺好的。结果最后搞了个什么高通量分子筛选出来,一
头扎进了粪坑。 |
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w***e 发帖数: 1331 | 10 要混钱其实也不难 。。任德呈还在吧 。。给华理搞几个仿制药的批号 。。。一下什
么都解决了 。。。大分子小分子仿制药一块上 。。。哪天牛逼了抢个first file, 到
时候都看不上国家教委的拨款 。。。
赶紧把药学院搞什么计算机高通量筛选的那几个混子赶出华理 。。。华理领导估计也
在制药上动过脑筋,可惜没啥见识,给几个混子加骗子把一部好棋下成了臭子 。。。
什么染料农药都赶紧关门,跟FMC签了个屁大的合同,还整天吹 。。。。FMC就是个吃
别人剩的不稀罕做的混混公司。。。农药能卖几个钱啊?当然要做人吃的了。。 |
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w***e 发帖数: 1331 | 11 要混钱其实也不难 。。任德呈还在吧 。。给华理搞几个仿制药的批号 。。。一下什
么都解决了 。。。大分子小分子仿制药一块上 。。。哪天牛逼了抢个first file, 到
时候都看不上国家教委的拨款 。。。
赶紧把药学院搞什么计算机高通量筛选的那几个混子赶出华理 。。。华理领导估计也
在制药上动过脑筋,可惜没啥见识,给几个混子加骗子把一部好棋下成了臭子 。。。
什么染料农药都赶紧关门,跟FMC签了个屁大的合同,还整天吹 。。。。FMC就是个吃
别人剩的不稀罕做的混混公司。。。农药能卖几个钱啊?当然要做人吃的了。。 |
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c*******n 发帖数: 1648 | 12 本报讯 日前,上海生物制造技术协同创新中心在华东理工大学成立。该中心还包括复
旦大学、中科院上海分院、上海医药集团和上海中信国健药业等单位,将打通生物分子
及生物系统的设计、生物过程优化放大及装备研制、大规模生物制造产业三大环节,建
立一个教学、科研、协同创新三位一体的知识服务平台。
据悉,该中心目前已凝聚了分子模拟与设计技术、基因重组与高效表达、细胞株构筑高
通量筛选、细胞培养优化调控、活性分子分离纯化、生物装备研发制造等6个协同创新
方向。( |
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s*****e 发帖数: 970 | 13 2010年2月17日,上海交大医学院附属瑞金医院张济研究员研究组在国际著名杂志
“Cancer Cell”上发表了关于癌蛋白PML/RARα选择性抑制造血特异性转录因子PU.1及其
靶基因的研究文章。该研究以急性早幼粒细胞白血病(又称APL)为研究对象,整合了生
命科学领域内的多种高通量前沿技术,从全基因组水平揭示了异常转录因子阻碍造血分
化、形成血液恶性肿瘤的机制,从而解决了困惑肿瘤领域近二十年来的一个难题:即APL
特异性的融合癌蛋白PML/RARα的形成与造血细胞分化受阻、白血病产生的关联问题。
该研究结果对于推动白血病以及其它恶性肿瘤的研究都具有实质性的意义。
多年以来,由于APL与其它白血病的分子关联证据有限,也由于PML/RARα产生的唯
一性(即仅存在于APL),学术界普遍认为对APL的相关研究具有相当程度的局限性、缺
乏普遍意义。而此次研究则有机地从时间和空间的层面上揭示了PML/RARα与造血细胞
分化受阻、白血病发生的直接关联。因此,从APL所具有的特性和与其它白血病以至于实
体瘤在内的其它恶性肿瘤所具有的共性两个方面而言,APL又是恶性肿瘤研究的一种绝佳
模型。我 |
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s****y 发帖数: 688 | 14 近日,我校生命科学学院在SARS冠状病毒方面的研究成果在国际权威综合性学术期刊《
美国科学院院报》(Proc Natl Acad Sci U S A,PNAS)在线发表(www.pnas.org)。
该成果由生科院病毒学国家重点实验室和现代病毒研究中心郭德银教授领导的研究组完
成,论文题目为 “Functional screen reveals SARS coronavirus nonstructural
protein nsp14 as a novel cap N7 methyltransferase”,通讯作者为郭德银教授,
第一作者为生科院博士生陈宇,共同作者还包括现代病毒中心主任田波院士等。
