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全部话题 - 话题: 基因组
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d*********o
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1
https://www.weibo.com/ttarticle/p/show?id=2309404475962745028713
新京报
伺机而动的病毒,再一次在人类社会长驱直入。
疫情暴发至今,全球科学家正全力拼凑新型冠状病毒的拼图。
测定病毒全基因组序列、提取病毒毒株,科学家在最短时间内破译了新冠病毒的解锁密
码。新冠肺炎的“解药”也逐渐浮现,疫苗进入动物试验阶段。从实验室到病床前,曙
光初现。
但病毒从何而来、谁是第一个被感染的“零号病人”,还有太多未知和争议,需要时间
找到答案。
病毒突袭
未知病毒出现在2019。
直到今天,躺在武汉金银潭医院病床上的林华(化名)还不知道,自己缘何被病毒偷袭
。她只记得,症状最早出现在12月,憋气、咳嗽、身上没力,体温高高低低。
这是病毒在她体内作祟。在它击垮林华之前,已突破了她身体的三道防线:先是穿透由
皮肤、黏膜和分泌物构成的物理屏障,随后绕过了日常“巡逻”可以发现并“吃掉”入
侵病毒的吞噬细胞,继而挣脱免疫细胞的阻挡。
最终,它通过识别位于肺部上皮细胞表面的ACE2蛋白——这个新冠病毒入侵人体的“门
把手”,病毒通过刺突蛋白(S蛋白)抓住... 阅读全帖
s**d
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2
Job Title: Accountant (Boston)
Key Responsibilities:
1. Responsible for payment to vendor and employee payables.
2. Analyze general ledger accounts and related activities for the
production of financial statements and management report.
3. Support finance manager to analyze and prepare financial reports,
including balance sheets, statements of financial position and ad hoc
analysis.
4. Responsible for preparing tax declaring reports and other reports for
tax bureau and foreign exchan... 阅读全帖
s**d
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3
Job Title: Laboratory Manager (Philadelphia, U.S.)
Key Responsibilities
(1) Be responsible for the BGI American Laboratories’ construction and
decoration project.
(2) Be responsible for the management of suppliers for the BGI American
Laboratories’ construction and decoration project.
(3) Be responsible for the preparatory works for BGI American
Laboratories’ construction and decoration project.
Required Qualifications:
(1) Bachelor’s Degree required.
(2) Major in Biology, Chemist... 阅读全帖
s**d
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4
ob Title: Overseas Sales Representative(U.S.)
Key Responsibilities:
1. Representing the BGI by interacting with established customers and
developing new prospects in order to sale the BGI’s services and products.
2. Developing territory by identifying any commercial opportunities,
attendance at professional events, product exhibits, scientific meeting and
visiting customers will be necessary for customer base expanding.
3. Applying a broad knowledge of the BGI’s products, services and
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s**d
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5
ob Title: Overseas Sales Representative(U.S.)
Key Responsibilities:
1. Representing the BGI by interacting with established customers and
developing new prospects in order to sale the BGI’s services and products.
2. Developing territory by identifying any commercial opportunities,
attendance at professional events, product exhibits, scientific meeting and
visiting customers will be necessary for customer base expanding.
3. Applying a broad knowledge of the BGI’s products, services and
t... 阅读全帖
m**e
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6
寻找天才的基因密码
WSJ 2013年 02月 23日
在香港一处曾经是纸品印刷工厂的场所,20岁的天才少年赵博文正致力于一项富有挑战
性且可能会引起争议的任务:解开智力的基因之谜。
赵博文在中学时辍学,人称中国的比尔•盖茨(Bill Gates)。他在华大基因(BGI)
负责监管认知基因组实验室。华大基因是一家部分由中国政府出资的私有企业。
在香港的这个场所,100多台强大的基因排序机器正在破译约2,200个DNA样本,从它们
的32亿个化学硷基对中一个字母一个字母地读取数据。这儿的DNA样本都不是普通的样
本,其中大多数取自美国最聪明的一些人──一些智力绝对超群的人。
这些DNA样本多数来自那些智商在160以上的人。相比之下,设定主体人口的平均智商值
是100。诺贝尔奖得主的平均智商大约是145。香港项目中多数被研究者的智商在每三万
人中才能挑出一个──找到他们本身就是一项艰巨的任务。
赵博文希望能在今年夏天发表他这个团队的初步研究成果。他说:“人类长期以来忽视
了智力基因。人们认为这是一个有争议的话题,尤其是在西方。在中国情况不是这样。
”智商研究在中国更多地被视为一... 阅读全帖
m**e
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寻找天才的基因密码
WSJ 2013年 02月 23日
在香港一处曾经是纸品印刷工厂的场所,20岁的天才少年赵博文正致力于一项富有挑战
性且可能会引起争议的任务:解开智力的基因之谜。
赵博文在中学时辍学,人称中国的比尔•盖茨(Bill Gates)。他在华大基因(BGI)
负责监管认知基因组实验室。华大基因是一家部分由中国政府出资的私有企业。
在香港的这个场所,100多台强大的基因排序机器正在破译约2,200个DNA样本,从它们
的32亿个化学硷基对中一个字母一个字母地读取数据。这儿的DNA样本都不是普通的样
本,其中大多数取自美国最聪明的一些人──一些智力绝对超群的人。
这些DNA样本多数来自那些智商在160以上的人。相比之下,设定主体人口的平均智商值
是100。诺贝尔奖得主的平均智商大约是145。香港项目中多数被研究者的智商在每三万
人中才能挑出一个──找到他们本身就是一项艰巨的任务。
赵博文希望能在今年夏天发表他这个团队的初步研究成果。他说:“人类长期以来忽视
了智力基因。人们认为这是一个有争议的话题,尤其是在西方。在中国情况不是这样。
”智商研究在中国更多地被视为一... 阅读全帖
V******t
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8
天才少年赵博文今年只有21岁,却已拥有深圳华大认知基因组学实验室主任的头衔,他
正致力于一项富有挑战性且可能会引起争议的任务:解开智力的遗传之谜,如果获得成
功,通过胚胎筛选提高婴儿的智商将成为可能。

赵博文准备看的重金属演唱会已经开始了,他和门卫讨价还价将门票价格砍掉了一半。