郭德银教授的研究组选择冠状病毒特有的多个RNA加工酶作为主要研究目标,通过
酵母菌系统的功能筛选和体外生物化学分析,发现SARS病毒基因组1b区编码的一种非结
构蛋白nsp14同时具有两种RNA加工酶活性,并使用SARS病毒复制子系统证明这些酶活性
是SARS病毒基因组复制必需的。同时,该工作建立的酵母菌功能筛选系统也可以作为抗
SARS病毒药物筛选的高通量平台。
据了解, |
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p******y 发帖数: 99 | 15 【 以下文字转载自 board 讨论区 】
发信人: virginiatech (adong), 信区: board
标 题: 申请“生物医学信息学”版
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Nov 4 16:12:13 2010, 美东)
[申请ID]:
virginiatech
[英文版名]:
biomedical informatics
[中文版名]:
生物医学信息学
[所属讨论区]:
学术学科
[申请理由]:
传统的生物信息学主要囊括genomics & proteomics,服务于相应的高通量技术;而医
学信息学则是一个逐渐壮大的学科,跟医院直接密切相关,直接服务于医院系统。我们
希望成立这样一个方向的版面,主要讨论跟医学、生物信息学甚至一切跟计算相关的生
物医学问题。
如果版面能以成立,至少会有如下益处:
1. 介绍熟悉生物信息学的应用软件:很多开源/免费的软体,如果熟悉算法的话,将大
大减少应用过程中的疑惑。实际上,生物学方面的算法大部分都不复杂。
2. 熟悉医学信息学的概念。医学信息学我一直认为将来会是信息学的主流。
3. 帮助有志于此方向的同学熟悉相关课程,需要... 阅读全帖 |
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r****r 发帖数: 220 | 16 实验室刚买的,用来做高通量数据分析。花了差不多$10k
# Two 2.93GHz Quad-Core Intel Xeon
# 32GB (8x4GB)
# Mac Pro RAID Card
# 2TB 7200-rpm Serial ATA 3Gb/s
# 4x NVIDIA GeForce GT 120 512MB
# One 18x SuperDrive
# Apple LED Cinema Display (24" flat panel)
# Apple Mouse
# Apple Keyboard with Numeric Keypad |
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s**u 发帖数: 1436 | 17 嗯, 我刚在dell搞了一个四 6168,32G内存的机子,$6500
现在不知道啥高通量数据分析的软件不能在linux上跑的。 |
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l******u 发帖数: 936 | 19 三年美国留学生活记叙
---回来了!祖国,我回来了!
2005年6月3日上午11点28分,当飞机在新白云机场上的降落的一瞬间, 我轻轻地喊了一声
“变化太大”。三年时间并不长,但变化却很大。旧机场变成了新机场,第一军医大学变
成了南方医科大学,药物研究所变成了药学院。而我自己,也从军人变成了老百姓,从刚
毕业的博士生变成了一个学有所成的“海归”,从为人儿女变成了为人父母。
药学院领导一直希望我把在美三年的工作学习生活情况总结一下,但因为忙着组建实验室
的各项事宜,回来三个月了,还没动笔。籍此中秋佳节休假之机,我决定详细记叙一下,
也算我向母校作的一个总汇报。
一、异国的土地
2002 年,是我博士研究生第三年,即将毕业。我的博士研究课题是"艾滋病病毒进入抑制
剂的高通量药物筛选"。这项课题是导师吴曙光教授与美国纽约血液中心LFK 研究所病毒
免疫实验室主任姜世勃博士的合作课题,受到国家科技部“863”研究计划、国家自然科
学基金(主任基金)、广东省团队基金等课题的资助。为了更好地完成这些课题,吴教授
决定派我到美国姜博士的实验室开展合作研究。2002年元月,收到姜博士的邀请信。在学
校 |
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m********h 发帖数: 14 | 20 新生血管生成(6)-堕胎药与抗肿瘤血管?
2007-02-21 16:36:52 / 个人分类:肿瘤新生血管
同很多科学发现一样,候选药物的发现很多时候也是一个偶然事件。科学家们期待着通
过对分子机制的了解,试图把偶然事件转化为必然;或者通过高通量筛选,来提高了这
种偶然的概率。 然而就算如此努力,一个活性化合物如何走上正确的道路,最终成为
药物,还是充满了众多的偶然因素,如何抓住这些偶然因素,涉及到科学家的眼光,知
识和阅历。下面就以一个国际专利诞生为例(我为发明者之一),讲讲药物发现中的一
些体会。
From astnt的blog, http://astnt.myresearchspace.cn
这个活性化合物的发现,跟我的一个同学关系挺大。那时候我们一起进所,我选的是肿
瘤药理,他选的是生殖药理。那时候其实什么都不懂,做生殖药理还以为做壮阳药,兴
奋的不行。加上伟哥98年刚上市,同学铆足了劲想发明一个新伟哥。他导师经常在实验
室,于是我们跑过去吹牛聊天。其实他们组做生殖药理研究的是避孕,男性避孕和女性
避孕(后来一做实验可把我同学后悔死了,一个单身男,每天都要观察老鼠matin |
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c*******d 发帖数: 192 | 21 这几天看了toptip的高通量DNA测序技术在生物学研究中的应用,,受益匪浅.. 俺们实验
室的研究也focus这种应用..所以平时也作了很多数据分析.. 这里比较一下两种测序的
平台(solid和solexa),,相关的软件,,也讨论一下他们的应用.. 本人经验有限,,本文权
当抛砖引玉,,希望各位大侠多多指教:
1. raw sequence 编码
SOLiD: Solid采用color-coded序列输出. 所以输出的序列除了首位以外,,都是数字(0-
3). 没两位编码一个nucleotide.. T0132123. 然后根据一个编码表,,可以转换成
nucleotide序列.
Solexa: 输出采用nucleotide编码, 不需要任何转换..
2. yield
两种测序技术每个单位的yield都在15M左右 (最近一次solexa平均yield约20M per
Lane).. 好像solid是spot,, solexa叫lane..solid每次可以测8个spot,, solexa每次
可以测序8个lane.. 所以从raw输出的数量来说,,两个没有大的差别..
3. S |
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b*****n 发帖数: 1841 | 22 科学都有一定的轮回,如果研究所的定位没有看到5年十年甚至更远的研究的方向,那
么过几年,所内的研究方向就会老化。apotosis曾经牛极一时,small RNA和
epigenetics现在还比较牛,可见的将来必将走下坡路。
NIBS的PI研究small RNA,epigenetics的很多,其它各个方向(看起来比较杂,做植物
的,免疫的,癌症的,转录的,衰老的,神经的)的研究员也基本上是用传统生物学方
法来继续研究原实验室的课题,再加上做结构的做保险,保证“SCI”产出。
bioinformatics方向,干细胞方向的鲜见;类似于zhuang的单分子技术,高通量的研究
思路没有;新思路,开创新领域的更没有。
NIBS如果以现在的研究方向定位,可以预见10年20年以后还是远远落后于国际一流研究
所,10年会有新的牛人再建类似于NIBS的研究所,然后因为没有自己的原创性,又落后
。这可能是王晓东本人的视野所限,不能不说是一个大的遗憾。 |
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m**********2 发帖数: 6568 | 23 你不如敬仰我。我都是高通量克隆,每天96X8=768个constructs |
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p*******r 发帖数: 4048 | 24 Those experiments are not easy. I can see that the transcriptome problem
will soon be solved by deep sequencing.
How do you plan to get high throuput protein data?
不是要求每一
个实验室都可以马上深入到借助数学工具去解释生物学问题。
,但是就高通
量而言,现在在转录和蛋白水平上得到高通量数据已经不是大的问题了,就直接测量而
言,这取决于
你回到什么问题了。直接测量可能在很多问题上对建模很关键,不过还有更多的问题,
我想要知道的
答案,我觉得没有这一类困难:),比如很简单的,我想知道一种细胞分化中已知的20个
有效作用因子
他们之间如何协同其作用的。又比如我想知道在一堆影响细胞包装产生病毒的因素中,
这些因素如何
协同其作用?他们的输出都可以定量化,但对应输入,中间显然仍然�: 泻芏嗖
街瑁馐歉龃嬖诘奈
侍獍 D阕懿荒馨颜飧鑫侍夥纸獬梢幌盗惺淙胫苯佣杂κ涑鲋嘈∥侍馊ソ饩霭伞!!