他走进北京一家酒吧,跟着吉他的尖叫声穿过一条走廊,来到灯光闪烁的摇滚区。这里
的温度高得像地狱,看上去也像———舞台上的男子装扮成魔鬼,用英语在演唱一首关
于魔鬼的歌,观众们在台下疯狂地摇摆头和身体。赵也加入进去。

闪光灯捕捉到身体的碰撞,汗水飞舞。眼镜飞起来,掉到地上被踩坏。人们的表情激动
又疯狂,像是一群暴民。此时,歌曲以一阵奇怪的尖叫结尾,乐队中场休息。人群高举
拳头大喊着“牛逼!”这是最高的赞美。

在这个青少年聚集的场所,赵显得如鱼得水。大眼睛上压着漆黑的眉毛,再配上一副银
边眼镜,让他看上去像个友好的卡通角色,有点婴儿肥的脸颊更加深了这一效果。他看
上去很平凡,平均的身高,平均的体重。

但赵绝不平凡。他很小就被发现具有科学天赋,通过特殊选拔,进入一所天才中学。然
而,在17岁时... 阅读全帖
m******r
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9
来自主题: Military版 - 转基因作物的毒性问题 zz
转基因作物的毒性问题 5
作者:石老人
科普几个问题:

一、关于植物基因组

植物中有核基因组、线粒体基因组和叶绿体基因组。它们各有独立的DNA复制系统,请
查自主复制这个概念。叶绿体是植物将太阳光的能量(“万物生长靠太阳”的根据在这
里)转变为化学能的场所(第一步是将光能转变成糖类,……);线粒体是细胞一切活
动的能量来源场所,类似于一个城市的发电场。但它们在生物体内是相互依赖相互影响
的,这个问题太复杂。

举2个例子,植物的叶子是光合作用的主要场所,植物的光合作用由叶绿体负责,多数
植物的光合作用的最关键酶叫RUBP羧化酶(另一个叫 PEP羧化酶,存在于玉米、高粱等
C4植物中,但C4植物的二样化碳固定也主要靠RUBP羧化酶,只是多了一条C4途径),这
个酶的最主要作用是固定二氧化碳(不止这一个功能)。RUBP羧化酶含16个亚基,其中
的8个亚基是核基因组编码的,8个亚基是叶绿体编码的,分别来自核基因组和叶绿体基
因组的16个亚基组成一个很大很复杂的蛋白质,这就是RUBP羧化酶,植物叶片中水溶性
蛋白质的一大半是这个酶。叶绿体中捕捉光子的主要色素是叶绿素,包括A、B等(当... 阅读全帖
n**e
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10
来自主题: Military版 - 基因宝宝的核心秘密 (转载)
【 以下文字转载自 Detective 讨论区 】
发信人: nile (nile), 信区: Detective
标 题: 基因宝宝的核心秘密
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Nov 30 01:53:07 2018, 美东)
就在一天之前,2018年11月28日,香港大学李兆基会议中心坐无虚席,中国科学家生物
物理学博士贺建奎在第二届人类基因编辑峰会上作了关于人类第一对基因宝宝诞生的主
题发言并回答了与会者的质问。让我们还是先从科学技术本身出发,去看看贺博士究竟
是怎样把基因宝宝编辑出来的。
首先尼罗河注意到贺博士所谓的道歉。很多人满心盼望着贺博士低头认罪。但是,贺博
士的道歉不是为成功创造基因宝宝的成就道歉。而是为将这一成就首先通过公共媒体发
布而非在专业平台发布对业内人士表示歉意。在尼罗河看来,这纯粹是为了争取科学界
对这一宏伟事业的支持而对他们表示尊重。这证明贺博士很懂得建立统一战线的重要性
。事实上,在决定针对CCR5这个基因进行胚胎编辑之前,他已经通过非公开方式与多位
基因操作的权威专家讨论过,在技术问题上获得了专业认同。
基因宝宝的医学需求和受试者的知情权
艾... 阅读全帖

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11
一、基因编辑技术与人工合成病毒产生的背景
人类基因组计划、曼哈顿原子弹计划、阿波罗计划并称为三大科学计划。人类基因组计
划(英语:Human Genome Project, HGP)是一项规模宏大,跨国跨学科的科学探索工
程。其宗旨在于测定组成人类染色体(指单倍体)中所包含的30亿个碱基对组成的核苷
酸序列,从而绘制人类基因组图谱,并且辨识其载有的基因及其序列,达到破译人类遗
传信息的最终目的。此计划在研究人类过程中建立起来的策略、思想与技术,构成了生
命科学领域新的学科——基因组学,可以用于研究微生物、植物及其他动物。 1970年
,从基因编辑技术诞生以来,人类就打开了控制物种自然演变的潘多拉魔盒。对人类基
因组的研究在70年代已具有一定的雏形,在80年代在许多国家已形成一定规模。 1984
年在Utah州的Alta,WhiteR and Mendelsonhn M受美国能源部(DOE)的委托主持召开了
一个小型专业会议讨论测定人类整个基因组的DNA序列的意义和前景(Cook Deegan RM,
1989) 1985年5月在加州SantaCruz由美国DOE的Sinsheimer ... 阅读全帖
D*****r
发帖数: 6791
12
来自主题: TrustInJesus版 - 基因开关调控物种进化
英文版:Regulating Evolution: How Gene Switches Make Life
http://www.scientificamerican.com/article.cfm?id=regulating-evo
【注:转载几段科学美国人中文版<环球科学>08年第6期上关于“基因开关”(genetic
switch)和物种进化的介绍文章。
作者 肖恩·B·卡罗尔(Sean B. Carroll)
本杰明·普吕多姆(Benjamin Prud’homme)
尼古拉斯·贡普勒(Nicolas Gompel)】
【摘要】人和狗的外形迥然不同,基因却有96% 完全相同。相似的基因为何产生如此巨
大的差异,原因隐藏在基因的非编码区。被称为“增强子”的不同基因开关,控制着同
一基因在不同物种的不同部位发挥不同作用。物种进化大都由基因开关的突变引起,基
因本身不必发生明显变化。正是这种基因开关产生了千变万化、多姿多彩的生物世界。
【以下为节选】
在人类基因组中,编码蛋白质的部分仅占1.5%左右,这些基因就像DNA序列海洋中为数
不多的信息孤岛。对于剩余的众多非编码DNA的功能,... 阅读全帖
g*********d
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13
对宏观物体量子效应的首次观测列居榜首
在今年之前,所有的人造物体的移动都遵循经典力学的法则。然而,在今年3月,一组
研究人员设计
了一种精巧的装置,其运动方式只能够用量子力学来描述(量子力学是一组支配如分子
、原子及亚原
子颗粒等细小物体运行的法则)。为了表彰他们的实验在概念上的拓展、其独创性以及
它的众多的潜
在用途,《科学》杂志称这一发现是2010年最重大的科学进展。
加州大学圣巴巴拉分校的物理学家Andrew Cleland 与John Martinis设计了这一机械:
一个人
们可用肉眼看到的极其细小的金属半导体桨状物,并巧妙地使它按照量子规范舞蹈。首
先,研究人员
将该浆状物冷却至其“基态”(即量子力学所允许的最低能态,这是物理学家长期以来
所追求的目
标)。他们接着将该装置的能量提高一个量子以产生一种纯粹的量子力学的运动状态。
他们甚至设法
将该装置同时进入到两种能态,因此该装置在同一时间会有微小的振动及很大的振动,
这种奇怪的现
象在量子力学的奇怪法则中是允许出现的。
科学网相关报道:科学家首次观测到宏观物体量子效应
《科学》杂志及其发行机构——美国科学促进会(AAAS)... 阅读全帖
m*********r
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14
腾讯科技 雷建平 7月17日报道
就在泰康投资20亿元入股华大基因不久,华大基因突然高层调整。华大基因官网发布消
息称,王俊不再担任华大基因研究院院长、华大基因CEO职务,继续留任华大基因董事
会,出任董事合伙人。
王俊已在自己的新浪微博账号和微信朋友圈更改了自身信息资料,并在一条信息下留言
,称这是最后一次以原来的身份出席活动。
资料显示,王俊1999年加入华大基因,在华大基因初期组建和发展过程中做出重大贡献
,是人类基因组计划、水稻基因组计划等重大项目的主要参与者。
王俊组建了华大生物信息平台,参与了杭州华大的成立,带领团队完成了第一个亚洲人
基因组、大熊猫基因组、千人基因组、人体肠道元基因组等系列标杆性项目。
华大基因称,王俊帮助实现对Complete Genomics收购,华大科技与华大医学的融资和
顺利重组。王俊还曾担任华大基因研究院院长。
经华大基因董事会决议支持由原华大基因CEO王俊主导组建以人工智能为核心,关注前
瞻性业务发展新业务机构。王俊继续留任华大基因董事会,出任董事合伙人。
2014年7月,华大基因曾表示,该集团旗下华大科技、华大医学计划于2015年分别在香
港... 阅读全帖
m*******t
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15
来自主题: Military版 - 普通老百姓如何对待转基因
普通老百姓如何对待转基因
这次回国,有不少人问到转基因,碰巧我做过这方面的工作,知道其中一二,就写了这
个帖子,给大家科普一下。
一,转基因有害? 别逗了。你要把酒桌上调侃"河南人都是骗子"当了真,那我还真无
话可说。老实说,笼统地讲"转基因有害"是个伪命题,就算可能有点道理,也没啥意
义。转基因要根据不同的目的转不同的基因。抗虫转抗虫基因,抗旱转抗旱基因,抗病
毒转抗病毒基因。这些基因性质不同,产生的蛋白结构不同,当然产生的效果也不可能
相同。即便可能有害,也应该是产生不同的危害。就好象抗生素,你可以说青霉素可能
引起过敏,土霉素可能引起黃斑牙,氯霉素可能引起再生障碍性贫血,但你非要说"抗
生素有害"有多少意思?