!!!�
的数据( |
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f******g 发帖数: 1003 | 25 上次开会,听到某人说现在有一种全基因组测序技术比基因芯片精确的多,但是我没有
记住全名,版上哪位知道?谢谢. |
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s******r 发帖数: 2876 | 28 这两片主要是用了新技术,
高通量的mass spec,看到了以前看不全的结果,
看来国内应该大力推广这样的研究。
美《科学》杂志罕见同时发表两篇中国专家文章 中新社
美国当地时间2月19日,最新出版的《科学》杂志,罕见地同时发表两篇复旦大学
生物医学研究院的最新成果。其中关于蛋白质向能量转化过程中“乙酰化修饰”的重要
发现,对肝病、肿瘤等代谢疾病的药物研发提供了开拓性的思路,生物医学研究在一个
全新的层面上呈现出广阔的前景。
19日,该项目的课题组负责人在此间介绍了此项研究在药物研发等方面的意义。两
篇分别题为《代谢酶的乙酰化协调碳源的利用和代谢流》和《蛋白赖氨酸的乙酰化调控
》的文章,分别研究了乙酰化对蛋白质进行修饰以及对代谢通路进行调控的问题。
据介绍,人体好比一个“战场”,细胞就是士兵,维持着人体的基本功能;“赤手
空拳”的蛋白质被乙酰“武装”起来后,才可以变成为人体“作战”的士兵。嫁接上一
个乙酰基分子,修饰后的蛋白质就可以对细胞内的各类通路进行精确调节与控制。
乙酰调控蛋白质活性变化,使其中活跃、不活跃的部分相互平衡。而当平衡出现问
题,就会导致代谢疾病。据了解,人类疾病中 |
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b****r 发帖数: 17995 | 29 我觉得microfluid很难说,工程的东西技术上的难关有时候几十年都攻克不了也不是不
可能。而且将来我觉得医学检验的方向是高通量的core lab,而不是到处分散的小作坊
。bioinformatics应该更有戏,摩尔定律在生物方面也不会失效的,起码目前没有。当
然要有计算机天赋,生物也不能丢 |
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e**r 发帖数: 1144 | 30 现在的高通量测序算第二代
第三代是什么样的?
中科院、浪潮携手研发第三代基因测序仪2009-12-28 09:06 作者:佚名 出处:
Yesky
责任编辑:Guyer 【文字大小:大 中 小】 能够想象仅仅花费8000元,等待几
十分
钟,就能知道自己的完整基因吗,中科院与浪潮宣布将共同研制国产第三代基因测序仪
,预
计3年内问世,可以让这一设想成为现实。这一重大装备的成功研制,不仅将填补我国
在基
因测序基础装备领域的空白,提升装备自主化水平,同时也将使国内生命科学研究机构
能够
获得低成本、高效率的测序工具,更有效的开发和利用我国丰富的基因资源,加速我国
基因
战略的发展。中科院北京基因组研究所与浪潮“高效能服务器和存储技术国家重点实验
室”
成立的“中科院北京基因组研究所-浪潮基因组科学联合实验室”承担研发工作。
据中科院北京基因组研究所副所长于军研究员介绍,现在国际最为领先的基因测序
仪是
第二代产品,完成一个人的基因组测序最少要花费6周时间,成本高达6-10万美金,自
行研
发的第三代基因测序仪预计,仅需几十分钟即可完成一个人的完整基因测序,同时,测
试成
本也将下 |
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r****r 发帖数: 379 | 31 恰恰相反,20年后,生物学一定会比现在fun100倍都不止,大部分routine的工作分工
給公司做了,scientists可以集中精力想问题,去开发很独特的工具。
你只要看看你现在手上的worm的工作,90%可能是毫无乐趣可言的,从克隆,到转基因
,到cross,生命科学真正fun的东西在于什么?