之所以当头強调这一点,是因为反对转基因的文章常常以偏概全,把针对单个转基因产
品的实验结果无限延伸,一板子打在所有转基因的屁股上。比如欧洲有位教授发现食用
转bt基因玉米的老鼠,其后代的生育力会下降。且不说这个教授的实验有无问题,就算
完全正确,也不能因此得出结论,说食用转抗旱基因水稻的老鼠,其后代的生育力也会
下降。就好象学工程的大学生可以造汽车,不等于任何大学生都可以造... 阅读全帖
c*********d
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16
来自主题: Military版 - 荒猫牛不耕微信号laoniu003005
荒猫牛不耕微信号laoniu003005
功能介绍
好文分享
来源:荒猫之舞
作者:荒猫
中美贸易战告一段落,毫不意外地,咱们又赢了。不过与以往不同的是,这次美国也赢
了,是双赢。据报道,咱们答应了美国减少贸易逆差的要求,所以美国赢了;而因为要
减少贸易逆差,中方将大量增加自美购买商品和服务,这样可以满足咱们不断增长的消
费需求和促进高质量经济发展,所以咱们也赢了。
但让我感觉不可思议的是,这么好的事情,为什么一直不做呢?为什么要在美国政府的
逼迫下去做呢?是因为没有想到?那岂不是说那些人能力低下?是因为想到了而不做,
那岂不是证明了那些人很坏?
而且在美国高调启动贸易战之初,咱们是抱着多大的决心,宁为玉碎不为瓦全,一定要
打赢的,一定要粉碎美国人阻挡咱们大国崛起的阴谋的。当美国提出500亿的清单时,
咱们针锋相对;当美国提出1000亿的清单时,咱们继续应战;而当美国把清单的总价提
高到2000亿的时候,一夜之间,美国就不是阻挡咱们大国崛起,而是有利于咱们大国崛
起了。美国的要求原来是有利于咱们的发展,而不是遏制咱们的发展了。我恍然大悟:
原来以前的针锋相对,是用的激将法,是为了刺激美... 阅读全帖
t**x
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17
人家在中国治病救人
靠服务人民挣钱
今年2月底在美国佛罗里达召开的生物技术领域最有影响力的“全球基因组生物学
与技术进展”(AGBT)大会上,美国科学院院士、北京大学长江讲座及千人计划
教授、北京大学生物动态光学成像中心(BIOPIC)主任谢晓亮代表北大BIOPIC-北医三
院生殖医学研究团队报告了一项最新的单细胞基因组扩增技术成果,首次实现了人类胚
胎在植入女性子宫前的遗传诊断,该技术有望大幅提高辅助生殖(试管婴儿)成功率,
并在其他产前诊断领域具有广泛的应用前景。
该团队由北京大学BIOPIC的谢晓亮实验室、汤富酬实验室及北京大学第三附属医院生殖
医学中心乔杰实验室组成。 他们将谢晓亮哈佛大学实验室去年底发表在《科学》上的
MALBAC(multiple annealing and looping-based amplification cycles) 技术应用
于临床,从而确立了基于单细胞基因组高通量测序的植入前基因诊断新方法。 据外媒
报道,该报告引起与会同行的高度关注并获得了多家媒体报道,冷泉港实验室的
Gholson Lyon 评价说谢晓亮教授的报告... 阅读全帖
v**e
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18
我国专家心头之痛:面对SARS中国科学家打了败仗
http://www.sina.com.cn 2003年05月26日03:05 中国青年报
“应该承认,在SARS面前,我们中国科学家整体打了败仗。”
这是近一个时期来杨焕明几乎逢人便讲,逢会必说的一句话。面对前来视察工作的
胡锦涛总书记他这样说,在中科院“紧急行动计划”的启动会议上他这样说,在接受中
科院基因组研究所所长的任命时他还是这样说。
5月1日,美国《科学》杂志网站刊登了两篇SARS病毒基因组序列的研究论文,一篇
以美国疾病预防与控制中心的科学家为主,并有美国、荷兰和德国科学家参与完成;另
一篇则以加拿大不列颠哥伦比亚癌症研究署基因组科学研究中心为主完成。
海外有华人同行指出:“这两篇经过同行评议的论文的发表,宣布SARS病毒基因组
序列战结束,中国科学家败北。”
这个问题,正好击中了杨焕明的心头之痛,而且这将会是他心中一种永久的伤痛。
作为中科院新组建的北京基因组研究所首任所长,“人类基因组计划”中国区总协
调人,杨焕明清楚,在SARS病毒基因组的测序上,中国本来完全有可能争得世界第一。
这不仅因为第一个SARS病人在中国发... 阅读全帖
p**f
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19
可见千老合成一个病毒也就分分钟的事
知道了基因序列,reverse engineering跟搭积木一样简单
这个新病毒是五毒所千老搞出来石锤了
跟贺建奎搞的转基因婴儿一样
不是技术有难度,而是稍微伦理常识的国外千老不会去做
换到你中帝这儿,就毫无底线,毫无顾忌了
五毒所千老各种瞎几把折腾,然后管理不善,泄露。。。
---
人类首次人工合成活新冠病毒:用已知基因序列构建
近日,瑞士一个科研团队在已知新冠病毒基因序列的基础上,通过反向遗传学手段在酵
母菌中快速构建出了活的新冠病毒。该技术能高效合成新冠病毒,尤其在新暴发病毒尚
未被成功分离出之前,可以帮助科学家尽快向卫生部门和实验室提供传染性病毒毒株,
且该替代方案更为高效、安全。
以上成果披露自预印本网站BioRxiv于当地时间2月21日发表了一篇名为“Rapid
reconstruction of SARS-CoV-2 using a synthetic genomics platform”的论文。该
尚未经同行审议。研究团队首次在试验中,利用合成基因组学平台快速重建了新冠病毒。
值得注意的是,这是一项根据已知病毒基因组进行病毒重建的基... 阅读全帖
l******8
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20
来自主题: pets版 - 最新发现认为犬类起源中东
http://newsroom.ucla.edu/portal/ucla/dogs-likely-originated-in-
【纽约时报】最新发现认为犬类起源中东
作者:Nicholas Wade
2010年3月17日
最近,研究人员借助人类疾病遗传学研究手段得出了一项研究成果,认为犬类的起源最
早来自中东地区某地对狼的驯养,而非之前另一项研究所暗示的东亚起源论。
中东是目前已知的人类最早开始改良植物以及驯养非犬类家畜的地区,而这一新发现认
为,人类最早的驯化行为——养狗,也同样起源于此,这一结论同时加强了人类社会第
一批家养动物出现与约一万年前农业的诞生之间存在的联系。
此外,中东起源说与现有的考古学证据更加相符,而且,从大约两万年前游猎部落与狼
的关系到维多利亚时代犬类爱好者创造的诸多现代犬种,中东起源说使遗传学家们能够
完整地重建一部犬类发展史。
由加州大学洛杉矶分校的Bridgett M. vonHoldt和Robert K. Wayne领导的一个研究组
分析了来源于世界各地的大量狼和狗的基因组样本。通过对相似序列的比对,研究组发
现,中东地区狼和狗的基因组相似度最高,尽管东... 阅读全帖
P******l
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21
10年内合成任何生命?且看华大梦想
2018-01-29 香柏领导力
记者 | 龙跃梅
文章来源 | 科技日报
编者按
上帝创造万物,最后按自己的“形象和样式”造人,并授予人类管理这个世界的权柄。
今天的人类也开始学上帝的“样式”来“创造生命”。例如2017年3月,经过多国科学
家的通力合作,人类成功合成了酵母菌。
这里需要指出的是,这次成功合成酵母菌的“技术含量”与上帝的“创造大能”相比,
真是太微不足道了。
首先,人类是先解读了上帝造物的密码,再遵循密码的原则,合成酵母菌。
其次,酵母菌还是太简单了,与高等的动、植物以及我们人类相比,它的遗传密码还是
太少、太简单了,差不止几个数量级。
但是,正如本文介绍的一样,居然有人宣称“5-10年内能合成任何生命”?人,总是太
骄傲,尤其是当他们不能够正视自己与造物主之间巨大的、本质性的差别的时候。相信
在我们当中绝大多数人都能继续活这之后的5-10年,尚且不妨让我们作为历史的见证人
,一同见证是否有人曾在当今确实夸口。
“未来5-10年,我们可以化学合成任何生命。”在近日召开的2017深商大会上,华大基
因集团董事长汪建称,未来人造生命的进... 阅读全帖
s**l
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22
http://www.j1000plan.org/CoverStoryContent.aspx?converstoryCont
用生物育种技术保障中国人舌尖上的安全
——访国家“千人计划”专家周发松
时间:2014-04-20 来源:千人杂志
提要:全球首张水稻全基因组育种芯片研制成功,实现了作物品种培育过程中一个关键
性技术成果的重大突破,为我国开展商业化育种提供了重要技术支撑和保障。
用生物育种技术保障中国人舌尖上的安全
文/王广黎
上世纪袁隆平院士的杂交水稻横空出世,被科学界看作是中国粮食安全稳产增产的定心
丸。然而,时代变迁新的问题层出不穷,尽管我国享有地大物博的美誉,但近年来,我
国在粮食生产自给上却隐忧不断。产不足需、进口常态化、丰年不充裕、灾年无足备等
多重尴尬撩拨着国人的粮食安全的神经,在新技术的冲击下,如何从源头上解决粮食安
全,对科学家提出更高要求。国家“千人计划”专家、中国种子集团有限公司生命科学
技术中心(以下简称“科技中心”)基因组育种部总监周发松博士对此提出了新的见解
。周发松和他的团队利用近年来植物功能基因组的最新研究成果,致力于生物育种创新
研究,成功研... 阅读全帖
l**********1
发帖数: 5204
23
来自主题: Biology版 - 我也来打个广告!
同济医学院科研要赶超复旦和交大了哈 at least Stem Cell parts
发信人: amedio (Boasting Father), 信区: Harvard_Medical_School
标 题: Re: 同济大学生物信息学海外团队招聘启事 (转载)
发信站: BBS 未名空间站 (Sat Nov 7 08:38:57 2009, 美东)
想告诉大家形势严峻,要回去趁早

team
RE
同济大学生物信息学海外团队招聘启事 (转载)
[俱乐部:Harvard_Medical_School][首篇作者:amedio] , 2009年11月06日06:28:26
[分页:1 ]
发信人: amedio (Boasting Father), 信区: Harvard_Medical_School
标 题: 同济大学生物信息学海外团队招聘启事 (转载)
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Nov 6 06:28:26 2009, 美东)
【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: biowilliam (magic), 信区: Biology
标 题: ... 阅读全帖
F****o
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来自主题: Biology版 - 饶毅PK王俊@11-27
http://paper.dxy.cn/article/39255
【编者按】华大:借人类基因组计划之势崛起,凭借庞大的测序能力,地里长的,圈里
滚的,在树叶上蠕动的的各种生物几乎测了个遍。饶毅:学术成果卓著,其出位的言辞
迥异于闷头做学术的科研人士。日前,有网友在参与北大举办的生物交叉科学学术论坛
时,记录了华大王俊与饶毅之间火星撞地球般的PK。
本周日(10-27)去参加了北大举办的生物交叉学科学术论坛!
当听完北大生科院饶毅院长开场致辞的最后一句话时,我惊呆了。但随后两位大牛间十
分钟的赤膊之战,让我彻底埋在了炮灰下...
还好,本想录制王俊老师的演讲报告回去仔细研读,没想却把这千载的一幕记载了下来
。饶毅院长招招致命的出击,与王俊老师雄霸天下的气势,这精彩的一幕有幸被我录了
下来,与草根们一起欣赏两位大牛的巅峰“对决”。
下面来概括一下:这次“论战”大致主要分四场,分别是:
论战一:华大你拿中国的钱为外国做事?
论战二:华大只会拿别人的idea做学术吗?
论战三:王俊,你是科学家吗?
论战四:华大是造福老百姓的吗?
下面分开而谈!
论战一:华大你拿中国的钱为外国做事?
饶毅:我... 阅读全帖
i****g
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大家看看这个技术 应用的领域很广
谢晓亮小组报告新技术有望大幅增加试管婴儿成功率
今年2月底在美国佛罗里达召开的生物技术领域最有影响力的“全球基因组生物学与技
术进展”(AGBT)大会上,美国科学院院士、北京大学长江讲座及千人计划教授、北京
大学生物动态光学成像中心(BIOPIC)主任谢晓亮代表北大BIOPIC-北医三院生殖医学
研究团队报告了一项最新的单细胞基因组扩增技术成果,首次实现了人类胚胎在植入女
性子宫前的遗传诊断,该技术有望大幅提高辅助生殖(试管婴儿)成功率,并在其他产
前诊断领域具有广泛的应用前景。
该团队由北京大学BIOPIC的谢晓亮实验室、汤富酬实验室及北京大学第三附属医院生殖
医学中心乔杰实验室组成。 他们将谢晓亮哈佛大学实验室去年底发表在《科学》上的
MALBAC(multiple annealing and looping-based amplification cycles) 技术应用
于临床,从而确立了基于单细胞基因组高通量测序的植入前基因诊断新方法。 据外媒
报道,该报告引起与会同行的高度关注并获得了多家媒体报道,冷泉港实验室的
Gholson Lyon ... 阅读全帖
i***s
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赫芬顿邮报网站报道,11月18日在伦敦召开的英国皇家协会会议上展出了来自尼安德特人和另一个不同的古代人类群体丹尼索瓦人的古代基因组。这表明3万多年前,好几个生活在欧洲和亚洲的古代人类群体成员,包括一个来自亚洲目前尚未知的人类祖先之间发生了异血缘交配。
“它似乎显示了我们正在观察一个类似指环王类型的世界——其中存在很多原始人类群体,”参会这项会议的英国伦敦大学进化遗传学家马克·托马斯(Mark Thomas)这样说道,他并未参与这项研究。
第一批尼安德特人和丹尼索瓦人的基因组序列彻底革命化了对古代人类历史的研究,这不仅因为它们显示了这些群体会与解剖学上的现代人类相互杂交,从而导致现代人类的基因多样化。
所有祖先起源于非洲以外的现代人类有2%的基因组来自于尼安德特人;生活在大洋洲——例如巴布亚新几内亚和澳大利亚土著居民——的某些人群的 DNA有4%来自于他们的祖先和丹尼索瓦人的混交,丹尼索瓦人是以他们被发现的西伯利亚阿尔泰山脉某洞穴为名,这些洞穴包含了3万年至5万年前沉积的沉积物。
然而,这些结论是基于低质量的基因组序列,充斥着错误且到处是缺口,美国马萨诸塞州波士顿哈佛大学医学院的进化遗传... 阅读全帖
a*****y