把routine的工作剥离出传统的实验室并交给公司来做,是未来10-20年的趋势,这不
仅仅是因为公司未来这些可以做得很好,同时日后对高通量数据的获取和分析需求的增
加会使得单个实验室并不是最佳完成这些实验的地点。 |
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a****o 发帖数: 1786 | 32 这正说明了要大力发展结构生物学,因为现在还落后于传统或高通量筛选 |
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s******e 发帖数: 163 | 33 好好搞自己会的东西。搞到极致就好了,这systems biology中的数学部分也不是那么
好搞的,东西容易出,用处可能不大,文章也发不了很好。如果是实验和理论结合,那
实验算是主要部分。如果是高通量的实验,楼主不学自己就能做了。最有前途的方向还
是不遗余力的发展新的实验技术。 |
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C*******e 发帖数: 4348 | 35 一点不错
这个完全可以做到高通量
我刚刚加入一个搞一点结构的实验室
然后会议开完以后我以前phd的老板跟我说:别再费时间学习晶体结构了啊
test |
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C*******e 发帖数: 4348 | 36 "to control the size of the crystals to be tens of the unit cell"
这个什么意思哪?
不过如果说是高通量的
他们直接把不符合要求的数据丢掉就完了
不管如何,肯定是代表了蛋白结晶、解构的将来
很多技术上的难题也许会比想象的更快解决 |
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r****r 发帖数: 379 | 37 所以说生物学研究的模式可能会发生变化,group数目增加的速度会落后研究经费投入
的速度,但每个group产生的数据量会大大增加。传统的不懂得利用高通量研究方法的
group占绝对主导地位的现状会有所改变。
and
method |
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p*****m 发帖数: 7030 | 38 谢谢啦 那你觉得从一个assay 到能scale-up的screen系统 一般得多少时间呢?换句话
说就是把assay定量搞好能上高通量外加数据分析blabla这些工作会需要很长时间么? |
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k****o 发帖数: 589 | 39 也许你对中国这个产业还有信心,可我觉得中国短期内是搞不出blockbuster的。这么
多年,有机合成,天然药化,生物高通量筛选,那帮人该玩的都玩过了,还是没下几滴
雨。我的看法是医药卫生当然要投钱不过不用投这么多,与其这么烧法不如改善医疗保
险系统让百姓有个着落。多的钱投到那些可以增强国际斗争实力的领域,膀子粗了,钱
包鼓了,直接从先进地区买人力资源。 |
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p*****m 发帖数: 7030 | 40 恩 看behavior也不错 如果看behavior不高通量的话就看necrosis marker的表达也是
不错感觉(怎么感觉也没有什么很好的necrosis specific gene marker? hehe)。 |
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l******u 发帖数: 936 | 41 所谓系统生物学, 其实就是一个概念, 研究理念, 严格讲不能算一个学科,
说不好听点就是捣浆糊的, 没啥新意.
几十年来人们研究生态就是用系统生物学的理念.
现在比较热主要是因为高通量和定量技术的迅猛发展
(microarray, silac, next generation sequencing等),
quantitative 和 modeling 是当代系统生物学的两个重要的方面.
(其实定量技术还差太远, 还远不能满足做modeling的需要, 而且
高等生物的modeling简直就是不可能, 玩玩酵母,e.coli 可能还马马虎虎) |
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k*****n 发帖数: 417 | 42 尤其是利用系统生物学或高通量筛选的方法研究代谢和相关疾病(diabetes,obesity
etc)的实验室。
要申请postdoc了,对这个方向比较感兴趣,希望能在思维方法和技术上得到一些
training。另外想请教一下完全没有系统生物学或生物信息学的基础想进入这个领域是
不是很难?
敬请不吝赐教,在此先谢了! |
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b****r 发帖数: 17995 | 43 据我的理解,现在大家还处在直接ignore 大部分isoform的阶段,实在躲不开了就自己
深入研究一下那个基因,基因组水平的annotation高质量的还没有吧。一般就是用est
拼出来的?