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http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2018/7/415023.shtm
哈佛讲席教授谢晓亮全职回北大任教
2018年7月1日起,北大生物动态光学成像中心主任、北京未来基因诊断高精尖创新中心
主任——谢晓亮正式全职回到母校北大任教,担任北京大学李兆基讲席教授。
谢晓亮
1998年,谢晓亮成为改革开放后哈佛大学聘任的第一位来自中国大陆的终身教授;2009
年,他成为改革开放后第一位哈佛冠名讲席教授的中国大陆学者;他是美国国家科学院
院士、美国国家医学院院士、美国艺术与科学院院士、美国物理化学和生物物理界最高
奖获得者,是获得美国生命医学大奖——阿尔伯尼生物医学奖的第一位华人。
附:谢晓亮教授为北大120周年校庆撰写的纪念文章:
梦想的启航与归程——我和北大的故事
光阴似箭,岁月如梭,历经百廿沧桑,母校北京大学即将迎来120周年华诞。
我生于北大,长于北大,熟悉这里的一草一木,一山一水。从北大幼儿园、北大附小、
北大附中到北京大学,我在北大度过了大部分的学生时光,与北大一起经历了中国的历
史变迁,建立了无法割舍的联系。每次回到燕园,我总会感觉到一种温暖的气... 阅读全帖
h*****h
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http://www.pku.edu.cn/ 头条
http://pkunews.pku.edu.cn/xwzh/2018-07/02/content_303545.htm
2018年7月1日起,北大生物动态光学成像中心主任、北京未来基因诊断高精尖创新中心
主任——谢晓亮正式全职回到母校北大任教,担任北京大学李兆基讲席教授。
谢晓亮
1998年,谢晓亮成为改革开放后哈佛大学聘任的第一位来自中国大陆的终身教授;2009
年,他成为改革开放后第一位哈佛冠名讲席教授的中国大陆学者;他是美国国家科学院
院士、美国国家医学院院士、美国艺术与科学院院士、美国物理化学和生物物理界最高
奖获得者,是获得美国生命医学大奖——阿尔伯尼生物医学奖的第一位华人。
附:谢晓亮教授为北大120周年校庆撰写的纪念文章:
梦想的启航与归程——我和北大的故事
光阴似箭,岁月如梭,历经百廿沧桑,母校北京大学今年迎来120周年华诞。
我生于北大,长于北大,熟悉这里的一草一木,一山一水。从北大幼儿园、北大附小、
北大附中到北京大学,我在北大度过了大部分的学生时光,与北大一起经历了中国的历
史变迁,建立了无法割舍的联系。每次回... 阅读全帖
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5月1日,美国《科学》杂志网站刊登了两篇SARS病毒基因组序列的研究论文,一篇
以美国疾病预防与控制中心的科学家为主,并有美国、荷兰和德国科学家参与完成;另
一篇则以加拿大不列颠哥伦比亚癌症研究署基因组科学研究中心为主完成。
海外有华人同行指出:“这两篇经过同行评议的论文的发表,宣布SARS病毒基因组
序列战结束,中国科学家败北。”
这个问题,正好击中了杨焕明的心头之痛,而且这将会是他心中一种永久的伤痛。
作为中科院新组建的北京基因组研究所首任所长,“人类基因组计划”中国区总协
调人,杨焕明清楚,在SARS病毒基因组的测序上,中国本来完全有可能争得世界第一。
这不仅因为第一个SARS病人在中国发现,中国科学家应当有机会最早接触到第一手资料
;而且中国的“人类基因组”计划研究中心无论是规模还是技术水平,绝不逊于国际同
行。
杨焕明的创业伙伴、基因组所副所长汪建更是痛心疾首。他曾在首家宣布SARS为一
种新型冠状病毒的加拿大研究中心工作过:“论规模,那家中心比我们所要小得多;说
技术,我在那里就是专门负责技术工作的。但现在我们竟落到了他们后面。”
尽管北京基因组研究所4月15日接到军事医学... 阅读全帖
a*******m
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看起来是华南农大在人为fit曲线, 蹭热点,抓眼球。
100个数据点, 中有80个, 可以和现有冠状病毒match 99%。
余下的20个数据点,根本match不上。 怎么办呢? 把这20个数据点
剔除掉, 用那80个数据点match就好了。
这就是他们的99%match的由来, 也太不要脸了。
这个时候了,还搞这种低级下三路的垃圾手段。
研究称穿山甲为新冠潜在中间宿主 专家认为需更多证据
2020年02月07日 14:07 来源于 财新网
华南农业大学发布的最新研究称,穿山甲为新型冠状病毒潜在中间宿主。专家指出,确
定穿山甲是中间宿主还需要实际的穿山甲接触史和流行病调研信息的支持
2月7日凌晨,华南农业大学发布消息称,最新研究表明,穿山甲为新型冠状病毒潜在中
间宿主。专家指出,确定穿山甲是中间宿主还需要实际的穿山甲接触史和流行病调研信
息的支持。
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陈剑:新冠肺炎湖北死亡率仍高于全国 医疗资源须进一步倾斜
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http://m.xinhuanet.com/gd/2020-02/08/c_1125544802.htm
7日凌晨,华南农业大学(以下简称“华农”)发布新型冠状病毒肺炎疫情研究攻关
成果:在穿山甲身上发现的一种β冠状病毒与人类感染的新型冠状病毒的相似度达99%
,表明穿山甲可能是新型冠状病毒的潜在中间宿主。
穿山甲是如何被科学家们“锁定”的?找到中间宿主对疫情防控有什么作用?本报
记者独家对话了3位科学家:华农兽医学院研究员、博士生导师沈永义,华农特聘教授
肖立华,华农兽医学院教授、博士生导师冯耀宇。
带毒穿山甲来自哪里?
南方日报:成果中提到的“宏基因组”是什么?
沈永义:我们几位科学家都是科技部重点领域创新团队成员,我的其中一个课题是
“华南地区主要野生动物携带病毒谱调查研究”。我们花了4年多时间,逐步建立了一
个野生动物的宏基因组库,目前收集了1000多个野生动物个体的宏基因组。
所谓宏基因组,就是某个生物个体身上带有的核酸片段集合,这些核酸片段可能来
自野生动物本身,也可能来自野生动物身上带有的细菌、病毒等。
南方日报:当初为什么要建这个数据库?
沈永义:SARS时期,寻找中... 阅读全帖
M********r
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首例生物科技并购还原
字号
评论 邮件 纠错 2013年10月21日11:23 来源:《财经》
“多年以来我听到的都是中国的生物企业被国外企业并购,”北京市投资促进局的
一位官员9月27日在一个闭门论坛上感叹说,“中国企业并购海外生物企业,这还是第
一次。”
今年3月,华大基因通过旗下子公司Beta Acquisition Corporation完成对美国上
市公司Complete Genomics(下称CG)的收购,二者整合之后华大基因将获得基因测序仪
的生产能力,降低对Illumina等上游公司的依赖,测序服务成本也有望大幅降低。
这是一桩业内瞩目的交易,但直到半年后,华大基因才向外界透露收购细节,而《
财经》(博客,微博)是独家获知这些细节的中文媒体。
一群平均年龄不到30岁的科学工作者摇身一变成为商业精英,他们至今都没完全适
应这个新身份。
“从来没人教过我商业并购。”华大基因CEO王俊在接受《财经》记者采访时问,
“你能想象一群科学家是如何做成这个事情的吗?”
彼时他们甚至不知道手里的人民币要换成美元才能用于海外并购,以为“像买菜一
样掏出钱来买就行了”,而很多类似的技术处理... 阅读全帖
M********r
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首例生物科技并购还原
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评论 邮件 纠错 2013年10月21日11:23 来源:《财经》
“多年以来我听到的都是中国的生物企业被国外企业并购,”北京市投资促进局的
一位官员9月27日在一个闭门论坛上感叹说,“中国企业并购海外生物企业,这还是第
一次。”
今年3月,华大基因通过旗下子公司Beta Acquisition Corporation完成对美国上
市公司Complete Genomics(下称CG)的收购,二者整合之后华大基因将获得基因测序仪
的生产能力,降低对Illumina等上游公司的依赖,测序服务成本也有望大幅降低。
这是一桩业内瞩目的交易,但直到半年后,华大基因才向外界透露收购细节,而《
财经》(博客,微博)是独家获知这些细节的中文媒体。
一群平均年龄不到30岁的科学工作者摇身一变成为商业精英,他们至今都没完全适
应这个新身份。
“从来没人教过我商业并购。”华大基因CEO王俊在接受《财经》记者采访时问,
“你能想象一群科学家是如何做成这个事情的吗?”
彼时他们甚至不知道手里的人民币要换成美元才能用于海外并购,以为“像买菜一
样掏出钱来买就行了”,而很多类似的技术处理... 阅读全帖
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来自主题: Macromolecules版 - [转载] 两种大科学的抉择
【 以下文字转载自 Science 讨论区,原文如下 】
发信人: atongmu (铁臂阿童木), 信区: Science
标 题: 两种大科学的抉择
发信站: Unknown Space - 未名空间 (Tue Aug 3 14:47:38 2004) WWW-POST
两种大科学的抉择
吴家睿
(中科院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所,上海 200031)
从科学研究的历史来看,形成一门学科并不是一件容易的事。但是,在人类基因组计划实
施的短短几年间,以“……组学”(-omics)构成的学科如雨后春笋,迅速地在生命科学
界蔓延。最早出现的是与DNA相关的“基因组学”(Genomics),随后又产生了许多与各
种生物大分子或小分子相关的“组学”,如“蛋白质组学”(Proteomics),转录组学(
transcriptomics),“代谢组学”(metabolomics)等等。复合名词则更是不可胜数,
以基因组学为例,在文献中就可以看到:结构基因组学、功能基因组学、癌症基因组学、
药物基因组学、毒理基因组学、环境基因组学和营养基因组学等等。这些术语的出现,从
积极的
j****e
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来自主题: History版 - 鸡:餐桌之外的生活
最后请允许我恶搞一下……
基因组时代使鸡有了更大的表现舞台。2004年,多国科学家公布了红原鸡基因
组图谱。这张图谱是对一只红原鸡进行测序而获得的,它将帮助了解鸡的基因功能、
培育新的良种鸡。将它与人类和其它生物基因组图谱比较,还将为识别人类基因、
认识生物进化史提供新的线索。
鸡的基因组规模相对较小,只有10亿个碱基对,相当于人类基因组的1/3;基因
总数却与人类相近,为2~2.3万个,人与鸡有60%的基因相同。这表明,鸡基因组中
的“垃圾”可能更少。科学家还将红原鸡与肉鸡、蛋鸡和中国乌鸡的基因组进行对
比,发现家鸡并不像人们以为的那样严重地近亲繁殖,仍有着较大的遗传多样性。
对鸡基因组的初步分析已经带来了一些收获。例如此前人们认为鸟类基本没有
嗅觉功能,但新发现了不少与嗅觉有关的基因,显示鸡的嗅觉虽然比狗还差得远,
但与人类已经可以比一比了。寻找味觉基因的努力则收获寥寥,可见鸡的味觉功能
很差。另外一个有趣的发现与编码角蛋白的基因有关。角蛋白对于人类和鸟类都是
很重要的蛋白质,它构成了人类的毛发和指甲,以及鸟类的羽毛和喙。科学家此前
认为人类和鸟类的角蛋白应... 阅读全帖
d**e
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中国为什么没有孟山都?
作者:土摩托
孟山都的豪赌
“中国最多时曾经有8700家种子公司,但它们的销售额加起来也远远不如孟
山都一家公司,双方实力相差太大了。”张启发教授忧心忡忡地对本刊记者说,
“我早在1996年就注意到了这家公司,那时候国内还没有什么人听说过孟山都。
我当时就建议中国应该成立一个像孟山都一样的公司和它抗衡,否则国内种子市
场必然被外国公司全面占领。当时的人们,包括政府部门都不知道我在说什么,
但今天再来看,我当初的预言都已经变成了现实。”
张启发是华中农业大学生命科学技术学院院长,中科院和美国国家科学院双
料院士,他还有一个头衔是国家农作物分子技术育种中心主任,该中心是在张启
发的倡议下,于2000年经农业部批准在武汉成立的。张启发希望将其打造成中国
的孟山都,可惜由于种种原因,这个中心至今在产业方面没有什么太大的作为。
与此同时,孟山都却从一家专门生产化学品的公司摇身一变,成了全世界种
子行业的领军者。
孟山都(Monsanto)成立于1901年,总部位于美国的密苏里州。这家公司最
初的主业是化工产品,曾经生产过DDT和橙剂,后者是一种高效除草剂,“越战”
时曾经... 阅读全帖
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英国《自然》杂志首次公布人类蛋白质组草图
字号:小中大2014-05-30 17:19:37
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关键字 >> 蛋白质蛋白质组《自然》杂志英国科学技术技术突破草图生物技术科技前沿
28日出版的英国新一期《自然》杂志,公布了人类蛋白质组草图绘制工作的里程碑成果
:两个小组发表了对人体组织、体液和细胞所做的质谱分析,标绘了人类蛋白质组草图。
如果说基因是描述生命奥秘的图纸,蛋白质就是构成生命的具体建筑材料。在人类基因
组草图完成后,科学家尚不能借此完全解释生命现象,因为有些基因信息不会真的表达
为蛋白质,而人类的生、老、病、死也只有在蛋白质这个更直接的层面上才能得到解释
。因此如果想要阐释人类生命活动及其病理机制的实质,必须绘制人类蛋白组。
上世纪90年代,人类基因组计划开始成形时,有科学家提出了破译人类蛋白质组的想法
。其目标是将人体所有蛋白质归类并描绘出它们的特性、在细胞中所处的位置以及蛋白
质之间的相互作用。中国科学家在这个工程中,主要负责人类肝脏蛋白组计划。但人类
蛋白质组的规模和复杂性使此类研究困难重重。
蛋白质
编码一个蛋白质氨基酸序列的基因的DNA序列
《自然》发表人... 阅读全帖
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来自主题: Military版 - 《山海经》与美洲
这个查查基因应该不难办
第一批美国人从哪里来?大部分研究人员认为,1.5万年前,史前美洲人从亚洲出发,
穿过白令陆桥,这暗示着他们的根在东亚。但是,他们的来源究竟是哪里,至今仍是一
个谜。
日前,一名在2.4万年前死去的西伯利亚男孩的完整核基因组(真核生物细胞核染色体
所包含的全部遗传信息)带来了一个令人惊讶的发现,这是迄今为止现代人中最古老的
完整基因组。他的DNA显示其与当今的土著美洲人(美洲印第安人)有着紧密联系。然
而,他显然不是东亚人的后代,而可能是欧洲人或西亚人的后代。丹麦哥本哈根大学古
DNA专家Eske Willerslev称,这一发现意味着,现在1/3的土著美洲人的祖先可以追溯
至欧亚大陆西部,而另外2/3来自东亚。
“我对土著美洲人有1/3是欧洲人的论断表示怀疑。”美国盖恩斯维尔市佛罗里达大学
遗传学家Connie Mulligan说。“这一发现令我目瞪口呆。”盐湖城犹他州大学遗传学
家Dennis O’Rourke说,“至少,这会激起广泛的讨论。”
数十年来,研究人员一直在分析第一批美国人的起源。大多数人认为,史前美洲人穿越
白令陆桥,开始在美国扩张,并在1.45... 阅读全帖

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https://tech.163.com/20/0124/09/F3L6J5NV000999LD.html
2020年1月23日,中国科学院武汉病毒研究所石正丽团队在bioRxiv预印版平台上发表文
章Discovery of a novel coronavirus associated with the recent pneumonia