楼主如果你发现了一种高通量annotate isoform的方法,应该可以发一篇很不错的文章 |
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v******s 发帖数: 51 | 44 现在这些高通量数据分析的软件太多了,基本上R里面都有;
老板们真要想在自己lab搞,招个懂R的学生,看懂manual就可以
照葫芦画瓢了;关键是这样做不一定比同别人合作更有优势。
我老板就是专门和做实验的lab合作的,现在的情况就是别人吃肉
我们喝口汤,呵呵。 |
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v**********h 发帖数: 230 | 45 http://www.mitbbs.com/article_t0/board/31339531.html
【 以下文字转载自 board 讨论区 】
发信人: virginiatech (adong), 信区: board
标 题: 申请“生物医学信息学”版
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Nov 4 16:12:13 2010, 美东)
[申请ID]:
virginiatech
[英文版名]:
biomedical informatics
[中文版名]:
生物医学信息学
[所属讨论区]:
学术学科
[申请理由]:
传统的生物信息学主要囊括genomics & proteomics,服务于相应的高通量技术;而医
学信息学则是一个逐渐壮大的学科,跟医院直接密切相关,直接服务于医院系统。我们
希望成立这样一个方向的版面,主要讨论跟医学、生物信息学甚至一切跟计算相关的生
物医学问题。
如果版面能以成立,至少会有如下益处:
1. 介绍熟悉生物信息学的应用软件:很多开源/免费的软体,如果熟悉算法的话,将大
大减少应用过程中的疑惑。实际上,生物学方面的算法大部分都不复杂。
2. 熟悉医... 阅读全帖 |
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p******y 发帖数: 99 | 46 【 以下文字转载自 board 讨论区 】
发信人: virginiatech (adong), 信区: board
标 题: 申请“生物医学信息学”版
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Nov 4 16:12:13 2010, 美东)
[申请ID]:
virginiatech
[英文版名]:
biomedical informatics
[中文版名]:
生物医学信息学
[所属讨论区]:
学术学科
[申请理由]:
传统的生物信息学主要囊括genomics & proteomics,服务于相应的高通量技术;而医
学信息学则是一个逐渐壮大的学科,跟医院直接密切相关,直接服务于医院系统。我们
希望成立这样一个方向的版面,主要讨论跟医学、生物信息学甚至一切跟计算相关的生
物医学问题。
如果版面能以成立,至少会有如下益处:
1. 介绍熟悉生物信息学的应用软件:很多开源/免费的软体,如果熟悉算法的话,将大
大减少应用过程中的疑惑。实际上,生物学方面的算法大部分都不复杂。
2. 熟悉医学信息学的概念。医学信息学我一直认为将来会是信息学的主流。
3. 帮助有志于此方向的同学熟悉相关课程,需要... 阅读全帖 |
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X******n 发帖数: 914 | 47 我觉得他的贡献主要是方法学上的,告诉别人:你可以这样搞生物研究。
但这种高通量的东西,大多数数据都是假阳性。一哥们重复他那protein microarray做
磷酸化的结果,一年时间,没有一个可以confirm的。杯具。 |
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z******3 发帖数: 860 | 48 高通量测序对生物学的影响不可限量。怎么能说是面子工程。 |
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h*****a 发帖数: 1010 | 49 搞高通量测序,和争世界第一,完全可以是两个不同的事情,没必要混为一谈吧。 |
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b*****e 发帖数: 288 | 50 这个也没瞧不起码工吧,我本人也做过几个月的纯码工,对码工这个职位颇有感触。
现在没人在否认开发工具的重要性,大家讨论的是进一步的发展问题。
论薪水和论发展,有几点还是比较受认同的:
1. 做技术的(包括码工)比不过做管理的。
2. 下层职位比不过上层职位。
尽管就论“编程语言的熟练使用”这一点来说,做管理的可能远不如做技术的。
我本人master学统计学,Ph.D改bioinformatics,再后来做computional bio。在这个
块前后摸爬滚打了10年左右,突然发现自己虽然在技术方面也算是略有积累了,但在文
章这方面做得再努力,也就是个NAR、bioinformatics、Genome bio这类期刊上下。
这个时候技术做得再多,也就是个量的问题,职业发展方面很难有质的突破。
对于一个30多岁以搞科研为本职的人来说,还有什么比思绪枯竭,没有生长点,发展潜
力达到瓶颈更为可怕呢?
现在转到一个纯生物学的实验室,文章方面虽然还不好说,但至少思维开阔了不少。
我承认有人能靠几项独门的、计算方面的技术吃饭,但大多数人做不到那样。
因为行业里的人越来越多,你会的大家都会。
而且高通量... 阅读全帖 |
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