outbreak in humans and its potential bat origin,报道了武汉新型冠状病毒nCoV-
2019。
2003年,SARS爆发之后,很多急性呼吸综合征相关的冠状病毒(severe acute
respiratory syndrome related coronaviruses (SARSr-CoV))在其天然宿主——蝙蝠
中被发现。以往研究表明其中一些SARSr-CoV具有感染人的潜力。
在该篇文章中,石正丽团队报道了这次在武汉最新发现的冠状病毒——nCoV-2019,该
病毒导致了这一次流行病的爆发。在早期开始的时候,从5名病人体内获得了该病毒的
全基因组,其中这5例基因组基本上一致,并于SARS-CoV的序... 阅读全帖
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关于 新冠病毒来源 的专业分析
新冠病毒神秘来源
Original 刘永 大卫深观察 2 days ago
随着新冠肺炎对全球的威胁与日俱增,越来越多的各国专家也对新冠病毒(2019-nCoV
或SARS-CoV-2)的来源投下更多关注的目光。本文从流行病学调查、病毒基因比对、跨
物种感染研究以及关键的“中间宿主”等领域,对新冠病毒来源进行了全景式梳理与深
度挖掘,为读者提供一个深刻而全新的视角。
一、华南海鲜市场:备受争议的“疫源地”
二、病毒学证据:武汉新冠病毒2019-nCoV的基因异样之处
三、石正丽:疑云笼罩的冠状病毒跨物种感染研究
四、穿山甲之谜:突如其来的“中间宿主”
自从武汉爆发新冠肺炎迄今,已经过去了两个月,但科学界对这个神秘的新冠状病毒“
2019-nCoV”(也叫SARS-CoV-2,本文简称新冠病毒)的认识依然十分有限。此次疫情
爆发的源头是华南海鲜市场吗?当局称新冠病毒来自原始宿主蝙蝠,华南农业大学几位
学者甚至声称他们找到了中间宿主穿山甲。但科学界对病毒基因序列的研究以及大量科
学文献的比对查证,均显示这个病毒的来源并非如此简单。
一、华南海鲜市场:备受... 阅读全帖
c******a
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41
注:带朋友发文,请直接使用文中Email联系方式!
中山大学肿瘤防治中心(华南肿瘤学国家重点实验室), 肿瘤遗传学方向贝锦新研究员
课题组主要从事恶性肿瘤等复杂疾病遗传学和基因组学研究,研究内容围绕“精准医学
”核心理念,旨在通过基因组、表达谱、基因组编辑和免疫细胞类群等组学手段,在群
体、个体、实验模型和单细胞等层面,发现与恶性肿瘤等重大疾病早期诊断、个体化治
疗靶点或方案、疗效判断等相关的生物标志物和策略,并阐明疾病致病分子机制,为恶
性肿瘤等重大疾病的精准医疗提供有效解决方案。本团队负责搭建中山大学精准医学科
学中心高通量组学平台、运营中山大学肿瘤防治中心高通量测序及分析平台,所在依托
单位华南肿瘤学国家重点实验室拥有先进的动物、细胞、分子水平相关研究平台。
现因课题组科研工作需要,公开招聘课题助理。现因课题组科研工作需要,公开招聘在
编工作人员、专职科研人员(生物信息学或肿瘤学相关)和博士后(生物信息学、肿瘤
发生分子机制研究)多名。我们将提供满意的工作、学习和生活氛围,让你的才华得到
最大程度的重视与发挥。
有意者请发送简历至邮箱[email protected]/... 阅读全帖
T****i
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11月18日在伦敦召开的英国皇家协会会议上展出了来自尼安德特人和另一个不同的古代
人类群体丹尼索瓦人的古代基因组。这表明3万多年前,好几个生活在欧洲和亚洲的古
代人类群体成员,包括一个来自亚洲目前尚未知的人类祖先之间发生了异血缘交配。
“它似乎显示了我们正在观察一个类似指环王类型的世界——其中存在很多原始人
类群体,”参会这项会议的英国伦敦大学进化遗传学家马克·托马斯(Mark Thomas)
这样说道,他并未参与这项研究。
第一批尼安德特人和丹尼索瓦人的基因组序列彻底革命化了对古代人类历史的研究
,这不仅因为它们显示了这些群体会与解剖学上的现代人类相互杂交,从而导致现代人
类的基因多样化。
所有祖先起源于非洲以外的现代人类有2%的基因组来自于尼安德特人;生活在大洋
洲——例如巴布亚新几内亚和澳大利亚土著居民——的某些人群的DNA有4%来自于他们
的祖先和丹尼索瓦人的混交,丹尼索瓦人是以他们被发现的西伯利亚阿尔泰山脉某洞穴
为名,这些洞穴包含了3万年至5万年前沉积的沉积物。
然而,这些结论是基于低质量的基因组序列,充斥着错误且到处是缺口,美国马萨
诸塞州波士顿哈佛大学医学院的进化遗传学... 阅读全帖
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目前表观遗传学(Epigenetics)通常被定义为基因表达通过有丝分裂或减数分裂发生了
可遗传的改变, 而DNA 序列不发生改变[1, 2]。表观遗传学的机
制主要包括DNA 甲基化、组蛋白修饰及非编码RNA。DNA 甲基化(DNA methylation)是指
在DNA甲基转移酶(DNA-methyltransferases, DNMTs)的催化下, CpG 二核苷酸中的胞嘧
啶被选择性地添加甲基, 形成5-甲基胞嘧啶[3, 4]。DNA 甲基转移酶有两种, 其中
DNMT1 主要起维持甲基化的作用, 能使半甲基化的DNA 双链分子上与甲基胞嘧啶相对应
的胞嘧啶甲基化, 可参与DNA 复制双链中新合成链的甲基化[5]; 而DNMT3a 和DNMT3b
主要起形成甲基化的作用, 能在未发生甲基化的DNA 双链上进
行甲基化[6]。DNA 甲基化一般与基因的沉默相关,DNA 去甲基化则与基因的活化相关[7
~9]。
组蛋白修饰(Histone modifications) 是指组蛋白的基础氨基末端尾部突出于核小体,
常在转录后发生变化, 包括甲基化、乙酰化、磷酸化和泛素化等翻译后的修饰... 阅读全帖
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44
来自主题: Biology版 - 名人云集冷泉港
最近在家里又看到那件印有“CSH 75”字样的T-恤,突然意识到我参加冷泉港(Cold
Spring Harbor)实验室的那次会议已经是一年多前的事情了。但那天发生的事情至今
还历历在目,回忆起来仍觉得有趣。
这是冷泉港纪念“数量生物学”(Quantitative Biology)会议75周年的年会,但会议
的内容已不限于数量生物学,内容囊括了生物学大部分的前沿领域,与会者也是“名人
云集”,当然其中最显眼的莫过于诺贝尔奖得主,DNA双螺旋结构的发现者之一James
Watson了。
会议首先由冷泉港实验室主任Bruce Stillman致欢迎辞。Stillman于1994年从James
Watson手中接任冷泉港实验室主任,并于2003年获得连任,为英国皇家学院(The
Royal Society)、美国国家科学院(National Academy of Sciences)、美国文理学
院(American Academy of Arts and Sciences)院士。做为冷泉港的总裁,他果然有
管理者的风范,举止得体,致辞周到,但让我觉得未免有点俗套。
这个为时一天的会议由HH... 阅读全帖
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2014-03-14 大数据文摘:
http://chuansongme.com/n/346230
癌症是细胞基因出了问题而得的疾病。当某些基因发生变异,会导致细胞行为表现怪异
。细胞分裂迅速,并躲过人体免疫系统的杀伤,从母体获取生长所需的营养,并最终发
展成肿瘤。
科学家们在20世纪70年代开始研究并鉴定这些癌症基因,已知的癌症基因数量逐年增长
。通过研究它们,科学家会更清楚不同类型的癌症如何发展,甚至在某些情况下,还能
够开发针对这些基因的靶向药物。 例如,去年五月美国食品和药物管理局批准的名为
Tarceva的治疗肺癌的一线药物,就是针对其中一个叫做EGFR的变异基因。
美国国立卫生研究院,为加快癌症基因的鉴定,于2005年批准了一个雄心勃勃的项目
“癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas)” 。 该项目涵盖了超过20种癌症,
每种癌症分析了大约500个样本,发现了很多的新基因。 该项目搜集的海量基因组数据
已经帮助科学家们更好的了解了癌细胞是怎样利用人体的资源发展成肿瘤的。
冷泉港实验室的总裁布鲁斯•斯蒂尔曼博士说:“癌症基因组图谱项目取得了... 阅读全帖
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总结2016.08.08【记录历史】谁重复验证了NgAgo?
引子
我们生活在一个幸运的时代,我们生活在一个变化的时代。
历史就在我们每一天不经意的时候悄悄地留了下来。
世界各地的2016年都不同寻常,记录一下有些瞬间即逝的印记。
鉴于韩春雨实验室于2016年8月8日在Adgene更新了实验流程 (Note-1),
“【记录历史】谁重复验证了NgAgo?”
于2016年8月8日进行第一次汇总留档。
第一类:NgAgo可否编辑基因组?
- Yes!
- 匿名或无记名网络、论坛发布
- 共计 11则 (Note-2)
第二类:NgAgo可否编辑基因组?
- Yes?!Wait,but No!
- 实名网络、论坛发布
- 共计 3则
第三类:NgAgo可否编辑基因组?
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第五类:NgAgo可否编辑基因组?
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w***7
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来自主题: Medicalpractice版 - zz: 医学界最具变革潜力的六大趋势
source: http://cn.wsj.com/gb/20130121/opn073445.asp?source=UpFeature
在这个追求即时满足的时代之中,医学界似乎有些格格不入。从一项激动人心的发现到
一种有效治疗方法的诞生,这其中的过程往往要花上十年甚至更长时间。
然而,就在这时好时坏、时阴时晴、最终又拨开迷雾见日出的漫长过程中,孕育而生的
是那些能够改变医学发展进程的深刻见解和科技进步。
11年前,人类基因组计划(Human Genome Project)的完成让人们看到曙光,彷佛衰竭性
疾病(debilitating disease)的治愈良方马上就能出现。如今,灵丹妙药依然难求,但
我们能以更快的速度和更低的成本来绘制人类基因图谱,这种能力带来了关于基因在疾
病产生中扮演何种角色的海量数据,而这些新知识正在持续地让一部分病人受益。在其
他一些方面,科技进步赋予了病人更多的能力,研究人员正在学习如何调动人体自身的
治疗和生长能力来抵抗各种疾病的侵扰。
Foundation Medicine
Foundation Medicine Inc.研究出一种检测突变基因的方法... 阅读全帖
b**********a
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分析方舟子的成功和失败
首先分析方舟子的失败之处,然后分析其成功。
方舟子心里有着巨大的不平衡。
方舟子的不平衡心理很容易理解,他应该在很多方面都很有不平衡。可以设一个很早期
就出国留学得到博士学位的人回国后(回国的时间也很早,大概在96年,那时候具有高
学位回国的学人很少),他找本科母校中国科技大学求职都不要他,这对他的打击可想
而知,此事应该对他后来的人生和价值观等都有巨大的影响。
方舟子到现在的人生有几个大事件对他影响深远。
1,2年期间(95-96)2度更换博士后老板和实验室。
博士毕业后做博士后,这在美国的高等教育体系中十分重要。博士后设置的开始愿意是
对有志于从事在大学和研究机构做faculty的人提供机会使其具有更好的研究能力,以
使得在申请教职位置时具有比较好的研究功底。具体到所谓的评估就是做完博士后以后
应该有比较好的文章发表,更好的就是在博士后期间的研究后期中可以独立(并非完全
独立,例如有了自己的课题和研究方向)申请到研究经费,哪怕就是几千或2到3为美金
的费用这对以后申请assistant professor有绝对的优势。道理很简单研究经费的获得
意味着你的研究... 阅读全帖
c***s
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天生原本应该是白白的小羊羔,如今一出生却与众不同:两只毛色纯黑,头顶部有白色斑点;两只毛色黑白相间像大熊猫的外衣;还有一只毛色是棕白相杂。
它们的“天赋异禀”来源于新疆畜牧科学院生物技术研究所刘明军研究员课题组的基因组编辑技术。
7日,新疆畜牧科学院在此间召开新闻发布会上,院长王力俭说:“这是利用基因组编辑技术(又称基因组遗传修饰技术),在国际上首次获得不同毛色图案的细毛羊,是新疆畜牧科技工作者在国际生命科学前沿领域技术应用研究上取得的重大突破。”
课题组负责人刘明军介绍说:“进行了基因修饰的五只羔羊表现出不同的毛色类型,羔羊的生长发育正常。利用基因组编辑技术改变大动物毛色这一技术突破,为今后家畜育种提供精准、高效、快速的新手段,今后将有更多具有不同优良性状的,经过基因编辑的家畜新品种诞生。”
记者在新疆畜牧科学院生物技术研究所设在乌鲁木齐近郊的试验基地,看到了这五只2016年3月出生的细毛羊羊羔,现在它们成为课题组的“萌宠”。
羊毛颜色是绵羊的一项重要经济性状,在绵羊育种上,被作为最重要的选育性状之一。
“我们课题组选择了影响绵羊毛色的一个关键基因(ASIP基因)进行修饰改造。通过基... 阅读全帖
m*******t
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算科普,但都是十年前的知识,这十多年转基因的技术发展很快,我说的一些问题应该
可以有改进了。
要获得转基因植物需要两个技术:一是植物组织培养,二是外源基因导入技术。
首先,你没法扛着注射器给老榆树疙瘩扎针吧?所以要转基因得先用激素让植物组织生
长得比较松散。对这种松散的植物组织,你可以大致理解为皮薄,外源基因容易进入。
但这种松散的组织有个大问题,就是它们还能不能重新生成完整的植物。你做半天转基
因,不能拿一堆开不了花结不了果的糟面团子去喂猪吧。所以植物组织培养中最考人的
就是所谓的植物再生。这不奇怪,世间任何事物都是破坏容易建设难,造谣容易辟谣难。
有网友说:美国只做玉米转基因不做小麦转基因,因为小麦是美国佬的主食,他们怕祸
害自己所以不做小麦转基因。但在我看来,更主要的原因恐怕还是小麦组织培养的问题
。小麦在植物组织培养领域臭名昭著。直到公元两千年后,很大程度上归功于中科院遗
传所的工作才解决了这个问题。组织培养过关后,转基因问题倒不太大。但从转基因植
物到拿到新品种就麻烦了。首先,你得拿到能够稳定遗传的植株。老子变成了鹰沟鼻子
蓝眼睛,儿子女儿还是老祖宗的塌鼻梁黑眼珠,转了等于没... 阅读全帖
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